Madhurig at 10:02, 7 August 2018

2018-08-07T10:02:43Z

Madhurig at 08:07, 7 August 2018

2018-08-07T08:07:46Z

Show changes

Madhurig at 08:08, 30 July 2018

2018-07-30T08:08:52Z

Show changes

Simhadriudaya: Created page with " {| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- |00:01 |Proteins and Macromolecules. పై ఈ ట్యుటోరియల్ కు స్వాగతం. |- |00:06 |ఈ..."

2018-02-08T06:19:43Z

Created page with " {| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- |00:01 |Proteins and Macromolecules. పై ఈ ట్యుటోరియల్ కు స్వాగతం. |- |00:06 |ఈ..."

New page

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''

|-
|00:01
|Proteins and Macromolecules. పై ఈ ట్యుటోరియల్ కు స్వాగతం.
|-
|00:06
|ఈ ట్యుటోరియల్ లో మనము
|-
|00:09
|ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) నుండి ప్రోటీన్ యొక్క నిర్మాణాల ను లోడ్ చేయడం
|-
|00:13
|PDB డేటాబేస్ నుండి pdb ఫైళ్లను డౌన్లోడ్ చేయడం
|-
|00:18
|వివిధ ఫార్మాట్లలో ప్రోటీన్ల యొక్క రెండవ నిర్మాణాన్ని ప్రదర్శించండం
|-
|00:24
|hydrogen bonds మరియు disulfide bonds లను హైలైట్ చేయడం నేర్చుకుంటాము:
|-
|00:29
|ఈ ట్యుటోరియల్ ను అనుసరించడానికి, మీకు Jmol Application window పై ప్రాథమిక కార్యకలాపాల గురించి తెలిసి ఉండాలి.
|-
|00:37
|లేకపోతే, మా వెబ్సైట్లో అందుబాటులో ఉన్న ట్యుటోరియల్స్ ను చూడండి.
|-
|00:42
|ఈ ట్యుటోరియల్ ను రికార్డ్ చేసేందుకు, నేను
|-
|00:46
|ఉబుంటు OS వర్షన్ 12 .04
|-
|00:50
| Jmol వర్షన్ .2.2.2
|-
|00:54
|Java వర్షన్ 7
|-
|00:57
|Mozilla Firefox Browser 22.0 ను ఉపయోగిస్తున్నాను:
|-
|01:02
|పెద్ద జీవాణువులు(biomolecules) అనగా
|-
|01:06
|Proteins మరియు Macromolecules
|-
|01:10
|Nucleic acids, DNAమరియు RNA
|-
|01:13
|structures మరియు polymers ల యొక్కStructure Analysis ను Jmol Applicationను ఉపయోగించి చేయవచ్చు.
|-
|01:19
|ఇక్కడ, నేను ఒక కొత్త Jmol windowను తెరిచాను.
|-
|01:24
|బయోమోలోక్యూల్స్ యొక్క 3D నిర్మాణం ను డేటాబేస్ నుండి ప్రత్యక్షంగా డౌన్లోడ్ చేసి, చూడవచ్చు.
|-
|01:29
|అలా చేయటానికి, File మెనుపై క్లిక్ చేసి, Get PDB. కు స్క్రోల్ చేయండి.
|-
|01:36
| screen పై ఒక Input డైలాగ్-బాక్స్ కనిపిస్తుంది.
|-
|01:40
|మనము Input బాక్స్లో protein యొక్క నాలుగు అక్షరాల PDB code ను టైప్ చేయాలి.
|-
|01:48
|ఈ కోడ్ ను Protein Data Bank (PDB) వెబ్సైట్ నుండి పొందవచ్చు.
|-
|01:53
|ఇది Protein Data Bank యొక్క వెబ్ పేజీ.
|-
|01:57
| ఇది proteins మరియు nucleic acids వంటి జీవాణువులు గురించి సమాచారం కలిగి ఉంది.
|-
|02:04
|ఉదాహరణకు, PDB వెబ్సైట్ నుండి Pancreatic Enzyme Insulin యొక్కPDB కోడ్ కనుగొనేందుకు ప్రయత్నిద్దాం.
|-
|02:13
|search box లో, ప్రోటీన్ యొక్క పేరు గా human insulin ను టైప్ చేసి, ఎంటర్ నొక్కండి.
|-
|02:24
| ఇప్పుడు, ప్రదర్శించబడిన వెబ్-పేజీలో, క్రిందికి స్క్రోల్ చేయండి.
|-
|02:28
|PDB codes తో పాటు Human Insulin యొక్క తెలిసిన నిర్మాణాల జాబితా తెరపై కనిపిస్తుంది.
|-
|02:36
|ఉదాహరణగా, మనము Human Insulin ను 4EX1 కోడ్ తో ఎంచుకుందాం.
|-
|02:44
|ప్రోటీన్ పేరు మీద క్లిక్ చేయండి.
|-
|02:47
|నిర్మాణం యొక్క అన్ని వివరాలతో ఒక window ప్రారంభమవుతుంది.
|-
|02:52
|సమాచారం-
|-
|02:54
|Primary Citation
|-
|02:56
|Molecular Description మరియు
|-
|02:58
|Structure Validation లు ఈ వెబ్ సైట్ లో అందుబాటులో ఉన్నాయి.
|-
|03:02
|మనము ప్రోటీన్ల యొక్క నిర్మాణాలను .pdb ఫైల్స్ గా సేవ్ చేయవచ్చు మరియు వాటిని Jmol లో3D mode లో చూడవచ్చు.
|-
|03:12
|page యొక్క కుడి ఎగువ భాగాన ఉన్నDownload Files లింకుపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|03:20
|డ్రాప్-డౌన్ మెను నుండి, PDB ఫైల్ (gz) ఎంపికను ఎంచుకోండి.
|-
|03:28
|తెరపై డైలాగ్-బాక్స్ తెరుచుకుంటుంది.
|-
|03:32
|Save file ఎంపికను ఎంచుకోండి.
|-
|03:35
| OK బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
|-
|03:39
| protein యొక్క నిర్మాణం Downloads ఫోల్డర్లో 4EX1.pdb.gz గా సేవ్ చేయబడుతుంది.
|-
|03:51
|అదేవిధంగా, మీరు వివిధ ప్రోటీన్ల అవసరమైన pdb ఫైళ్ళను డౌన్లోడ్ చేయవచ్చ మరియు వాటిని వేర్వేరు ఫైళ్ళలో save చేయవచ్చు.
|-
|04:02
|ఇప్పుడు, Insulin యొక్క 3D నిర్మాణం యొక్క దృశ్యాలను చూడడానికి Jmol విండోకు మారుదాం.
|-
|04:09
|మీరు ఇంటర్నెట్ కు అనుసంధానించబడి ఉంటే, మీరు నేరుగా Jmol panel లో ప్రోటీన్ నిర్మాణాన్ని డౌన్లోడ్ చేసుకోవచ్చు.
|-
|04:15
|టెక్స్ట్ బాక్స్లో 4 అక్షరాల PDB కోడ్, 4EX1 ను టైప్ చేసి,OK బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
|-
|04:25
|మీరు ఇంటర్నెట్ కు కనెక్ట్ చేసిలేకపోతే, టూల్బార్లో Open a File ఐకాన్ పై క్లిక్ చేయండి.
|-
|04:34
|ప్యానెల్లో ఒక డైలాగ్-బాక్స్ తెరుస్తుంది.
|-
|04:38
|4EX1.pdb.gz ఫైలు యొక్క స్థానానికి అనగా Downloads ఫోల్డర్ కు నావిగేట్ చేయండి
|-
|04:47
| Downloads ఫోల్డర్ ను ఎంచుకుని, Open బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
|-
|04:52
|4EX1.pdb.gz ఫైల్ ను ఎంచుకొని, Open బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
|-
|05:00
|ఇన్సులిన్ యొక్క 3D నిర్మాణం తెరపై తెరుచుకుంటుంది.
|-
|05:05
|ప్యానెల్లోని ప్రోటీన్ యొక్క డిఫాల్ట్ ప్రదర్శన ball and stick.
|-
|05:12
| ప్యానెల్లో ప్రోటీన్ యొక్క నమూనా హైడ్రోజన్ పరమాణువులు లేకుండా చూపబడింది.
|-
|05:17
|హైడ్రోజన్ పరమాణువులతో మోడల్ ను చూపించడానికి, modelkit మెనూని తెరవండి.
|-
|05:23
|add hydrogens ఎంపిక వరకు స్క్రోల్ చేసి, దానిపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|05:28
|ప్యానెల్లో మోడల్ ఇప్పుడు హైడ్రోజన్ అణువులతో ప్రదర్శించబడుతుంది.
|-
|05:33
|protein నిర్మాణం కూడా నీటి అణువులతో చూపబడింది.
|-
|05:38
|నీటి అణువులను దాచడానికి, చూపిన విధంగా దశలను అనుసరించండి.
|-
|05:43
| మొదట, పాప్-అప్ మెనుని తెరిచి select ను ఎంచుకోండి.
|-
|05:48
|ఉప మెను నుండి, Hetero ను ఎంచుకుని, All Water ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|05:55
|మళ్ళీ పాప్-అప్ మెనుని తెరవండి.Style >> Scheme కు వెళ్ళి, CPK spacefill ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|06:05
| ఇది నీటి అణువులను అన్నింటిని CPK Spacefill గా మారుస్తుంది.
|-
|06:11
|పాప్-అప్ మెనుని మళ్ళి తెరచి, Style కు వెళ్ళి, Atoms వరకు స్క్రోల్ చేసి, Off ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|06:22
|ఇప్పుడు ప్యానెల్లోని, Insulin ఎటువంటి నీటి అణువుల నిర్మాణం లేకుండా ఉంటుంది.
|-
|06:27
|తరువాత, వివిధ ఫార్మాట్లలో protein యొక్క ద్వితీయ నిర్మాణం ప్రదర్శించడం నేర్చుకుందాం.
|-
|06:35
|పాప్-అప్ మెను ను తెరవండి.
|-
|06:37
|Select ఎంపికకి వెళ్ళండి.
|-
|06:39
|Protein వరకు స్క్రోల్ చేసి, All ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|06:44
|పాప్-అప్ మెనుని మళ్ళీ తెరచి, Style, తరువాత Scheme. కి స్క్రోల్ చేయండి, తరువాత Scheme
|-
|06:50
| CPK Spacefill, Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace వంటి ఎంపికలతో ఒక ఉప మెను తెరవబడుతుంది.
|-
|07:02
|ఉప మెను నుండి Cartoon ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|07:07
|ఇది ప్రోటీన్ యొక్క ద్వితీయ నిర్మాణం ను helices, random coils, strands, sheets etc. గా ప్రదర్శిస్తుంది.
|-
|07:17
|మరిన్ని ప్రదర్శన ఎంపికలు కోసం-
|-
|07:19
|పాప్-అప్ మెనుని తెరిచి, Style, తరువాత Structures కు స్క్రోల్ చేయండి.
|-
|07:25
|ఇక్కడ, ప్రోటీన్ యొక్క ద్వితీయ నిర్మాణాన్ని ప్రదర్శించడానికి మరిన్ని ఎంపికలు ఉన్నాయి.
|-
|07:31
|ఉదాహరణకు, Strands ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|07:35
|ప్రోటీన్ ఇప్పుడు ప్యానెల్ పై Strands గా ప్రదర్శించబడుతుంది.
|-
|07:40
| ప్రదర్శన రంగు మార్చడానికి: పాప్-అప్-మెనుని తెరవండి.Color వద్దకు స్క్రోల్ చేయండి.Atoms ఎంచుకొని, Blue ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|07:52
|ప్యానెల్లో రంగులో మార్పును గమనించండి.
|-
|07:56
|నిర్మాణం మార్చడానికి, Ball-and-stick ప్రదర్శన కు వెళ్ళండి.
|-
|07:59
| పాప్-అప్ మెనుని తెరిచి, Style, తరువాత Scheme ఆపై Ball and stick ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|08:08
| protein model లో hydrogen bonds మరియు di-sulpfide bonds హైలైట్ చేయవచ్చు.
|-
|08:14
|Hydrogen Bonds ప్రదర్శించడానికి:పాప్-అప్ మెనుని తెరిచి, Style వెళ్ళి తరువాత Hydrogen Bondsఎంపికకు స్క్రోల్ చేయండి.
|-
|08:25
|పాప్-అప్ మెనులోని Hydrogen Bonds ఎంపిక ఈ క్రింది లక్షణాలను కలిగి ఉన్నది
|-
|08:30
|Calculate, Set Hydrogen Bonds Side Chain,
|-
|08:35
|Set Hydrogen Bonds in the Backbone మరియు మందమును మార్చుటకు ఎంపికలను కూడా కలిగి ఉన్నది.
|-
|08:42
|మోడల్ లో hydrogen bonds ను చూపించడానికి Calculate ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|08:47
|hydrogen bonds తెలుపు మరియు ఎరుపు రంగులో పొడవైన డాష్లుగా ప్రదర్శించబడతాయి.
|-
|08:53
|hydrogen bonds యొక్క మందాన్ని మార్చడానికి, pop-up-menu నుండి 0.10 A ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|09:02
| ఇప్పుడు, ప్యానెల్లో, మనం మందమైన hydrogen bonds ను చూడవచ్చు.
|-
|09:06
| మనము హైడ్రోజన్ బంధాల రంగును కూడా మార్చవచ్చు.
|-
|09:11
| పాప్-అప్ మెను నుండి, Color తరువాత, Hydrogen Bonds కు స్క్రోల్ చేయండి, ఆపై orange ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|09:20
|ప్యానెల్లో, మనకు నారింజ రంగులో అన్ని hydrogen bonds ఉన్నాయి.
|-
|09:25
| పసుపురంగు రంగులో Disulfide bonds మరియు sulphur అణువులను నమూనాలో చూపించాం.
|-
|09:31
|డైషల్ఫైడ్ బంధాలను సవరించడానికి, పాప్-అప్ మెన్యులో ఎంపిక disulfide bonds ను తెరవండి.
|-
|09:38
| size, color మొదలైనవాటిలో మీరు మార్చదలచిన లక్షణాలపై క్లిక్ చేయండి.
|-
|09:44
| అదే విధంగా, విభిన్నenzymes యొక్క .pdb ఫైళ్ళను తెరిచి, వాటి 3D నిర్మాణాలను వీక్షించండి.
|-
|09:51
|ఈ ట్యుటోరియల్ ను సంగ్రహించుదాం. ఈ ట్యుటోరియల్ లో మనము నేర్చుకున్నాము:
|-
|09:57
| ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) నుండి ప్రోటీన్ నిర్మాణాల లోడ్.
|-
|10:00
|డేటాబేస్ నుండి .pdb ఫైల్స్ డౌన్లోడ్.
|-
|10:05
|PDB కోడ్ (4EX1) ను ఉపయోగించి ఇన్సులిన్ యొక్క 3D structure ను వీక్షించండం.
|-
|10:10
|నీటి అణువులు లేకుండా, Protein నిర్మాణం చూడడం.
|-
|10:14
| ద్వితీయ నిర్మాణమును వివిధ రూపాలలో ప్రదర్శించడం
|-
|10:17
| hydrogen bonds మరియు disulfide bonds లను హైలైట్ చేయడం నేర్చుకున్నాము.
|-
|10:22
|మీ కోసం ఒక అసైన్మెంట్
|-
|10:24
|PDB డేటాబేస్ నుండి Human Hemoglobin యొక్క .pdb ఫైల్ ను డౌన్లోడ్ చెయ్యండి.
|-
|10:31
| cartoon ప్రదర్శనలో ద్వితీయ నిర్మాణం చూపించండి.
|-
|10:35
|ప్రోటీన్ యొక్క పోర్ఫిరిన్ యూనిట్లను హైలైట్ చేయండి.
|-
|10:39
|PDB code కోసం ఈ క్రింది లింక్ను చూడండి.
|-
|10:42
| ఈ URL లో అందుబాటులో ఉన్న వీడియోను చూడండి.http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial
|-
|10:46
|ఈ వీడియో స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ సారాంశాన్ని ఇస్తుంది.
|-
|10:50
|మీకు మంచి బ్యాండ్విడ్త్ లేకపోతే, మీరు దీన్ని డౌన్లోడ్ చేసి చూడవచ్చు.
|-
|10:55
|స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ టీమ్:
|-
|10:57
|స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్స్ ఉపయోగించి వర్క్ షాప్స్ నిర్వహిస్తుంది.
|-
|11:01
| ఆన్ లైన్ పరీక్షలో ఉత్తీర్ణులైనవారికి సర్టిఫికేట్లను ఇస్తుంది.
|-
|11:06
| దయచేసి మమ్మల్ని సంప్రదించండి. contact@spoken-tutorial.org
|-
|11:13
|స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్' ప్రాజెక్ట్ టాక్ టు ఎ టీచర్ ప్రాజెక్ట్ లో ఒక భాగం.
|-
|11:18
|స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ కు భారతదేశం ప్రభుత్వం యొక్క NMEICT-MHRD నిధులు సమకూరుస్తుంది.
|-
|11:25
|ఈ మిషన్ పై మరింత సమాచారం ఈ లింక్ వద్ద అందుబాటులో ఉంది.http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro.
|-
|11:31
|దీనిని అందించినది స్నేహలత. అనువదించినది స్వామి ధన్యవాదములు.
|}

@@ Line 84: / Line 84: @@
 |-
 |02:13
-|Search box లో,  ప్రోటీన్ యొక్క పేరు గా human insulin ను టైప్ చేసి, ఎంటర్ నొక్కండి.
+|Search box లో,  ప్రోటీన్ యొక్క పేరు గా human insulin ను టైప్ చేసి, కీ బోర్డు పైన ఎంటర్ కీ ని నొక్కండి.
 |-
 |02:24
@@ Line 111: / Line 111: @@
 |-
 |02:58
-|Structure Validation లు ఈ వెబ్ సైట్ లో అందుబాటులో ఉన్నాయి.
+|Structure Validationల వంటివి ఈ పేజీ లో అందుబాటులో ఉన్నాయి.
 |-
 |03:02
@@ Line 255: / Line 255: @@
 |-
 |08:08
-| protein model లో hydrogen bonds  మరియు di-sulpfide bonds  హైలైట్ చేయవచ్చు.
+|Protein model లో hydrogen bonds  మరియు di-sulpfide bonds  హైలైట్ చేయవచ్చు.
 |-
 |08:14
@@ Line 261: / Line 261: @@
 |-
 |08:25
-|పాప్-అప్ మెనులో Hydrogen Bonds  ఎంపిక ఈ క్రింది లక్షణాలను కలిగి ఉన్నది.
+|పాప్-అప్ మెనులో Hydrogen Bonds ఎంపిక ఈ క్రింది లక్షణాలను కలిగి ఉన్నది.
 |-
 |08:30
@@ Line 300: / Line 300: @@
 |-
 |09:44
-| అదే విధంగా, విభిన్నenzymes యొక్క .pdb  ఫైళ్ళను తెరిచి, వాటి 3D నిర్మాణాలను వీక్షించండి.
+| అదే విధంగా, విభిన్న enzymes యొక్క .pdb  ఫైళ్ళను తెరిచి, వాటి 3D నిర్మాణాలను వీక్షించండి.
 |-
 |09:51
@@ Line 312: / Line 312: @@
 |-
 |10:05
-|PDB కోడ్ (4EX1) ను ఉపయోగించి ఇన్సులిన్ యొక్క 3D structure ను వీక్షించండం.
+|PDB కోడ్ 4EX1 ను ఉపయోగించి ఇన్సులిన్ యొక్క 3D structure ను వీక్షించండం.
 |-
 |10:10
@@ Line 318: / Line 318: @@
 |-
 |10:14
-| ద్వితీయ నిర్మాణమును వివిధ రూపాలలో ప్రదర్శించడం
+|ద్వితీయ నిర్మాణమును వివిధ రూపాలలో ప్రదర్శించడం
 |-
 |10:17

Jmol-Application/C4/Proteins-and-Macromolecules/Telugu - Revision history

Madhurig at 10:02, 7 August 2018

Madhurig at 08:07, 7 August 2018

Madhurig at 08:08, 30 July 2018

Simhadriudaya: Created page with " {| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- |00:01 |Proteins and Macromolecules. పై ఈ ట్యుటోరియల్ కు స్వాగతం. |- |00:06 |ఈ..."