Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Nepali - Revision history

PoojaMoolya at 12:57, 24 April 2017

2017-04-24T12:57:52Z

Mandira: Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 |यो '''Proteins and Macromolecules''' स्पोकन ट्युटोरियलमा स्वागत छ |..."

2014-10-19T11:35:31Z

Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 |यो '''Proteins and Macromolecules''' स्पोकन ट्युटोरियलमा स्वागत छ |..."

New page

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''
|-
| 00:01
|यो '''Proteins and Macromolecules''' स्पोकन ट्युटोरियलमा स्वागत छ
|-
| 00:06
|यो ट्युटोरियलमा हामी सिक्नेछौं
|-
|00:09
|* '''Protein Data Bank (PDB)''' बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
|-
|00:13
|* '''PDB''' डाटाबेसबाट '''.pdb ''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
|-
|00:18
|*प्रोटिनको सेकन्डरी संरचनाहरु विभिन्न फर्म्याटहरुमा डिस्प्ले गर्न
|-
|00:24
|* '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
|-
|00:29
|यो ट्युटोरियल अनुसरण गर्न तपाईसँग '''Jmol Application विन्डो''' को आधारभूत ज्ञान हुनुपर्छ
|-
|00:37
|यदि छैन भने सान्दर्भिक ट्युटोरियलको लागि हाम्रो वेबसाइटमा हेर्नुहोस्
|-
| 00:42
|यो ट्युटोरियल रेकर्ड गर्न म प्रयोग गर्दैछुँ,
|-
| 00:46
|* '''उबुन्टु''' अपरेटिंग सिस्टम संस्करण १२.०४
|-
|00:50
|* '''Jmol''' संस्करण १२.२.२
|-
|00:54
|* '''Java''' संस्करण ७
|-
|00:57
|* '''Mozilla Firefox ''' ब्राउजर २२.०
|-
| 01:02
|ठूला '''बायोमलिक्युल''' हरुको Structure Analysis
|-
|01:06
|* '''Proteins''' र '''Macromolecules'''
|-
|01:10
|* '''Nucleic acids, DNA''' र '''RNA'''
|-
|01:13
|* '''Crystal structures र polymers''','''Jmol Application''' को प्रयोगले गर्न सकिन्छ
|-
| 01:19
|यहाँ मैले एउटा नयाँ '''Jmol''' विन्डो खोल्ने छौं
|-
| 01:24
| '''बायोमलिक्युल''' हरुको 3D संरचनाहरु सिधै डाटाबेसबाट डाउनलोड गरी हेर्न सकिन्छ
|-
| 01:29
|यसो गर्न '''File ''' मेनुमा क्लिक गरौँ, तल ''' Get PDB''' मा क्लिक गरौँ
|-
| 01:36
|स्क्रिनमा एउटा इनपुट डाइलग बक्स देखापर्छ
|-
| 01:40
|हामीले इनपुट बक्समा निश्चित '''protein''' को लागि चार अक्षरको '''PDB code''' टाइप गर्नुपर्ने हुन्छ
|-
| 01:48
|यो कोड '''Protein Data Bank (PDB) '''वेबसाइट'''''' बाट प्राप्त गर्न सकिन्छ
|-
| 01:53
|यो '''Protein Data Bank''' को वेबपेज हो
|-
| 01:57
|यसमा बायोमलिक्युलहरु जस्तै '''proteins''' र '''nucleic acid''' को जानकारी छ
|-
| 02:04
|उदारहणको रुपमा: '''PDB ''' वेबसाइटबाट '''Pancreatic Enzyme Insulin''' को '''PDB कोड''' पत्ता लगाऊ
|-
|02:13
|सर्च बक्समा टाइप प्रोटिनको नाम टाइप गरौँ,'''Human''' '''Insulin''', किबोर्डको इन्टर कि थिचौं
|-
| 02:24
|अब देखिएको वेबपेजमा तल स्क्रोल गरौँ
|-
| 02:28
|स्क्रिनमा परिचित '''Human Insulin'''संरचनाहरु साथै '''PDB कोड ''' हरु देखापर्छ
|-
| 02:36
|उदाहरणको रुपमा कोड '''4EX1''' सहितको ''' Human Insulin''' छानौं
|-
| 02:44
|प्रोटिनको नाममा क्लिक गरौँ
|-
| 02:47
|संरचनाको विवरण सहितको एउटा विन्डो खुल्छ
|-
| 02:52
|जानकारीहरु जस्तै
|-
| 02:54
|* '''Primary Citation'''
|-
| 02:56
|* '''Molecular Description ''' र
|-
|02:58
|* '''Structure Validation''' हरु यो पेजमा उपलब्ध छन्
|-
| 03:02
|हामी प्रोटिनको संरचना '''.pdb ''' फाइलको रुपमा सेभ गर्न र तिनीहरुलाई '''Jmol''' मा 3D मोडमा हेर्न सक्छौं
|-
| 03:12
|पेजको माथि दायाँ कुनामा रहेको '''Download Files''' लिंकमा क्लिक गरौँ
|-
| 03:20
|ड्रपडाउन मेनुबाट '''PDB file (gz) '''विकल्प ''' ''' छानौं
|-
| 03:28
|स्क्रिनमा एउटा डाइलग बक्स खुल्छ
|-
| 03:32
|'''Save file''' विकल्प छानौं
|-
|03:35
| '''OK''' बटनमा क्लिक गरौँ
|-
| 03:39
|प्रोटिनको संरचना '''4EX1.pdb.gz''' को रुपमा '''Downloads ''' फोल्डरमा सेभ हुनेछ
|-
| 03:51
|यसैगरी, तपाई विभिन्न प्रोटिनहरुको आवश्यक '''.pdb ''' फाइल डाउनलोड गर्न र तिनीहरुलाई भिन्नै फाइलमा सेभ गर्न सक्नुहुन्छ
|-
| 04:02
|अब, '''Insulin''' को 3D संरचना हेर्न '''Jmol''' विन्डोमा जाउँ
|-
|04:09
|यदि तपाईसँग इन्टरनेट छ भने तपाई सिधै Jmol प्यानलमा प्रोटिन संरचना डाउनलोड गर्न सक्नुहुन्छ
|-
| 04:15
|टेक्स्ट बक्समा ४ अक्षरको '''PDB code “4EX1” ''' टाइप गरौ र '''OK''' बटन क्लिक गरौँ
|-
| 04:25
|यदि तपाईसँग इन्टरनेट छैन भने टूलबारको '''Open a File''' आइकनमा क्लिक गरौँ
|-
| 04:34
|प्यानलमा एउटा डाइलग बक्स खुल्छ
|-
| 04:38
| '''4EX1.pdb.gz''' फाइल भएको स्थान मतलब '''Downloads''' फोल्डरमा जाउँ
|-
| 04:47
| '''Downloads''' फोल्डर छानौं र '''open''' बटन क्लिक गरौँ
|-
| 04:52
| '''4EX1.pdb.gz''' फाइल छानौं र '''open''' बटनमा क्लिक गरौँ
|-
| 05:00
|स्क्रिनमा Insulin को 3D संरचना खुल्छ
|-
| 05:05
|प्यानलमा '''protein''' को डिफल्ट डिस्प्ले '''ball and stick''' हो
|-
| 05:12
|प्यानलमा प्रोटिनको मोडल हाइड्रोजन एटमहरु विना देखिन्छ
|-
| 05:17
|हाइड्रोजन एटमहरु सहितको मोडल देखाउन, '''modelkit''' मेनु खोलौं
|-
| 05:23
|तल '''add hydrogens''' विकल्पमा स्क्रोल गरौँ र यसमा क्लिक गरौँ
|-
| 05:28
|अहिले प्यानलमा हाइड्रोजन एटमहरु सहितको मोडल देखाइएको छ
|-
| 05:33
| '''protein''' संरचनामा पानीको मलिक्युलहरु पनि देखाइएको छ
|-
| 05:38
|पानीको मलिक्युल नदेखाउन, यो कदमहरु अनुसरण गर्नुहोस्
|-
| 05:43
|पहिले पप-अप मेनु खोलौं र '''Select''' मा जाउँ
|-
| 05:48
|सब-मेनुबाट '''Hetero''' छानौं र '''“All Water''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 05:55
|पुन: पप-अप मेनु खोलौं, '''Style''' मा जाउँ, '''Scheme ''' र '''CPK spacefill ''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 06:05
|यसले पानीको मलिक्युललाई '''CPK Spacefill ''' डिस्प्ले गर्ने छ
|-
| 06:11
|पुन: पप अप मेनु खोलौं र '''Style''' मा जाउँ र तल '''Atoms ''' मा स्क्रोल गरौँ र '''Off ''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 06:22
|अब प्यानलमा हामीसँग कुनै पनि पानीको मलिक्युल बिनाको '''Insulin''' संरचना छ
|-
| 06:27
|अर्को '''protein''' को सेकन्डरी संरचना विभिन्न फर्म्याटहरुमा डिस्प्ले गर्न सिकौं
|-
| 06:35
|पप-अप मेनु खोलौं
|-
| 06:37
| '''Select '''विकल्पमा जाउँ
|-
| 06:39
|तल '''Protein ''' मा स्क्रोल गरौँ र ''' All ''' विकल्पमा क्लिक गरौँ
|-
| 06:44
|पुन” पप-अप मेनु खोलौं र तल '''Style ''' अनि ''' Scheme ''' मा स्क्रोल गरौँ
|-
| 06:50
|एउटा सब-मेनु यी विकल्पहरु सहित खुल्ने छ '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace, आदि'''
|-
|07:02
|सबमेनुको ''' Cartoon ''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
|07:07
|यो डिस्प्ले मा प्रोटिनको सेकन्डरी संरचनाहरु हेलिसेस '''helices, random coils, strands, sheets ''' आदि देखिन्छन्
|-
| 07:17
|थप डिस्प्ले विकल्पहरुको लागि,
|-
| 07:19
|पप-अप मेनु खोलौं र तल '''Style,''' मा स्क्रोल गरौँ अनि ''' Structures''' मा जाउँ
|-
| 07:25
|यहाँ हामी प्रोटिनको सेकन्डरी संरचना डिस्प्ले गर्ने विभिन्न विकल्पहरु देख्छौं
|-
| 07:31
|उदाहरणको लागि '''Strands''' विकल्पमा क्लिक गरौँ
|-
| 07:35
|अहिले प्यानलमा प्रोटिन '''Strands''' को रुपमा देखाइएको छ
|-
| 07:40
|डिस्प्ले को रंग बदल्न, पप-अप मेनु खोलौं, तल '''Color''' मा स्क्रोल गरौँ र '''Atoms''' छानौं र '''Blue''' विकल्प क्लिक गरौं
|-
| 07:52
|प्यानलको रंगमा परिवर्तन हेरौं
|-
| 07:56
|संरचनालाई पुन: '''Ball-and-stick''' डिस्प्लेमा परिणत गर्न,
|-
| 07:59
|पप-अप मेनु खोलौं, '''Style'''अनि '''Scheme''' छानौं र '''Ball and stick ''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 08:08
|हामी प्रोटिन मोडलमा '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' र ''' di-sulfide बन्डहरु ''' हाइलाइट गर्न सक्छौं
|-
| 08:14
| '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' देखाउन: पप-अप मेनु खोलौं र तल '''Style''' अनि '''Hydrogen Bonds''' विकल्पमा मा स्क्रोल गरौँ
|-
|08:25
|पप-अप मेनुको '''Hydrogen Bonds''' विकल्पमा यी बिशेषताहरु छन्
|-
|08:30
|'''Calculate''', '''Set Hydrogen इन् Bonds Side Chain.'''
|-
|08:35
|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone'''
र बन्डको मोटाई बदल्ने विकल्प पनि छ
|-
| 08:42
|मोडलमा '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' देखाउन '''Calculate''' विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 08:47
| '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' सेतो र रातो लामो ड्यासहरुको रुपमा देखाइएको छ
|-
| 08:53
|'''हाइड्रोजन बन्डहरु''' को मोटाई बदल्न पप-अप मेनुको ''' 0.10 A ''' एंगस्ट्रम विकल्प क्लिक गरौँ
|-
| 09:02
|अब हामी प्यानलमा अलि मोटो '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' देख्न सक्छौं
|-
|09:06
|हामी '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' को रंग पनि बदल्न सक्छौं
|-
| 09:11
|पप-अप मेनुबाट, '''Color''' अनि '''Hydrogen Bonds''' मा स्क्रोल गरौँ अनि '''orange''' विकल्पमा क्लिक गरौँ
|-
| 09:20
|प्यानलमा हामीसँग सम्पूर्ण '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' सुन्तला रंगमा छन्
|-
| 09:25
|मोडलमा '''Disulfide''' बन्डहरु र सल्फर एटमहरु पहेँलो रंगमा देखाइएको छ
|-
|09:31
| disulfide बन्डहरु परिमार्जन गर्न पप-अप मेनुको disulfide bonds विकल्प खोलौं
|-
| 09:38
|तपाईले बदल्न चाहेको बिशेषताहरु जस्तै size र color आदिमा क्लिक गरौँ
|-
| 09:44
|यसैगरी विभिन्न '''enzyme''' हरुको '''.pdb ''' फाइल खोलौं र तिनीहरुको 3D संरचना हेरौं
|-
|09:51
|संक्षेपमा हेरौं, यो ट्युटोरियलमा हामीले सिक्यौं:
|-
|09:57
|* Protein Data Bank (PDB) बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
|-
|10:00
|* डाटाबेसबाट '''.pdb''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
|-
|10:05
|* '''PDB code''' प्रयोग गरि इन्सुलिनको 3D संरचना हेर्न
|-
|10:10
|* पानीको मलिक्युल विनाको '''Protein''' संरचना हेर्न
|-
|10:14
|* सेकन्डरी संरचना विभिन्न फर्म्याटहरुमा देखाउन
|-
|10:17
|* '''हाइड्रोजन बन्डहरु ''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
|-
|10:22
|यहाँ तपाईको लागि एउटा कार्य छ
|-
|10:24
|* '''PDB ''' डाटाबेसबाट '''Human Hemoglobin''' को '''.pdb''' फाइल डाउनलोड गर्नुहोस्
|-
|10:31
|*सेकन्डरी संरचना '''cartoon '''डिस्प्लेमा देखाउनुहोस्
|-
|10:35
|* '''protein''' को “'''porphyrin'''” युनिट हाइलाइट गर्नुहोस्
|-
|10:39
|*'''PDB code''' को लागि तलको लिंक प्रयोग गर्नुहोस्
|-
| 10:42
|यो URL मा उपलब्ध भिडियो हेर्नुहोस्
[http://spoken-tutorial.org/What http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial]
|-
|10:46
|यसले स्पोकन ट्युटोरियल प्रोजेक्टको सार दिन्छ
|-
|10:50
|यदि तपाईसँग राम्रो ब्याण्डविड्थ छैन भने डाउनलोड गरि हेर्नुहोस्
|-
| 10:55
|स्पोकन ट्युटोरियल प्रोजेक्ट टिमले:
|-
|10:57
|स्पोकन ट्युटोरियल प्रयोग गरि कार्यशाला संचालन गर्छ
|-
|11:01
|अनलाइन टेस्ट पास गर्नेलाई प्रमाणपत्र प्रदान गर्छ
|-
|11:06
|बिस्तृत जानकारीको लागि कृपया contact@spoken-tutorial.org मा लेख्नुहोस्
|-
| 11:13
|स्पोकन ट्युटोरियल प्रोजेक्ट टक टु अ टिचर प्रोजेक्टको एक भाग हो
|-
|11:18
|यसलाई नेशनल मिसन अनि एजुकेसन थ्रु आइसीटी, MHRD,भारत सरकारको सहयोग रहेको छ
|-
|11:25
|यो मिसन सम्बन्धि थप जानकारी तलको लिंकमा उपलब्ध छ
[http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro] ]
|-
|11:31
|म मन्दिरा थापा बिदा हुदैछुँ, सहभागिताको, लागि धन्यवाद, नमस्कार
|}

@@ Line 10: / Line 10: @@
 |-
 |00:09
-|* '''Protein Data Bank (PDB)''' बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
+| '''Protein Data Bank (PDB)''' बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
 |-
 |00:13
-|* '''PDB''' डाटाबेसबाट '''.pdb ''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
+| '''PDB''' डाटाबेसबाट '''.pdb ''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
 |-
 |00:18
-|*प्रोटिनको सेकन्डरी संरचनाहरु विभिन्न फर्म्याटहरुमा डिस्प्ले गर्न
+|प्रोटिनको सेकन्डरी संरचनाहरु विभिन्न फर्म्याटहरुमा डिस्प्ले गर्न
 |-
 |00:24
-|* '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
+| '''हाइड्रोजन बन्डहरु''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
 |-
 |00:29
@@ Line 31: / Line 31: @@
 |-
 | 00:46
-|* '''उबुन्टु''' अपरेटिंग सिस्टम संस्करण १२.०४
+| '''उबुन्टु''' अपरेटिंग सिस्टम संस्करण १२.०४
 |-
 |00:50
-|* '''Jmol''' संस्करण १२.२.२
+| '''Jmol''' संस्करण १२.२.२
 |-
 |00:54
-|* '''Java''' संस्करण ७
+| '''Java''' संस्करण ७
 |-
 |00:57
-|* '''Mozilla Firefox ''' ब्राउजर २२.०
+| '''Mozilla Firefox ''' ब्राउजर २२.०
 |-
 | 01:02
@@ Line 46: / Line 46: @@
 |-
 |01:06
-|* '''Proteins''' र '''Macromolecules'''
+| '''Proteins''' र '''Macromolecules'''
 |-
 |01:10
-|* '''Nucleic acids, DNA''' र '''RNA'''
+| '''Nucleic acids, DNA''' र '''RNA'''
 |-
 |01:13
-|* '''Crystal structures र polymers''','''Jmol Application''' को प्रयोगले गर्न सकिन्छ
+| '''Crystal structures र polymers''','''Jmol Application''' को प्रयोगले गर्न सकिन्छ
 |-
 | 01:19
@@ Line 103: / Line 103: @@
 |-
 | 02:54
-|* '''Primary Citation'''
+| '''Primary Citation'''
 |-
 | 02:56
-|* '''Molecular Description ''' र
+| '''Molecular Description ''' र
 |-
 |02:58
-|* '''Structure Validation''' हरु यो पेजमा उपलब्ध छन्
+| '''Structure Validation''' हरु यो पेजमा उपलब्ध छन्
 |-
 | 03:02
@@ Line 265: / Line 265: @@
 |-
 |08:35
-|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone'''
+|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone'''र बन्डको मोटाई बदल्ने विकल्प पनि छ
 र बन्डको मोटाई बदल्ने विकल्प पनि छ
 |-
 | 08:42
@@ Line 305: / Line 304: @@
 |-
 |09:57
-|* Protein Data Bank (PDB) बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
+| Protein Data Bank (PDB) बाट प्रोटिनको संरचनाहरु लोड गर्न
 |-
 |10:00
-|* डाटाबेसबाट '''.pdb''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
+| डाटाबेसबाट '''.pdb''' फाइलहरु डाउनलोड गर्न
 |-
 |10:05
-|* '''PDB code''' प्रयोग गरि इन्सुलिनको 3D संरचना हेर्न
+| '''PDB code''' प्रयोग गरि इन्सुलिनको 3D संरचना हेर्न
 |-
 |10:10
-|* पानीको मलिक्युल विनाको '''Protein''' संरचना हेर्न
+| पानीको मलिक्युल विनाको '''Protein''' संरचना हेर्न
 |-
 |10:14
-|* सेकन्डरी संरचना विभिन्न फर्म्याटहरुमा देखाउन
+| सेकन्डरी संरचना विभिन्न फर्म्याटहरुमा देखाउन
 |-
 |10:17
-|* '''हाइड्रोजन बन्डहरु ''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
+| '''हाइड्रोजन बन्डहरु ''' र '''disulfide बन्डहरु''' हाइलाइट गर्न
 |-
 |10:22
@@ Line 326: / Line 325: @@
 |-
 |10:24
-|* '''PDB ''' डाटाबेसबाट '''Human Hemoglobin''' को '''.pdb''' फाइल डाउनलोड गर्नुहोस्
+| '''PDB ''' डाटाबेसबाट '''Human Hemoglobin''' को '''.pdb''' फाइल डाउनलोड गर्नुहोस्
 |-
 |10:31
-|*सेकन्डरी संरचना '''cartoon '''डिस्प्लेमा देखाउनुहोस्
+|सेकन्डरी संरचना '''cartoon '''डिस्प्लेमा देखाउनुहोस्
 |-
 |10:35
-|* '''protein''' को “'''porphyrin'''” युनिट हाइलाइट गर्नुहोस्
+| '''protein''' को “'''porphyrin'''” युनिट हाइलाइट गर्नुहोस्
 |-
 |10:39
-|*'''PDB code''' को लागि तलको लिंक प्रयोग गर्नुहोस्
+|'''PDB code''' को लागि तलको लिंक प्रयोग गर्नुहोस्
 |-
 | 10:42
-|यो URL मा उपलब्ध भिडियो हेर्नुहोस्
+|यो URL मा उपलब्ध भिडियो हेर्नुहोस् [http://spoken-tutorial.org/What http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial]
 [http://spoken-tutorial.org/What http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial]
 |-
 |10:46
@@ Line 366: / Line 364: @@
 |-
 |11:25
-|यो मिसन सम्बन्धि थप जानकारी तलको लिंकमा उपलब्ध छ
+|यो मिसन सम्बन्धि थप जानकारी तलको लिंकमा उपलब्ध छ [http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro] ]
 [http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro] ]
 |-
 |11:31
 |म मन्दिरा थापा बिदा हुदैछुँ, सहभागिताको, लागि धन्यवाद, नमस्कार
 |}