PoojaMoolya at 09:05, 19 April 2017

2017-04-19T09:05:35Z

Ranjana at 09:37, 21 April 2016

2016-04-21T09:37:18Z

Ranjana: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- ||00:01 || '''3D Models of Enzymes in Jmol''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्..."

2016-04-21T09:32:29Z

Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- ||00:01 || '''3D Models of Enzymes in Jmol''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्..."

New page

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
||00:01
|| '''3D Models of Enzymes in Jmol''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्वागत.

|-
||00:08
|| ह्या ट्यूटोरियलमध्ये आपण शिकणार आहोत '''Jmol''' पॅनेल वर '''Human Pancreatic Hexokinase''' चे स्ट्रक्चर लोड करणे.

|-
||00:16
||* दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे.

|-
||00:20
||* सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.

|-
||00:25
||* एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.

|-
||00:30
||* आणि प्रोटीन साठी 'रामचंद्रन प्लॉट' पहाणे.

|-
||00:35
|| ह्या ट्युटोरियलचे अनुसरण करण्यास तुम्हाला मूलभूत जीवरसायनशास्त्रचे

|-
||00:41
|| आणि '''Jmol''' अप्लिकेशन विंडोचे मूलभूत ऑपरेशन्स ह्याचे प्राथमिक ज्ञान असले पाहिजे.

|-
||00:46
|| कृपया ''' Jmol''' अप्लिकेशन सिरीस मधील '''Proteins and Macromolecules''' चे ट्यूटोरियल पहा.

|-
||00:53
|| हे खालील लिंकवर उपलब्ध आहे.

|-
||00:57
|| हे ट्यूटोरियल रेकॉर्ड करण्यासाठी मी वापरत आहे 'उबंटू' ऑपरेटिंग सिस्टम वर्जन 12.04.

|-
||01:05
||* '''Jmol''' वर्जन 12.2.2.

|-
||01:08
||* '''Java''' वर्जन 7 आणि '''Mozilla Firefox browser''' 22.0

|-
||01:16
|| '''Jmol''' विंडो उघडून '''hexokinase''' एनजाईमचे स्ट्रक्चर लोड करा.

|-
||01:22
|| मी इंटरनेटशी जूडलेली आहे, त्यामुळे मी थेट '''PDB''' वेबसाइट मधून स्ट्रक्चर लोड करणार आहे.

|-
||01:28
|| हे करण्यासाठी, '''File''' मेनू उघडा, खाली स्क्रोल करून '''Get PDB''' पर्याय वर क्‍लिक करा.

|-
||01:37
|| स्क्रीन वर '''Input''' डायलॉग बॉक्स दिसेल. टेक्स्ट बॉक्समध्ये '''hexokinase''' साठी चार अक्षर टाईप करा जे '''3IDH''' आहे.

|-
||01:50
|| हा कोड 'प्रोटीन डेटा बॅंक' वेबसाइट मधून प्राप्त केलेला आहे.

|-
||01:55
|| जर तुमच्याकडे कार्यरत इंटरनेट जोडणी नसेल तर: टूल बार वरील '''Open a file''' आइकन वापरुन अस्तित्वतिल '''pdb''' फाईल उघडा.

|-
||02:06
|| '''OK''' बटणावर क्लिक करा.

|-
||02:09
|| स्क्रीन वर उघडलेल्या '''hexokinase''' च्या 3D स्ट्रक्चरला देखील '''glucokinase''' म्हटले जाते.

|-
||02:16
|| '''File''' मेनू वापरुन कॉन्सोल विंडो उघडा.

|-
||02:21
|| कॉन्सोल वर दाखवल्याप्रमाणे, पॅनेल वर स्ट्रक्चर '''Human Pancreatic Glucokinase''' साठी substrate '''Glucose''' आहे.

|-
||02:31
|| कॉन्सोल बंद करा.

|-
||02:34
|| पॅनेल वर, आपल्याकडे '''hexokinase''' चे '''बॉल आणि स्टिक''' मॉडल आहे.

|-
||02:40
|| पॅनेल वर प्रोटीन मॉडेल मधून '''water molecules''' ला काढून टाका.

|-
||02:44
|| ही प्रक्रिया '''Jmol''' ट्युटोरियलच्या '''Proteins and macromolecules''' मध्ये तपशीलमध्ये स्पष्ट केली आहे.

|-
||02:53
|| '''hexokinase''' एनजाईम बद्दल-

|-
||02:56
|| '''Hexokinase''' 465 अमीनो एसिड्सचा मॉनोमेरिक प्रोटीन आहे.

|-
||03:02
|| ह्याला दोन 'डोमेन्स', एक मोठा डोमेन आणि एक लहान डोमेन असतो.

|-
||03:07
|| ह्या एनजाईमसाठी 'सक्रिय-साइट' दोन डोमेन्सच्या मध्ये क्लेफ्ट म्हणजे दुभंगलेले मध्ये स्थित आहे.

|-
||03:14
|| '''hexokinase''' साठी 'सक्रिय-साइट' 3 अमीनो एसिड रेसीड्यूस ठेवतो: 204 वर '''Aspergine''', पोज़िशन 231 वर '''Aspergine''' आणि 256 वर '''Glutamic acid'''.

|-
||03:30
|| '''Alpha-D-Glucose''' ह्या एनजाईम साठी सबस्ट्रेट आहे.

|-
||03:34
|| आता, '''Jmol''' पॅनेल वर परत जाऊ.

|-
||03:38
|| आपण सक्रिय-साइट वर एनजाईम्सच्या घटकानसारखे जसे : सबस्ट्रेट, कॉफाकटर्स किंवा अमीनो एसिड रेसिड्यूसला हाइलाइट आणि निवडू शकता.

|-
|| 03:49
|| एक विशेष घटक निवडण्यासाठी - राइट क्‍लिक वापरुन पोप-अप मेनू उघडा.

|-
||03:55
|| '''Select''' पर्याय वर खाली स्क्रोल करा.

|-
||03:57
|| सब-मेनू मधून, '''Proteins''', '''By Residue name''' निवडा.

|-
||04:04
|| येथे आपल्याकडे वेग-वेगळे अमीनो एसिड रेसिड्यूस सूचीबद्ध आहेत.

|-
||04:10
|| ह्याला निवडण्यासाठी अमीनो एसिडच्या नवावर क्‍लिक करा.

|-
||04:14
|| तसेच अमीनो एसिड्स शीर्षकांच्या जसे '''Polar''', '''Non-polar''', '''Basic''', '''Acidic''', '''Uncharged''' इत्यादी अंतर्गत गटामध्ये समाविष्ट केले जातात.

|-
||04:26
|| मेटल आयन '''potassium''' आणि '''substrate glucose Hetero''' मेनू मध्ये सूचीबद्ध आहेत.

|-
||04:34
|| आपण सबस्ट्रेट बाइंडिंग साइटला सहजपणे शोधण्यास एन्ज़ाइमचा डिसप्ले बदलू शकतो.

|-
||04:41
|| आपण प्रोटीनच्या अणूंचे रंग आणि डिसप्ले बदलूया.

|-
||04:46
|| पॉप-उप मेनू उघडा, '''Select''' वर जा आणि '''Protein''' पर्याय पर्यन्त खाली जा. '''All''' वर क्‍लिक करा.

|-
||04:55
|| पुन्हा पॉप-उप मेनू उघडा, '''Style''' पर्यन्त जा, नंतर '''Scheme''' पर्यन्त जा. आणि '''Sticks''' पर्याय वर क्‍लिक करा.

|-
||05:05
|| आता आपल्या जवळ, पॅनेल वर प्रोटीन '''sticks''' डिसप्ले मध्ये आहे.

|-
||05:11
|| आता रंग बदलण्यासाठी, पुन्हा पॉप-उप मेनू उघडा, '''Color''', '''Atoms''' वर जा, आणि '''Blue''' पर्याय वर क्‍लिक करा.

|-
||05:23
|| आपल्या जवळ स्क्रीन वर '''hexokinase''' चा मॉडल निळ्या रंगात आणि स्टिक्स डिसप्ले मध्ये आहे.

|-
||05:30
|| सबस्ट्रेटला बघा, क्लेफ्ट मध्ये '''Alfa-D-Glucose''' बॉल आणि स्टिक डिसप्ले मध्ये आहे.

|-
||05:38
|| सबस्ट्रेटला हाइलाइट करण्यासाठी, पॉप-उप मेनू उघडा, '''Select''' वर जा, नंतर '''Hetero''' आणि '''GLC-ALFA-D-GLUCOSE''' वर क्‍लिक करा.

|-
||05:52
|| पुन्हा पॉप-उप मेनू उघडा, '''Style''' पर्यन्त खाली जा, '''Scheme''' आणि '''Sticks''' पर्याय वर क्‍लिक करा.

|-
||06:00
|| रंग बदलण्यासाठी, पुन्हा पॉप-उप मेनू उघडा, '''Color''', '''Atoms''' वर जा आणि '''White''' पर्याय वर क्‍लिक करा.

|-
||06:12
|| पॅनेल वर स्पष्टपणे हाइलाइट केलेले सबस्ट्रेटच्या स्थिती सोबत '''hexokinase''' चा मॉडल आहे.

|-
||06:20
|| आपण अमीनो एसिड्स हाइलाइट करण्यासाठी सक्रिय साइटवर त्यांचा रंग बदलू शकतो.

|-
||06:26
|| असे करण्यासाठी, आपल्याला कॉन्सोल विंडो वर कमांड्स टाईप करायचे आहे.

|-
||06:32
|| आधी सांगितल्याप्रमाणे, सक्रिय साइटवर सहभागी अमीनो एसिड्स आहेत पोज़िशन 204 वर '''Aspergine''', पोज़िशन 231 वर '''Aspergine''' आणि 256 वर '''Glutamic acid'''.

|-
|| 06:50
|| '''File menu''' वापरुन कॉन्सोल विंडो उघडा. '''Console''' वर क्‍लिक करा.

|-
||06:57
|| मी कॉन्सोल विंडो मॅग्निफाइ करण्यास '''Kmag''' स्क्रीन मॅग्निफाइयर वापरत आहे.

|-
||07:03
|| $ (डॉलर) प्रॉंप्टवर टाईप करा: select चौकोनी कंसात aspergine साठी '''"Asn"''' कंस बंद करा, '''204''' जी पोज़िशन आहे सेमिकॉलन '''color atoms orange'''

|-
||07:25
|| एंटर दाबा.

|-
||07:27
|| लक्ष द्या की '''aspargine''' रेसिड्यूचे अणू आता ऑरेंज रंगात आहे.

|-
||07:33
|| की बोर्ड वरील अप एरो बटण दाबून कमांड एडिट करा.

|-
||07:39
|| अमीनो एसिड्सची पोज़िशन 231 आणि अणूंच्या रंगला रेड मध्ये एडिट करा.

|-
||07:48
|| एंटर दाबा.

|-
||07:51
|| पुन्हा अप-एरो की दाबा आणि अमीनो एसिड्सचे नाव GLU जे की '''glutamic acid''' आहे आणि पोज़िशन ला 256 शी एडिट करा.

|-
||08:06
|| अणूंचे रंग ग्रीन आणि एंटर दाबा.

|-
||08:13
|| पॅनेल वर आपल्या जवळ सबस्ट्रेट आणि हाइलाइट केलेली सक्रिय साइट सह '''hexokinase''' चा 3D मॉडल आहे.

|-
||08:23
|| येथे पर्पल रंगात दर्शविले गेलेले '''potassium''' अणू देखील मॉडल मध्ये हाइलाइट केलेले आहे.

|-
||08:30
|| आपण '''Jmol''' मध्ये एक विशिष्ट प्रोटीन साठी '''ramachandran plots''' देखील दाखवू शकतो.

|-
||08:36
|| कॉन्सोल वर, ($) प्रॉंप्ट वर टाईप करा: '''plot ramachandran'''

|-
||08:45
|| एंटर दाबा.

|-
||08:47
|| स्क्रीन वर आपल्या जवळ '''hexokinase''' साठी '''ramachandran plot''' आहे.

|-
||08:54
|| डेटाबेस मधून '''pdb files''' वापरुन विविध एन्ज़ाइम्स लोड करण्याचा प्रयत्न करा.

|-
||09:00
|| दुय्यम स्ट्रक्चरचा डिस्पले बदला.

|-
||09:04
|| थोडक्यात. ह्या ट्यूटोरियल मध्ये आपण शिकलो: * PDB कोड वापरुन ह्यूमन पैन्क्रीऐटिक हेक्सोकाइनेसचे स्ट्रक्चर लोड करणे.

|-
||09:14
||* दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे

|-
||09:17
||* सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.

|-
||09:21
||* एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.

|-
||09:25
|| आणि प्रोटीनसाठी '''रामचंद्रन प्लॉट''' पहाणे.

|-
||09:30
|| असाइनमेंट म्हणून: '''Jmol''' पॅनेल वर एन्ज़ाइम '''Lysozyme''' ची डॉट pdb फाईल लोड करा.

|-
||09:38
|| एन्ज़ाइमशी जुडलेल्या सबस्ट्रेटला हाइलाइट करा.

|-
||09:42
|| सक्रिय साइटवर अमीनो आसिड हाइलाइट करा.

|-
||09:46
||सूचना: '''PDB''' डेटाबेस मधून '''Lysozyme''' ची '''pdb''' फाईल प्राप्त करा.

|-
||09:52
||प्रकल्पाची माहिती दिलेल्या URL वर उपलब्ध आहे.

|-
||09:56
|| ज्यामध्ये तुम्हाला प्रॉजेक्टचा सारांश मिळेल.

|-
||10:00
|| जर तुमच्याकडे चांगली Bandwidth नसेल तर आपण व्हिडिओ download करूनही पाहू शकता.

|-
||10:04
|| स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्ट टीम:

|-
||10:07
|| स्पोकन ट्यूटोरियलच्या सहाय्याने कार्यशाळा चालविते आणि प्रमाणपत्रही दिले जाते.

|-
||10:10
|| अधिक माहितीसाठी कृपया contact@spoken-tutorial.org वर लिहा.

|-
||10:14
|| "स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्ट" हे "टॉक टू टीचर" या प्रॉजेक्टचा भाग आहे.

|-
||10:19
|| यासाठी अर्थसहाय्य National Mission on Education through ICT, MHRD, Government of India यांच्याकडून मिळालेले आहे.

|-
||10:25
|| यासंबंधी माहिती पुढील साईटवर उपलब्ध आहे.

|-
||10:30
|| मी रंजना भांबळे आपला निरोप घेते. सहभागासाठी धन्यवाद.

|-
|}

@@ Line 13: / Line 13: @@
 |-
 ||00:16
-||* दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे.
+|| दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे.
 |-
 ||00:20
-||* सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.
+|| सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.
 |-
 ||00:25
-||* एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.
+|| एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.
 |-
 ||00:30
-||* आणि प्रोटीन साठी 'रामचंद्रन प्लॉट' पहाणे.
+|| आणि प्रोटीन साठी 'रामचंद्रन प्लॉट' पहाणे.
 |-
@@ Line 49: / Line 49: @@
 |-
 ||01:05
-||* '''Jmol''' वर्जन 12.2.2.
+|| '''Jmol''' वर्जन 12.2.2.
 |-
 ||01:08
-||* '''Java''' वर्जन 7 आणि '''Mozilla Firefox browser''' 22.0
+|| '''Java''' वर्जन 7 आणि '''Mozilla Firefox browser''' 22.0
 |-
@@ Line 309: / Line 309: @@
 |-
 ||09:14
-||* दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे
+|| दुय्यम स्ट्रक्चरचे डिसप्ले बदलणे
 |-
 ||09:17
-||* सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.
+|| सक्रिय साइटवर बाकीचे अमीनो आसिड हाइलाइट करणे.
 |-
 ||09:21
-||* एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.
+|| एनजाईमचे सबस्ट्रेट आणि कोफॅक्टर्स हाइलाइट करणे.
 |-

@@ Line 101: / Line 101: @@
 |-
 ||02:34
-|| पॅनेल वर, आपल्याकडे '''hexokinase'''  चे '''बॉल आणि स्टिक''' मॉडल आहे.
+|| पॅनेल वर, आपल्याकडे '''hexokinase'''  चे बॉल आणि स्टिक मॉडल आहे.
 |-
@@ Line 321: / Line 321: @@
 |-
 ||09:25
-|| आणि प्रोटीनसाठी '''रामचंद्रन प्लॉट''' पहाणे.
+|| आणि प्रोटीनसाठी रामचंद्रन प्लॉट पहाणे.
 |-

Jmol-Application/C4/3D-Models-of-Enzymes/Marathi - Revision history

PoojaMoolya at 09:05, 19 April 2017

Ranjana at 09:37, 21 April 2016

Ranjana: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- ||00:01 || '''3D Models of Enzymes in Jmol''' वरील ट्यूटोरियलमध्ये आपले स्..."