GChemPaint/C2/Formation-of-Bonds/Gujarati - Revision history

PoojaMoolya at 10:18, 27 February 2017

2017-02-27T10:18:29Z

Jyotisolanki at 06:44, 11 September 2014

2014-09-11T06:44:07Z

Jyotisolanki at 09:47, 2 September 2014

2014-09-02T09:47:32Z

Show changes

Jyotisolanki at 07:35, 2 September 2014

2014-09-02T07:35:50Z

Show changes

Jyotisolanki at 06:29, 2 September 2014

2014-09-02T06:29:51Z

Show changes

Jyotisolanki: Created page with 'Title of the tutorial: Formation-of-Bonds Author: Madhuri Ganapathi Key words: Video tutorial, Add bonds to the existing bond, Orient bonds, Add Stereochemical bonds and Invers…'

2014-09-02T05:22:32Z

Created page with 'Title of the tutorial: Formation-of-Bonds Author: Madhuri Ganapathi Key words: Video tutorial, Add bonds to the existing bond, Orient bonds, Add Stereochemical bonds and Invers…'

New page

Title of the tutorial: Formation-of-Bonds

Author: Madhuri Ganapathi

Key words: Video tutorial, Add bonds to the existing bond, Orient bonds, Add Stereochemical bonds and Inverse wedge hashes GChemPaint tools- Add a bond or change the multiplicity of an existing one, Add a wedge bond, Add a hash bond, Add a squiggle bond and Add a fore bond.

{|border=1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
|00:00
|Hello everyone.

|-
|00:02
|Welcome the tutorial on '''Formation of bonds''' in '''GChemPaint.'''

|-
|00:07
|In this tutorial, we will learn to,

|-
|00:10
|* Add bonds to the existing bond

|-
|00:13
|* Orient the bonds

|-
|00:15
|* Add Stereochemical bonds and

|-
|00:18
|* Inverse wedge hashes

|-
|00:21
|Here I am using '''Ubuntu Linux''' OS version. 12.04

|-
|00:27
|'''GChemPaint''' version 0.12.10

|-
|00:33
|To follow this tutorial you should be familiar with,

|-
|00:37
|'''GChemPaint''' chemical structure editor.

|-
|00:40
|If not, for relevant tutorials, please visit our website.

|-
|00:46
|I have opened a new '''GChemPaint''' application with '''Ethane''' structure.

|-
|00:51
|Let us learn to convert '''Saturated Hydrocarbons''' to '''Unsaturated Hydrocarbons'''.

|-
|00:58
|Let us copy the '''Ethane''' structure and paste it twice on the '''Display area'''.

|-
|01:05
|Click on '''Select one or more objects''' tool

|-
|01:08
|Click on '''Ethane''' structure to select it.

|-
|01:11
|Press '''CTRL +C''' to copy the structure

|-
|01:14
|and Press '''CTRL + V''' to paste the structures.

|-
|01:19
|Observe that two structures overlap each other.

|-
|01:23
|Let's move the second overlapping structure aside.

|-
|01:27
|Place the cursor on the structure and drag it with the mouse.

|-
|01:33
|Observe the single bond between the carbon atoms in the structures.

|-
|01:40
|Let's first convert single bond to a double bond.

|-
|01:44
|Click on '''Add a bond or change the multiplicity of an existing one''' tool.

|-
|01:51
|Click on the existing bond of the second ''' Ethane''' structure.

|-
|01:55
|Observe that Single bond is converted to a double bond.

|-
|02:00
|Number of '''Hydrogen''' atoms reduced from 6 to 4.

|-
|02:06
|The new structure is '''Ethene'''.

|-
|02:09
|Next let's convert the single bond to a triple bond.

|-
|02:14
|Click on the existing bond of the third '''Ethane''' structure twice.

|-
|02:20
|Observe that Single bond is converted to a triple bond.

|-
|02:25
|Number of hydrogen atoms reduced from 6 to 2.

|-
|02:30
|The new structure is '''Ethyne'''.

|-
|02:34
|Let us write the names of the structures.

|-
|02:37
|Click on '''Add or modify a text''' tool

|-
|02:41
|Click below the structures.

|-
|02:43
|Enter the names of the structures as '''Ethane, Ethene''' and '''Ethyne'''.

|-
|02:53
|Next, let us learn about '''Tetrahedral geometry'''.

|-
|02:57
|Let's move the structures to a side.

|-
|03:00
|Press '''CTRL+A''' to select all objects.

|-
|03:03
|Click on '''Select one or more objects''' tool and drag the structures.

|-
|03:10
|Here is a slide for the '''Tetrahedral Methane''' structure.

|-
|03:14
|All the bond lengths are equal to 1.09 '''angstrom'''.

|-
|03:19
|In '''Tetrahedral methane''' structure, all the bond angles are equal to '''109.5 degree.'''

|-
|03:31
|Now, let's draw '''Tetrahedral''' ''' Ethane''' structure.

|-
|03:35
|Click on '''Add a bond or change the multiplicity of existing one''' tool.

|-
|03:41
|Click on the '''Display area.'''

|-
|03:43
|Orient the bond in horizontal direction.

|-
|03:47
|On each edge of the bond let us draw three bonds.

|-
|03:51
|Orient the bonds to form a '''Tetrahedral geometry'''.

|-
|03:55
|Click on each edge. Then orient the three bonds in different directions.

|-
|04:02
|Likewise let us draw on the other edge.

|-
|04:07
|Let us attach hydrogen atoms at the ends.

|-
|04:10
|To attach '''Hydrogen''' atoms to the ends, Press capital '''H.'''

|-
|04:16
|A submenu opens in which we will select '''H'''.

|-
|04:21
|Observe that '''Hydrogen''' atom appears in the tool box.

|-
|04:26
|Click on '''Add or modify an atom''' tool.

|-
|04:29
|Click on all the positions to add '''hydrogen''' atoms.

|-
|04:37
|Now let us add '''Stereochemical''' bonds to '''Ethane''' structure.

|-
|04:42
|'''Stereochemical''' bonds available in the tool box are,

|-
|04:46
|* '''Add a wedge bond,'''

|-
|04:48
|* '''Add a hash bond,'''

|-
|04:50
|* '''Add a squiggle bond'''

|-
|04:53
|* and '''Add a fore bond'''.

|-
|04:55
|Let us use '''Add a wedge bond''' to convert '''Ethane''' to a "Stereochemical" structure.

|-
|05:03
|Click on '''Add a wedge bond'''.

|-
|05:05
|Then click on all the bonds.

|-
|05:10
|Observe the changes.

|-
|05:13
|Click on '''Add a hash bond'''

|-
|05:15
|and then click on the '''Display area'''.

|-
|05:19
|Now I will explain about '''Invert wedge hashes'''.

|-
|05:25
|Go to '''Edit''' menu, navigate to '''Preferences''' and click on it.

|-
|05:31
|'''GChemPaint Preferences''' window opens.

|-
|05:34
|Click on '''Invert wedge hashes''' checkbox.

|-
|05:38
|If set, the '''wedge hashes''' bonds will follow the usual convention.

|-
|05:43
|Narrow end is at the start of the bond and broad end is at the other end.

|-
|05:50
|This helps to visualize the bond correctly.

|-
|05:55
|Default convention in '''GChemPaint''' is inverse, because it is more consistent with the perspective rules.

|-
|06:05
|Observe the changes in the '''Hash''' bond.

|-
|06:09
|Let us click on '''Close''' button to close the window.

|-
|06:13
|Let us change the bonds to '''Add a hash bond''' in the '''Ethane''' structure.

|-
|06:18
|Click on '''Add a hash bond'''

|-
|06:21
|Click on all the bonds.

|-
|06:27
|Let us now save the file.

|-
|06:30
|Click on '''Save the current file''' icon on the toolbar

|-
|06:34
|'''Save as''' dialog box opens.

|-
|06:37
|Enter the file name as '''Formation of bond '''

|-
|06:41
|Click on Save button.

|-
|06:44
|Let's summarise.

|-
|06:46
|In this tutorial we have learnt to,

|-
|06:49
|* Add bonds to the existing bond

|-
|06:52
|* Orient the bonds

|-
|06:54
|* Add Stereochemical bonds

|-
|06:56
|* and Inverse wedge hashes

|-
|07:00
|As an assignment,

|-
|07:01
|* Convert '''Propane''' to '''Propyne'''

|-
|07:04
|* Draw '''Propane''' and '''butane''' structures

|-
|07:07
|* Show the '''stereochemical bonds.'''

|-
|07:11
|Your completed assignment should look like this.

|-
|07:16
|Watch the video available at this URL '''http://spoken-tutorial.org /What_a_Spoken_Tutorial'''

|-
|07:19
|It summarises the Spoken Tutorial project

|-
|07:23
|If you do not have good bandwidth, you can download and watch it

|-
|07:28
|The Spoken Tutorial Project Team Conducts workshops using spoken tutorials

|-
|07:33
|Gives certificates to those who pass an online test

|-
|07:36
|For more details, please write to '''contact@spoken-tutorial.org'''

|-
|07:42
|Spoken Tutorial Project is a part of the Talk to a Teacher project

|-
|07:47
|It is supported by the National Mission on Education through ICT, MHRD,Government of India

|-
|07:54
|More information on this Mission is available at this link '''http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro'''

|-
|08:00
|Animation is done by '''Udhaya Chandrika.'''

|-
|08:02
|This is '''Madhuri Ganpathi''' from '''IIT Bombay''' signing off. Thank you for joining.

|-

@@ Line 23: / Line 23: @@
 |-
 |00:10
-|*  મોજુદ બોન્ડમા બોન્ડ ઉમેરતા.
+| મોજુદ બોન્ડમા બોન્ડ ઉમેરતા.
 |-
 |00:13
-|* બોન્ડ્સ ની સ્થિતિ નિર્ધારિત કરતા
+|બોન્ડ્સ ની સ્થિતિ નિર્ધારિત કરતા
 |-
 |00:15
-|* '''Stereochemical bonds''' (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) ઉમેરતા અને
+|'''Stereochemical bonds''' (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) ઉમેરતા અને
 |-
 |00:18
-|* '''Inverse wedge hashes''' (ઇન્વર્સ વેજ હેશીસ)
+| '''Inverse wedge hashes''' (ઇન્વર્સ વેજ હેશીસ)
 |-
@@ Line 67: / Line 67: @@
 |-
 |00:58
-|  ઈથેન સ્ટ્રક્ચરને કોપી અને ડિસ્પ્લે એરિયા પર બે વખત પેસ્ટ કરો.
+| ઈથેન સ્ટ્રક્ચરને કોપી અને ડિસ્પ્લે એરિયા પર બે વખત પેસ્ટ કરો.
 |-
 |01:05
-|  '''Select one or more objects''' ટૂલ પર ક્લિક કરો.
+| '''Select one or more objects''' ટૂલ પર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 129: / Line 129: @@
 | આગળ ચાલો સિંગલ બોન્ડને ત્રિવિધ બોન્ડ મા બદલીએ.
 |-
 |02:14
@@ Line 188: / Line 187: @@
 |-
 |03:19
-|  '''Tetrahedral methane''' (ટેટ્રાહેડ્રલ મીથેન ) સ્ટ્રક્ચરમાં બધા બોન્ડના ખૂણા  '''109.5 degree.''' છે.
+| '''Tetrahedral methane''' (ટેટ્રાહેડ્રલ મીથેન ) સ્ટ્રક્ચરમાં બધા બોન્ડના ખૂણા  '''109.5 degree.''' છે.
 |-
 |03:31
-|   '''Tetrahedral'''  ''' Ethane'''  (ટેટ્રાહેડ્રલ ઈથેન ) સ્ટ્રક્ચર દોરીએ.
+| '''Tetrahedral'''  ''' Ethane'''  (ટેટ્રાહેડ્રલ ઈથેન ) સ્ટ્રક્ચર દોરીએ.
 |-
@@ Line 256: / Line 255: @@
 |-
 |04:46
-|* '''Add a wedge bond,''' (એડ અ વેજ્ડ બોન્ડ)
+| '''Add a wedge bond,''' (એડ અ વેજ્ડ બોન્ડ)
 |-
 |04:48
-|* '''Add a hash bond,''' (એડ અ હેશ બોન્ડ)
+| '''Add a hash bond,''' (એડ અ હેશ બોન્ડ)
 |-
 |04:50
-|* '''Add a squiggle bond''' (એડ અ સ્યુઈગલ બોન્ડ)
+|'''Add a squiggle bond''' (એડ અ સ્યુઈગલ બોન્ડ)
 |-
 |04:53
-|* અને  '''Add a fore bond'''. (એડ અ ફોર બોન્ડ)
+| અને  '''Add a fore bond'''. (એડ અ ફોર બોન્ડ)
-−
 |-
@@ Line 275: / Line 273: @@
 | ચાલો ઈથેન ને સ્ટિરીયોકેમિકલ મા બદલવા માટે '''Add a wedge bond,''' (એડ અ વેજ્ડ બોન્ડ) નો ઉપયોગ કરીએ.
 |-
 |05:03
@@ Line 315: / Line 312: @@
 |05:38
 |  જો સેટ છે, તો વેજ્ડ હેશીસ  બોન્ડ, આપેલ કન્વેન્શન ને અનુસરસે.
 |-
@@ Line 379: / Line 375: @@
 |-
 |06:49
-|* મોજુદ બોન્ડમા બોન્ડ ઉમેરતા.
+| મોજુદ બોન્ડમા બોન્ડ ઉમેરતા.
 |-
 |06:52
-|* બોન્ડ્સ ની સ્થિતિ નિર્ધારિત કરતા
+| બોન્ડ્સ ની સ્થિતિ નિર્ધારિત કરતા
 |-
 |06:54
-|*  '''Stereochemical bonds''' (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) ઉમેરતા
+| '''Stereochemical bonds''' (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) ઉમેરતા
 |-
 |06:56
-|* અને  '''Inverse wedge hashes''' (ઇન્વર્સ વેજ હેશીસ)
+|અને  '''Inverse wedge hashes''' (ઇન્વર્સ વેજ હેશીસ)
 |-
 |07:00
-|અસાઇનમેન્ટ છે,
+|અસાઇનમેન્ટ છે, '''Propane''' (પ્રોપેન ) ને '''Propyne''' (પ્રોપાઈન) થી બદલો.
-−
-|-
-|07:01
-|*  '''Propane''' (પ્રોપેન ) ને '''Propyne''' (પ્રોપાઈન) થી બદલો.
 |-
 |07:04
-|* '''Propane'''  (પ્રોપેન )  અને  '''butane''' (બ્યુટેન) સ્ટ્રક્ચર દોરો.
+|'''Propane'''  (પ્રોપેન )  અને  '''butane''' (બ્યુટેન) સ્ટ્રક્ચર દોરો.
 |-
 |07:07
-|* '''stereochemical bonds.'''  (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) પ્રદશિત કરો.
+|'''stereochemical bonds.'''  (સ્ટીરીઓ કેમિકલ બોન્ડ ) પ્રદશિત કરો.
 |-
@@ Line 454: / Line 446: @@
 |-
 |08:02
 |જોડાવા બદલ આભાર.
-|-

@@ Line 47: / Line 47: @@
 |-
 |00:33
-|Tઆ ટ્યુટોરીયલનાં અનુસરણ માટે તમે પરિચિત હોવા જોઈએ ,
+|આ ટ્યુટોરીયલનાં અનુસરણ માટે તમે પરિચિત હોવા જોઈએ ,
 |-
@@ Line 55: / Line 55: @@
 |-
 |00:40
-|જો નથી , સંદર્ભિત ટ્યુટોરીયલો માટે, કૃપા કરી અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.
+|જો નથી , સંદર્ભિત ટ્યુટોરીયલો માટે, અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.
 |-
@@ Line 67: / Line 67: @@
 |-
 |00:58
-|  ઈથેન સ્ટ્રક્ચરને કોપી કરો અને ડિસ્પ્લે એરિયા પર બે વખત પેસ્ટ કરો.
+|  ઈથેન સ્ટ્રક્ચરને કોપી અને ડિસ્પ્લે એરિયા પર બે વખત પેસ્ટ કરો.
 |-
@@ Line 119: / Line 119: @@
 |-
 |02:00
-|  હાઈડ્રોજન પરમાણુ ની સંખ્યા 6  થી કમી થઈને 4  થયી છે.
+|  હાઈડ્રોજન પરમાણુ ની સંખ્યા 6  ઘટીને 4  થયી છે.
 |-
@@ Line 188: / Line 188: @@
 |-
 |03:19
-|In  '''Tetrahedral methane''' (ટેટ્રાહેડ્રલ મીથેન ) સ્ટ્રક્ચરમાં બધા બોન્ડના ખૂણા  '''109.5 degree.''' છે.
+|  '''Tetrahedral methane''' (ટેટ્રાહેડ્રલ મીથેન ) સ્ટ્રક્ચરમાં બધા બોન્ડના ખૂણા  '''109.5 degree.''' છે.
 |-
 |03:31
-|  ચાલો  હવે '''Tetrahedral'''  ''' Ethane'''  (ટેટ્રાહેડ્રલ ઈથેન ) સ્ટ્રક્ચર દોરીએ.
+|   '''Tetrahedral'''  ''' Ethane'''  (ટેટ્રાહેડ્રલ ઈથેન ) સ્ટ્રક્ચર દોરીએ.
 |-
@@ Line 220: / Line 220: @@
 |-
 |04:02
-| આજ રીતે આપને બીજી કિનારીઓ પર દોરીશું.
+| આજ રીતે આપણે બીજી કિનારીઓ પર દોરીશું.
 |-
@@ Line 232: / Line 232: @@
 |-
 |04:16
-|સબમેનુ ખુલે છે જેમાં આપને '''H''' પસંદ કરીશું.
+|સબમેનુ ખુલે છે જેમાં આપણે '''H''' પસંદ કરીશું.
 |-
@@ Line 268: / Line 268: @@
 |-
 |04:53
-|* and '''Add a fore bond'''. (એડ અ ફોર બોન્ડ)
+|* અને  '''Add a fore bond'''. (એડ અ ફોર બોન્ડ)
@@ Line 278: / Line 278: @@
 |-
 |05:03
-|  '''Add a wedge bond''' (એડ અ ફોર બોન્ડ) પર ક્લિક કરો.
+|  '''Add a wedge bond''' (એડ અ વેજ્ડ બોન્ડ) પર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 302: / Line 302: @@
 |-
 |05:25
-| '''Edit''' મેનુ પર જાઓ , navigate to '''Preferences''' પર જાઓ અને તેના પર ક્લિક કરો.
+| '''Edit''' મેનુ પર જાઓ , '''Preferences''' પર જાઓ અને તેના પર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 339: / Line 339: @@
 |-
 |06:13
-|Let us change the bonds to   in the '''Ethane''' structure.इथेन स्ट्रक्चर में बांड्स को 'ऐड अ हैश बांड' से बदलें।  ઈથેન સ્ટ્રક્ચર મા બોન્ડ્સને  '''Add a hash bond''' થી બદલો.
+|  ઈથેન સ્ટ્રક્ચર મા બોન્ડ્સને  '''Add a hash bond''' થી બદલો.
 |-