Satarupadutta: Created page with "'''Title of the Script''': Build and Modify Process Diagram '''Author''': Bella Tony '''Keywords''': Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis, Generic Protein, Aminotra..."

2017-12-05T09:58:59Z

Created page with "'''Title of the Script''': Build and Modify Process Diagram '''Author''': Bella Tony '''Keywords''': Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis, Generic Protein, Aminotra..."

New page

'''Title of the Script''': Build and Modify Process Diagram

'''Author''': Bella Tony

'''Keywords''': Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis,
Generic Protein, Aminotransferase

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''
|-
| 00:01
| CellDesigner এ Build and Modify Process Diagram এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।

|-
| 00:08
| এখানে আমরা শিখব: Macros এর ব্যবহার, কম্পোনেন্ট ড্র এরিয়াতে সরানো, স্পিসিসের চারপাশে রিঅ্যাকশন লাইন যোগ করা।

|-
| 00:18
| রিঅ্যাকশন লাইন এলাইন এবং প্রসারিত করা, একটি প্রোডাক্ট এবং রিঅ্যাকটেন্ট যোগ করা।

|-
| 00:23
| এই টিউটোরিয়ালের জন্য, উবুন্টু লিনাক্স অপারেটিং সিস্টেম 14.04, CellDesigner সংস্করণ 4.3, Java সংস্করণ 1.7 ব্যবহার করছি।

|-
| 00:35
| টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে, শিক্ষার্থীদের স্নাতক স্তরের Biochemistry এবং CellDesigner ইন্টারফেস সম্পর্কে জানা উচিত।

|-
| 00:43
|না হলে, প্রাসঙ্গিক CellDesigner টিউটোরিয়ালের জন্য, Spoken Tutorial ওয়েবসাইটে যান।

|-
| 00:51
| এখন শুরু করি।

|-
| 00:53
| আপনি এখানে Alanine Biosynthesis এর একটি প্রচলিত ডায়াগ্রাম দেখেন।

|-
| 00:58
| এই প্রসেস ডায়াগ্রাম বানাতে CellDesigner ব্যবহার করব।

|-
| 01:02
| Ctrl + Alt + T কী একসাথে টিপে টার্মিনাল খুলুন।

|-
| 01:09
| এখন ./runCellDesigner4.3 লিখুন এবং এন্টার টিপুন।

|-
| 01:20
| আপনার টার্মিনালে CellDesigner উইন্ডোটি খুলেছে।

|-
| 01:24
| CTRL + N টিপে একটি নতুন ফাইল খুলুন এবং এটিকে Build and Modify Process Diagram নাম দিন।

|-
| 01:34
| প্রস্থ এবং উচ্চতা ডিফল্ট রাখুন এবং OK বোতামে ক্লিক করুন।

|-
| 01:39
| এখন Macros সম্পর্কে শিখি।

|-
| 01:42
| Macros প্রায়ই ব্যবহার করা Components সেট, যা সহজে ডায়াগ্রাম বানাতে সাহায্য করে।

|-
| 01:47
| টুলবারে, Catalysis এর জন্য Macros আইকনে ক্লিক করুন তারপর ড্র এরিয়াতে ক্লিক করুন।

|-
| 01:57
| এখন ড্র এরিয়াতে Macros-Catalysis reaction রয়েছে।

|-
| 02:02
| সকল কম্পোনেন্ট ড্র এরিয়ার অপর প্রান্তে সরানো শিখি।

|-
| 02:08
| তাই Edit মেনুতে এবং তারপর Select All এ ক্লিক করুন।

|-
| 02:16
|এছাড়া আপনি Ctrl + A কী প্রয়োগ করতে পারেন।

|-
| 02:21
|এখন সকল কম্পোনেন্ট লক্ষণীয় রয়েছে।

|-
| 02:24
| এখন লক্ষণীয় কম্পোনেন্টের কোথাও ক্লিক করুন এবং তাদের পছন্দসই স্থানে সরান।

|-
| 02:30
| এখন এগোই।

|-
| 02:32
| লক্ষণীয় করা কম্পোনেন্ট অচিহ্নিত করতে ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।

|-
| 02:37
| আবার ড্র এরিয়াতে, Generic Protein S1 এ ডান ক্লিক করুন।

|-
| 02:43
| তারপর Change Identity বিকল্পে ক্লিক করুন।

|-
| 02:47
| class বাক্সে, Protein কে Simple Molecule এ বদলান।

|-
| 02:53
| Name এ: 2-keto-isovalerate লিখুন

|-
| 02:58
|এবং তারপর Apply বোতামে ক্লিক করুন।

|-
| 03:02
| The Same Species Exists ডায়ালগ বাক্সে No তে ক্লিক করুন।

|-
| 03:10
| তবে স্পিসিসের সকল কম্পোনেন্টে এই পরিবর্তন করতে চাইলে Yes এ ক্লিক করুন। এখানে No ক্লিক করব।

|-
| 03:20
| দেখুন Generic Protein S1, এখন 2-keto-isovalerate নামে simple molecule হয়েছে।

|-
| 03:30
|আমি নাম অন্তর্ভুক্ত করতে অণু টেনে আনবো।

|-
| 03:34
| end-point এর কেন্দ্রে Generic protein-S1 এ ডান ক্লিক করুন যা একটি প্রোডাক্ট।

|-
| 03:42
|Change identity কে Simple Molecule করুন এবং এটিকে Valine নাম দিন।

|-
| 03:50
| Apply বোতামে ক্লিক করুন।

|-
| 03:52
|আপনার ড্র এরিয়াতে Valine রয়েছে।

|-
| 03:36
| তারপর, অনুঘটক S2 এর নাম বদলান। এতে ডান ক্লিক করুন এবং Edit Protein চয়ন করুন।

|-
| 04:06
|name এ, Aminotransferase লিখুন।

|-
| 04:11
| Update এ ক্লিক করুন এবং ডায়লগ বাক্স বন্ধ করুন।

|-
| 04:16
|নাম অন্তর্ভুক্ত করতে অণুর প্রান্ত ড্রেগ করুন।
|-
| 04:21
| তারপর, লিঙ্ক করা রিঅ্যাকশননের স্থিতি বদলাই।

|-
| 04:25
| end-point species অর্থাৎ Valine এর কেন্দ্রে ক্লিক করুন এবং পছন্দসই স্থানে ড্র্যাগ এবং ড্রপ করুন।

|-
| 04:33
| Aminotransferase এর সাথে এটি পুনরাবৃত্তি করুন।
|-
| 04:37
| লক্ষ্য করুন end-point Species যেদিকে যায় লিঙ্ক করা রিঅ্যাকশন তা অনুসরণ করে।

|-
| 04:44
| এখন reaction line কে species এর আশেপাশে জোড়া শিখব।

|-
| 04:49
| Reaction line কে Species এর আশেপাশে 16 টি সংযোগ বিন্দুতে যার কারোর সাথে যুক্ত করা যাবে।

|-
| 04:56
|আমি আপনাকে এটি করা দেখাবো।

|-
| 04:59
| CTRL + N টিপে একটি নতুন উইন্ডো খুলুন।

|-
| 05:04
|ফাইলটিকে Connection points নাম দিন।

|-
| 05:08
| প্রস্থ এবং উচ্চতা ডিফল্ট রাখুন এবং Ok বোতামে ক্লিক করুন।

|-
| 05:14
| ড্র এরিয়াতে, দুটি generic proteins আঁকুন এবং তাদের Protein 1 এবং Protein 2 নাম দিন।

|-
| 05:23
| মেন মেনুতে, State Transition আইকনে ক্লিক করুন।

|-
| 05:28
|তারপর, ড্র এরিয়াতে, মাউসকে start-point Species, Protein 1 এ ঘোরান।

|-
| 05:36
| লক্ষ্য করুন সকল 16 টি সংযোগ বিন্দু ধূসর রঙে লক্ষণীয় হয়।

|-
| 05:42
| উল্লেখ্য যখন কার্সারটি এর কোনো একটি সংযোগ বিন্দুতে যায়, এটি নীল রঙে বদলাবে।

|-
| 05:49
| একটি সংযোগ বিন্দুতে ক্লিক করুন।

|-
| 05:53
| একইভাবে মাউসকে end-point Species অর্থাৎ Protein 2 তে ঘোরান।

|-
| 06:00
| আবার, উপরোক্ত বর্ণন অনুযায়ী, আবশ্যক সংযোগ বিন্দুতে ক্লিক করুন।

|-
| 06:05
| চয়নিত সংযোগ বিন্দুর মাঝে একটি State Transition রিঅ্যাকশন লাইন গঠিত হয়েছে।

|-
| 06:12
| এরপর, আমরা Reaction line সারিবদ্ধ করব।

|-
| 06:16
| Protein 1 এবং Protein 2 এর মাঝে State transition reaction line এ ক্লিক করুন।

|-
| 06:21
| উল্লেখ্য যে reaction line এ 2 process nodes লক্ষণীয় হয়।

|-
| 06:27
| আমরা মাউস 2 process nodes এর মধ্যে কোনোটিতে ঘোরালে, একটি plus চিহ্ন দেখায়।

|-
| 06:34
| process nodes এর মধ্যে একটিতে ক্লিক করুন।

|-
| 06:37
|এখন পয়েন্টার ড্রেগ করুন এবং পছন্দসই connection point এ রাখুন।

|-
| 06:43
| লক্ষণীয় করা কম্পোনেন্ট আনচেক করতে ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।

|-
| 06:49
| reaction line বাড়াতে বা প্রসারিত করতে, প্রথমে এতে ক্লিক করুন।

|-
| 06:54
| এখন start-point বা end-point Species এ স্থিত process nodes এর যে কোনো একটিতে ক্লিক করুন।

|-
| 07:01
| reaction line প্রসারিত করতে মাউস পছন্দসই কনেকশন পয়েন্ট পর্যন্ত ড্রেগ করুন।

|-
| 07:07
| এখানে থেকে, প্রসেস ডায়াগ্রামের সাথে এগোই।

|-
| 07:12
| Build and Modify Process Diagram তে ফিরে আসি।

|-
| 07:16
| বিদ্যমান রিঅ্যাকশনে, একটি Reactant এবং একটি Product জুড়ুন।

|-
| 07:21
| টুলবার থেকে, 2 simple molecules এ ক্লিক করে ড্র এরিয়াতে রাখুন।

|-
| 07:27
| তাদের Glutamate এবং 2-Oxoglutarate নাম দিন।

|-
| 07:36
| তাদের ড্রেগ করুন তারপর Simple molecules: 2-keto-isovalerate এবং Valine এর কাছে রাখুন।

|-
| 07:44
| আগের বর্ণন অনুযায়ী, কম্পোনেন্টকে ড্র এরিয়াতে সারিবদ্ধ করি।

|-
| 07:49
| পূর্বে করা বর্ণন থেকে, আমি এখন কম্পোনেন্ট সারিবদ্ধ করেছি।

|-
| 07:55
| টুলবারে Add Product আইকনে ক্লিক করুন।

|-
| 08:00
| এখন মাউস State Transition রিঅ্যাকশন 2-keto-isovalerate এবং Valine এর মাঝে ঘোরান।

|-
| 08:07
| লক্ষণীয় করা process node এ ক্লিক করুন।

|-
| 08:10
| এরপর, মাউস 2-Oxoglutarate এ ঘোরান।

|-
| 08:17
|লক্ষণীয় করা 16 process nodes এর যে কোনো একটিতে ক্লিক করুন।

|-
| 08:21
| লক্ষ্য করুন, State Transition এবং 2-Oxoglutarate এর মাঝে একটি reaction line দেখায়।

|-
| 08:29
| একইভাবে Add Reactant আইকনে ক্লিক করুন।

|-
| 08:34
| মাউস Glutamate এ রেখে লক্ষণীয় হওয়া 16 process nodes থেকে একটিতে ক্লিক করুন।

|-
| 08:40
| তারপর, মাউস State Transition রিঅ্যাকশনে ঘোরান এবং process node এ ক্লিক করুন।

|-
| 08:49
| দেখুন যে State Transition এবং Glutamate এর মাঝে একটি reaction line দেখায়।

|-
| 08:55
| এরপর Reactant এবং Product সহ একটি সম্পূর্ণ Catalysis রিঅ্যাকশন রয়েছে।

|-
| 09:01
| আমি প্রসেস ডায়াগ্রামের অন্যান্য কম্পোনেন্ট সমাযোজিত করতে reaction সারিবদ্ধ করব।

|-
| 09:09
| টুলবার থেকে State Transition, Simple Molecule, Generic Protein এবং Catalysis আইকন ব্যবহার করুন।

|-
| 09:18
| এটি সম্পূর্ণ প্রসেস ডায়াগ্রাম।

|-
| 09:22
| এটি সঠিকভাবে দেখতে, মেন মেনু বারে View তে যান এবং Zoom Fit এ ক্লিক করুন।

|-
| 09:32
|এখন আপনি সম্পূর্ণ Process Diagram দেখেন।

|-
| 09:36
| সংক্ষিপ্তকরণ করি। এখানে আমরা শিখেছি Macros এর ব্যবহার।

|-
| 09:42
|কম্পোনেন্ট ড্র এরিয়াতে সরানো, স্পিসিসের চারপাশে রিঅ্যাকশন লাইন যোগ করা।

|-
| 09:48
| রিঅ্যাকশন লাইন এলাইন এবং প্রসারিত করা, একটি Product এবং Reactant যোগ করা।

|-
| 09:54
| অনুশীলনী হিসাবে: CellDesigner টুলস দ্বারা Methionine Biosynthesis এর জন্য একটি প্রসেস ডায়াগ্রাম বানান, GTP / GD এর জন্য Macros অন্বেষণ করুন, একটি Curve রিঅ্যাকশন লাইন বানানো সম্পর্কে খোঁজ করুন।

|-
| 10:11
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প সম্পর্কে-

|-
| 10:14
|প্রদত্ত লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়।

|-
| 10:19
| ভালো ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন।

|-
| 09:24
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে।

|-
| 09:29
| অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়।

|-
| 10:34
| অধিক জানতে contact@spoken-tutorial.org তে লিখুন।

|-
| 10:40
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পের অংশবিশেষ। এটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা সমর্থিত। এই মিশন সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য: http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro

|-
| 10:54
| আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ।

|}

CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Bengali - Revision history

Satarupadutta: Created page with "'''Title of the Script''': Build and Modify Process Diagram '''Author''': Bella Tony '''Keywords''': Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis, Generic Protein, Aminotra..."