Sandhya.np14 at 14:05, 14 August 2019

2019-08-14T14:05:55Z

Udayana: Created page with "{| Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 |'''Manipulating Sequences''' इत्याख्ये अनुशिक्षणे भवद्भ्यः स्..."

2019-08-11T12:11:07Z

Created page with "{| Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 |'''Manipulating Sequences''' इत्याख्ये अनुशिक्षणे भवद्भ्यः स्..."

New page

{| Border=1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
| 00:01
|'''Manipulating Sequences''' इत्याख्ये अनुशिक्षणे भवद्भ्यः स्वागतम् ।
|-
| 00:06
| अस्मिन् अनुशिक्षणे वयं बयोपैथन् टूल्स् ; किञ्चन DNA सीक्वेन्स् सृष्ट्यर्थं,
|-
| 00:13
| निर्दिष्टस्थलेषु डएन्ए सीक्वेन्स् स्लैस् कर्तुं,
|-
| 00:17
| सीक्वेन्स्-द्वयं संयोज्य नूतनमेकं सीक्वेन्स् रचयितुम् इत्युक्ते काङ्क्याटिनेट् (concatenate) कर्तुं,
|-
| 00:22
| सिक्वेन्स् दैर्घ्यम् ज्ञातुम् ,
|-
| 00:26
| प्रत्येकं बेस् अथवा स्ट्रिङ्ग् इत्यस्य भागं गणयितुं,
|-
| 00:31
| किञ्चन निर्दिष्टं बेस् अथवा स्ट्रिङ्ग् भागम् अन्वेष्टुं,
|-
| 00:35
| किञ्चन सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्, म्यूटेबल् सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् (परिवर्तनयोग्यं सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्) रूपेण परिवर्तयितुम् उपयुञ्ज्महे ।
|-
| 00:40
| एतत् अनुशिक्षणम् अवगन्तुं, भवतां पदवीपूर्वस्तरीयस्य बयोकेमेस्ट्रि अथवा बयोइन्फर्मेटिक्स्
|-
| 00:47
| तथा बेसिक् पैथान् प्रोग्रामिङ्ग् इत्येतेषां ज्ञानं स्यात् ।
|-
| 00:51
| तथा नास्ति चेत्, अधः निर्दिष्टायां पर्चन्यां पैथन् अनुशिक्षणानि पश्यन्तु । ಇಲ್ಲದಿದ್ದಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗೆ
|-
| 00:56
| एतत् अनुशिक्षणं रेकार्ड् कर्तुम्, अहं Ubuntu OS इत्यस्य 14.10 आवृत्तिः,
|-
| 01:03
| पैथन् इत्यस्य 2.7.8 आवृत्तिः,
|-
| 01:07
| Ipython interpreter इत्यस्य 2.3.0 आवृत्तिः,
|-
| 01:12
| बयोपैथन् इत्यस्य 1.64 आवृत्तिः, इत्येतेषाम् उपयोगं कुर्वन् अस्मि ।
|-
| 01:16
| अहं टर्मिनल् उद्घाटयामि, ipython interpreter आरम्भं करोमि च ।
|-
| 01:21
| Ctrl, Alt तथा t की युगपदेव नुदन्तु ।
|-
|01:26
| प्राम्प्ट् मध्ये, ipython इति टङ्कयित्वा Enter की नुदन्तु ।
|-
| 01:31
| स्क्रीन् उपरि, Ipython प्राम्प्ट् दृश्यते ।
|-
| 01:35
| बयोपैथन् उपयुज्य, किञ्चन निर्दिष्ट-दैर्घ्ययुतस्य, यस्य कस्यचित् DNA सीक्वेन्स् निमित्तम्, अस्माभिः सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् रचयितुं शक्यते ।
|-
| 01:44
| अधुना वयं 20 बेस् इत्येतेषां DNA सीक्वेन्स् निमित्तम्, किञ्चन सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् रचयाम ।
|-
|01:50
| प्राम्पट् मध्ये, एवं टङ्कयन्तु : import random , Enter की नुदन्तु च ।
|-
| 01:56
| अनन्तरं, Bio प्याकेज् तः Seq माड्यूल् इम्पोर्ट् कुर्वन्तु ।
|-
| 02:01
| तदा तदा Seq इत्येतत् seek इत्यपि उच्चार्यते ।
|-
| 02:06
| प्राम्पट् मध्ये एवं टङ्कयन्तु '''From Bio dot Seq import Seq''', Enter की नुदन्तु ।
|-
| 02:15
| DNA सीक्वेन्स् मध्ये विद्यमानानां स्थानाम् अक्षराणि सूचयितुं, वयं Bio.Alphabet माड्यूल् उपयुञ्ज्महे ।
|-
| 02:22
| एवं टङ्कयन्तु '''from Bio dot Alphabet import generic underscore dna'''. Enter की नुदन्तु ।
|-
| 02:32
| यस्य कस्यचन DNA सीक्वेन्स् निमित्तं, सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् रचयितुम्,अधोनिर्दिष्टं कमाण्ड् टङ्कयन्तु ।
|-
| 02:38
| सीक्वेन्स् इत्येतत्, '''dna1''' इति वेरियबल्-मध्ये स्टोर् कुर्वन्तु ।
|-
| 02:42
| कृपया अवलोकयन्तु : एतत् कमाण्ड्-मध्ये, डबल्-कोट्स् परतया, सिङ्गल्-कोट्-द्वयम् उपयोक्तव्यम् । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 02:50
|औट्-पुट्-निमित्तं, '''dna1''' इति टङ्कनं कृत्वा, Enter की नुदन्तु ।
|-
| 02:55
|ಔಟ್ಪುಟ್, ಸೂಚಿಸಿದ DNA ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
|-
| 03:00
| भवद्भ्यः नूतनं सीक्वेन्स् अपेक्षितं चेत्,उपरितनमेव कमाण्ड् प्राप्तुम्, अप्-आरो (up-arrow) की नुदन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 03:11
| औट्-पुट्-निमित्तं, वेरियबल् नाम dna1 इति टैप् कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 03:17
| औट्-पुट्, किञ्चन नूतनं DNA सीक्वेन्स् दर्शयति । एतत् प्रथमसीक्वेन्स् अपेक्षया भिन्नं भवति ।
|-
| 03:23
| सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्स् विषये :
|-
| 03:25
| सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्स् सामान्यतः इतरे पैथन्-स्ट्रिङ्ग्स् इव व्यवहरति ।
|-
| 03:30
| अतः, अन्य-पैथन्-स्ट्रिङ्ग्स्-निमित्तम् अनुस्रियमाणाः पद्धतीः अनुसरन्तु ।
|-
| 03:35
| पैथन्-मध्ये, स्ट्रिङ्ग्स्-मध्ये विद्यमान-क्यारेक्टर्स् (अक्षराणि) १ परतया ० तः कुर्मः ।
|-
| 03:41
| सीक्वेन्स्-मध्ये विद्यमानस्य प्रथम-अक्षरस्य स्थानं ० (शून्यम्) अस्ति ।
|-
| 03:45
| टर्मिनल् प्रति प्रत्यागच्छ्न्तु ।
|-
| 03:47
| बहुवारं, भवद्भिः, सीक्वेन्स् इत्यस्य एकस्मिन् भागे एव कार्यं करणीयं भवेत् ।
|-
| 03:52
| इदानीं, स्ट्रिङ्ग्-भागान् निष्कास्य, तानि सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्स्-रूपेण कथं स्टोर्-करणीयम् इति पश्यामः ।
|-
| 03:58
| उदाहरणार्थं, वयं DNA सीक्वेन्स् इत्येतत् स्थानद्वये स्लैस् कुर्मः ।
|-
| 04:04
| प्रथमं, 6 ,7 बेस् मध्ये अस्ति ।
|-
| 04:08
| एतत् सीक्वेन्स् आरम्भात् 6 बेस् पर्यन्तमपि विद्यमानम् एकं भागम् उद्घाटयति ।
|-
| 04:15
| द्वितीय स्लैस्, 11 ,12 बेस् मध्ये अस्ति ।
|-
| 04:20
| द्वितीयः भागः, सीक्वेन्स् इत्यस्य 12 बेस्-तः सीक्वेन्स् अन्तपर्यन्तमपि भवति ।
|-
| 04:26
| प्रथमभागम् उद्घाटयितुम्, प्राम्प्ट्-मध्ये अधोनिर्दिष्टं कमाण्ड् टैप्-कुर्वन्तु ।
|-
| 04:31
| '''String1 equal to dna1 within brackets 0 colon 6'''.
|-
| 04:39
| '''string1''', प्रथमभागं स्टोर्-कर्तुं विद्यमानं वेरियबल् अस्ति ।
|-
| 04:43
| कमाण्ड् इत्यस्य अवशिष्टः भागः, सामान्यपैथन्-मध्ये यथा, तथैव भवति ।
|-
| 04:47
| एतस्य आवरणस्य अन्तः विद्यमानं, कोलन्-द्वारा विभक्तं, आरम्भस्य अन्त्यस्य च स्थानम् ।
|-
| 04:53
| एतानि स्थानानि प्रथमस्थानयुक्तानि किन्तु अन्तिमस्थानयुक्तानि न । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 05:01
| औट्-पुट् द्रष्टुं, '''string1''' इति टैप् कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 05:04
| औट्-पुट्, प्रथमभागं, सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् इव दर्शयति
|-
| 05:10
| सीक्वेन्स्-तः द्वितीयस्ट्रिङ्ग् निष्कासयितुम्, अप्-आरो (up-arrow) की नुदन्तु कमाण्ड् एवम् edit कुर्वन्तु च ।
|-
| 05:17
| वेरियबल् नाम '''string2''' इति, स्थानानि 11 , 20 इति च परिवर्तयन्तु ।
|-
| 05:24
| औट्-पुट्-निमित्तं, '''string2''' इति टङ्कयन्तु, Enter की नुदन्तु ।
|-
| 05:30
| इदानीम् अस्माभिः द्वितीयं भागम् अपि सीक्वेन्स् आब्जेक्ट्-रूपेण प्राप्तवन्तः स्मः ।
|-
| 05:34
| इदानीं वयं काङ्क्याटिनेट् (concatenate) कुर्मः । तन्नाम, एतत् स्ट्रिङ्-द्वयं योजयित्वा किञ्चन नूतनं स्ट्रिङ् कुर्मः ।
|-
| 05:42
| नूतनं सीक्वेन्स्, '''dna2''' इत्याख्ये वेरियबल्-मध्ये स्टोर् कुर्मः ।
|-
| 05:46
| एवं टङ्कनं कुर्वन्तु : '''dna2 equal to string1 plus string2''', Enter की नुदन्तु ।
|-
| 05:53
| कृपया अवलोकयन्तु : असङ्गत-अल्फाबेट्-युक्त-सीक्वेन्स् वयं योजयितुं न शक्नुमः ।
|-
| 05:59
| तन्नाम, वयं DNA सीक्वेन्स् प्रोटीन् सीक्वेन्स् च काङ्क्याटिनेट्-कृत्वा नूतनं सीक्वेन्स् कर्तुं न शक्नुमः
|-
| 06:07
| सीक्वेन्स्-द्वयमपि समानविधमेव अल्फाबेट् अट्रिब्यूट्स् (गुणलक्षण)युक्तं स्यात् ।
|-
| 06:12
| औट्-पुट् द्रष्टुं, '''dna2''' इति टङ्कनं कृत्वा, Enter की नुदन्तु ।
|-
| 06:17
| औट्-पुट्, string1 , string2 इत्येतयोः संयुक्तं नूतनं सीक्वेन्स् दर्शयति ।
|-
| 06:23
| नूतनसीक्वेन्स् दैर्घ्यं ज्ञातुं, वयं '''len''' फङ्क्षन् इत्यस्य उपयोगं कुर्मः ।
|-
| 06:29
| एवं टङ्कनं कुर्वन्तु : "len" within parenthesis "dna2" , '''Enter''' की नुदन्तु च ।
|-
| 06:34
| औट्-पुट्, सीक्वेन्स् इत्येतत् 15 बेस्-दीर्घयुतं दर्शयति ।
|-
| 06:39
| सीक्वेन्स्-मध्ये विद्यमान-प्रत्येक-बेस्-सङ्ख्याः अपि अस्माभिः गणयितुं शक्याः ।
|-
| 06:44
| तथा कर्तुं, वयं '''count()''' फङ्क्षन् उपयोगं कुर्मः ।
|-
| 06:47
| उदाहरणार्थं – सीक्वेन्स्-मध्ये विद्यमान-अलनैन्-सङ्ख्याः गणयितुम्, अधोनिर्दिष्टकमाण्ड् टङ्कयन्तु: '''dna2 dot count within parenthesis within double quotes alphabet A'''.
|-
| 07:02
| Enter की नुदन्तु ।
|-
| 07:04
|औट्-पुट्, '''dna2''' सीक्वेन्स्-मध्ये विद्यमानानाम् अलनैन् इत्येतेषां सङ्ख्यां दर्शयति ।
|-
| 07:10
| किञ्चन निर्दिष्टं बेस् अथवा स्ट्रिङ्ग् इत्यस्य भागम् अन्वेष्टुं, वयं '''find()''' फङ्क्षन् उपयोगं कुर्मः ।
|-
| 07:16
| एवं टैप् कुर्वन्तु : '''dna2 dot find''' within parenthesis within double quotes "GC". Enter की नुदन्तु ।
|-
| 07:26
|औट्-पुट्, स्ट्रिङ्ग्-मध्ये प्रथमवारं GC इति दृश्यमानस्थानं दर्शयति ।
|-
| 07:32
| सामान्यतः, सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् एडिट् कर्तुं न शक्यते ।
|-
| 07:35
| किञ्चन सीक्वेन्स् एडिट् कर्तुम्, अस्माभिः तत् म्यूटेब सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् रूपेण परिवर्तनीयम् ।
|-
| 07:41
|तत् कर्तुम्, एवं टङ्कयन्तु : '''dna3 equal to dna2 dot to mutable''' open and close parenthesis. Enter की नुदन्तु ।
|-
| 07:52
| औट्-पुट्-निमित्तं, '''dna3''' इति टङ्कनं कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 07:55
| इदानीं सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् एडिट् कर्तुं शक्यते ।
|-
| 07:59
| वयं सीक्वेन्स् मध्ये विद्यमानं बेस् परिवर्त्य स्थापयामः ।
|-
| 08:01
| उदाहरणार्थं – 5 स्थाने विद्यमानं बेस्, अनलैन्-तः रीप्लेस्-कर्तुं, एवं टङ्कनं कुर्वन्तु: '''dna3 within brackets 5 equal to within double quotes alphabet A'''. Enter की नुदन्तु ।
|-
| 08:19
|औट्-पुट्-निमित्तं, '''dna3''' इति टङ्कनं कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 08:24
| औट्-पुट् अवलोकयन्तु । 5 स्थाने विद्यमानं “सैटोसिन्” (cytosine) इत्येतत्, “अलनिन्” (alanine) इत्येतस्मात् परिवर्तितम् अस्ति ।
|-
| 08:31
| स्ट्रिङ्ग् इत्यस्य किञ्चन भागं परिवर्तयितुम्, अधोनिर्दिष्टं कमाण्ड् टङ्कयन्तु ।
|-
| 08:35
| '''Dna3 within brackets 6 colon 10 equal to within double quotes ATGC'''. Enter की नुदन्तु ।
|-
| 08:45
| औट्-पुट्-निमित्तं, '''dna3''' इति टङ्कनं कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 08:52
|6स्थानात् 9स्थानपर्यन्तं 4 बेस्-परतया, नूतनानु बेस् ATGC आगतानि इति औट्-पुट् दर्शयति ।
|-
| 09:01
| भवतां सीक्वेन्स् आब्जेक्ट् सकृत् भवद्भिः एडिट्-करणानन्तरं, तत् read only फार्म्-प्रति पुनः परिवर्तयन्तु ।
|-
| 09:07
| एवं टङ्कनं कुर्वन्तु : '''dna4 equal to dna3 dot to seq open and close parenthesis'''. Enter की नुदन्तु ।
|-
| 09:19
| औट्-पुट्-निमित्तं '''dna4''' इति टङ्कनं कुर्वन्तु । Enter की नुदन्तु ।
|-
| 09:25
| सङ्क्षेपेण,
|-
| 09:27
| अस्मिन् अनुशिक्षणे, अस्माभिः ज्ञाताः अंशाः : कस्यापि एकस्य DNA सीक्वेन्स्-रचनम्,
|-
| 09:32
| निर्दिष्टेषु स्थानेषु, DNA सीक्वेन्स् स्लैस्-करणम्,
|-
| 09:36
| किञ्चन नूतनं सीक्वेन्स् रचयितुं, सीक्वेन्स्-द्वयस्य मिलित्वा योजनं तन्नाम काङ्क्याटिनेट्(concatenate)करणम् ।
|-
| 09:43
| तथैव, '''len, count''' , '''find''' फङ्क्षन् इत्येतेषाम् उपयोगः ।
|-
| 09:49
|सीक्वेन्स्-आब्जेक्ट् इत्येतत्, म्यूटेबल् सीक्वेन्स्-आब्जेक्ट्-रूपेण परिवर्तनं, स्ट्रिङ्ग् इत्यस्य बेस् अथवा एकस्य भागस्य परिवर्तनम् - एतत्सर्वम् अस्माभिः पठितम् ।
|-
| 09:57
| गृहकार्यार्थं, 30 बेस्-युक्तं किञ्चन DNA सीक्वेन्स् रचयन्तु ।
|-
| 10:02
| बयोपैथन्-टूल्स् उपयुज्य, GC पर्सेण्टेज् तथा सीक्वेन्स् मालिक्युलार् वैट् (molecular weight) अभिजानन्तु ।
|-
| 10:09
| भवतां सम्पन्नं गृहकार्यम् एवं भवति ।
|-
| 10:13
| औट्-पुट्, GC कण्टेण्ट् पर्सेण्टेज्-मध्ये दर्शयति ।
|-
| 10:18
| औट्-पुट् , DNA सीक्वेन्स् इत्यस्य मालिक्युलार् वैट् (molecular weight) दर्शयति ।
|-
| 10:23
| एतत् चलच्चित्रं, स्पोकन् ट्युटोरियल्-योजनायाः सारांशभूतम् अस्ति ।
|-
| 10:26
| भवताम् अन्तर्जालसम्पर्कस्य वेगः अल्पः अस्ति चेत्,भवन्तः एतत् डौन्-लोड्-कृत्वा द्रष्टुं शक्नुवन्ति ।
|-
| 10:30
|वयं कार्यशालाः सञ्चालयामः, प्रमाणपत्राणि च दद्मः ।
|-
| 10:32
| कृपया अस्माकं सम्पर्कं कुर्वन्तु ।
|-
| 10:35
| स्पोकन् ट्युटोरियल्-योजना, राष्ट्रिय-साक्षरता-मिषन्, ICT, MHRD द्वारा भारतसर्वकारस्य सहयोगं प्राप्तवती अस्ति ।
|-
| 10:43
| अस्य अनुशिक्षणस्य अनुवादकः डा. उदयन हेगडे, प्रवाचकश्च श्री नवीनभट्टः, उप्पिनपट्टनम् । धन्यवादाः ।
|}

Biopython/C2/Manipulating-Sequences/Sanskrit - Revision history

Sandhya.np14 at 14:05, 14 August 2019

NaveenBhat at 04:41, 12 August 2019

Udayana: Created page with "{| Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 |'''Manipulating Sequences''' इत्याख्ये अनुशिक्षणे भवद्भ्यः स्..."

@@ Line 53: / Line 53: @@
 |-
 | 01:21
-| Ctrl, Alt तथा  t की युगपदेव नुदन्तु ।
+| '''Ctrl, Alt''' तथा  '''T''' की युगपदेव नुदन्तु ।
 |-
 |01:26
@@ Line 248: / Line 248: @@
 |-
 | 07:41
-|तत् कर्तुम्, एवं टङ्कयन्तु : '''dna3 equal to dna2 dot to mutable''' open and close parenthesis. Enter की नुदन्तु ।
+|तत् कर्तुम्, एवं टङ्कयन्तु : '''dna3 equal to dna2 dot to mutable open and close parenthesis'''. Enter की नुदन्तु ।
 |-
 | 07:52