Venuspriya at 09:17, 12 January 2018

2018-01-12T09:17:45Z

Jayashree: Created page with "{| border=1 ! Time ! Narration |- | 00:01 | Chimeraஐ பயன்படுத்தி, '''Picking மற்றும் தேர்ந..."

2017-12-05T10:41:32Z

Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | Chimeraஐ பயன்படுத்தி, '''Picking மற்றும் தேர்ந..."

New page

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| Chimeraஐ பயன்படுத்தி, '''Picking மற்றும் தேர்ந்தெடுப்பு''' குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
| 00:06
| இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது, atomகள் மற்றும் '''residue'''களுக்கு, labelகளை காட்டுவது.

|-
| 00:12
| '''Select menu'''ஐ பயன்படுத்தி, அல்லது, '''Picking''' மூலம், '''atom'''கள் மற்றும் '''residue'''க்களை தேர்ந்தெடுப்பது.

|-
| 00:17
| '''Residue'''க்களின், நிறம் மற்றும் displayஐ மாற்றுவது.

|-
| 00:21
| Atomகளை, சேர்ப்பது, நீக்குவது, மற்றும், மாற்றுவது, bondகளை சுழற்றுவது.

|-
| 00:27
| Display windowவில், ஒன்றுக்கும் மேற்பட்ட modelஐ திறப்பது. Modelஐ தேர்ந்தெடுத்து, நகர்த்துவது.

|-
| 00:34
| இந்த டுடோரியலை பின்பற்ற, உங்களுக்கு இளங்கலை'''Biochemistry''' தெரிந்து இருக்க வேண்டும்.

|-
| 00:40
| அல்லது, '''structural biology''' பரீட்சயமாக இருக்க வேண்டும். அதற்கான டுடோரியல்களுக்கு, எங்கள் வலைத்தளத்தை பார்க்கவும்.

|-
| 00:47
| இந்த டுடோரியலை பதிவு செய்வதற்கு, நான், '''Ubuntu Operating System''' பதிப்பு. 14.04

|-
| 00:52
| '''Chimera''' பதிப்பு 1.10.2

|-
| 00:57
| '''Mozilla firefox''' browser 35.0

|-
| 01:01
| மற்றும், ஒரு இணைய இணைப்பை பயன்படுத்துகிறேன்.

|-
| 01:04
| இங்கு, ஒரு '''Chimera window'''ஐ நான் திறந்துள்ளேன்.

|-
| 01:07
| '''Rapid access window'''வில், recently accessed data பட்டியலில் இருந்து, '''1zik '''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 01:15
| '''Graphics window'''வில், '''Leucine zipper'''ன் ஒரு model, திறக்கிறது.

|-
| 01:20
| Residueக்கள், atomக்கள், bondகள், போன்ற, structureன் தனிப்பட்ட componentகளை, '''Chimera'''வில் கிடைக்கின்ற toolகளை பயன்படுத்தி, மாற்றலாம்.

|-
| 01:31
| முதல் படி, தேர்ந்தெடுப்பை செய்வதாகும்.

|-
| 01:34
| ஒரு தேர்ந்தெடுப்பை செய்ய, வெவ்வேறு வழிகள் உள்ளன: Menu barல் இருக்கின்ற, '''Select''' menuஐ பயன்படுத்துவது.

|-
| 01:40
| '''graphics''' windowல் இருந்து '''picking''' செய்வது.

|-
| 01:43
| Command lineல், commandகளை டைப் செய்வது. அல்லது, '''Favorites''' menuல் இருக்கும், '''Model Panel''' மற்றும் '''Sequence''' optionஐ தேர்ந்தெடுப்பது.

|-
| 01:53
| Chimera windowக்கு திரும்பவும்.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' motif, தொடர் வரிசையில், '''leucine''' residueக்களை மீண்டும் மீண்டும் கொண்டிருக்கிறது.

|-
| 02:02
| இந்த structureல் இருக்கின்ற, '''leucine''' residueக்களை, எப்படி முன்னிலைப்படுத்துவது என்று நான் இப்போது விளக்குகிறேன்.

|-
| 02:08
| '''Presets''' menuவில் இருந்து, '''interactive 2''' optionஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
| 02:12
| இது, structureஐ , atoms displayக்கு மாற்றிவிடும். ''' Select''' menuவில் இருந்து, '''Residue''' optionஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
| 02:20
| Sub-menu, பல optionகளை கொண்டிருக்கிறது.

|-
| 02:23
| Amino acid category menu, amino acidகளை: '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''', போன்ற குழுக்களாக கொண்டிருக்கிறது.

|-
| 02:34
| Standard amino acid menu, structureல் இருக்கின்ற, amino acid residueக்களின் பட்டியல் ஒன்றை கொண்டிருக்கிறது. '''leucine'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 02:42
| எல்லா, '''leucine''' residueக்களும் இப்போது முன்னிலைப்படுத்தப்படுகின்றன.

|-
| 02:46
| '''Actions ''' menuஐ க்ளிக் செய்து, '''color.'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
| 02:49
| நிறங்களின் பட்டியலில் இருந்து, நான் மஞ்சளை தேர்வு செய்கிறேன். எல்லா '''leucine'''களும், இப்போது மஞ்சள் நிறத்தில் காட்டப்படுகின்றன.

|-
| 02:57
| தேர்ந்தெடுப்பைclear செய்ய, '''Select''' menuஐ க்ளிக் செய்யவும். பின், '''Clear selection''' optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 03:03
| '''Leucine''', '''hydrophobic'''ஆக இருப்பதினால், அது, proteinனின் '''hydrophobic''' coreயினுள் தொகுக்கப்படுகிறது.

|-
| 03:09
| இப்போது, '''presets''' optionஐ பயன்படுத்தி, displayஐ ribbonsக்கு மாற்றவும். '''Interactive 1'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 03:17
| திரையிலிருந்து, ஒரு '''residue'''ஐ pick செய்ய: Cursorஐ structureன் மேல் வட்டமிடவும்.

|-
| 03:22
| அடையாளம் காண்பதற்கான தகவலுடன், ஒரு '''pop-up balloon''' தோன்றுகிறது.

|-
| 03:26
| அது, '''residue'''ன் பெயர், '''residue'''ன் எண், மற்றும், Chain போன்ற தகவல்களைக் கொண்டிருக்கிறது.

|-
| 03:32
| Cursorஐ நீங்கள் நகர்த்தும் போது, '''balloon''' மறைந்துவிடுகிறது.

|-
| 03:36
| Chain A ல் இருக்கின்ற, முதல் '''residue''', அதாவது, '''arginine'''க்கு, cursorஐ கொண்டு வரவும்.

|-
| 03:41
| Keyboardல் CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே, இடது mouse பட்டனை க்ளிக் செய்யவும். CTRL key ஐ விடவும்.

|-
| 03:49
| '''Residue'''ன் outline, முன்னிலைப்படுத்தப்படுகிறது. முன்னிருப்பாக, தேர்ந்தெடுப்பு, பச்சை நிறத்தில் outline செய்யப்படுகிறது.

|-
| 03:57
| ஒன்றுக்கும் மேற்பட்ட '''residue'''ஐ நீங்கள் தேர்ந்தெடுக்க வேண்டுமெனில்: Keyboardல் CTRL மற்றும் Shift key ஐ அழுத்திக்கொண்டே இருக்கவும்.

|-
| 04:04
| Peptide chainனின் மீது mouseஐ வட்டமிடவும். நீங்கள் pick செய்ய விரும்புகின்ற '''residue'''க்களின் மீது, க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 04:10
| Keyboardல் இருந்து, CTRL மற்றும் Shift keyகளை விடவும்.

|-
| 04:14
| இப்போது, மாற்றியமைப்பதற்கான residueக்களை, நீங்கள் pick செய்துவிட்டீர்கள்.

|-
| 04:18
| '''Actions''' menuல் இருந்து, ஒரு optionஐ தேர்வு செய்யவும். '''Actions''' menuஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 04:23
| உதாரணத்திற்கு, atomsஐ காட்ட, '''atoms/bonds.'''ஐ தேர்வு செய்யவும். '''Show'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 04:30
| தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட residueக்கள், இப்போது atoms displayல் தெரிகின்றன. தேர்ந்தெடுப்பை clear செய்யவும்.

|-
| 04:36
| Strucutureல் இருக்கின்ற, atomகள் அல்லது bondகளையும், '''Picking''' மூலம், நாம் மாற்றலாம்.

|-
| 04:42
| Atom அல்லதுbond போன்ற, ஒரு objectன் மீது, cursorஐ வைக்கவும்.

|-
| 04:47
| இது, அதன் label தகவலை, ஒரு '''atomspec balloon'''ல் காட்டும்.

|-
| 04:52
| ஒரு atomக்கான, '''Atomspec balloon''', '''residue'''ன் பெயர், எண், chain மற்றும் atomன் பெயர் போன்ற தகவல்களைக் கொண்டிருக்கிறது.

|-
| 05:01
| ஒரு atomஐ தேர்ந்தெடுக்க, Keyboardல் CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே இருக்கவும்.

|-
| 05:06
| CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே, நீங்கள் மாற்ற விரும்புகின்ற atomஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 05:11
| Atom இப்போது முன்னிலைப்படுத்த்தப்பட்டுவிட்டது. Atomஐ மாற்ற, CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே, atomஐ டபுள்-க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 05:20
| ஒரு '''''context menu ''''', optionகளுடன் திறக்கிறது.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' optionஐ க்ளிக் செய்யவும். CTRL key ஐ விடவும்.

|-
| 05:30
| ஒரு '''Build Structure''' window திறக்கிறது.

|-
| 05:33
| தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டatom, அதாவது, Nitrogenஐ , ஒரு methyl groupக்கு மாற்றுவோம்.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' windowவில், elementஆக carbonஐயும், bondsஐ 4 ஆகவும், தேர்ந்தெடுத்து, பின், apply பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 05:49
| Panelஐ கவனிக்கவும்.

|-
| 05:51
| இப்போது, existing structureக்கு, ஒரு methyl group சேர்க்கப்படுகிறது. Windowஐ மூடவும்.

|-
| 05:57
| Bondகளை சுழற்றவும் ஒரு option உள்ளது.

|-
| 06:00
| நீங்கள் சுழற்ற விரும்பும் bondன் மீது, cursorஐ வட்டமிடவும்.

|-
| 06:04
| Bondக்கு தொடர்புடைய தகவல்கள், '''atomspec balloon'''ல் தோன்றுகிறது.

|-
| 06:09
| ஒரு atomஐ தேர்ந்தெடுக்க, bondன் மீது cursorஐ வைக்கவும்.

|-
| 06:13
| CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே இருக்கவும். இடதுmouse பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 06:18
| தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டbond, இப்போது முன்னிலைப்படுத்த்தப்பட்டுவிட்டது. CTRL key ஐ அழுத்திக்கொண்டே, bondஐ டபுள்-க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 06:26
| Keyboardல், CTRL key ஐ விடவும்.

|-
| 06:29
| ஒரு '''context-menu''' திறக்கிறது. '''rotate bond''' optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 06:35
| ஒரு , ''' Build Structure '''dialog box திரையில் தோன்றுகிறது.

|-
| 06:39
| Dialog boxல் இருக்கின்ற, rotating toolஐ க்ளிக் செய்து, சுழற்றவும்.

|-
| 06:46
| Panelஐ கவனிக்கவும். தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட bond, இப்போது சுழல்கிறது.

|-
| 06:51
| விருப்பமான angleஐ அடைந்தவுடன், சுழற்றுவதை நிறுத்தவும். Dialog boxஐ மூடவும்.

|-
| 06:57
| தேர்ந்தெடுப்பைclear செய்யவும். Chainகளை முன்னிலைப்படுத்த, tools menuல் இருக்கின்ற, '''Sequence '''optionஐயும் நாம் பயன்படுத்தலாம்.

|-
| 07:05
| Tools menuல் கீழே scroll செய்து, '''Sequence''' optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 07:10
| Sub-menuவில் இருந்து, '''Sequence'''ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
| 07:13
| ஒரு '''Show model sequence''' dialog box தோன்றுகிறது.

|-
| 07:17
| Chain Aஐ தேர்ந்தெடுக்க வேண்டுமெனில், '''chain A '''ஐ க்ளிக் செய்யவும். பின், '''show'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 07:23
| Amino acid sequenceஉடன், மற்றொருdialog box திரையில் தோன்றுகிறது.

|-
| 07:28
| '''Amino acid residue'''க்கள், ஒற்றை எழுத்து சுருக்கங்களால், வர்ணிக்கப்படுகின்றன.

|-
| 07:34
| தேர்ந்தெடுக்க, sequenceஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 07:37
| Panelஐ கவனிக்கவும், '''Chain A''' இப்போது முன்னிலைப்படுத்த்தப்பட்டுவிட்டது.

|-
| 07:41
| Windowஐ மூட, '''quit'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 07:44
| '''Actions menu'''க்கு சென்று, '''color'''க்கு கீழே scroll செய்யவும். மஞ்சள் optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' இப்போது, மஞ்சள் நிறத்தில் உள்ளது. தேர்ந்தெடுப்பைclear செய்யவும்.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''வில், ஒன்றுக்கும் மேற்பட்ட structureஐ நாம் திறக்கலாம்.

|-
| 07:59
| இரண்டாவது structureஐ திறக்க: File menuவில், கீழே scroll செய்யவும்.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 08:06
| ஒரு '''Fetch structure by ID''' dialog box திறக்கிறது.

|-
| 08:11
| '''PDB''' optionஐ தேர்ந்தெடுக்கவும். பின் 4 எழுத்து, '''PDB code'''ஐ டைப் செய்யவும். உதாரணத்திற்கு, '''human insulin'''ஐ பெற, டைப் செய்க: 4ex1.

|-
| 08:23
| '''fetch''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 08:25
| இரண்டு protein structureகளும், panelலில் ஒன்றன் மேல் ஒன்றாக உள்ளன.

|-
| 08:29
| ஒன்றன் மேல் ஒன்றாக உள்ள structureகளைப் பிரிக்க: panelலில், ஒரு modelஐ தேர்ந்தெடுத்து நகர்த்த வேண்டும்.

|-
| 08:36
| '''Favorites''' menuஐ பயன்படுத்தி, '''Command line'''ஐ திறக்கவும்.

|-
| 08:39
| '''Command line''', windowவின் கீழே தோன்றுகிறது.

|-
| 08:43
| '''leucine zipper'''ஐ வர்ணிக்கின்ற, model zeroஐ uncheck செய்ய, அதை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 08:48
| Cursorஐ , '''insulin''' structureக்கு கொண்டு வரவும்: நடு mouse பட்டனை அழுத்திக்கொண்டே இருக்கவும்.

|-
| 08:54
| பின், panelலில், விரும்புகின்ற இடத்திற்கு, '''insulin''' modelஐ நகர்த்த, அதை இழுக்கவும். Mouse பட்டனை விடவும்.

|-
| 09:01
| திரையிலிருந்து, குறிப்பிட்ட modelஐ நீக்க: '''Favorites''' menuஐ பயன்படுத்தி, model panel ஐ திறக்கவும்.

|-
| 09:08
| ஒரு '''Model Panel''' dialog box தோன்றுகிறது.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ஐ க்ளிக் செய்து, நீங்கள் நீக்க விரும்புகின்ற modelஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
| 09:16
| உதாரணத்திற்கு, திரையிலிருந்து, '''insulin''' modelஐ நான் நீக்க விரும்புகிறேன்.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ஐ க்ளிக் செய்யவும். Close optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
| 09:26
| Panelஐ கவனிக்கவும். '''Insulin'''னின் model, இப்போது, திரையிலிருந்து நீக்கப்பட்டுவிட்டது.

|-
| 09:32
| '''model panel window'''ஐ மூடவும்.

|-
| 09:34
| இத்துடன், நாம் இந்த டுடோரியலின் முடிவுக்கு வந்துவிட்டோம்.

|-
| 09:37
| நாம் கற்றதை, சுருங்கச் சொல்ல.

|-
| 09:40
| இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது, atomகள் மற்றும் '''residue'''களுக்கு, labelகளை காட்டுவது.

|-
| 09:46
| '''Select''' menuஐ பயன்படுத்தி, அல்லது, '''Picking''' மூலம், atomகள் மற்றும் residueக்களை தேர்ந்தெடுப்பது.

|-
| 09:51
| '''Residue'''க்களின், நிறம் மற்றும் displayஐ மாற்றுவது.

|-
| 09:55
| Atomகளை, சேர்ப்பது, நீக்குவது, மற்றும், மாற்றுவது. Bondகளை சுழற்றுவது.

|-
| 10:00
| Display windowவில், ஒன்றுக்கும் மேற்பட்ட modelஐ திறப்பது. Modelஐ தேர்ந்தெடுத்து, நகர்த்துவது.

|-
| 10:06
| பயிற்சியாக, Chimera windowவில், '''human insulin'''ன் ஒரு structureஆன, '''pdb code 4ex1'''ஐ திறக்கவும்.

|-
| 10:14
| எல்லா '''hydrophobic''' amino acid '''residue'''க்களையும், நீல நிறமாக்கவும்.

|-
| 10:19
| எல்லா '''polar residue'''க்களையும், சிவப்பு நிறமாக்கவும்.

|-
| 10:23
| நிறைவுபெற்ற உங்கள் பயிற்சி, பின்வருமாறு காணப்பட வேண்டும்.

|-
| 10:29
| பின்வரும் இணைப்பில் உள்ள வீடியோ, ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. அதை தரவிறக்கிக் காணவும்.

|-
| 10:36
| ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டக்குழு, செய்முறை வகுப்புகள் நடத்தி, இணையத்தில் பரீட்சை எழுதி தேர்வோருக்கு சான்றிதழ்கள் தருகிறது. மேலும் விவரங்களுக்கு, எங்களுக்கு மின்னஞ்சல் செய்யவும்.

|-
| 10:45
| ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்திற்கு ஆதரவு, இந்திய அரசாங்கத்தின், NMEICT, MHRD மூலம் கிடைக்கிறது. மேலும் விவரங்களுக்கு, கீழ்கண்ட இணைப்பை பார்க்கவும்.

|-
| 10:55
| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.
|-
|}

@@ Line 181: / Line 181: @@
 |-
 |  04:14
-| இப்போது, மாற்றியமைப்பதற்கான residueக்களை, நீங்கள் pick  செய்துவிட்டீர்கள்.
+| இப்போது, மாற்றியமைப்பதற்கான residueக்களை, pick  செய்துவிட்டீர்கள்.
 |-
@@ Line 409: / Line 409: @@
 |-
 |  09:11
-| '''model ID'''ஐ க்ளிக் செய்து, நீங்கள் நீக்க விரும்புகின்ற modelஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
+| '''model ID'''ஐ க்ளிக் செய்து, நீக்க விரும்புகின்ற modelஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
 |-
@@ Line 485: / Line 485: @@
 |-
 | 10:55
-| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.
+| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.குரல்கொடுத்தது IIT Bombayஇல் இருந்து சண்முகப் பிரியா , நன்றி
 |-
 |}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Tamil - Revision history

Venuspriya at 09:17, 12 January 2018

Jayashree: Created page with "{| border=1 ! Time ! Narration |- | 00:01 | Chimeraஐ பயன்படுத்தி, '''Picking மற்றும் தேர்ந..."