Pratik kamble at 10:49, 15 January 2018

2018-01-15T10:49:30Z

Shivanigada at 13:31, 3 November 2017

2017-11-03T13:31:37Z

Shivanigada: Created page with "'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ '''Author''' : બેલા ટોની '''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Bio..."

2017-11-03T13:31:06Z

Created page with "'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ '''Author''' : બેલા ટોની '''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Bio..."

New page

'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’

'''Author''' : બેલા ટોની

'''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis,
Generic Protein, Aminotransferase

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ ''''Build and Modify Process Diagram''''માં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : '''Macros'''નો ઉપયોગ, '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Components'''ને move કરવું, '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' જોડવી.

|-
| 00:18
| '''reaction line'''ને સંરેખિત(Align) અને વિસ્તૃત(extend) કરવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ને ઉમેરવા.

|-
| 00:23
| આ ટ્યૂટોરિઅલ માટે , હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
| આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:43
| જો તમે ન જાણતા હોવ,તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' અમારી વેબસાઈટ ઉપર ઉપલબ્ધ છે. ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’

|-
| 00:51
| ચાલો તો શરુ કરીએ.

|-
| 00:53
| તમે અહીં જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Alanine Biosynthesis ''' માટેનું એક કન્વેનશનલ (પ્રણાલીગત) ડાયાગ્રામ(આકૃતિ) છે.

|-
| 00:58
| હવે આપણે '''CellDesigner'''ની મદદથી આ પ્રોસેસ ડાયાગ્રામને બનાવીશું.

|-
| 01:02
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:09
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:20
| '''CellDesigner ''' વીન્ડો તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:24
| હવે નવી ફાઈલ ''' CTRL+N''' દબાવી ખોલીએ અને તેને '''Build and Modify Process Diagram'''નામ આપીએ.

|-
| 01:34
| '''width''' અને '''length''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખીશું અને '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 01:39
| હવે આપણે જોઈએ કે ‘'''Macros’''' શું છે!

|-
| 01:42
| '''Macros''' એ વારંવાર વપરાતા ''' Components sets''' છે જે ડાયાગ્રામને સરળતાપૂર્વક બનાવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 01:47
| ટૂલબાર ઉપર, '''Catalysis ''' માટે '''Macros''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 01:57
| હવે આપણી પાસે '''draw''' વિસ્તારમાં '''Macros-Catalysis reaction ''' આવી ગયું છે.

|-
| 02:02
| ચાલો હવે બધા કમ્પોનંટ્સને '''Draw''' વિસ્તારની બીજી બાજુએ ખસેડતા શીખીએ.

|-
| 02:08
| તે માટે ''''Edit'''' menu ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''' 'Select All' ''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:16
| વિલ્કપ વૈકલ્પિક રીતે ''Ctrl + A ''' કીઝ પણ ક્લિક કરી શકો છો.

|-
| 02:21
| બધા '''Components''' હવે પ્રકાશિત છે.

|-
| 02:24
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''Components''' ઉપર કશે પણ ક્લિક કરીએ અને યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરીએ .

|-
| 02:30
| ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 02:32
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર કશે પણ ક્લિક કરી પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરીએ.

|-
| 02:37
| પાછા Draw વિસ્તારમાં ,''' Generic Protein S1''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:43
| પછી ''''Change Identity'''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:47
| ''''class'''' બોક્સમાં , '''Protein''' ને ''' Simple Molecule'''માં બદલીએ.

|-
| 02:53
| ''' Name '''માં ટાઇપ કરો : '''2-keto-isovalerate'''.

|-
| 02:58
| ત્યાર બાદ '''‘Apply’''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:02
| ડાયલોગ બોક્સમાં ‘'''The Same Species Exists'''’ માટે '''‘No’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:10
| જો તમે આ બદલાવને સ્પીશિશના બધા જ કમ્પોનંટ્સ ઉપર જોવા માંગતા હોવ તો ‘'''Yes'''’ ઉપર ક્લિક કરો. અહીં,હું ''' ‘No’''' ક્લિક કરીશ.

|-
| 03:20
| નોંધ લો કે ''' Generic Protein S1, ''' એ '''simple molecule ''' બન્યું છે જેનું નામ છે '''2-keto-isovalerate''' છે.

|-
| 03:30
| નામનો સમાવેશ કરવા હું મોલેક્યુલને ડ્રેગ કરીશ.

|-
| 03:34
| ''' end-point'''ના કેન્દ્રમાં રાઈટ-ક્લિક કરો , '''Generic protein'''-'''S1 ''' જે એક '''product''' છે.

|-
| 03:42
| '''identity''' ને ''' Simple Molecule '''માં બદલો અને '''name ''' આપો '''Valine.'''

|-
| 03:50
| '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:52
| draw વિસ્તારમાં તમારીએ પાસે ''' Valine''' આવી ગયું છે.

|-
| 03:36
| ત્યાર બાદ, catalyst''' S2.'''ને ફરીનામ આપો, તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને '''Edit Protein'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:06
| '''‘name’''' ક્ષેત્રમાં , ટાઈપ કરો '''Aminotransferase.'''

|-
| 04:11
| '''Update''' ઉપર ક્લિક કરીએ અને ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરીએ.

|-
| 04:16
| નામનો સમાવેશ કરવા મોલેક્યુલના ખૂણાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 04:21
| ત્યાર બાદ, ચાલો હવે આ જોડાયેલા રિએક્શનનું સ્થાન બદલીએ .

|-
| 04:25
| ''''end-point'''' '''species''' ના કેન્દ્ર ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Valine ''' અને પસંદ કરેલ યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરી ત્યાં તેને ડ્રોપ કરો.

|-
| 04:33
| '''Aminotransferase''' સાથે પણ તે પુનરાવર્તિત કરો.

|-
| 04:37
| નોંધ લો કે ‘'''end-point’ Species ''' જ્યાં પણ જાય છે તેની સાથે જોડાયેલ રિએક્શન તેને '''અનુસરે''' છે.

|-
| 04:44
| હવે આપણે શીખીશું કે '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' કેવી રીતે જોડવી.

|-
| 04:49
| '''Reaction line ''' એ '''Species'''ની ફરતે કોઈ પણ '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' ને જોડાઈ શકે છે.

|-
| 04:56
| હું તમને બતાઉં તે કેવી રીતે કરવું.

|-
| 04:59
| ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ ખોલીએ.

|-
| 05:04
| આ ક્ષેત્રને નામ આપીએ : ''' Connection points '''

|-
| 05:08
| '''width''' and '''height''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખો અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 05:14
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , બે '''generic proteins ''' ડ્રો કરો અને તેમને નામ આપો '''Protein 1 ''' અને '''Protein 2.'''

|-
| 05:23
| '''main menu'''માં ,'''State Transition''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:28
| પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , ‘'''start-point'''' '''Species,Protein 1''' ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 05:36
| હવે નોંધ લો કે બધા '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' તમને ભૂખરા રંગમાં પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 05:42
| નોંધ લો કે આ કનેક્શન પોઈન્ટ્સમાંથી કોઈ પણ એક પોઇન્ટ ઉપર જ્યારે કર્સર આવે છે, ત્યારે તે પોઇન્ટ ભૂરા રંગમાં ફેરવાઈ જશે.

|-
| 05:49
| ચાલો હવે કોઈ એક કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:53
| આ જ પ્રમાણે , ‘'''end-point'''' '''Species ''' જે '''Protein 2''' છે તેના ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 06:00
| ફરી,જેમ અગાઉ સમજાવ્યું તે મુજબ, તમને યોગ્ય લાગતા કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| તમારા પસંદ કરેલ કનેક્શન પોઈન્ટ્સ વચ્ચે એક '''State Transition ''' રિએક્શન લાઈન સર્જાય છે.

|-
| 06:12
| ત્યાર બાદ, આપણે ચાલો '''Reaction line'''ને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 06:16
| '''Protein 1 '''and '''Protein 2''' વચ્ચે રહેલ '''State transition reaction line ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:21
| નોંધ લો '''reaction line''' ઉપરના બે '''process nodes''' પ્રકાશિત થાય છે.

|-
| 06:27
| જો આપણે આ બંને '''process nodes'''માંથી એક ઉપર માઉસ ફેરવીએ છીએ, તો એક ‘'''plus’''' ચિહન દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:34
| કોઈ એક '''process nodes''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:37
| હવે પોઇન્ટર ને પસંદિત '''connection point''' ઉપર ડ્રેગ કરી સ્થાપિત કરો.

|-
| 06:43
| પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરવા ડ્રો વિસ્તારમાં ગમે ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 06:49
| '''reaction line'''ને વિસ્તારવા કે લંબાવવા , ક્લિક કરો.

|-
| 06:54
| હવે '''start-point''' અથવા '''end-point Species''' ઉપર રહેલા બંને માંથી એક '''process nodes ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:01
| હવે '''reaction line '''ને, પસંદ કરેલા યોગ્ય કનેક્શન પોઇન્ટ સુધી લંબાવવા માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| અહીંથી આપણે , આપણે '''Process diagram''' સાથે આગળ વધીશું.

|-
| 07:12
| ચાલો આપણે '''Build and Modify Process Diagram''' વીન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 07:16
| ચાલો આ અહીં દેખાતા(વર્તમાન) રિએક્શન ઉપર એક '''Reactant '''અને એક '''Product''' ઉમેરીએ .

|-
| 07:21
| ટૂલ બારમાંથી બે '''simple molecules''' ક્લિક કરી તેને '''draw''' વિસ્તાર ઉપર સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:27
| તેઓને નામ આપીએ : '''Glutamate''' અને ''' 2-Oxoglutarate'''.

|-
| 07:36
| હવે તેને ડ્રેગ કરીને '''Simple molecules:''' '''2-keto-isovalerate ''' અને '''Valine'''ને અડીને સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:44
| અગાઉ સમજાવ્યું એ મુજબ , draw વિસ્તાર ઉપર આ કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 07:49
| અગાઉ જે સમજાવ્યુ છે તે મુજબ , મેં કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત કરી દીધા છે.

|-
| 07:55
| ટૂલબાર ઉપરથી, આઇકોન ''' ‘Add Product’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:00
| હવે માઉસને ''' 2-keto-isovalerate '''અને '''Valine''' વચ્ચે રહેલા ''' State Transition ''' રિએક્શન ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:07
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:10
| ત્યાર બાદ માઉસને '''2-Oxoglutarate''' ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:17
| 16 પ્રકાશિત થયેલ '''process nodes'''માંથી કોઈ પણ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:21
| નોંધ લો કે'''State Transition ''' અને '''2-Oxoglutarate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:29
| હવે તે જ પ્રમાણે '''‘Add Reactant’''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:34
| '''Glutamate''' ઉપર માઉસ ફેરવો અને 16 પ્રકાશિત થયેલ ''' process nodes'''માંથી કોઈ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:40
| ત્યાર બાદ , ''' State Transition '''રિએક્શન ઉપર માઉસ ફેરવો અને '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ધ્યાનથી જુઓ ,'''State Transition ''' અને ''' Glutamate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:55
| હવે એક '''Reactant''' અને એક '''Product'''ની સાથેનું એક સંપૂર્ણ '''Catalysis '''રિએક્શન આપણી પાસે આવી ગયું છે .

|-
| 09:01
| હું આ '''reaction'''ને સંરેખિત કરીશ જેથી પ્રોસેસ ડાયાગ્રામમાં બીજા '''components'''નો સમાવેશ થઇ શકે.

|-
| 09:09
| ટૂલબાર માંથી આ આઇકોન્સનો ઉપયોગ કરો : '''State Transition''' '''Simple Molecule''' '''Generic Protein''' અને '''Catalysis'''

|-
| 09:18
| આ એક સંપૂર્ણ '''Process Diagram ''' છે.

|-
| 09:22
| તેને બરાબર જોવા માટે , '''main menu''' બારમાં '''View ''' ઉપર જાઓ અને ''' Zoom Fit''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:32
| હવે તમે આ સંપૂર્ણ '''Process Diagram''' જુઓ.

|-
| 09:36
| ચાલો હવે સારાંશ જોઈએ. આ ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આ શીખ્યા : '''Macros'''નો ઉપયોગ,

|-
| 09:42
| '''draw''' વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સ ને Move કરવું, speciesની ફરતે કેનેક્શન લાઇનને જોડવી.

|-
| 09:48
| રિએક્શન લાઈનને સંરેખિત કરવી અને વિસ્તારવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ઉમેરવા.

|-
| 09:54
| અભ્યાસ માટે : '''CellDesigner'''ના ટૂલ્સનો ઉપયોગ કરી '''Methionine Biosynthesis''' માટે નો પ્રોસેસ ડાયાગ્રામ બનાવો # '''GTP/GD''' માટે '''Macros''' શોધો # ’Curve’ રિએક્શન લાઈન કેવી રીતે બનાવાય તે શોધો.

|-
| 10:11
| આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના વિષે જાણવા

|-
| 10:14
| આ લિંક :'''www.spoken-tutorial.org''' ઉપરનો વિડીયો નિહાળો તે આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 10:19
| જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 09:24
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે.

|-
| 09:29
| જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| 10:34
| વધુ માહિતી માટે અમને અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 10:40
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટ એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:54
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

← Older revision		Revision as of 10:49, 15 January 2018
Line 1:		Line 1:
−	~~'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’~~
−
−	~~'''Author''' : બેલા ટોની~~
−
−	~~'''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis,~~
−	~~Generic Protein, Aminotransferase~~
−
	{\| border=1		{\| border=1
	\|\| '''Time'''		\|\| '''Time'''

@@ Line 39: / Line 39: @@
 |-
-|  00:53
+| 00:53
-| તમે અહીં જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Alanine Biosynthesis ''' માટેનું એક કન્વેનશનલ (પ્રણાલીગત) ડાયાગ્રામ(આકૃતિ) છે.
+| તમે અહીં જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Alanine Biosynthesis '''માટેનું એક કન્વેનશનલ (પ્રણાલીગત) ડાયાગ્રામ(આકૃતિ) છે.
 |-

CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Gujarati - Revision history

Pratik kamble at 10:49, 15 January 2018

Shivanigada at 13:31, 3 November 2017

Shivanigada: Created page with "'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ '''Author''' : બેલા ટોની '''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Bio..."