Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Gujarati - Revision history

Jyotisolanki at 11:31, 24 March 2017

2017-03-24T11:31:01Z

Jyotisolanki at 10:41, 29 December 2014

2014-12-29T10:41:57Z

Jyotisolanki at 10:27, 29 December 2014

2014-12-29T10:27:13Z

Jyotisolanki at 11:14, 5 December 2014

2014-12-05T11:14:14Z

Show changes

Jyotisolanki at 07:18, 5 December 2014

2014-12-05T07:18:03Z

Show changes

Jyotisolanki: Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 | '''Proteins and Macromolecules.''' પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છ..."

2014-12-04T11:27:04Z

Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 | '''Proteins and Macromolecules.''' પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છ..."

New page

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''

|-
| 00:01
| '''Proteins and Macromolecules.''' પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
|આ ટ્યુટોરીયલમાં, હું આપેલ વિશે સમજાવીશ:

|-
|00:09
|* '''Protein Data Bank (PDB).''' થી પ્રોટીનસ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.

|-
|00:13
|* '''.pdb ''' ડેટાબેસ થી '''PDB''' ફાઈલ્સ ડાઉનલોડ કરતા.

|-
|00:18
|* પ્રોટીન્સના સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર વિવિધ ફોર્મેટ્સમાં બતાવવા.

|-
|00:24
|* હાઇડ્રોજન બોન્ડસ અને ડાઈસલ્ફાઇડ બોન્ડને હાઈલાઈટ કરતા.

|-
|00:29
| આ ટ્યુટોરીયલનાં અનુસરણ માટે, તમે '''Jmol Application window.''' બેસિક ઓપરેશન શાથે પરિચિત હોવા જોઈએ.

|-
|00:37
| જો નથી તો અમારી વેબ સાઈટ પર ઉપલબ્ધ ટ્યુટોરીયલનો સંદર્ભ લો.

|-
| 00:42
|આ ટ્યુટોરીયલ રેકોર્ડ કરવા માટે હું વાપરી રહ્યી છું,

|-
| 00:46
|* ઉબુન્ટુ ઓપરેટીંગ સીસ્ટમ આવૃત્તિ 12.04

|-
|00:50
|* '''Jmol''' આવૃત્તિ 12.2.2

|-
|00:54
|* '''Java''' આવૃત્તિ 7

|-
|00:57
|* '''Mozilla Firefox ''' બ્રાઉઝર 22.0

|-
| 01:02
| મોટા જૈવિકઅણુઓ ના સ્ટ્રક્ચરના વિશ્લેષણ જેવા

|-
|01:06
|* '''Proteins''' (પ્રોટીન્સ)અને '''Macromolecules''' (મેક્રોમોલેક્યુલ્સ)

|-
|01:10
|* '''Nucleic acids, (ન્યુક્લીક એસીડ) DNA''' અને '''RNA'''

|-
|01:13
|* '''ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર અને પોલીમર્સ ''' જેમોલ એપ્લીકેશન નો ઉપયોગ કરીને કરી શકાય છે.

|-
| 01:19
| મેં નવી '''Jmol''' વિન્ડો ખોલી છે.

|-
| 01:24
| જૈવિકઅણુઓના 3D સ્ટ્રક્ચરસ ને ડેટાબેસ થી ડાયરેક્ટ ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકાય છે.

|-
| 01:29
| આ કરવા માટે '''File '''મેનુ પર ક્લોઈક કરો ''' Get PDB.''' મેળવવા માટે સ્ક્રોલડાઉન કરો.

|-
| 01:36
| ઈનપુટ ડાઈલોગ બોક્સ સ્ક્રીન પર દેખાય છે.

|-
| 01:40
| ચોક્કસ પ્રોટીન માટે આપણે ઈનપુટ બોક્સમાં ચાર અક્ષર ના '''PDB code''' કરવા પડશે.

|-
| 01:48
| '''''' આ કોડ '''Protein Data Bank (PDB) '''વેબસાઈટ થી મેળવી શકીએ છીએ.

|-
| 01:53
| આ '''Protein Data Bank.''' નું વેબ પુષ્ઠ છે.

|-
| 01:57
|આ જૈવિકઅણુઓ વિષે માહિતી ધરવે છે જેમ કે '''proteins''' (પ્રોટીન્સ) અને '''nucleic acids.''' (ન્યુક્લીક એસીડ)

|-
| 02:04
| દાહરણ તરીકે:હવે'''PDB '''વેબસાઈટ થી '''Pancreatic Enzyme Insulin ''' (પેનક્રીએટીક એન્ઝાઈમ ઇન્સ્યુઇન) માટે '''PDB code ''' મેળવવાની કોશિશ કરે છે.

|-
|02:13
| In the search box type name of the protein as '''Human''' '''Insulin.'''Press Enter key on the keyboard.

|-
| 02:24
| Now, on the web-page that is displayed, scroll down.

|-
| 02:28
| A list of known structures of '''Human Insulin''' along with the '''PDB codes '''appear on screen.

|-
| 02:36
| As an example, let's select''' Human Insulin''' with a code '''4EX1.'''

|-
| 02:44
|Click on the name of the protein.

|-
| 02:47
| A window opens with all the details of the structure.

|-
| 02:52
| Information like

|-
| 02:54
|* '''Primary Citation'''

|-
| 02:56
|* '''Molecular Description '''and

|-
|02:58
|* '''Structure Validation'''are available on this page.

|-
| 03:02
| We can save the structures of proteins as '''.pdb '''files and view them in 3D mode in '''Jmol.'''

|-
| 03:12
| Click on the '''Download Files''' link, located at the top right hand corner of the page.

|-
| 03:20
| From the drop down menu, select '''PDB file (gz) '''option'''. '''

|-
| 03:28
|A dialog box opens on the screen.

|-
| 03:32
|Select '''Save file''' option.

|-
|03:35
|Click on '''OK''' button.

|-
| 03:39
| The structure of protein will be saved as '''4EX1.pdb.gz,''' in the '''Downloads '''folder.

|-
| 03:51
| Similarly, you can download the required '''.pdb '''files of various proteins and save them in separate files.

|-
| 04:02
| Now, lets switch to '''Jmol''' window to view the 3D structure of '''Insulin'''.

|-
|04:09
| If you are connected to Internet, you can directly download the protein structure on Jmol panel.

|-
| 04:15
| Type the 4 letter '''PDB code “4EX1” '''in the text box and click on '''OK''' button.

|-
| 04:25
| If you are not connected to Internet, then click on '''Open a File''' icon on the tool bar.

|-
| 04:34
| A dialog box opens on the panel.

|-
| 04:38
|Navigate to the location of '''4EX1.pdb.gz''' file i.e. to '''Downloads '''folder.

|-
| 04:47
|Select '''Downloads''' folder and click on '''open '''button.

|-
| 04:52
|Select '''4EX1.pdb.gz''' file and click on '''open''' button.

|-
| 05:00
| 3D Structure of Insulin opens on screen.

|-
| 05:05
| The default display of the '''protein''' on the panel, is '''ball and stick.'''

|-
| 05:12
| The model of protein on the panel is shown without hydrogens atoms.

|-
| 05:17
| To show the model with hydrogen atoms, open the '''modelkit''' menu.

|-
| 05:23
|Scroll down to '''add hydrogens''' option and click on it.

|-
| 05:28
| The model on the panel is now displayed with hydrogen atoms.

|-
| 05:33
| The '''protein''' structure is also shown with water molecules.

|-
| 05:38
| To hide the water molecules, follow the steps as shown.

|-
| 05:43
| First open the pop-up menu and go to '''Select.'''

|-
| 05:48
| From the sub-menu,choose '''Hetero'''and click on '''“All Water''' option.

|-
| 05:55
| Open the pop-up menu again, go to '''Style''', '''Scheme '''and click on '''CPK spacefill '''option.

|-
| 06:05
|This will convert all the water molecules to '''CPK Spacefill '''display.

|-
| 06:11
| Open the pop-up menu again and go to '''Style''' scroll down to '''Atoms '''and click on '''Off '''option.

|-
| 06:22
| Now on panel we have '''Insulin'''structure without any water molecules.

|-
| 06:27
| Next, let us learn to display the secondary structure of the '''protein''' in various formats.

|-
| 06:35
|Open the pop-up menu.

|-
| 06:37
| Go to '''Select '''option.

|-
| 06:39
| Scroll down to '''Protein '''and click on''' All '''option.

|-
| 06:44
|Open the pop-up menu again and scroll down to '''Style, '''then''' Scheme. '''

|-
| 06:50
|A sub-menu opens with options like '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace, etc. '''

|-
|07:02
|Click on''' Cartoon '''option from the sub-menu.

|-
|07:07
| This display shows the secondary structure of protein as '''helices, random coils, strands, sheets '''etc.

|-
| 07:17
| For more display options,

|-
| 07:19
| Open the pop-up menu and scroll down to '''Style,''' then to''' Structures'''.

|-
| 07:25
| Here we see many more options to display secondary structure of protein.

|-
| 07:31
| For example click on '''Strands''' option.

|-
| 07:35
| The protein is now displayed as '''Strands''' on the panel.

|-
| 07:40
| To change the color of display, open the Pop-up-menu. Scroll down to '''Color''' select '''Atoms''' and click on '''Blue''' option.

|-
| 07:52
| Observe the change in color on the panel.

|-
| 07:56
| To convert the structure back to '''Ball-and-stick''' display,

|-
| 07:59
| Open the pop-up menu, select '''Style''', then '''Scheme''' and click on '''Ball and stick '''option.

|-
| 08:08
| We can also highlight '''hydrogen bonds '''and''' di-sulpfide bonds '''in the protein model.

|-
| 08:14
| To display '''hydrogen bonds''': Open the pop-up menu and scroll down to '''Style''' and then to '''Hydrogen Bonds''' option.

|-
|08:25
| '''The Hydrogen Bonds''' option in the Pop-up menu has features such as:

|-
|08:30
|'''Calculate''', '''Set Hydrogen Bonds Side Chain.'''

|-
|08:35
|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''
And also has options to change the thickness of the bonds.

|-
| 08:42
| Click on '''Calculate''' option to show the '''hydrogen bonds''' in the model.

|-
| 08:47
|The '''hydrogen bonds''' are displayed as white and red long dashes.

|-
| 08:53
| To change the thickness of '''hydrogen bonds''', Click on''' 0.10 A '''option from the''' pop-up-menu'''.

|-
| 09:02
|Now on the panel we can see thicker''' hydrogen bonds'''.

|-
|09:06
| We can also change the color of hydrogen bonds.

|-
| 09:11
| From the Pop-up-menu scroll down to '''Color''' then '''Hydrogen Bonds''' then click on '''orange''' option.

|-
| 09:20
| On the panel, we have all the '''hydrogen bonds''' in orange color.

|-
| 09:25
| '''Disulfide''' bonds, and sulphur atoms are shown in the model in yellow colour.

|-
|09:31
| To modify disulfide bonds open the option disulfide bonds in pop menu

|-
| 09:38
| Click on the features you may want to change like size and color etc.

|-
| 09:44
| Similarly try to open '''.pdb '''files of different '''enzymes '''and view their 3D structures.

|-
|09:51
| Let us summarize, in this tutorial we have learnt to:

|-
|09:57
|* To Load structures of protein from Protein Data Bank (PDB).

|-
|10:00
|* Download '''.pdb''' files from the database.

|-
|10:05
|* View 3D structure of Insulin using '''PDB code.'''

|-
|10:10
|* View '''Protein''' structure without water molecules.

|-
|10:14
|* Display secondary structure in various formats.

|-
|10:17
|* Highlight '''hydrogen bonds '''and '''disulfide bonds.'''

|-
|10:22
| Here is an assignment for you.

|-
|10:24
|* Download the '''.pdb''' file of '''Human Hemoglobin''' from '''PDB '''database.

|-
|10:31
|* Show secondary structure in '''cartoon '''display.

|-
|10:35
|* Highlight the “'''porphyrin'''” units of the '''protein'''.

|-
|10:39
|* Refer the following link for the '''PDB code.'''

|-
| 10:42
| Watch the video available at this URL.
[http://spoken-tutorial.org/What http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial

|-
|10:46
|It summarizes the Spoken Tutorial project

|-
|10:50
|If you do not have good bandwidth, you can download and watch it

|-
| 10:55
| The Spoken Tutorial Project Team:

|-
|10:57
|Conducts workshops using spoken tutorials

|-
|11:01
|Gives certificates to those who pass an on-line test

|-
|11:06
|For more details, please write to contact@spoken-tutorial.org

|-
| 11:13
| Spoken Tutorial Project is a part of the Talk to a Teacher project

|-
|11:18
|It is supported by the National Mission on Education through ICT, MHRD, Government of India

|-
|11:25
|More information on this Mission is available at this link [http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro] ]

|-
|11:31
|This is Snehalatha from IIT Bombay signing off. Thank you for joining.

|}

@@ Line 13: / Line 13: @@
 |-
 |00:09
-|*  '''Protein Data Bank (PDB).''' થી પ્રોટીનસ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.
+|  '''Protein Data Bank (PDB).''' થી પ્રોટીનસ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.
 |-
 |00:13
-|* '''.pdb ''' ડેટાબેસ થી  '''PDB'''  ફાઈલ્સ ડાઉનલોડ કરતા.
+| '''.pdb ''' ડેટાબેસ થી  '''PDB'''  ફાઈલ્સ ડાઉનલોડ કરતા.
 |-
 |00:18
-|* પ્રોટીન્સના સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર વિવિધ ફોર્મેટ્સમાં બતાવવા.
+| પ્રોટીન્સના સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર વિવિધ ફોર્મેટ્સમાં બતાવવા.
 |-
 |00:24
-|*   હાઇડ્રોજન બોન્ડસ અને ડાઈસલ્ફાઇડ બોન્ડને હાઈલાઈટ કરતા.
+|   હાઇડ્રોજન બોન્ડસ અને ડાઈસલ્ફાઇડ બોન્ડને હાઈલાઈટ કરતા.
@@ Line 43: / Line 43: @@
 |-
 | 00:46
-|*  ઉબુન્ટુ ઓપરેટીંગ સીસ્ટમ આવૃત્તિ 12.04
+|  ઉબુન્ટુ ઓપરેટીંગ સીસ્ટમ આવૃત્તિ 12.04
 |-
 |00:50
-|* '''Jmol''' આવૃત્તિ 12.2.2
+| '''Jmol''' આવૃત્તિ 12.2.2
 |-
 |00:54
-|* '''Java''' આવૃત્તિ 7
+| '''Java''' આવૃત્તિ 7
 |-
 |00:57
-|* '''Mozilla Firefox ''' બ્રાઉઝર 22.0
+| '''Mozilla Firefox ''' બ્રાઉઝર 22.0
 |-
@@ Line 63: / Line 63: @@
 |-
 |01:06
-|* '''Proteins'''  (પ્રોટીન્સ)અને  '''Macromolecules''' (મેક્રોમોલેક્યુલ્સ)
+| '''Proteins'''  (પ્રોટીન્સ)અને  '''Macromolecules''' (મેક્રોમોલેક્યુલ્સ)
 |-
 |01:10
-|* '''Nucleic acids, (ન્યુક્લીક એસીડ) DNA''' અને  '''RNA'''
+| '''Nucleic acids, (ન્યુક્લીક એસીડ) DNA''' અને  '''RNA'''
 |-
 |01:13
-|* '''ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર અને  પોલીમર્સ ''' જેમોલ એપ્લીકેશન નો ઉપયોગ કરીને કરી શકાય છે.
+| '''ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર અને  પોલીમર્સ ''' જેમોલ એપ્લીકેશન નો ઉપયોગ કરીને કરી શકાય છે.
 |-
@@ Line 139: / Line 139: @@
 |-
 | 02:54
-|* '''Primary Citation''' (પ્રાયમરી સાઇટેશન)
+| '''Primary Citation''' (પ્રાયમરી સાઇટેશન)
 |-
 | 02:56
-|* '''Molecular Description '''અને (મોલેક્યૂલર ડીસ્કરીપશન)
+| '''Molecular Description '''અને (મોલેક્યૂલર ડીસ્કરીપશન)
 |-
 |02:58
-|* '''Structure Validation''' (સ્ટ્રક્ચર વેલિડેશન) આ પુષ્ઠ પર ઉપલબ્ધ છે.
+| '''Structure Validation''' (સ્ટ્રક્ચર વેલિડેશન) આ પુષ્ઠ પર ઉપલબ્ધ છે.
 |-
@@ Line 355: / Line 355: @@
 |-
 |08:35
-|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''
+|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.'''અને બોન્ડ્સની જડાઈ બદલવા માટે પણ વિકલ્પ ધરાવે છે.
- અને બોન્ડ્સની જડાઈ બદલવા માટે પણ વિકલ્પ ધરાવે છે.
 |-
@@ Line 408: / Line 407: @@
 |-
 |09:57
-|* '''Protein Data Bank (PDB).''' થી પ્રોટીનસ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા
+| '''Protein Data Bank (PDB).''' થી પ્રોટીનસ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા
 |-
 |10:00
-|*  '''.pdb ''' ડેટાબેસ થી  '''PDB'''  ફાઈલ્સ ડાઉનલોડ કરતા.
+|  '''.pdb ''' ડેટાબેસ થી  '''PDB'''  ફાઈલ્સ ડાઉનલોડ કરતા.
 |-
 |10:05
-|*  '''PDB code.'''  વાપરીને  ઇન્સ્યુલીનના  3D  સ્ટ્રક્ચર ને જોતા.
+|  '''PDB code.'''  વાપરીને  ઇન્સ્યુલીનના  3D  સ્ટ્રક્ચર ને જોતા.
 |-
 |10:10
-|*  પાણીના પરમાણુ વગર  પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચરને જોતા
+|  પાણીના પરમાણુ વગર  પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચરને જોતા
 |-
 |10:14
-|*  સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર વિવિધ ફોર્મેટ્સમાં બતાવવા.
+|  સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર વિવિધ ફોર્મેટ્સમાં બતાવવા.
 |-
 |10:17
-|*  '''hydrogen bonds '''અને  '''disulfide bonds.''' ને હાઈલાઈટ કરતા.
+|  '''hydrogen bonds '''અને  '''disulfide bonds.''' ને હાઈલાઈટ કરતા.
 |-
@@ Line 436: / Line 435: @@
 |-
 |10:24
-|*  '''PDB '''ડેટાબેસ પરથી  '''Human Hemoglobin''' ની '''.pdb'''ફાઈલ ડાઉન લોડ કરો .
+|  '''PDB '''ડેટાબેસ પરથી  '''Human Hemoglobin''' ની '''.pdb'''ફાઈલ ડાઉન લોડ કરો .
 |-
 |10:31
-|* '''cartoon '''ડિસ્પ્લેમા સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર બતાઓ.
+| '''cartoon '''ડિસ્પ્લેમા સેકેન્ડરી સ્ટ્રક્ચર બતાઓ.
 |-
 |10:35
-|* પ્રોટીનના  “'''porphyrin'''” યુનિટને હાઈલાઈટ કરો.
+| પ્રોટીનના  “'''porphyrin'''” યુનિટને હાઈલાઈટ કરો.
 |-
 |10:39
-|* ''PDB code.''' માટે આપેલ લીનક નો સંદર્ભ લો
+| ''PDB code.''' માટે આપેલ લીનક નો સંદર્ભ લો
 |-

@@ Line 231: / Line 231: @@
 |-
 |  05:23
-| સ્ક્રોલ ડાઉન કરીને  '''add hydrogens'''  વિકલ્પ  ક્લિક કરો.
+| સ્ક્રોલ ડાઉન કરીને  '''add hydrogens'''  વિકલ્પ પસંદ ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 251: / Line 251: @@
 |-
 | 05:48
-| સબ મેનુમાંથી  '''Hetero''' (હેટરો) પસંદ કરો '''“All Water'''  વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
+| સબ મેનુમાંથી  '''Hetero''' (હેટરો) પસંદ કરો '''“All Water'''  વિકલ્પ પસંદ  કરો.
 |-
 | 05:55
-| ફરીથી પોપ અપ મેનુ ને ખોલો  '''Style''', '''Scheme ''' પર જાઓ અને  '''CPK spacefill ''' વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
+| ફરીથી પોપ અપ મેનુ ને ખોલો  '''Style''', '''Scheme ''' પર જાઓ અને  '''CPK spacefill ''' વિકલ્પ પસંદ  કરો.
 |-
@@ Line 263: / Line 263: @@
 |-
 | 06:11
-|  પોપ અપ મેનુ ને ફરીથી ખોલો અને  '''Style''' પર જાઓ '''Atoms ''' માટે સ્ક્રોલ કરો અને '''Off ''' વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
+|  પોપ અપ મેનુ ને ફરીથી ખોલો અને  '''Style''' પર જાઓ '''Atoms ''' માટે સ્ક્રોલ કરો અને '''Off ''' વિકલ્પ પસંદ  કરો.
 |-
@@ Line 291: / Line 291: @@
 |-
 |  06:50
-|સબ મેનુ આપેલ વિકલ્પો સાથે ખુલે છે જેમકે '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace, etc. '''
+|સબ મેનુ આપેલ વિકલ્પો સાથે ખુલે છે જેમકે '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace, વગેરે. '''
 |-
@@ Line 347: / Line 347: @@
 |-
 |08:25
-|   પોપ -અપ મેનુમા '''The Hydrogen Bonds''' વિકલ્પ ઘણા ફીચર ધરાવે છે જેમકે
+|   પોપ -અપ મેનુમા ''' Hydrogen Bonds''' વિકલ્પ ઘણા ફીચર ધરાવે છે જેમકે
 |-
@@ Line 364: / Line 364: @@
 |-
 |  08:47
-|The '''hydrogen bonds''' સફેદ અને લાલ લાંબા ડેશેસ ના જેવું દેખાય છે.
+| '''hydrogen bonds''' સફેદ અને લાલ લાંબા ડેશેસ ના જેવું દેખાય છે.
 |-
@@ Line 380: / Line 380: @@
 |-
 | 09:11
-| પોપ -અપ મેનુમા સ્ક્રોલ કરી '''Color''' અને પછી '''Hydrogen Bonds'''  પસંદ કરીને   '''orange'''  વિકલ્પ પસંદ કરો.
+| પોપ -અપ મેનુમા સ્ક્રોલ કરી '''Color''' અને  '''Hydrogen Bonds'''  પસંદ કરીને   '''orange'''  વિકલ્પ પસંદ કરો.
 |-
@@ Line 388: / Line 388: @@
 |-
 | 09:25
-| ડિસલ્ફાઇડ બોન્ડ્સ અને સલ્ફર પરમાણુ મોડેલમાં પીડા રંગમા દેખાય છે.
+|  ડાઈસલ્ફાઇડ બોન્ડ્સ અને સલ્ફર પરમાણુ મોડેલમાં પીડા રંગમા દેખાય છે.
 |-
 |09:31
-| ડિસલ્ફાઇડ  બોન્ડમા સુધારા કરવા માટે પોપ-અપ  મેનુમાં '''disulfide bonds'''  વિકલ્પને ખોલો
+| ડાઈસલ્ફાઇડ  બોન્ડમા સુધારા કરવા માટે પોપ-અપ  મેનુમાં '''disulfide bonds'''  વિકલ્પને ખોલો
 |-
@@ Line 465: / Line 465: @@
 |-
 | 10:55
-| Tસ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટીમ:
+| સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટીમ:
 |-

@@ Line 123: / Line 123: @@
 |-
 | 02:36
-| ઉદાહરણ તરીકે, ''' Human Insulin''' with a code '''4EX1.''' કોડ સાથે  '''Human''' ''' ઇન્સ્યુલીન ને પસંદ કરો.
+| ઉદાહરણ તરીકે,  '''4EX1.''' કોડ સાથે  '''Human''' ''' ઇન્સ્યુલીન ને પસંદ કરો.
 |-
@@ Line 211: / Line 211: @@
 |-
 |  04:52
-|  '''4EX1.pdb.gz''' fપસંદ કરો અને  '''open''' બટન પર ક્લિક કરો.
+|  '''4EX1.pdb.gz''' પસંદ કરો અને  '''open''' બટન પર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 231: / Line 231: @@
 |-
 |  05:23
-| સ્ક્રોલ ડાઉન કરીને  '''add hydrogens'''  વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
+| સ્ક્રોલ ડાઉન કરીને  '''add hydrogens'''  વિકલ્પ  ક્લિક કરો.
 |-