Kaushik Datta at 20:35, 24 November 2014

2014-11-24T20:35:07Z

Kaushik Datta at 20:34, 24 November 2014

2014-11-24T20:34:20Z

Kaushik Datta: Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 |'''Proteins''' এবং '''Macromolecules''' এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্..."

2014-09-24T07:50:25Z

Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 |'''Proteins''' এবং '''Macromolecules''' এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্..."

New page

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''

|-
| 00:01
|'''Proteins''' এবং '''Macromolecules''' এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।

|-
| 00:06
| এই টিউটোরিয়ালে আমরা শিখব:

|-
|00:09
|'''Protein Data Bank''' (PDB) থেকে প্রোটিন লোড করা।

|-
|00:13
|'''PDB''' ডাটাবেস থেকে '''.pdb''' ফাইল ডাউনলোড করা।

|-
|00:18
|বিভিন্ন ফরম্যাটে প্রোটিনের গৌণ কাঠামো প্রদর্শন করা।

|-
|00:24
|হাইড্রোজেন এবং ডাইসালফেট বন্ধন লক্ষনীয় করা।

|-
|00:29
| টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে '''Jmol''' অ্যাপ্লিকেশন উইন্ডো থেকে মৌলিক অপারেশন সম্পর্কে জানতে হবে।

|-
|00:37
|না হলে, নিম্নলিখিত লিঙ্ক থেকে প্রাসঙ্গিক টিউটোরিয়াল দেখুন।

|-
| 00:42
|টিউটোরিয়ালটি রেকর্ড করতে

|-
| 00:46
|উবুন্টু '''OS''' সংস্করণ '''12.04''',

|-
|00:50
|'''Jmol''' সংস্করণ '''12.2.2'''

|-
|00:54
|জাভা সংস্করণ '''7'''

|-
|00:57
|মোজিলা ফায়ারফক্স ব্রাউজার '''22.0''' ব্যবহার করছি।

|-
| 01:02
|বড় জৈব অণুর গাঠনিক বিশ্লেষণ যেমন:

|-
|01:06
|'''Proteins''' এবং '''macromolecules'''

|-
|01:10
|'''Nucleic acids''' (DNA এবং RNA)

|-
|01:13
|'''Crystal structures''' এবং '''Polymers, Jmol''' ব্যবহার করে করা যেতে পারে।

|-
| 01:19
|এখানে আমি একটি নতুন '''Jmol''' উইন্ডো খুলেছি।

|-
| 01:24
|জৈব অণুর '''3D''' কাঠামো ডাটাবেস থেকে সরাসরি ডাউনলোড করে দেখা যাবে।

|-
| 01:29
| এটি করতে, '''File''' মেনুতে গিয়ে, '''Get PDB''' তে টিপুন।

|-
| 01:36
| পর্দায় '''Input''' ডায়ালগ বাক্স খোলে।

|-
| 01:40
|আমাদের '''Input''' বাক্সে, নির্দিষ্ট প্রোটিনের জন্য চার অক্ষরের PDB কোড লিখতে হবে।

|-
| 01:48
| এই কোড '''Protein Data Bank''' (PDB) ওয়েবসাইট থেকে পাওয়া যাবে।

|-
| 01:53
| এটি হল '''Protein Data Bank''' এর ওয়েব পেজ।

|-
| 01:57
|এতে জৈব অণু সম্পর্কে তথ্য রয়েছে, যেমন প্রোটিন এবং নিউক্লিক অ্যাসিড।

|-
| 02:04
| উদাহরণরূপে: '''PDB''' ওয়েবসাইট থেকে '''Pancreatic Enzyme Insulin''' এর '''PDB''' কোড খোঁজার চেষ্টা করি।

|-
|02:13
| সার্চ বাক্সে প্রোটিনের নাম লিখুন '''Human Insulin'''. কীবোর্ডের '''Enter''' কী টিপুন।

|-
| 02:24
| এখন, প্রদর্শিত ওয়েব পেজে, নীচে স্ক্রোল করুন।

|-
| 02:28
| '''PDB''' কোডের সাথে পরিচিত '''Human Insulin''' এর কাঠামোর তালিকা পর্দায় প্রদর্শিত হয়।

|-
| 02:36
| উদাহরণস্বরূপ, '''Human Insulin''' এর সাথে কোড '''4EX1''' নির্বাচন করুন।

|-
| 02:44
|প্রোটিন নামের উপর টিপুন।

|-
| 02:47
| কাঠামোর সকল বিবরণের সাথে একটি উইন্ডো খোলে।

|-
| 02:52
| এই পৃষ্ঠায়
|-
| 02:54
| '''Primary Citation'''

|-
| 02:56
|'''Molecular Description''' এবং

|-
|02:58
|'''Structure Validation''' উপলব্ধ।

|-
| 03:02
| আমরা '''.pdb''' ফাইল হিসাবে প্রোটিনের কাঠামো সংরক্ষণ করে তা '''Jmol''' এ '''3D''' মোডে দেখতে পারি।

|-
| 03:12
| '''Download Files''' লিঙ্কে টিপুন, যা পৃষ্ঠার উপরের ডান দিকের কোণায় অবস্থিত।

|-
| 03:20
| ড্রপ ডাউন মেনু থেকে '''PDB file''' (gz) বিকল্প নির্বাচন করুন।

|-
| 03:28
|পর্দায় একটি ডায়লগ বাক্স খোলে।

|-
| 03:32
|'''Save file''' বিকল্প নির্বাচন করুন।

|-
|03:35
|'''OK''' বোতামে টিপুন।

|-
| 03:39
| প্রোটিনের কাঠামো '''Downloads''' ফোল্ডারে '''4EX1.pdb.gz''' হিসাবে সংরক্ষিত হবে।

|-
| 03:51
| একইভাবে, আপনি বিভিন্ন প্রোটিনের প্রয়োজনীয় '''.pdb''' ফাইল ডাউনলোড করে তা পৃথক ফাইলে সংরক্ষণ করতে পারেন।

|-
| 04:02
| এখন, '''Jmol''' উইন্ডোতে গিয়ে ইনসুলিলের '''3D''' কাঠামো দেখুন।

|-
|04:09
| ইন্টারনেট থাকলে সরাসরি '''Jmol''' প্যানেলে প্রোটিনের কাঠামো ডাউনলোড করতে পারেন।

|-
| 04:15
| টেক্সট বাক্সে '''4''' অক্ষরের '''PDB''' কোড '''“4EX1”''' লিখুন এবং '''OK''' বোতামে টিপুন।

|-
| 04:25
| আপনি ইন্টারনেটের সাথে সংযুক্ত থাকলে টুল বারে '''Open a File''' আইকনে টিপুন।

|-
| 04:34
| প্যানেলে একটি ডায়লগ বাক্স খোলে।

|-
| 04:38
|'''4EX1.pdb.gz''' ফাইলের স্থানে যান অর্থাৎ '''Downloads '''ফোল্ডারে।

|-
| 04:47
|'''Downloads''' ফোল্ডার নির্বাচন করে '''Open''' বোতামে টিপুন।

|-
| 04:52
|'''4EX1.pdb.gz''' ফাইল নির্বাচন করে '''Open''' বোতামে টিপুন।

|-
| 05:00
| পর্দায় ইনসুলিলের '''3D''' কাঠামো খোলে।

|-
| 05:05
| প্যানেলে প্রোটিনের ডিফল্ট ডিসপ্লে হল, '''"Ball and Stick"'''.

|-
| 05:12
| প্যানেলে হাইড্রোজেন পরমাণু ছাড়া প্রোটিন মডেল খোলে।

|-
| 05:17
| হাইড্রোজেন পরমাণুর সাথে মডেল প্রদর্শন করতে '''model kit''' মেনু খুলুন।

|-
| 05:23
|স্ক্রোল করে '''add hydrogens''' এ গিয়ে এটিতে টিপুন।

|-
| 05:28
| এখন প্রোটিন মডেল প্যানেলে হাইড্রোজেন পরমাণু সহ খোলে।
|-
| 05:33
| প্রোটিনের কাঠামোতে জলের অণুও দেখায়।

|-
| 05:38
| জলের অণু বাদ দিতে, নিম্ন পদক্ষেপ অনুসরণ করুন।

|-
| 05:43
| প্রথমে পপ আপ মেনু খুলুন এবং '''Select''' এ যান।

|-
| 05:48
| সাব মেনু থেকে, '''Hetero''' নির্বাচন করুন এবং '''"All Water"''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 05:55
| আবার পপ আপ মেনু খুলুন, '''Style''' এ যান এবং '''"CPK spacefill"''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 06:05
|এটি সকল জলের অনু '''CPK Spacefill''' ডিসপ্লে তে রূপান্তর করবে।

|-
| 06:11
| আবার পপ আপ মেনু খুলুন এবং '''Style''' এ স্ক্রোল করে '''Atoms''' এ যান এবং '''Off''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 06:22
| এখন প্যানেলে কোনো জলের অণু ছাড়া ইনসুলিনের কাঠামো রয়েছে।

|-
| 06:27
| এরপর বিভিন্ন ফরম্যাটে প্রোটিনের গৌণ কাঠামো প্রদর্শন করা শিখি।

|-
| 06:35
|পপ আপ মেনু খুলুন।

|-
| 06:37
| '''Select''' বিকল্পে যান।

|-
| 06:39
| '''Protein''' এ স্ক্রোল করুন এবং '''All''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 06:44
|আবার পপ আপ মেনু খুলুন এবং তারপর নীচে '''Style''' এ স্ক্রোল করে '''Scheme''' এ যান।

|-
| 06:50
|একটি সাব মেনু খোলে যেখানে বিকল্পগুলি হল '''CPK Spacefill, Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace''' ইত্যাদি।

|-
|07:02
|সাব মেনু থেকে '''Cartoon''' বিকল্পে টিপুন।

|-
|07:07
| এটি প্রোটিনের গৌণ কাঠামো প্রদর্শন করে যেমন '''helices, random coils, strands, sheets''' ইত্যাদি।

|-
| 07:17
| আরো ডিসপ্লে বিকল্পের জন্য,

|-
| 07:19
| পপ আপ মেনু খুলুন এবং '''Style''' এ স্ক্রোল করে '''Structures''' এ যান।

|-
| 07:25
| এখানে প্রোটিনের গৌণ কাঠামো প্রদর্শন করার আরো অনেক বিকল্প দেখি।

|-
| 07:31
| উদাহরণস্বরূপ '''Strands''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 07:35
| প্রোটিন এখন প্যানেলে '''Strands''' রূপে প্রদর্শিত হয়েছে।

|-
| 07:40
| ডিসপ্লের রঙ পরিবর্তন করতে, পপ আপ মেনু খুলুন। '''Color''' এ স্ক্রোল করে '''Atoms''' নির্বাচন করুন এবং '''Blue''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 07:52
| প্যানেলের রঙের পরিবর্তন লক্ষ্য করুন।

|-
| 07:56
|কাঠামো আবার '''Ball and Stick''' এ রূপান্তর করতে,
|-
| 07:59
| পপ আপ মেনু নির্বাচন করুন, '''Style''' এ গিয়ে '''Scheme''' নির্বাচন করে তারপর '''Ball and stick''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 08:08
|আমরা প্রোটিন মডেলে হাইড্রোজেন এবং ডাই-সালফাইড বন্ধন ও লক্ষনীয় করতে পারি।

|-
| 08:14
| হাইড্রোজেন বন্ধন প্রদর্শন করতে: পপ আপ মেনু খুলুন এবং নীচে '''Style '''এ স্ক্রোল করে '''Hydrogen Bonds''' বিকল্পে যান।

|-
|08:25
| পপ আপ মেনুতে হাইড্রোজেন বন্ধনের নিম্ন বৈশিষ্ট্য রয়েছে:

|-
|08:30
|'''Set Hydrogen Bonds Side Chain.'''

|-
|08:35
|'''Set Hydrogen Bonds in the Backbone.''' এবং এছাড়াও বন্ধনের বেধ পরিবর্তন করার বিকল্প রয়েছে।

|-
| 08:42
| মডেলে হাইড্রোজেন বন্ধন দেখাতে '''Calculate''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 08:47
|হাইড্রোজেন বন্ধন সাদা এবং লাল দীর্ঘ ড্যাশ হিসাবে প্রদর্শিত হয়েছে।

|-
| 08:53
| হাইড্রোজেন বন্ধনের বেধ বদলাতে পপ আপ মেনু থেকে '''0.10 A''' (অন্গস্ত্রম) বিকল্পে টিপুন।

|-
| 09:02
|এখন আমরা প্যানেলে ঘন হাইড্রোজেন বন্ধন দেখি।

|-
|09:06
| আমরা হাইড্রোজেন বন্ধনের রঙ ও বদলাতে পারি।

|-
| 09:11
| পপ আপ মেনু থেকে নীচে '''Color''' এ স্ক্রোল করে '''Hydrogen Bonds''' এ গিয়ে '''Orange''' বিকল্পে টিপুন।

|-
| 09:20
| প্যানেলে, সকল হাইড্রোজেন বন্ধন কমলা রঙে রয়েছে।

|-
| 09:25
| ডাইসালফাইড বন্ধন এবং সালফার পরমাণু মডেলে হলুদ রঙে দেখানো হয়েছে।

|-
|09:31
| ডাইসালফাইড বন্ধন পরিবর্তন করতে পপ মেনুতে '''Disulfide Bonds''' বিকল্প খুলুন।

|-
| 09:38
| আপনার পছন্দমত বিকল্পে টিপুন যেমন আকার, রঙ ইত্যাদি।

|-
| 09:44
| একইভাবে বিভিন্ন এনজাইমের '''.pdb''' ফাইল খুলুন এবং তাদের '''3D''' কাঠামো দেখুন।

|-
|09:51
| সংক্ষেপে, এই টিউটোরিয়ালে আমরা শিখেছি:

|-
|09:57
|'''Protein Data Bank''' (PDB) থেকে প্রোটিনের কাঠামো লোড করা।

|-
|10:00
|ডাটাবেস থেকে '''.pdb''' ফাইল ডাউনলোড করা।

|-
|10:05
|'''PDB''' কোড ব্যবহার করে ইনসুলিনের '''3D''' কাঠামো দেখা।

|-
|10:10
|জলের অণু ছাড়া প্রোটিনের কাঠামো দেখা।

|-
|10:14
|বিভিন্ন ফরম্যাটে গৌণ কাঠামো দেখা

|-
|10:17
|হাইড্রোজেন এবং ডাইসালফাইড বন্ধন লক্ষনীয় করা।

|-
|10:22
| নির্দেশিত কাজ হল:

|-
|10:24
|PDB ডাটাবেস থেকে মানব হিমোগ্লোবিলের '''.pdb''' ফাইল ডাউনলোড করা।

|-
|10:31
|'''Cartoon''' ডিসপ্লেতে গৌণ কাঠামো দেখানো।

|-
|10:35
|প্রোটিনের '''"Porphyrin"''' (পরফিরিন) ইউনিট লক্ষনীয় করা।

|-
|10:39
|'''PDB''' কোডের জন্য নিম্ন লিঙ্কে যান।

|-
| 10:42
| এই লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, '''http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_ Tutorial'''

|-
|10:46
|এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে বোঝায়।

|-
|10:50
|ভাল ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন।

|-
| 10:55
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল

|-
|10:57
|কর্মশালার আয়োজন করে।

|-
|11:01
|অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়।

|-
|11:06
|বিস্তারিত তথ্যের জন্য '''contact@spoken-tutorial.org''' তে ইমেল করুন।

|-
| 11:13
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প '''Talk to a Teacher''' প্রকল্পের অংশবিশেষ।

|-
|11:18
|এটি ভারত সরকারের '''ICT, MHRD''' এর জাতীয় শিক্ষা মিশন দ্বারা সমর্থিত।

|-
|11:25
|এই বিষয়ে বিস্তারিত তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য, '''http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro'''

|-
|11:31
|আমি কৌশিক দত্ত টিউটোরিয়ালটি অনুবাদ করেছি। ধন্যবাদ।

@@ Line 65: / Line 65: @@
 |-
 |01:10
-|'''Nucleic acids''' (DNA এবং RNA)
+|'''Nucleic acids''' ('''DNA''' এবং '''RNA''')
 |-

Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Bengali - Revision history

Kaushik Datta at 20:35, 24 November 2014

Kaushik Datta at 20:34, 24 November 2014

Kaushik Datta: Created page with "{| border=1 |'''Time''' | '''Narration''' |- | 00:01 |'''Proteins''' এবং '''Macromolecules''' এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্..."