https://script.spoken-tutorial.org/index.php?action=history&feed=atom&title=UCSF-Chimera%2FC4%2FAnimation%2FBengali 2026-04-21T17:43:39Z Revision history for this page on the wiki MediaWiki 1.23.17 https://script.spoken-tutorial.org/index.php?title=UCSF-Chimera/C4/Animation/Bengali&diff=45011&oldid=prev 2018-10-31T10:54:47Z

<p></p> <a href="https://script.spoken-tutorial.org/index.php?title=UCSF-Chimera/C4/Animation/Bengali&amp;diff=45011&amp;oldid=42395">Show changes</a>

Kaushik Datta https://script.spoken-tutorial.org/index.php?title=UCSF-Chimera/C4/Animation/Bengali&diff=42395&oldid=prev 2018-02-16T06:33:44Z

<p>Created page with &quot;{| border=1 ! &lt;center&gt;Time&lt;/center&gt; ! &lt;center&gt;Narration&lt;/center&gt; |- | 00:01 |Chimera Interface দ্বারা Animation এর এই টিউটোরিয়ালে...&quot;</p> <p><b>New page</b></p><div>{| border=1<br /> ! &lt;center&gt;Time&lt;/center&gt;<br /> ! &lt;center&gt;Narration&lt;/center&gt;<br /> <br /> |-<br /> | 00:01<br /> |Chimera Interface দ্বারা Animation এর এই টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।<br /> <br /> |-<br /> | 00:06<br /> |এখানে আমরা শিখব ডিসপ্লেকে পরমাণুতে বদলাতে কমান্ড লেখা।<br /> <br /> |-<br /> | 00:12<br /> | ribbons দেখা এবং লুকোনো।<br /> <br /> |-<br /> | 00:14<br /> | amino acid residues এর রঙ বদলানো।<br /> <br /> |-<br /> | 00:18<br /> | এক এক residues লেবেল করা।<br /> <br /> |-<br /> | 00:21<br /> | solvent অণু সরানো এবং ইমেজ বিভিন্ন ফাইল ফরম্যাটে সংরক্ষণ করা।<br /> <br /> |-<br /> | 00:28<br /> |টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে স্নাতক স্তরের Biochemistry সম্পর্কে জানতে হবে।<br /> <br /> |-<br /> | 00:34<br /> | Structural Biology এবং Chimera interface এর সাথে পরিচিত হতে হবে।<br /> <br /> |-<br /> | 00:40<br /> | প্রাসঙ্গিক টিউটোরিয়ালের জন্য আমাদের ওয়েবসাইটে যান।<br /> <br /> |-<br /> | 00:44<br /> |টিউটোরিয়ালটি রেকর্ড করতে ব্যবহার করছি উবুন্টু OS সংস্করণ 14.04 chimera সংস্করণ 1.10.2.<br /> <br /> |-<br /> | 00:53<br /> | Mozilla Firefox ব্রাউজার 42.0 এবং একটি কার্যকর ইন্টারনেট সংযোগ।<br /> <br /> |-<br /> | 01:00<br /> | Chimera উইন্ডো খুলতে Chimera আইকনে ডাবল ক্লিক করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 01:06<br /> |graphics window খুলতে lightning bolt আইকনে ক্লিক করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 01:10<br /> |এখানে আমি দেখাবো যে কাঠামোতে পরিবর্তন আনতে commands কিভাবে প্রয়োগ করে।<br /> <br /> |-<br /> | 01:16<br /> | Favorites মেনু ব্যবহার করে Command Line খুলুন।<br /> |-<br /> | 01:20<br /> |Chimera উইন্ডোর নীচের অংশে একটি command text box দেখায়।<br /> <br /> |-<br /> | 01:25<br /> |menus ব্যবহার করে কাজগুলি commands দ্বারা সম্পন্ন করা যায়।<br /> <br /> |-<br /> | 01:31<br /> |Chimera Commands সম্পর্কে।<br /> <br /> |-<br /> | 01:34<br /> |Chimera commands, Command line এ প্রবিষ্ট করা হয়।<br /> <br /> |-<br /> | 01:38<br /> |semicolon সেপারেটর দ্বারা একাধিক commands একই লাইনে মিলিত হতে পারে।<br /> <br /> |-<br /> | 01:43<br /> |command নিষ্পাদিত করতে Enter কী টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 01:47<br /> |পূর্ববর্তী commands এ command History থেকে অ্যাক্সেস করা যায়।<br /> <br /> |-<br /> | 01:51<br /> |commands সম্পর্কে আরো তথ্য প্রদত্ত লিঙ্কে দেওয়া হয়েছে।<br /> <br /> |-<br /> | 01:56<br /> |Chimera উইন্ডোতে ফিরে আসুন। একটি কমান্ড লিখে leucine zipper এর একটি মডেল খুলি।<br /> <br /> |-<br /> | 02:03<br /> |command একটি command শব্দ দিয়ে শুরু হয়।<br /> <br /> |-<br /> | 02:06<br /> |command line টেক্সট বাক্সে open space 1zik লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 02:13<br /> |আপনার একটি কার্যকর ইন্টারনেট সংযোগ প্রয়োজন।<br /> <br /> |-<br /> | 02:17<br /> |command নিষ্পাদিত করতে Enter টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 02:20<br /> |কাঠামো পর্দায় দেখায়।<br /> <br /> |-<br /> | 02:23<br /> |ribbons ডিসপ্লেকে atoms এ বদলাতে command line text box এ লিখুন: The command word display এবং এন্টার টিপুন। <br /> <br /> |-<br /> | 02:34<br /> |এখন atoms display তে protein এর কাঠামো রয়েছে।<br /> <br /> |-<br /> | 02:38<br /> |এই কাঠামো আংশিকভাবে ribbons হিসাবে দেখায়।<br /> <br /> |-<br /> | 02:42<br /> |ribbons লুকোতে লিখুন wave symbol যা tilda নামেও পরিচিত, তারপর command শব্দ ribbon লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 02:51<br /> |tilda সহ কমান্ড রিভার্স ফাংশন নির্দেশ করে।<br /> <br /> |-<br /> | 02:55<br /> |এখানে, এরপর ribbon keyword দ্বারা tilda চিহ্ন ribbons লুকোয়। এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> |03:03<br /> | আমরা atoms, bonds, surfaces ইত্যাদি রঙ্গিন করতে color command ব্যবহার করতে পারি।<br /> <br /> |-<br /> | 03:10<br /> |উদাহরণস্বরূপ, সকল leucines এর রঙ বদলাতে লিখুন: <br /> <br /> Color space yellow space colon এবং তারপর amino acid এর জন্য তিনটি অক্ষরের ছোট রূপ।<br /> <br /> |-<br /> | 03:24<br /> | leucine এর জন্য, আমি লিখব leu.<br /> <br /> |-<br /> | 03:28<br /> |এখানে color yellow argument সহ command word রয়েছে এবং লক্ষ্য হল কাঠামোর সকল leucines.<br /> <br /> |-<br /> | 03:37<br /> |আপনি লক্ষ্য নির্দিষ্ট না করলে সম্পূর্ণ কাঠামো হলুদ রঙের হবে। এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 03:45<br /> |panel টি দেখুন। সকল leucines এখন হলুদ রঙে রয়েছে।<br /> <br /> |-<br /> | 03:51<br /> | আমরা একটি বিশেষ স্থানের amino acid কে বিশেষ রঙ দ্বারা রঙ করতে পারি।<br /> <br /> |-<br /> | 03:56<br /> |উদাহরণস্বরূপ histidine এর রঙ বদলাতে, যা chain B তে স্থান 18 এ উপস্থিত, লিখুন color space red space colon18.B এবং এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 04:13<br /> |প্যানেলটি দেখুন। histidine এখন লাল হয়ে গেছে।<br /> <br /> |-<br /> | 04:19<br /> | সম্পূর্ণ কাঠামোর ডিসপ্লে CPK spacefill এ বদলাতে, rep লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 04:26<br /> |rep কীওয়ার্ড represent এর সংক্ষিপ্ত রূপ। rep space sphere; এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 04:37<br /> |প্যানেলটি দেখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 04:39<br /> |কাঠামো stick ডিসপ্লেতে ফিরিয়ে আনতে, আবার লিখুন rep space stick এবং এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 04:50<br /> |solvent অণুর কাঠামো লুকোতে লিখুন del (মুছে ফেলতে), space solvent. এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 05:02<br /> |চয়নের জন্য residues সক্রিয় করতে, select command শব্দ চয়ন করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 05:08<br /> |command line টেক্সট বাক্সে লিখুন, select space colon তারপর রেসিডিউ এর সংখ্যা এবং chain.<br /> <br /> |-<br /> | 05:18<br /> | উদাহরণস্বরূপ chain B এর স্থানে 28 এ উপস্থিত lysine সক্রিয় করতে লিখুন select space colon তারপর 28 dot B. এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 05:34<br /> |এখন চয়নিত residue এর label দেখাতে লিখুন rlabel space sel. এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 05:44<br /> |প্যানেলটি দেখুন। চয়নিত residue এর residue label প্রদর্শিত হয়।<br /> <br /> |-<br /> | 05:51<br /> |পূর্বে চয়নিত residue অচয়নিত করতে, select command পেতে আপ অ্যারো কী টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 05:59<br /> |command এর প্রারম্ভে tilda চিহ্ন লিখুন। এন্টার টিপুন।<br /> <br /> |-<br /> | 06:05<br /> |Help menu তে keywords এবং command index এর একটি তালিকা উপলব্ধ।<br /> <br /> |-<br /> | 06:09<br /> |Help menu তে ক্লিক করুন, স্নীচে ক্রোল করুন এবং Commands index এ ক্লিক করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 06:16<br /> | commands লিখতে keywords এর সূচী সহ একটি web-page খোলে।<br /> <br /> |-<br /> | 06:22<br /> |Chimera উইন্ডোতে ফিরে আসুন।<br /> <br /> |-<br /> | 06:25<br /> |আপনি ব্যাকগ্রাউন্ডের রঙ কালো থেকে নীলে বদলাতে চাইলে লিখুন: background space solid space blue. এন্টার টিপুন।<br /> |-<br /> | 06:38<br /> |প্যানেল এখন নীল রঙে রয়েছে।<br /> <br /> |-<br /> | 06:41<br /> |Command এর হিস্ট্রি দেখতে, Command line এর ডান পাশে স্থিত কালো ত্রিভুজে ক্লিক করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 06:48<br /> |Command history পূর্বে ব্যবহৃত কমান্ড তালিকাভুক্ত করে।<br /> <br /> |-<br /> | 06:53<br /> |Commands, Command এ ক্লিক করে আবার নিষ্পাদিত করা যায়।<br /> <br /> |-<br /> | 06:57<br /> |Command line লুকোতে, ড্রপ ডাউন মেনুতে Hide command line বিকল্পে ক্লিক করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:03<br /> |আপনার নির্মিত কাঠামো save করার অনেক বিকল্প রয়েছে। File menu খুলুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:09<br /> |আপনি এটি করতে পারেন: Restore a Session, Save a Session<br /> <br /> |-<br /> | 07:14<br /> |ইমেজ JPEG বা PNG ফরম্যাটে সংরক্ষণ করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:19<br /> |ইমেজ PDB বা Mol2 ফাইল হিসাবে সংরক্ষণ করুন, দৃশ্য Export করুন ইত্যাদি।<br /> <br /> |-<br /> | 07:27<br /> |প্রদর্শন করতে, ইমেজে JPEG ফরম্যাটে সংরক্ষণ করি।<br /> <br /> |-<br /> |07:33<br /> |Save image বিকল্পে ক্লিক করুন। একটি Save image ডায়লগ বাক্স খোলে।<br /> <br /> |-<br /> | 07:40<br /> |ফাইলের স্থান হিসাবে ডেস্কটপ চয়ন করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:44<br /> | File name কে 1zik লিখুন। File name কে JPEG হিসাবে লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:52<br /> |আপনার প্রয়োজন অনুযায়ী ইমেজের আকার নিশ্চিত করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 07:56<br /> |প্রদর্শন করতে, আমি প্রস্থ হিসাবে 800 এবং উচ্চতা হিসাবে 600 লিখব।<br /> <br /> |-<br /> | 08:05<br /> |Save বোতামে ক্লিক করুন। ইমেজ ডেস্কটপে 1zik.jpg হিসাবে সংরক্ষণ হয়।<br /> <br /> |-<br /> | 08:15<br /> |সংক্ষিপ্তকরণ করি যে এখানে আমরা শিখেছি।<br /> <br /> |-<br /> |08:17<br /> |এখানে আমরা কমান্ড লিখেছি, display কে atoms এ বদলানো।<br /> <br /> |-<br /> | 08:22<br /> | ribbons দেখানো এবং লুকোনো।<br /> <br /> |-<br /> | 08:25<br /> | amino acid residues এর রঙ বদলানো।<br /> <br /> |-<br /> | 08:28<br /> |আলাদা আলাদা residues লেবেল করা.<br /> <br /> |-<br /> | 08:31<br /> |solvent molecules মুছে ফেলা। ইমেজ ভিন্ন ভিন্ন ফাইল ফরম্যাটে সংরক্ষণ করা।<br /> |-<br /> |08:38<br /> |অনুশীলনী হিসাবে Human oxy-hemoglobin (PDB code: 2dn1) এর কাঠামো লোড করতে কম্যান্ড লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> | 08:48<br /> | ডিসপ্লে atoms এ বদলান এবং ribbons লুকোন।<br /> <br /> |-<br /> | 08:52<br /> | সকল histidine residues কে সবুজ রঙ করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 08:56<br /> |solvent molecules সরান এবং ইমেজ JPEG ফরম্যাটে সংরক্ষণ করুন।<br /> <br /> |-<br /> | 09:03<br /> |আপনার সম্পন্ন কাজ নিম্নরূপ হওয়া উচিত।<br /> <br /> |-<br /> | 09:12<br /> |নিম্ন লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়।<br /> <br /> এটি ডাউনলোড করে দেখুন।<br /> |-<br /> | 09:19<br /> |স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে এবং অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়।<br /> <br /> অধিক জানতে আমাদের লিখুন।<br /> <br /> |-<br /> |09:29<br /> |স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা পরিচালিত।<br /> <br /> |-<br /> | 09:35<br /> |এই মিশনের সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য।<br /> <br /> |-<br /> | 09:40<br /> |আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ।<br /> <br /> |}</div>

Satarupadutta