Sandhya.np14: Created page with "{|Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯ..."

2018-07-19T15:06:43Z

Created page with "{|Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯ..."

New page

{|Border=1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
| 00:01
| ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗೆ ನಿಮಗೆ ಸ್ವಾಗತ.

| -
| 00:07
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು: 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ಸ್' ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ರಚಿಸುವುದು,

| -
| 00:13
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯುವುದು,
| -
| 00:15
| 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದು

| -
| 00:19
| ಮತ್ತು, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸುವುದು (sort) ಇವುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಕಲಿಯುವೆವು.

| -
| 00:23
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು, ನೀವು

| -
| 00:27
| ಪದವಿಪೂರ್ವ ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಅಥವಾ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್

| -
| 00:31
| ಮತ್ತು ಬೇಸಿಕ್ Python (ಪೈಥನ್) ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಇವುಗಳನ್ನು ತಿಳಿದಿರಬೇಕು.

| -
| 00:34
| ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಪೈಥನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಿ.

| -
| 00:38
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು '''Ubuntu OS''' ನ 14.10 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,

| -
| 00:45
| '''Python''' ನ 2.7.8 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,

| -
| 00:48
| '''Ipython interpreter''' ನ (ಐ ಪೈಥನ್ ಇಂಟರ್ಪ್ರಿಟರ್) 2.3.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಮತ್ತು '''Biopython''' ನ 1.64 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಇವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ.
| -
| 00:55
| ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವುದನ್ನು ಓದಲಿಕ್ಕಾಗಿ, '''parse''' ಮತ್ತು '''read''' ಎಂಬ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಈಗಾಗಲೇ ನಾವು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.

| -
| 01: 03
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು '''write''' 'ಫಂಕ್ಷನ್' ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುವುದು

| -
| 01:09
| ಮತ್ತು, '''Convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ, ವಿವಿಧ 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಒಂದರಿಂದ ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ನಾವು ಕಲಿಯುತ್ತೇವೆ.

| -
| 01:16
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸಬೇಕು ಎಂಬುದನ್ನು ಈಗ ನಾನು ತೋರಿಸುತ್ತೇನೆ.

| -
| 01:20
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನೊಂದಿಗೆ, ಇಲ್ಲಿ ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ಇದೆ.

| -
| 01: 24
| 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.

| -
| 01: 28
| ಫೈಲ್, '''GI''' ಆಕ್ಸೆಶನ್ ನಂಬರ್ (GI accession number) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ.

| -
| 01: 36
| ಈಗ ನಾವು ಈ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ, '''FASTA ''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತೇವೆ.

| -
| 01: 41
| ಇಲ್ಲಿ, 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್' ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ.

| -
| 01:45
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ:

| -
| 01: 49
| ಇದು ' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್' ಗಾಗಿ ಬೇಸಿಕ್ ಡೇಟಾ ಟೈಪ್ ಆಗಿದೆ.

| -
| 01: 55
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, '''identifier''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.
|-
| 02: 04
| '''Ctrl, Alt''' ಮತ್ತು '''t''' ಕೀ ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಒತ್ತುವ ಮೂಲಕ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.

| -
| 02:10
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ: '''ipython''' ಮತ್ತು '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 02: 15
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ:

| -
| 02: 18
| from Bio dot Seq ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Seq ಕ್ಲಾಸ್.

| -
| 02: 24
| from Bio dot SeqRecord ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Sequence Record ಕ್ಲಾಸ್.

| -
| 02: 31
| ನಂತರ, from Bio dot Alphabet ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import generic protein ಕ್ಲಾಸ್.

| -
| 02: 38
| ಆಮೇಲೆ, ನಾನು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''record1''' ಎಂಬ ವೇರಿಯಬಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡುವೆನು.

| -
| 02: 45
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ನಿಂದ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, id (ಐಡಿ) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳನ್ನು ಕಾಪಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನುಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಆಯಾ ಸಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಪೇಸ್ಟ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 02: 56
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 02:58
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''record1''' ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 03: 02
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 03: 04
| ಔಟ್ಪುಟ್, 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.

| -
| 03: 10
| ಇದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು '''id''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.

| -
| 03:13
| ಮೇಲಿನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ನಾವು ''' write ''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವೆವು.

| -
| 03: 21
| '''Bio package''' ನಿಂದ '''SeqIO module''' ಅನ್ನು ಇಂಪೋರ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
| -
| 03: 26
| ನಂತರ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು, 'ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್' ಅನ್ನು '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ನೊಂದಿಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 03: 40
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್, 3 'ಆರ್ಗ್ಯುಮೆಂಟ್' ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.

| -
| 03: 44
| ಮೊದಲನೆಯದು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಟೋರ್ ಮಾಡುವ ವೇರಿಯಬಲ್ ಆಗಿದೆ.

| -
| 03: 49
| ಎರಡನೆಯದು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬರೆಯಬೇಕಾದ ಫೈಲ್ ನ ಹೆಸರು ಆಗಿದೆ.

| -
| 03: 54
| ಮೂರನೆಯದು, ಬರೆಯಲು ಬೇಕಾಗಿರುವ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಆಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 03:58
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಒಂದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂದರೆ, ನಾವು ಒಂದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿದ್ದೇವೆ.
|-
| 04: 07
| FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ "example.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಾಲಾಗಿದೆ.

| -
| 04: 13
| ನಾನು ನಿಮ್ಮನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಎಚ್ಚರಿಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ. ಔಟ್ಪುಟ್, ಇದೇ ಹೆಸರಿನ ಫೈಲ್ ಈಗಾಗಲೇ ಇದ್ದರೆ, ಅದರ ಮೇಲೆಯೇ ಬರೆದುಬಿಡುತ್ತದೆ.

| -
| 04:18
| ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಗೆ ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 04: 24
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.

| -
| 04: 27
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, ಈಗ FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿದೆ.

| -
| 04: 31
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.

| -
| 04:33
| ಅನೇಕ 'ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್' ಟೂಲ್ ಗಳು, ವಿಭಿನ್ನ ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.

| -
| 04: 38
| ಹೀಗಾಗಿ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳ ನಡುವೆ ಪರಸ್ಪರ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ.

| -
| 04: 44
| '''SeqIO''' ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲ್ ಪರಿವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ನಾವು ಮಾಡಬಹುದು.

| -
| 04:50
| ಪ್ರದರ್ಶನಕ್ಕಾಗಿ, ನಾನು ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತೇನೆ.

| -
| 04: 55
| ನನ್ನ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಇದೆ.
| -
| 04: 59
| ನಾನು ಇದನ್ನು ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯುತ್ತೇನೆ.

| -
| 05: 02
| ಫೈಲ್, '''GenBank''' (ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್) ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, '''HIV genome''' ಅನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್) ಹೊಂದಿದೆ.

| -
| 05: 07
| ಈ 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್, 'ಜೀನೋಮ್' ನಲ್ಲಿಯ ಎಲ್ಲಾ ಜೀನ್ ಗಳ ವಿವರಣೆಗಳನ್ನು, ಫೈಲ್ ನ ಮೊದಲ ಭಾಗದಲ್ಲಿ, ಹೊಂದಿದೆ.

| -
| 05: 14
| ನಂತರ, ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣವಾದ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.

| -
| 05: 18
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ. ಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 05: 23
| ಇಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್, 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸಂಪೂರ್ಣ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 05: 33
| 'FASTA' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಈಗ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, 'HIV.fasta' ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.

| -
| 05:39
| ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ ಈ ಫೈಲ್ ಗೆ ಹೋಗಿ ಮತ್ತು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.

| -
| 05: 46
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.

| -
| 05: 49
| ನಾವು '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದಾಗಿದೆ. ಆದರೆ ಅದು ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ.

| -
| 05: 56
| ಕೆಲವು ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು, ಇನ್ನುಳಿದ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳು ಹೊಂದಿರದ ಮಾಹಿತಿಯು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
|-
| 06: 02
| ಉದಾಹರಣೆಗೆ: ನಾವು 'GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು, ಆದರೆ ಇದರ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.

| -
| 06: 09
| ಹಾಗೆಯೇ, ನಾವು ಒಂದು 'FASTQ' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, 'FASTA' ಫೈಲ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು ಆದರೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.

| -
| 06: 15
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, '''help''' ಕಮಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 06: 21
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 06: 24
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ಗೆ ಹಿಂತಿರುಗಲು, ಕೀ ಬೋರ್ಡ್ ನಲ್ಲಿಯ 'q' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| -
| 06: 28
| '''GenBank''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, 'ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್' ನಿಂದ, ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು ನಾವು ಹೊರತೆಗೆಯಬಹುದು.

| -
| 06: 35
| ಈ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು, 'FASTA' ಅಥವಾ ಇತರ ಯಾವುದೇ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಬಹುದು.

| -
| 06: 41
| ಇದಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 06: 47
| ಈ ಕೋಡ್, ಎಲ್ಲ ಪ್ರತ್ಯೇಕ '''CDS''' (ಸಿಡಿಎಸ್) ಜೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ '''id''' ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 'ಜೀನ್' ನ ಹೆಸರನ್ನು ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಬರೆಯುತ್ತದೆ.

| -
| 06: 56
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, "HIV_geneseq.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.

| -
| 07:07
| ನಾವು 'ಬಯೋಪೈಥನ್' ಟೂಲ್ ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು.

| -
| 07: 12
| ಇಲ್ಲಿ, ನಾನು “hemoglobin.fasta” ಎಂಬ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆದಿದ್ದೇನೆ. ಇದು ಆರು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.

| -
| 07: 19
| ಪ್ರತಿಯೊಂದು ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಉದ್ದವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ.

| -
| 07:23
| ಅತ್ಯಂತ ಉದ್ದ ಇರುವ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಅನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 07: 27
| ವಿಂಗಡಿಸಲಾದ (sorted ) ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು "sorted_hemoglobin.fasta" ಎಂದು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.

| -
| 07: 38
| ಚಿಕ್ಕ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, '''records.sort''' ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್ ನಲ್ಲಿ, ಆರ್ಗ್ಯೂಮೆಂಟ್ ಗಳನ್ನು ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಇರಿಸಿ.

| -
| 07:45
| ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ, ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ನಾವು: ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು,

| -
| 07: 51
| 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್' ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು,

| -
| 07: 58
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು,

| -
| 08: 03
| ಮತ್ತು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.

| -
| 08:07
| ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಗಾಗಿ -

| -
| 08: 09
|HIV ಯ 'ಜೆನೊಮಿಕ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನಿಂದ, 4587 ರಿಂದ 5165 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀನ್ "HIV1gp3" ಯನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ 1 ಜಿಪಿ 3) ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್ ಮಾಡಿ.

| -
| 08: 21
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಕೋಡ್ ಫೈಲ್ ಗಳಲ್ಲಿ, "HIV.gb" ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ.

| -
| 08: 28
| ನಿಮ್ಮ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್, ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
|-
| 08:43
| ಈ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿರುವ ವೀಡಿಯೋ, ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.

|-
|08:48
| ದಯವಿಟ್ಟು ಇದನ್ನು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ ನೋಡಿ. ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಟೀಮ್, ಕಾರ್ಯಶಾಲೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆನ್ಲೈನ್ ಟೆಸ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ ತೇರ್ಗಡೆಯಾದವರಿಗೆ ಸರ್ಟಿಫಿಕೇಟ್ ಕೊಡುತ್ತದೆ.

|-
|08:57
| ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, ದಯವಿಟ್ಟು ನಮ್ಮನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ.

|-
|09:00
| ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್, ರಾಷ್ಟ್ರಿಯ ಸಾಕ್ಷರತಾ ಮಿಷನ್ ICT, MHRD ಮೂಲಕ ಭಾರತ ಸರ್ಕಾರದ ಆಧಾರವನ್ನು ಪಡೆದಿದೆ.

|-
|09:06
| ಈ ಮಿಶನ್ ನ ಬಗೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯು ಇಲ್ಲಿ ಇರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ.

|-
| 09:10
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಅನುವಾದಕಿ IIT Bombay ಯಿಂದ ಸಂಧ್ಯಾ ಪುಣೇಕರ್ ಮತ್ತು ಧ್ವನಿ ನವೀನ್ ಭಟ್, ಉಪ್ಪಿನಪಟ್ಟಣ. ಧನ್ಯವಾದಗಳು.

|}

Biopython/C2/Writing-Sequence-Files/Kannada - Revision history

Sandhya.np14 at 15:20, 19 July 2018

Sandhya.np14 at 15:15, 19 July 2018

Sandhya.np14: Created page with "{|Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯ..."