Satarupadutta: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | Getting started with CellDesigner এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগ..."

2017-12-08T06:36:48Z

Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | Getting started with CellDesigner এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগ..."

New page

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| Getting started with CellDesigner এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।

|-
| 00:05
| এখানে আমরা শিখব: CellDesigner সম্পর্কে, CellDesigner এ মেনু এবং টুল বার সম্পর্কে।

|-
| 00:13
|সেল ডিজাইনার ওয়ার্কস্পেসে বিভিন্ন ক্ষেত্র সম্পর্কে।

|-
| 00:17
|সেল ডিজাইনার কম্পোনেন্ট সম্পর্কে যাতে Species এবং Reactions রয়েছে।

|-
|00:23
| আমরা এও শিখব একটি সাধারণ নেটওয়ার্ক কিভাবে বানায়।

|-
| 00:27
|নেটওয়ার্ক সংরক্ষণ করা।

|-
| 00:29
|ইমেজ এক্সপোর্ট করা।

|-
| 00:30
|নেটওয়ার্ক জুম করা।

|-
| 00:33
| সেল ডিজাইনার জিন-রেগুলেটরী এবং বায়োকেমিক্যাল নেটওয়ার্ক আঁকতে একটি প্রসেস ডায়াগ্রাম এডিটর।

|-
| 00:40
| প্রসেস ডায়াগ্রাম kitano দ্বারা প্রস্তাবিত হয়েছে, এই ডায়াগ্রাম Systems Biology Markup Language (SBML) দ্বারা সংরক্ষণ করা হয়।

|-
| 00:50
| আমি উইন্ডোজ XP এবং সেলডিসাইনার সংস্করণ 4.2 ব্যবহার করছি। সেলডিজার লিনাক্স এবং ম্যাক OS X এও কাজ করে।

|-
| 01:00
| CellDesigner খুলতে ডেস্কটপে সেল ডিজাইনারের শর্টকাট আইকনে ডবল ক্লিক করুন।

|-
| 01:07
|এটি সেল ডিজাইনার খুলবে, এখন এটি সম্পর্কে শিখি।

|-
| 01:12
| Menu বারে আপনি বিভিন্ন মেনু বিকল্প যেমন File, Edit, Component ,View, Database এবং অন্যান্য পাবেন।

|-
| 01:24
| Main Menu তে আপনি বিভিন্ন Toolbars দেখবেন।

|-
| 01:30
| এখানে এডিটিং, স্পিসিস, রিঅ্যাকশন, কম্পার্টমেন্টের জন্য Toolbars রয়েছে।
|-
| 01:38
|আমরা এগোনোর সাথে এর মধ্যে কিছু সম্পর্কে শিখব।
|-
| 01:42
| সেল ডিজাইনার ওয়ার্ক স্পেসের বিভিন্ন অংশ সম্পর্কে শিখি।

|-
| 01:48
| যেমনকি আপনি দেখেন সেখানে 5 টি ক্ষেত্র রয়েছে।

|-
| 01:52
|ডানদিকে Draw ক্ষেত্র রয়েছে।

|-
| 01:55
|এটি সেই স্থান যেখানে আমরা নেটওয়ার্ক অঙ্কন করব।

|-
| 01:58
| Draw ক্ষেত্রে প্রদর্শিত যে কোনো আকৃতি যেমন- আয়তক্ষেত্র, একটি ওভাল বা একটি লাইন সেগমেন্টকে কম্পোনেন্ট বলে।

|-
| 02:08
| species, reactions বা compartment এর জন্য কম্পোনেন্ট একটি সাধারণ শব্দ।

|-
| 02:14
| যে কেউ সেলডিসাইনার ওয়েবসাইট www.celldesigner.org থেকে এই সকল সিম্বল এবং তাদের অর্থের সূচী দেখতে পারে।

|-
| 02:29
| আমি Documents এ ক্লিক করব।

|-
| 02:33
|এখন স্টার্টআপ গাইডে ক্লিক করুন। এটি আরেকটি ট্যাবেও রয়েছে।

|-
| 02:40
|আমি সরাসরি পৃষ্ঠা সংখ্যা 82 তে যাবো।

|-
| 02:45
|এখানে আপনি বিভিন্ন সিম্বল এবং তাদের অর্থ দেখতে পারেন।

|-
| 02:51
|এখন সেল ডিজাইনার উইন্ডোতে ফিরে আসি।

|-
|02:55
|Draw ক্ষেত্রের নীচে List ক্ষেত্র রয়েছে।

|-
| 02:59
| এখানে যে কেউ মডেলের কম্পোনেন্ট এবং ফাংশনের তালিকা দেখতে এবং এডিট করতে পারে।

|-
| 03:06
| Notes ক্ষেত্রের ব্যবহার কম্পোনেন্টের নোট দেখতে এবং এডিট করতে ব্যবহৃত হয়।

|-
| 03:12
|বাম দিকে, Tree ক্ষেত্র রয়েছে যা ট্রি স্ট্রাকচারে থাকা কম্পোনেন্ট সূচীবদ্ধ করে।

|-
| 03:21
| এর নীচে Layer ক্ষেত্র রয়েছে যা মডেলের সকল লেয়ার দেখায়।

|-
| 03:27
| বর্ডার লাইন টেনে এনে ক্ষেত্রের আকার বদলানো যেতে পারে।

|-
| 03:33
| আমি কার্সার বর্ডার লাইনে রাখব। আপনি ডবল হেডেড অ্যারো দেখবেন। ক্ষেত্র বাড়াতে বা কমাতে এটি টানুন।

|-
| 03:45
|লিস্ট এবং নোটস ক্ষেত্রে স্থিতি বদলাতে

|-
| 03:50
| View বিকল্পে যান. List এ ক্লিক করুন এবং Right চয়ন করুন।

|-
| 03:56
| এটি লিস্ট বদলে ডানদিকে আনে। ডাউন হল ডিফল্ট।

|-
| 04:00
|এখন স্লাইডে ফিরে যাই।

|-
| 04:05
| এটি একটি সরল নেটওয়ার্ক যা আমরা বানাবো।

|-
| 04:10
| এই নেটওয়ার্কে প্রোটিন C এর catalysis এ, প্রোটিন A প্রোটিন B এর state transition হয়ে যায়।

|-
| 04:21
| এর বদলে প্রোটিন B প্রোটিন D এর state transition হয়ে যায়।

|-
| 04:27
| এই transition প্রোটিন E দ্বারা বাধিত হয়।

|-
| 04:32
| এখন এই নেটওয়ার্ক বানাই।

|-
| 04:34
|আমি CellDesigner উইন্ডোতে ফিরে যাবো।

|-
| 04:39
|এখন File এবং তারপর New তে ক্লিক করুন।

|-
| 04:43
| New Document নামে একটি ছোট ডায়লগ বাক্স খুলবে।

|-
| 04:48
| এটি হল name ফীল্ড।

|-
| 04:50
| আমি simple network লিখব।
|-
| 04:53
| এখানে আবশ্যকতা অনুযায়ী উচ্চতা এবং প্রস্থ বদলানো যেতে পারে। যদিও আমি ডিফল্ট উচ্চতা এবং প্রস্থ রাখব।

|-
| 05:03
| OK তে ক্লিক করুন। আপনি Draw ক্ষেত্রের উপরে বামদিকে থাকা নাম দেখতে পাবেন।

|-
| 05:12
| এখন, Edit এ যান এবং Grid snap এবং Grid visible সক্ষম করুন।

|-
| 05:21
|ড্র ক্ষেত্রে একটি গ্রিড দেখায়।

|-
| 05:25
| Grid snap কম্পোনেন্টগুলিকে গ্রিডের সাথে সঠিকভাবে সারিবদ্ধ করবে।

|-
| 05:29
| নেটওয়ার্ক পূর্ণ হলে আপনি Grid visible অচয়নিত করতে পারেন।

|-
| 05:34
|কম্পোনেন্ট যোগ করার পূর্বে আপনাকে স্পিসিস এবং রিঅ্যাকশনের কিছু উদাহরণ দেখাই।

|-
| 05:42
|প্রথমে আমরা স্পিসিস দেখি।

|-
| 05:45
| এখানে দেওয়া সঙ্কেত জেনেরিক প্রোটিন, রিসেপটর, আয়ন চ্যানেল, truncated প্রোটিন, জিন, RNA ইত্যাদি রয়েছে।

|-
| 05:58
|এখন রিঅ্যাকশন দেখি, প্রথমে রয়েছে State transition, Heterodimer association, Dissociation, Catalysis, Inhibition ইত্যাদি।

|-
| 06:11
| আমরা Species টুলবারে প্রথমে আইকনে ক্লিক করব। এই আইকন প্রোটিনের জন্য।

|-
| 06:22
| Draw area যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন যেখানে আপনি এই species রাখতে চান।

|-
| 06:28
| আমি এটি Draw area এর বামদিকে রাখবো।

|-
| 06:33
| একটি ছোট ডায়লগ বাক্স খুলবে এবং species এর নাম জিজ্ঞাসা করবে।

|-
| 06:39
| আমি নতুন species এর নাম A রাখবো এবং OK তে ক্লিক করব।

|-
| 06:46
|লিস্ট এলাকার পরিবর্তনও দেখুন।

|-
| 06:50
| যেমনকি আপনি দেখতে পারেন আমরা Draw area তে একটি নতুন স্পিসিস জুড়েছি। একইভাবে আমি B জুড়ব।

|-
| 06:58
| যে কোনো কম্পোনেন্ট এডিট বা সরানোর আগে আপনাদের এটি চয়ন করতে হবে।

|-
| 07:03
| কম্পোনেন্ট চয়ন করতে তাতে ক্লিক করুন। নিশ্চিত করুন এটি করার আগে সিলেক্ট আইকন অন হোক।

|-
| 07:12
| আমি A এর পাশে B রাখতে চাই। তাই B তে ক্লিক করে এটি চয়ন করুন।

|-
| 07:17
| এটি টেনে এনে A এর পাশে রাখুন।

|-
| 07:21
| এখন কম্পোনেন্টের আকার বদলানো দেখবো।

|-
| 07:24
| আমি A তে ক্লিক করব। আমরা এতে ছোট স্কোয়ার দেখি।

|-
| 07:29
| এই আকার বদলাতে হ্যান্ডেল রয়েছে।

|-
| 07:32
| আমি এই প্রান্তে কার্সার রেখে টানি।

|-
| 07:36
| আমরা দেখি যে A এর আকার বদলে গেছে।

|-
| 07:39
| কম্পোনেন্টের আকার বদলানোর আরেকটি উপায় রয়েছে যা পরবর্তী টিউটোরিয়ালে শিখব।

|-
| 07:46
| আপনি Ctrl + Z টিপে আগের কাজ পূর্বাবস্থায় নিয়ে যেতে পারেন।

|-
| 07:52
| আপনি redo করতে চাইলে Ctrl + Y টিপুন।

|-
| 07:54
| আপনি সরাসরি undo এবং redo এর আইকনে ক্লিক করেও এটি করতে পারেন।

|-
| 08:03
|এখন reactions যোগ করি।

|-
| 08:06
| রিঅ্যাকশন হল দুটি অবজেক্টের ইন্টারেকশন।

|-
| 08:09
| এটি একটি State transition রিঅ্যাকশন।

|-
| 08:12
| আমি Reaction টুলবারে State transition আইকনে ক্লিক করব।

|-
| 08:18
| A এর যে কোনো পাশে এবং তারপর B তে ক্লিক করুন।

|-
| 08:23
|এইভাবে, আপনি দেখেন যে রিঅ্যাকশন অ্যারো এখন A এবং B কে জোড়ে।

|-
| 08:30
| প্রথমে চয়নিত কম্পোনেন্টকে reactant হিসাবে ধরা হয়।

|-
| 08:35
| তাই সর্বদা প্রথমে reactants চয়ন করতে মনে রাখবেন।

|-
| 08:39
| ডিফল্ট রিঅ্যাকশন আইডি re1 হিসাবে আসে।

|-
| 08:43
| এখন C স্পিসিস জুড়ি এবং প্রথমে স্লাইডে দেখানো অনুযায়ী সঠিক স্থানে রাখি।

|-
| 08:54
|আমি Reaction টুলবার থেকে এই আইকন চয়ন করছি। এটি Catalysis এর জন্য।

|-
|09:00
| আমি C এর প্রান্তে এবং State transition রিঅ্যাকশনের square symbol এ ক্লিক করব।
|-
| 09:08
|এখন আমি স্পিসিস D জুড়বো এবং এটি B এর পাশে রাখবো।

|-
| 09:15
| এখন B থেকে D পর্যন্ত একটি State transition রিঅ্যাকশন জুড়ুন। ডিফল্ট রিঅ্যাকশন id হল re2.

|-
| 09:26
| আমি স্পিসিস E জুড়বো এবং পূর্ববর্তী স্লাইডে দেখানো অনুযায়ী যথাযথ স্থানে রাখবো।

|-
| 09:35
|এখন Reaction টুলবার থেকে এই আইকন চয়ন করব, যা Inhibition reaction প্রদর্শন করে।

|-
| 09:44
| আমি E এর প্রান্তে এবং State transition রিঅ্যাকশনের এই বর্গাকার সিম্বলে ক্লিক করব। এটি দুটি বিন্দু জুড়বে।
|-
| 09:54
| এখন একটি সরল নেটওয়ার্ক দেখি।

|-
| 09:57
| আপনার কাজটি সংরক্ষণ করুন।

|-
| 10:00
| File এ যান. Save as এ ক্লিক করুন।

|-
| 10:04
| এটিকে Simple Network নাম দেবো।

|-
| 10:06
| এটি আমাদের কাজ .xml ফরম্যাটে সংরক্ষণ করবে। Save এ ক্লিক করুন।

|-
| 10:12
| এখন একটি ইমেজ এক্সপোর্ট করা শিখি। এটি করতে, File>Export Image এ যান।

|-
| 10:22
|আপনি ইমেজ pdf, png, jpeg ইত্যাদি বিভিন্ন ফরম্যাটে সংরক্ষণ করতে পারেন।

|-
| 10:29
| আমি এটি jpeg ইমেজ হিসাবে সংরক্ষণ করব। Save এ ক্লিক করুন।

|-
| 10:35
| এখন নেটওয়ার্ক জুম করা দেখি।

|-
| 10:38
| আমাদের জুমের 4 টি বিকল্প রয়েছে - জুম ইন, জুম আউট, জুম ফিট, জুম রিসেট।

|-
| 10:47
| আমি দুইবার Zoom In আইকনে ক্লিক করব। আমরা ম্যাগ্নিফাইড ইমেজ দেখি।

|-
| 10:54
| এখন Zoom Reset এ ক্লিক করব। নেটওয়ার্ক মূল আকারে ফিরে আসে।

|-
|11:02
| Getting started with CellDesigner এর টিউটোরিয়াল এখানেই শেষ হয়।

|-
| 11:08
|সংক্ষেপে, আমরা সেল ডিজাইনারে মেনু এবং টুল বার সম্পর্কে শিখেছি।

|-
| 11:14
| সেল ডিজাইনারের বিভিন্ন ক্ষেত্র সম্পর্কে। স্পিসিস এবং রিঅ্যাকশন যেমন কম্পোনেন্ট সম্পর্কে।

|-
| 11:20
| আমরা স্পিসিস এবং রিঅ্যাকশন কম্পোনেন্ট দ্বারা সরল নেটওয়ার্ক বানানো শিখেছি।

|-
| 11:26
|এছাড়া জুম করা, নেটওয়ার্ক সংরক্ষণ করা এবং একটি ইমেজ এক্সপোর্ট করাও শিখেছি।

|-
| 11:32
| অনুশীলনী হিসাবে CellDesigner 4.2 এর সাহায্যে একটি নেটওয়ার্ক বানান।

|-
| 11:39
| এই নেটওয়ার্কে, ক্যাটালিস্ট প্রোটিন C এর উপস্থিতিতে A এবং B প্রোটিন যুক্ত হয়ে একটি কমপ্লেক্স বানায়।

|-
| 11:51
| এই কমপ্লেক্স ক্যাটালিস্ট D এর উপস্থিতিতে ডিগ্রেড হয়ে যায়।

|-
| 11:58
|আপনাকে এইরকম একটি নেটওয়ার্ক পেতে হবে।

|-
| 12:01
| প্রদত্ত লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়। ভালো ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন।

|-
| 12:13
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে। অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়। অধিক জানতে contact@spoken-tutorial.org তে লিখুন।

|-
| 12:28
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পের অংশবিশেষ। এটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা সমর্থিত।

|-
| 12:41
| এই মিশন সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য: http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro

|-
| 12:53
|আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ।

|}

CellDesigner/C2/Getting-Started-with-CellDesigner/Bengali - Revision history

Satarupadutta: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | Getting started with CellDesigner এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগ..."