Shivanigada at 08:14, 10 October 2017

2017-10-10T08:14:37Z

Shivanigada at 10:21, 5 October 2017

2017-10-05T10:21:53Z

Shivanigada at 10:21, 5 October 2017

2017-10-05T10:21:25Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિ..."

2017-10-05T10:19:55Z

Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિ..."

New page

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું : સેલડિઝાઈનર Menu અને Tool બાર્સ

|-
| 00:13
| સેલડિઝાઈનરમાં કાર્યકારવાની જગ્યામાં રહેલા જુદા જુદા areas

|-
| 00:17
| સેલડિઝાઈનરના Components જેમાં સમાવેશ થાય છે : Species અને Reactions

|-
|00:23
| એક સામાન્ય નેટવર્ક કેવી રીતે બનાવવું તે પણ આપણે જોઈશું।

|-
| 00:27
|નેટવર્કસેવ કેવી રીતે કરવું તે

|-
| 00:29
| એક આકૃતિની નિકાસ કેવી રીતે કરવી

|-
| 00:30
| માળખાને ઝીણવટથી કેમ જોવાય તે

|-
| 00:33
| CellDesigner એ જનીન-નિયમનકારી અને જીવરાસાયણિક માળખાઓને દોરવા માટેનું એક પ્રક્રિયા આધારિત રેખાકૃતિ સંપાદક(પ્રોસેસ ડાયેગ્રામ એડિટર)છે.

|-
| 00:40
|પ્રક્રિયા આધારિત રેખાકૃતિ કિટાનોએ સૂચવેલ છે. આ રેખાકૃતિઓ Systems Biology Markup Language (SBML) દ્વારા સંગ્રહિત કરવામાં આવે છે.

|-
| 00:50
| હું વિન્ડોવ્સ એક્સપી અને સેલડિઝાઈનર 4.2 વાપરી રહી છું. સેલડિઝાઈનર લીનક્સ અને મેક ઓએસ એક્સ ઉપર પણ કામ કરે છે.

|-
| 01:00
|સેલડિઝાઈનરને શરૂ કરવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલા સેલડિઝાઈનર શોર્ટકટના આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|આ સેલડિઝાઈનરને ખોલશે,હવે ચાલો આનું નિરીક્ષણ કરીએ.

|-
| 01:12
| Menu બાર ઉપર તમે વિવિધ મેનુ વિકલ્પો જોઈ શકો છો, જેવાકે File, Edit, Component ,View, Database અને બીજા અન્ય.

|-
| 01:24
|Main Menuની નીચે તમે વિવિધ Toolbars જોઈ શકો છો.

|-
| 01:30
| આ Toolbars છે જે editing, species, reactions, compartments વગેરે..

|-
| 01:38
| જેમ જેમ આગળ જઈશું આપણે એમાંના થોડા ક વિશે શીખીશું.

|-
| 01:42
| ચાલો સેલડિઝાઈનરના કાર્ય કરવાની જગ્યાના થોડાક વિસ્તારો વિશે શીખીએ।

|-
| 01:48
|તમે જોઈ શકો ચો તેમ અહીં પાંચ વિસ્તારો છે.

|-
| 01:52
| જે જમણા હાથ તરફ છે તે છે Draw વિસ્તાર(Area).

|-
| 01:55
| આ એ જગ્યા છે જ્યાં આપણે માળખાઓ આલેખિત કરીશું।

|-
| 01:58
|જે પણ આકારો તમે Draw વિસ્તાર માં જુઓ છો, દાખલ તરીકે - લંબચોરસ,લંબગોળ અથવા રેખાખંડ , એને Component કહેવાય છે.

|-
| 02:08
| Component એ એક સામાન્ય શબ્દ છે જે species, reactions અથવા compartment સૂચવે છે.

|-
| 02:14
| કોઈ પણ આ બધા ચિહ્નો અને તેના અર્થ સેલડિઝાઈનર વેબસાઈટ - જે છે www.celldesigner.org ઉપરથી મેળવી શકે છે.

|-
| 02:29
|હું Documents ઉપર ક્લિક કરીશ.।

|-
| 02:33
|હવે ચાલો સ્ટાર્ટઅપ ગાઈડ ઉપર ક્લિક કરીએ. જે પણ બીજા ટેબ ઉપર છે.

|-
| 02:40
|હું સીધી પૃષ્ઠ આંક 82 ઉપર જઈશ.

|-
| 02:45
|અહીં તમે વિવિધ ચિહ્નો અને તેના અર્થ જોઈ શકો છો.

|-
| 02:51
|ચાલો પાછા સેલડિઝાઈનર વિન્ડો ઉપર જઈએ.

|-
|02:55
| Draw વિસ્તારની નીચે છે List વિસ્તાર.

|-
| 02:59
|અહીં તમે મોડેલના કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) અને ફંક્શન્સ(ક્રિયાઓ)ની સૂચિ દર્શાવી તથા તેમાં ફેરફાર કરી શકો છો.

|-
| 03:06
|Notes વિસ્તારનો ઉપયોગ componentની નોંધ બતાવવા અને તેમાં ફેરફાર કરવા વપરાય છે.

|-
| 03:12
| ડાબા હાથ તરફ, એક Tree વિસ્તાર છે જે ઘટકોને એક વૃક્ષની રચનારૂપે સૂચિત કરે છે.

|-
| 03:21
| તેના નીચે Layer વિસ્તાર છે જે મોડેલના સ્તરો પ્રદર્શિત કરે છે.

|-
| 03:27
| આ વિસ્તારોના માપ આપણે બોર્ડરલાઇનને ખેંચીને નાના-મોટા કરી શકીએ છીએ .

|-
| 03:33
| હું આ બોર્ડરલાઈન ઉપર મારુ કર્સર મુકું છું. તમે બે માથા વાળો એરો જોઈ શકો છો.તેને મેક્સિમાઈઝ અને મિનિમાઈઝ ડ્રેગ કરો.

|-
| 03:45
| List અને Notes વિસ્તારોના સ્થળ બદલવા

|-
| 03:50
| View વિકલ્પમાં જાઓ >> List ને ક્લિક કરો અને Rightને પસંદ કરો.

|-
| 03:56
| તે તેને જમણી તરફ બદલી કાઢશે। નીચેની તરફ હોવું એ ડિફોલ્ટ છે.

|-
| 04:00
|ચાલો આપણે પાછા સ્લાઈડ ઉપર જઈએ.

|-
| 04:05
|આ એક સામાન્ય નેટવર્ક છે જે આપણે બનાવીશું.

|-
| 04:10
| આ નેટવર્ક માં પ્રોટીન A , પ્રોટીન B ની સ્ટેટ ટ્રાન્ઝીશન (અવસ્થા સંક્રમણ)માંથી પ્રોટીન C ના કેટાલિસિસ (ઉદ્દીપન) દ્વારા પસાર થાય છે.

|-
| 04:21
| પ્રોટીન B બદલામાં પ્રોટીન Dની સ્ટેટ ટ્રાન્ઝીશન માંથી પસાર થાય છે.

|-
| 04:27
| આ ટ્રાન્ઝીશન પ્રોટીન E દ્વારા ઈન્હિબિટેડ
(અવરોધાય) થાય છે.

|-
| 04:32
| ચાલો આ નેટવર્ક બનાવીએ।

|-
| 04:34
| હું પાછી સેલડિઝાઈનર વિન્ડો ઉપર જઈશ.

|-
| 04:39
| હવે File ઉપર દબાવી અને પછી New પસંદ કરીએ.

|-
| 04:43
| New Document નામનો એક નાનો ડાયલોગ બોક્સ ખુલશે.

|-
| 04:48
| આ name વિભાગ છે.

|-
| 04:50
| હું ટાઈપ કરીશ simple network.

|-
| 04:53
| અહીં કોઈ ઊંચાઈ અને પહોળાઈ જોઈએ એ મુજબ બદલી શકે છે. જોકે હું જે ડિફોલ્ટ ઊંચાઈ અને પહોળાઈ છે તે જ રાખું છું.

|-
| 05:03
|"OK " ક્લિક કરીએ. તમે ઉપર Draw વિસ્તારના ડાબી બાજુએ ખૂણામાં નામ જોઈ શકો છો.

|-
| 05:12
|હવે, Edit ઉપર જાઓ,અને Grid snap અને Grid visible ને એનેબલ(કાર્યરત) કરો.

|-
| 05:21
| એક ગ્રીડ(જાળી) તમને Draw વિસ્તારમાં દ્રશ્યમાન થશે.

|-
| 05:25
| Grid snap કમ્પોનંટ્સને ગ્રીડ સાથે યોગ્ય રીતે સંરેખિત કરશે.

|-
| 05:29
| એકવાર નેટવર્ક તૈયાર થઇ જાય પછી તમે Grid visibleને ના પસંદ કરી શકો છો.

|-
| 05:34
| કમ્પોનંટ્સ ઉમેરવાનું શરુ કરતા પહેલા,ચાલો હું તમને સ્પીશિસ અને રિએક્શન્સના થોડાક ઉદાહરણો બતાવું.

|-
| 05:42
| ચાલો પહેલા જોઈએ સ્પીશિસ.

|-
| 05:45
| અહીં જે ચિહ્નો છે તે છે generic protein, receptor, ion channel, truncated protein, gene, RNA વગેરે.

|-
| 05:58
| હવે રિએક્શન્સ(પ્રતિક્રિયાઓ) જોઈએ જેમાં પ્રથમ છે State transition, Heterodimer association, Dissociation, Catalysis, Inhibition વગેરે.

|-
| 06:11
| આપણે Species ટૂલ બારમાનો પ્રથમ આઇકોન તેને ક્લિક કરીને પસંદ કરીશું।આ આઇકોન પ્રોટીન માટે છે.

|-
| 06:22
|Draw વિસ્તારમાં કશે પણ ક્લિક કરો જ્યાં તમારે આ સ્પીશિસ મૂકવું છે.

|-
| 06:28
| હું તેને Draw વિસ્તારની ડાબી બાજુએ મુકીશ.

|-
| 06:33
|એન નાનો ડાયલોગ બોક્સ ખુલશે જે મને સ્પીશિસના નામ માટે પૂછશે.

|-
| 06:39
| હું તે નવા સ્પીશિસને A નામ આપીશ અને OK ક્લિક કરીશ..

|-
| 06:46
| List વિસ્તારમાં થયેલો ફેરફાર પણ જુઓ.

|-
| 06:50
| તમે જોઈ શકો છો કે આપણે Draw વિસ્તારમાં નવું સ્પીશિસ ઉમેર્યું. તે જ રીતે હું B ઉમેરીશ.

|-
| 06:58
| તમારે કમ્પોનન્ટને એડિટ (બદલવા) અથવા મુવ(ખસેડતા) કરતા પહેલા તેને સિલેક્ટ કરવો પડશે.

|-
| 07:03
| કમ્પોનન્ટને પસંદ કરવા તેને ક્લિક કરો. પૂરું ધ્યાન રાખજો કે સિલેક્ટ કરેલ આઇકોન ON હોય તમે કરો તે પહેલા.

|-
| 07:12
| મારે A ની બાજુમાં B મૂકવું છે. તેથી B ઉપર ક્લિક કરી તેને સિલેક્ટ કરીએ.

|-
| 07:17
| હવે તેને ડ્રેગ અને A પછી મુકો.

|-
| 07:21
| હવે આપણે જોઈશું કે કમ્પોનન્ટનું માપ કેવી રીતે બદલવું.

|-
| 07:24
| હું A ઉપર ક્લિક કરીશ.. આપણે તેના ઉપર નાના ચોકઠાંઓ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 07:29
| આ માપ બદલવાના હેન્ડલર્સ(હાથાઓ) છે.

|-
| 07:32
| હું આ કિનારી ઉપર કર્સર મૂકી તેને ડ્રેગ કરીશ.

|-
| 07:36
| આપણે A નું માપ બદલાયેલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 07:39
| કમ્પોનન્ટનું માપ બદલવાની બીજી અન્ય રીત પણ છે જે આપણે પછી બીજા ટ્યૂટોરિઅલમાં જોઈશું.

|-
| 07:46
| તમે તેને પહેલા જેવી પરિસ્થિતિમાં પાછું લાવી શકો છો Ctrl-Z દબાવીને.

|-
| 07:52
| જો પાછું મોટું કરવું હોય તો Ctrl-Y ક્લિક કરો.

|-
| 07:54
| તમે આ સીધા undo અને re-do ના આઇકોન્સ ક્લિક કરીને પણ કરી શકો છો.

|-
| 08:03
| હવે ચાલો રિએક્શન્સ ઉમેરીએ.

|-
| 08:06
| રિએક્શન એ બે વસ્તુઓ વચ્ચે થતી પારસ્પરિક ક્રિયા છે.

|-
| 08:09
| આ છે સ્ટેટ ટ્રાન્સીશન રિએક્શન(અવસ્થા સંક્રમણ પ્રતિક્રિયા)

|-
| 08:12
|તો હું Reaction ટૂલ બાર માના State transition ના આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીશ..

|-
| 08:18
| A અને Bની કોઈ પણ કિનારી ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:23
| આમ તમે જોઈ શકો છો કે રિએક્શન બાતવતું તીર A અને B ને જોડે છે.

|-
| 08:30
| જે કમ્પોનન્ટ પહેલા પસંદ કરેલ છે તેને રિએક્ટન્ટ તરીકે મનાય છે.

|-
| 08:35
| તેથી હંમેશા રિએક્ટન્ટસને પહેલા પસંદ કરવું યાદ રાખો.

|-
| 08:39
| ડિફોલ્ટ રિએક્શનનો આઈડી re1 તરીકે આવે છે.

|-
| 08:43
| હવે ચાલો સ્પીશિસ C ઉમેરીએ અને તેને યોગ્ય જગ્યાએ સ્લાઈડમાં અગાઉ જોયું એ પ્રમાણે મૂકીએ.

|-
| 08:54
| હું Reaction ટૂલ બારમાંથી આ આઇકોનને સિલેક્ટ કરું છું. તે Catalysis માટે છે.

|-
|09:00
|હું Cની કિનારી ઉપર ક્લિક કરીશ., અને State transition રિએક્શનના આ ચોરસ ચિહન ઉપર

|-
| 09:08
| હવે હું સ્પીશિસ D ઉમેરીશ અને તેને B ની બાજુમાં મુકીશ।

|-
| 09:15
| ચાલો હવે B થી D માટે State transition રિએક્શન ઉમેરીએ। ડિફોલ્ટ રિએક્શન આઈડી re2 છે.

|-
| 09:26
| હવે હું સ્પીશિસ E ઉમેરીશ અને તેને તેની યોગ્ય જગ્યા એ મુકીશ અગાઉ સ્લાઈડમાં જોયું તે પ્રમાણે.

|-
| 09:35
| હવે હું આ Reaction ટૂલ બારમાના આ આઇકોનને પસંદ કરીશ, જે Inhibition reaction ને દર્શાવે છે.

|-
| 09:44
| હું હવે Eની કિનારીને ક્લિક કરીશ. અને આ State transitionના આ ચોરસ ચિહનને. જે આ બંને બિંદુઓને જોડશે.

|-
| 09:54
| હવે આપણે આ સામાન્ય નેટવર્ક જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 09:57
|ચાલો આપણું કામ સેવ કરીએ.

|-
| 10:00
| File ઉપર જાઓ. Save as ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:04
| હું તેને Simple Network નામ આપીશ.

|-
| 10:06
|આ આપણા કામને .xml ફોર્મેટથી સેવ કરશે. Save ક્લિક કરો.

|-
| 10:12
|હવે આપણે શીખીશું કે કોઈ આકૃતિને કેવી રીતે સમાવવી. તે કરવા, File > Export Image માં જાઓ.

|-
| 10:22
| તમે આકૃતિને વિવિધ બંધારણોમાં સેવ કરી શકો છો જેવાકે pdf, png, jpeg વગેરે..

|-
| 10:29
| હું તેને jpeg આકૃતિ તરીકે સેવ કરીશ. Save ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:35
| ચાલો જોઈએ કે નેટવર્કને ઝૂમ( ઝીણવટ પૂર્વક) કરીને કેવી રીતે જોઈ શકાય!

|-
| 10:38
| આપણી પાસે ચાર વિકલ્પો છે ઝૂમ માટે - Zoom In, Zoom Out, Zoom Fit. Zoom Reset .

|-
| 10:47
|હું Zoom In આઇકોન ઉપર બે વખત ક્લિક કરીશ.। આપણે મોટી થયેલી આકૃતિ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 10:54
| હવે Zoom Reset ઉપર ક્લિક કરીએ।નેટવર્ક તેની અગાઉની સામાન્ય સ્થિતિમાં પાછું આવી જાય છે.

|-
|11:02
|તો આની સાથે આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલના અંતે પોહચી ગયા.

|-
| 11:08
| સારાંશમાં, આપણે સેલડિઝાઇનરના Menu અને Tool Bar વિષે શીખ્યા.

|-
| 11:14
|તેના જુદાજુદા વિસ્તારો જોયા. કમ્પોનંટ્સ જેવાકે "સ્પીશિસ" અને "રિએક્શન્સ".

|-
| 11:20
|આપણે એક સામાન્ય નેટવર્ક બનાવ્યું સ્પીશિસ અને કમ્પોનંટ્સની મદદથી।

|-
| 11:26
| આપણે ઝૂમ કરવાનું,નેટવર્કસેવ કરવાનું તથા આકૃતિના નિકાસ વિષે પણ શીખ્યા।

|-
| 11:32
| અભ્યાસ કરવા એકનેટવર્કસેલડિઝાઈનર 4.2ની મદદથી તમે પણ બનાવો।

|-
| 11:39
| તે માળખામાં, A અને B સહયોગી બની કોમ્પ્લેક્સ બનાવે જેમાં કેટલિસ્ટ પ્રોટીન C પણ ઉપલબ્ધ હોય.

|-
| 11:51
| આ કોમ્પ્લેક્સ ખરાબ થઇ જાય જ્યારે તેમાં કેટલિસ્ટ પ્રોટીન D રહેલ હોય.

|-
| 11:58
| તમને આ પ્રમાણેનું નેટવર્ક મળવું જોઈએ।

|-
| 12:01
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 12:28
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.

|-
| 12:41
| આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:53
|ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર।

|}

@@ Line 170: / Line 170: @@
 | 04:10
 | આ નેટવર્કમાં પ્રોટીન A, પ્રોટીન C નાં કેટાલિસિસ (ઉદ્દીપન) અંતર્ગત પ્રોટીન B ની સ્ટેટ ટ્રાન્ઝીશન (સંક્રમણ અવસ્થા) માંથી પસાર થાય છે.
 |-

CellDesigner/C2/Getting-Started-with-CellDesigner/Gujarati - Revision history

Shivanigada at 08:14, 10 October 2017

Shivanigada at 08:13, 10 October 2017

Shivanigada at 10:21, 5 October 2017

Shivanigada at 10:21, 5 October 2017

Shivanigada: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિ..."

@@ Line 366: / Line 366: @@
 | 08:54
 | હું Reaction ટૂલ બારમાંથી આ આઇકોનને સિલેક્ટ કરું છું. તે Catalysis માટે છે.
 |-

@@ Line 6: / Line 6: @@
 | 00:01
 | ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
 |-
@@ Line 159: / Line 158: @@
 | 03:56
 | તે તેને જમણી તરફ બદલી કાઢશે। નીચેની તરફ હોવું એ ડિફોલ્ટ છે.
 |-
@@ Line 180: / Line 177: @@
 |-
 | 04:27
-| આ ટ્રાન્ઝીશન પ્રોટીન E દ્વારા ઈન્હિબિટેડ
+| આ ટ્રાન્ઝીશન પ્રોટીન E દ્વારા ઈન્હિબિટેડ(અવરોધાય)  થાય છે.
 (અવરોધાય)  થાય છે.
 |-