Jmol-Application/C4/Proteins-and-Macromolecules/Marathi - Revision history

PoojaMoolya at 07:41, 19 April 2017

2017-04-19T07:41:37Z

Ranjana at 06:41, 20 March 2015

2015-03-20T06:41:31Z

Ranjana at 06:39, 20 March 2015

2015-03-20T06:39:22Z

Show changes

Ranjana: Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 | '''Proteins and Macromolecules''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्वा..."

2015-03-20T06:29:13Z

Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 | '''Proteins and Macromolecules''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्वा..."

New page

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''

|-
| 00:01
| '''Proteins and Macromolecules''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्वागत.

|-
| 00:06
| ह्या ट्युटोरियलमध्ये आपण शिकणार आहोत,

|-
|00:09
|* '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.

|-
|00:13
|* '''PDB''' डेटाबेसमधून '''.pdb''' filesडाऊनलोड करणे.

|-
|00:18
|* प्रोटीन्सचे सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.

|-
|00:24
|* 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.

|-
| 00:29
| हा पाठ समजण्यासाठी तुम्हाला, '''Jmol''' अप्लिकेशन विंडोमधील मूलभूत ऑपरेशन्सची माहिती असावी.

|-
|00:37
| नसल्यास, संबधित पाठांसाठी आपल्या वेबसाईटला भेट द्या.

|-
| 00:42
| हे ट्युटोरियल रेकॉर्ड करण्यासाठी, मी वापरत आहे

|-
| 00:46
|* 'उबंटू' OS वर्जन 12.04

|-
|00:50
|* 'Jmol' वर्जन 12.2.2

|-
|00:54
|* '''Java''' वर्जन 7

|-
|00:57
|* '''Mozilla Firefox''' ब्राउजर 22.0

|-
| 01:02
| लार्ज 'बायोमॉलिक्यूल्स'चा स्ट्रक्चर अनॅलिसिस जसे

|-
|01:06
|* 'प्रोटिन्स' आणि 'मॅक्रोमॉलिक्यूल्स'

|-
|01:10
|* न्यूक्लिक एसिड्स '''DNA''' आणि '''RNA'''

|-
|01:13
|* 'क्रिस्टल स्ट्रक्चर्स आणि पॉलिमर्स' '''Jmol''' अप्लिकेशन वापरून केले जाऊ शकते.

|-
| 01:19
| येथे मी एक नवीन '''Jmol''' विंडो उघडली आहे.

|-
| 01:24
| '''biomolecules''' चे 3D स्ट्रक्चर्स डेटाबेसमधून थेट डाऊनलोड करून पाहिले जाऊ शकतात.

|-
| 01:29
| हे करण्यासाठी , '''File''' मेनूवर क्लिक करा , ''' Get PDB''' पर्यंत खाली स्क्रोल करा .

|-
| 01:36
| स्क्रीनवर एक इनपुट डायलॉग बॉक्स दिसतो.

|-
| 01:40
| आपल्याला इनपूट बॉक्समध्ये विशिष्ट प्रोटीनसाठी '''PDB''' कोडचे चार अक्षर टाईप करणे आवश्यक आहे.

|-
| 01:48
| हा कोड प्रोटीन डेटा बॅंक(PDB) वेबसाईटवरून मिळू शकतो.

|-
| 01:53
| प्रोटीन डेटा बॅंकचे हे वेब पेज आहे.

|-
| 01:57
| यावर बायोमॉलिक्यूल्स जसे प्रोटीन्स आणि न्यूक्लिक एसिडसबद्दलची माहिती आहे.

|-
| 02:04
| उदाहरण म्हणून : आपण ''PDB''' वेबसाईटमधून '''Pancreatic Enzyme Insulin ''' साठी '''PDB''' कोड शोधण्याचा प्रयत्न करू.

|-
|02:13
| सर्च बॉक्समध्ये '''Human''' '''Insulin''' म्हणून प्रोटीनचे नाव टाईप करा. कीबोर्डवरील एंटर की दाबा .

|-
| 02:24
| आता, वेब-पेज वर हे प्रदर्शित झाले आहे, खाली स्क्रोल करा.

|-
| 02:28
| स्क्रीनवर '''PDB''' कोड्ससोबत '''Human Insulin''' ची माहिती असलेल्या संरचनांची यादी दिसते.

|-
| 02:36
| उदाहरण म्हणून, ''' Human Insulin''' सह कोड '''4EX1''' निवडा .

|-
| 02:44
| प्रोटीनच्या नावावर क्लिक करा .

|-
| 02:47
| संरचनेच्या सर्व माहितीसह विंडो उघडते.

|-
| 02:52
| माहिती जशी

|-
| 02:54
|* '''Primary Citation'''

|-
| 02:56
|* '''Molecular Description ''' आणि

|-
|02:58
|* '''Structure Validation''' ह्या पेजवर उपलब्ध आहेत.

|-
| 03:02
| '''Jmol''' मध्ये प्रोटीन्सच्या संरचनांना आपण '''.pdb ''' म्हणून सेव्ह करू शकतो आणि त्यांना 3D मोडमध्ये पाहू शकतो.

|-
| 03:12
| पेजच्या वरच्या उजव्या कोपर्‍यात '''Download Files''' लिंकवर क्लिक करा .

|-
| 03:20
| ड्रॉप डाऊन मेनूमधून, '''PDB file (gz) ''' पर्याय निवडा.

|-
| 03:28
| स्क्रीनवर एक डायलॉग बॉक्स उघडतो.

|-
| 03:32
| '''Save file''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
|03:35
| '''OK''' बटणावर क्लिक करा.

|-
| 03:39
| डाऊनलोड्स फोल्डरमध्ये प्रोटीन्सची संरचना '''4EX1.pdb.gz''' म्हणून सेव्ह केली जाईल .

|-
| 03:51
| त्याचप्रमाणे आपण आपल्याला हव्या असलेल्या विविध प्रोटीन्सच्या फाईल्स डाऊनलोड करून त्या स्वतंत्र फाईली म्हणून सेव्ह करू शकता.

|-
| 04:02
| आता, Insulin ची 3D संरचना पाहण्यासाठी Jmol विंडोवर जाऊ.

|-
|04:09
| आपण इंटरनेटशी जुडला असाल तर, पॅनलवर प्रोटीन संरचना थेट डाऊनलोड करू शकता.

|-
| 04:15
| चार अक्षरी '''PDB कोड '''“4EX1”''' टेक्स्टबॉक्समध्ये टाईप करून '''OK''' बटणावर क्लिक करा.

|-
| 04:25
| जर तुम्ही इंटरनेटशी जुडला नसाल तर , नंतर टूलबारवरील '''Open a File''' आयकॉनवर क्लिक करा.

|-
| 04:34
| पॅनलवर एक डायलॉग बॉक्स उघडते.

|-
| 04:38
| '''4EX1.pdb.gz''' फाईलच्या स्थानावर जा जो '''Downloads ''' फोल्डर आहे.

|-
| 04:47
| '''Downloads''' फोल्डर निवडून '''open''' बटणावर क्लिक करा.

|-
| 04:52
| '''4EX1.pdb.gz''' फाईल निवडून '''open''' बटणावर क्लिक करा.

|-
| 05:00
| स्क्रीनवर Insulin ची 3D संरचना उघडते .

|-
| 05:05
| पॅनलवर प्रोटीनची डिफॉल्ट डिसप्ले, '''बॉल''' आणि '''स्टिक''' आहे.

|-
| 05:12
| पॅनेलवर प्रोटीनचे मॉडेल हायड्रोजन अणूंशिवाय दर्शविले जाते.

|-
| 05:17
| हायड्रोजन अणूसह मॉडेल दर्शविण्यासाठी, '''modelkit''' मेनू उघडा.

|-
| 05:23
| '''add hydrogens''' पर्यायपर्यंत खाली स्क्रोल करून त्यावर क्लिक करा.

|-
| 05:28
| आता पॅनलवर मॉडेल हायड्रॉजन अणूसह प्रदर्शित झाला आहे.

|-
| 05:33
| 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर जल रेणूंसाहित देखील दाखवले गेले आहे.

|-
| 05:38
| जल रेणू लपविण्यासाठी, दर्शविलेल्या स्टेप्सचे अनुसरण करा.

|-
| 05:43
| प्रथम पॉप-अप मेनू उघडा आणि '''Select''' वर जा.

|-
| 05:48
| सब-मेनूमधून , '''Hetero''' निवडा आणि '''“All Water''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 05:55
| पुन्हा पॉप-आप मेनू उघडा, '''Style''', '''Scheme ''' वर जा आणि '''CPK spacefill''' वर क्लिक करा.

|-
| 06:05
| हे सर्व जल रेणू '''CPK Spacefill''' डिसप्लेमध्ये बदलून टाकेल.

|-
| 06:11
| पुन्हा पॉप-आप मेनू उघडा आणि '''Style''' वर जा खाली स्क्रोल करून '''Atoms ''' वर जा आणि '''Off''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 06:22
| आता आपल्याकडे पॅनलवर जल रेणूंशिवाय 'इन्सुलिन' स्ट्रक्चर आहे.

|-
| 06:27
| पुढे , आपण 'प्रोटीन'चे सेकेंडरी स्ट्रक्चर विविध स्वरुपात प्रदर्शित करणे शिकू.

|-
| 06:35
| पॉप-अप मेनू उघडा.

|-
| 06:37
| '''Select ''' पर्यायवर जा.

|-
| 06:39
| खाली '''Protein''' पर्यंत स्क्रोल करून '''All ''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 06:44
| पॉप-अप मेनू पुन्हा उघडा आणि खाली '''Style''' पर्यंत स्क्रोल करून नंतर ''' Scheme ''' वर जा.

|-
| 06:50
| '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace इत्यादी सारख्या पर्यायांसोबत एक सब-मेनू उघडते.

|-
|07:02
| सब-मेनूमधून ''' Cartoon ''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
|07:07
| हा डिसप्ले प्रोटीन्सचे सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स जसे '''helices, random coils, strands, sheets इत्यादी दर्शवतो.

|-
| 07:17
| अधिक डिसप्ले पर्यायांसाठी,

|-
| 07:19
| पॉप-अप मेनू उघडून खाली '''Style''' पर्यंत स्क्रोल करून नंतर ''' Structures''' वर जा.

|-
| 07:25
| येथे आपण 'प्रोटीनचे सेकेंडरी स्ट्रक्चर प्रदर्शित करण्याचे अनेक पर्याय पाहू.

|-
| 07:31
| उदाहरणार्थ, '''Strands''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 07:35
| पॅनलवर प्रोटीन्स '''Strands''' म्हणून प्रदर्शित आहे.

|-
| 07:40
| डिस्पलेचा रंग बदलण्यासाठी, पॉप-अप-मेनू उघडा. '''Color''' पर्यंत खाली स्क्रोल करून '''Atoms''' निवडून '''Blue''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 07:52
| पॅनलवरील रंगात बदल पहा.

|-
| 07:56
| स्ट्रक्चर पुन्हा '''Ball-and-stick''' मध्ये बदलण्यासाठी,

|-
| 07:59
| पॉप-अप मेनू उघडा, '''Style''' निवडा, नंतर '''Scheme''' आणि '''Ball and stick ''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 08:08
| आपण प्रोटीन मॉडेलमध्ये '''hydrogen bonds''' आणि di-sulpfide bonds''' देखील हाईलाइट करू शकतो.

|-
| 08:14
| 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' दर्शविण्यासाठी: पॉप-अप मेनू उघडून '''Style''' पर्यंत खाली स्क्रोल करून नंतर '''Hydrogen Bonds''' निवडा.

|-
|08:25
| पोप-अप मेनूमधील 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' पर्यायला काही वैशिष्ट्ये आहेत जसे की:

|-
|08:30
|'''Calculate''', '''Set Hydrogen Bonds Side Chain.'''

|-
|08:35
|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''
आणि बॉन्ड्सची जाडी बदलण्यास देखील पर्याय आहेत.

|-
| 08:42
| मॉडेलमधील 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' ''' दाखविण्यास '''Calculate''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 08:47
| '''hydrogen bonds''' पांढरे आणि लाल लांब डॅशस म्हणून दाखविले जाते.

|-
| 08:53
| ''''हायड्रोजन बॉन्ड्स'''' ची जाडी बदलण्यास, 'पॉप-अप' मेनूमधील '''0.10 A''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 09:02
| पॅनलवर आपण '''हायड्रोजन बॉन्ड्सची जाडी पाहू शकतो.

|-
|09:06
| आपण 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' चे रंगदेखील बदलू शकतो.

|-
| 09:11
| पॉप-अप-मेनूमधून '''Color''' पर्यंत खाली स्क्रोल करून नंतर '''हायड्रोजन बॉन्ड्स''' आणि नंतर '''orange''' पर्यायवर क्लिक करा.

|-
| 09:20
| पॅनलवर, सर्व '''हायड्रोजन बॉन्ड्स''' नारंगी रंगात दिसत आहेत.

|-
| 09:25
| मॉडेलमध्ये ''''डायसल्फाईड बॉन्ड्स आणि '''सल्फर''' अणू पिवळ्या रंगात दर्शविले आहेत.

|-
|09:31
| डायसल्फाईड बॉन्ड्स रुपांतरित करण्यास, पॉप-अप मेनूमधील 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' पर्याय उघडा.

|-
| 09:38
| आकार आणि रंग इत्यादी आपल्याला बदलायचे असल्यास त्या वैशिष्ट्यांवर क्लिक करा.

|-
| 09:44
| त्याचप्रमाणे विविध '''enzymes ''' च्या '''.pdb''' फाईल्स उघडण्याचा प्रयत्न करा आणि त्याचे 3D स्ट्रक्चर्स पहा.

|-
|09:51
| थोडक्यात, या ट्युटोरियलमध्ये आपण शिकलो:

|-
|09:57
|* '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.

|-
|10:00
|* डेटाबेसमधून '''.pdb''' फाईल्स डाऊनलोड करणे.

|-
|10:05
|* '''PDB कोड''' वापरून इन्सुलिनचे 3D स्ट्रक्चर पाहणे.

|-
|10:10
|* जल रेणूंशिवाय 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर पाहणे.

|-
|10:14
|* सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.

|-
|10:17
|* 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.

|-
|10:22
| तुमच्यासाठी असाइनमेंट.

|-
|10:24
|* '''PDB ''' डेटाबेसमधून '''Human Hemoglobin''' चे '''.pdb''' फाईल डाऊनलोड करा.

|-
|10:31
|* '''cartoon''' डिस्प्लेमध्ये सेकेंडरी स्ट्रक्चर दाखवा.

|-
|10:35
|* ''''प्रोटीन'''' चे 'Porphyrin' यूनिट्स हायलाईट करा.

|-
|10:39
|* '''PDB code''' साठी खालील लिंक पहा.

|-
| 10:42
| स्क्रीनवर दिसत असलेल्या लिंकवर उपलब्ध असलेला व्हिडिओ बघा.

|-
|10:46
| ज्यामध्ये तुम्हाला प्रॉजेक्टचा सारांश मिळेल.

|-
|10:50
| जर तुमच्याकडे चांगली Bandwidth नसेल तर आपण व्हिडिओ download करूनही पाहू शकता.

|-
| 10:55
| स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्ट टीम,

|-
|10:57
|Spoken Tutorial च्या सहाय्याने कार्यशाळा चालविते.

|-
|11:01
| परीक्षा उत्तीर्ण होणा-या विद्यार्थ्यांना प्रमाणपत्रही दिले जाते.

|-
|11:06
| अधिक माहितीसाठी कृपया contact [at] spoken hyphen tutorial dot org वर लिहा.

|-
| 11:13
| "स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्ट" हे "टॉक टू टीचर" या प्रॉजेक्टचा भाग आहे.

|-
|11:18
| यासाठी अर्थसहाय्य National Mission on Education through ICT, MHRD, Government of India यांच्याकडून मिळालेले आहे.

|-
|11:25
| यासंबंधी माहिती पुढील साईटवर उपलब्ध आहे.

|-
|11:31
| मी रंजना भांबळे आपला निरोप घेते. धन्यवाद.
|}

@@ Line 13: / Line 13: @@
 |-
 |00:09
-|* '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.
+| '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.
 |-
 |00:13
-|*  '''PDB''' डेटाबेसमधून '''.pdb''' files डाऊनलोड करणे.
+|  '''PDB''' डेटाबेसमधून '''.pdb''' files डाऊनलोड करणे.
 |-
 |00:18
-|* प्रोटीन्सचे सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.
+| प्रोटीन्सचे सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.
 |-
 |00:24
-|* 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.
+| 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.
 |-
@@ Line 41: / Line 41: @@
 |-
 | 00:46
-|* 'उबंटू' OS वर्जन 12.04
+| 'उबंटू' OS वर्जन 12.04
 |-
 |00:50
-|* 'Jmol' वर्जन 12.2.2
+| 'Jmol' वर्जन 12.2.2
 |-
 |00:54
-|* '''Java''' वर्जन 7
+| '''Java''' वर्जन 7
 |-
 |00:57
-|* '''Mozilla Firefox''' ब्राउजर 22.0
+| '''Mozilla Firefox''' ब्राउजर 22.0
 |-
@@ Line 61: / Line 61: @@
 |-
 |01:06
-|* 'प्रोटिन्स' आणि 'मॅक्रोमॉलिक्यूल्स'
+| 'प्रोटिन्स' आणि 'मॅक्रोमॉलिक्यूल्स'
 |-
 |01:10
-|* न्यूक्लिक एसिड्स '''DNA''' आणि '''RNA'''
+| न्यूक्लिक एसिड्स '''DNA''' आणि '''RNA'''
 |-
 |01:13
-|* 'क्रिस्टल स्ट्रक्चर्स आणि पॉलिमर्स' '''Jmol''' अप्लिकेशन वापरून केले जाऊ शकते.
+| 'क्रिस्टल स्ट्रक्चर्स आणि पॉलिमर्स' '''Jmol''' अप्लिकेशन वापरून केले जाऊ शकते.
 |-
@@ Line 137: / Line 137: @@
 |-
 | 02:54
-|* '''Primary Citation'''
+| '''Primary Citation'''
 |-
 | 02:56
-|* '''Molecular Description ''' आणि
+| '''Molecular Description ''' आणि
 |-
 |02:58
-|*  '''Structure Validation''' ह्या पेजवर उपलब्ध आहेत.
+|  '''Structure Validation''' ह्या पेजवर उपलब्ध आहेत.
 |-
@@ Line 353: / Line 353: @@
 |-
 |08:35
-|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''
+|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''आणि बॉन्ड्सची जाडी बदलण्यास देखील पर्याय आहेत.
 आणि बॉन्ड्सची जाडी बदलण्यास देखील पर्याय आहेत.
 |-
@@ Line 406: / Line 405: @@
 |-
 |09:57
-|* '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.
+| '''Protein Data Bank (PDB)''' मधून प्रोटीन्सचे स्ट्रक्चर्स लोड करणे.
 |-
 |10:00
-|* डेटाबेसमधून '''.pdb''' फाईल्स डाऊनलोड करणे.
+| डेटाबेसमधून '''.pdb''' फाईल्स डाऊनलोड करणे.
 |-
 |10:05
-|* '''PDB''' कोड वापरून इन्सुलिनचे 3D स्ट्रक्चर पाहणे.
+| '''PDB''' कोड वापरून इन्सुलिनचे 3D स्ट्रक्चर पाहणे.
 |-
 |10:10
-|* जल रेणूंशिवाय 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर पाहणे.
+| जल रेणूंशिवाय 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर पाहणे.
 |-
 |10:14
-|* सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.
+| सेकेंडरी स्ट्रक्चर्स विविध स्वरुपात दाखवणे.
 |-
 |10:17
-|* 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.
+| 'हायड्रोजन बॉन्ड्स' आणि 'डायसल्फाईड बॉन्ड्स' हायलाईट करणे.
 |-
@@ Line 434: / Line 433: @@
 |-
 |10:24
-|* '''PDB''' डेटाबेसमधून  '''Human Hemoglobin''' चे '''.pdb''' फाईल डाऊनलोड करा.
+| '''PDB''' डेटाबेसमधून  '''Human Hemoglobin''' चे '''.pdb''' फाईल डाऊनलोड करा.
 |-
 |10:31
-|* '''cartoon''' डिस्प्लेमध्ये सेकेंडरी स्ट्रक्चर दाखवा.
+| '''cartoon''' डिस्प्लेमध्ये सेकेंडरी स्ट्रक्चर दाखवा.
 |-
 |10:35
-|* '''प्रोटीन''' चे 'Porphyrin' यूनिट्स हायलाईट करा.
+| '''प्रोटीन''' चे 'Porphyrin' यूनिट्स हायलाईट करा.
 |-
 |10:39
-|* '''PDB code''' साठी खालील लिंक पहा.
+| '''PDB code''' साठी खालील लिंक पहा.
 |-

@@ Line 372: / Line 372: @@
 | पॅनलवर आपण '''हायड्रोजन बॉन्ड्सची जाडी पाहू शकतो.
 |-
 |09:06