PoojaMoolya at 07:35, 13 February 2018

2018-02-13T07:35:49Z

Vijinair at 09:13, 19 January 2018

2018-01-19T09:13:17Z

Prena at 08:07, 9 January 2018

2018-01-09T08:07:21Z

Prena: Created page with "{| Border=1 ! Time ! Narration |- | 00:01 | '''Biopython''' ടൂൾസ് '' 'BLAST' '' '' 'ബയോപിത്തോൺ' '' ഉപയ..."

2018-01-09T08:02:03Z

Created page with "{| Border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Biopython''' ടൂൾസ് '' 'BLAST' '' '' 'ബയോപിത്തോൺ' '' ഉപയ..."

New page

{| Border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Biopython''' ടൂൾസ് '' 'BLAST' '' '' 'ബയോപിത്തോൺ' '' ഉപയോഗിച്ചു് ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.

|-
| 00:06
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കുംBiopython ടൂൾസ് ഉപയോഗിച്ച്' '' ക്വറി ക്വിസ് '' 'നുള്ള'''' "BLAST"'റൺ ചെയുന്നത്

|-
| 00: 13
| കൂടുതൽ വിശകലനത്തിനായി ബ്ലാസ്റ്റ് ഔട്ട്പുട്ട് '''parse''' ചെയുന്നത്

|-
| 00:17
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, നിങ്ങൾ അണ്ടർഗ്രഡ്യൂട്ട് ബയോകെമിസ്ട്രി അല്ലെങ്കിൽ ബയോ ഇൻഫർമാറ്റിക്സ് പരിചയത്തിലായിരിക്കണം

|-
| 00: 24
| basic '''Python''' പ്രോഗ്രാമിങ്ങും.

|-
| 00: 27
| '''Python''' ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ തന്നിരിക്കുന്ന ലിങ്ക് കാണുക.

|-
| 00:31
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ രേഖപ്പെടുത്താൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു: '' 'ഉബുണ്ടു' '' ഓപ്പറേറ്റിംഗ് സിസ്റ്റം പതിപ്പ് 14.10

|-
| 00: 37
| '' 'പൈഥൺ' '' പതിപ്പ് 2.7.8

|-
| 00: 41
| '''Ipython interpretor''പതിപ്പ് 2.3.0

|-
| 00: 46
| '''Biopython'''പതിപ്പ് 1.64, * ഒരു വർക്കിംഗ് ഇൻറർനെറ്റ് കണക്ഷൻ.

|-
| 00:52
|'''BLAST''' അടിസ്ഥാന ലോക്കൽ അലൈൻമെന്റ് ടൂൾ ടൂളിനുള്ള ചുരുക്കപ്പേരാണ്. '' '

|-
| 00: 57
| ഇത് '''sequence''' വിവരങ്ങളെ താരതമ്യം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു'''algorithm'''ആണ്.

|-
| 01:02
| ഡാറ്റാബേസുകളിലെ ശ്രേണികളിലേക്ക് '' 'ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്' '' അല്ലെങ്കിൽ '' പ്രോട്ടീൻ ''സീക്വൻസ് താരതമ്യം ചെയ്ത്, മാഷെ ലെ ലെ സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ സിഗ്നിഫിക്കൻസ് കണക്കുകൂട്ടുന്നു.

|-
| 01: 14
| '' 'BLAST:' 'റൺ ചെയ്യാൻ രണ്ട് വഴികളുണ്ട്:

|-
| 01: 17
| നിങ്ങളുടെ മെഷീനിൽ ലോക്കൽ'''BLAST''' അല്ലെങ്കിൽ' '''BLAST''' 'ഇന്റർനെറ്റ് NCBI സെർവറിലൂടെ ഇന്റർനെറ്റ് ഉപയോഗിക്കുന്നു.

|-
| 01:24
|'ബ്ലെയ്പ്പോത്തനിൽ'''BLAST''' രണ്ട് ഘട്ടങ്ങളുണ്ട്.

|-
| 01: 28
| ആദ്യം, നിങ്ങളുടെr '''query sequence'''ലെ'''BLAST''' ചില ഔട്ട്പുട്ട് ലഭിക്കുക.

|-
| 01: 33
|രണ്ടാമത്, '''BLAST''' ഔട്ട്പുട്ട്.കൂടുതൽ വിശകലനത്തിനായി'''parse''' ചെയുക

|-
| 01:38
| ഒരു ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് അനുപാതത്തിനായി '' 'ടെർമിനൽ തുറന്ന്' '''BLAST'''തുറക്കും.

|-
| 01: 43
| '' 'Ctrl, Alt' '', '' 'ടി' 'എന്നീ കീകളും ഒരേസമയം അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കൂ.

|-
| 01:48
|'' 'പ്രോംപ്റ്റിൽ' '' ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: '' 'ipython' '' അമർത്തുക '' 'Enter' '' അമർത്തുക.

|-
| 01:52
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, '' 'BLAST' '' ഇന്റർനെറ്റ് ഉപയോഗിക്കുന്ന '''NCBI BLAST''' സർവീസ് എങ്ങനെ പ്രവർത്തിക്കുമെന്ന് കാണിച്ചു തരാം.

|-
| 02: 01
| പ്രോംപ്റ്റിൽ ഇനിപ്പറയുന്നവ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക:'''ipython''' '''.Enter '' അമർത്തുക .

|-
| 02:14
| അടുത്തതായി, '' 'ബ്ലാസ്റ്റ് ഇന്റർനെറ്റിൽ റൺ ചെയ്യുന്നതിനായി പ്രോംപ്റ്റിൽ താഴെ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. result= NCBIWWW.qblast("blastn","nt","186429").

|-
| 02: 20
| '' 'NCBIWWW' '' മൊഡ്യൂളിലെ '' 'qblast ഫംഗ്ഷൻ' 'ഉപയോഗിക്കും.

|-
| 02:25
| '' 'qblast ഫംഗ്ഷൻ' '' മൂന്നു '''arguments''':ഏറ്റെടുക്കുന്നു:

|-
| 02: 29
| തിരച്ചിലിന് ഉപയോഗിക്കാനായി ആദ്യത്തെ '''argument''' '''blast program''' എന്നതാണ്.

|-
| 02: 33
| രണ്ടാമതായി, തിരയാനായി ഡാറ്റബേസുകൾ വ്യക്തമാക്കുന്നു.

|-
| 02: 38
| മൂന്നാമത്തെ '''argument''' നിങ്ങളുടെ'''query sequence.'''
|-
| 02:43
| '''query sequence''' ലെ ഇന്പുട് '''GI''' നമ്പർ അല്ലെങ്കിൽ '''FASTA''' ഫയൽ ആകാം അല്ലെങ്കിൽ '''sequence record object'''.ആകാം
|-
| 02:53
| ഈ പ്രദർശനത്തിനായി ഞാൻ ഒരു'''nucleotide sequence'''നായി ''''GI number'''ഉപയോഗിക്കുന്നു.

|-
| 02: 58
| '''GI number''' '''insulin'''. '' ന്റെ ന്യൂ'''nucleotide sequence''' നു വേണ്ടിയുള്ളതാണ്.

|-
| 03:03
| '' 'Qblast ഫംഗ്ഷൻ' '' മറ്റ് നിരവധി ഓപ്റ്റ് ആർഗ്യുമെന്റുകളും എടുക്കുന്നു.

|-
| 03: 09
| 'BLACK' 'വെബ്ബ് പേജിൽ നിങ്ങൾക്ക് സജ്ജമാക്കാൻ കഴിയുന്ന വിവിധ പാരാമീറ്ററുകൾക്ക് സമാനമാണ് ഈ വാദങ്ങൾ.

|-
| 03: 15
| '''qblast function''' '''BLAST''' റിസൾട്ട് '' 'xml' '' ഫോർമാറ്റിൽ ലഭിക്കും.

|-
| 03:20
| '''terminal'''. എന്നതിലേക്ക് തിരികെ പോകുക.

|-
| 03: 22
| നമ്മൾ ഉചിതമായ ''Blast''' പ്രോഗ്രാം ഉപയോഗിക്കണം,

|-
| 03: 25
| ഞങ്ങളുടെ ക്യുറി സെക്യുഎൻസ് '''nucleotide''' അല്ലെങ്കിൽ '''protein sequence'''. ആണെന്നതിനെ ആശ്രയിച്ച്.

|-
| 03: 30
| നമ്മുടെ അന്വേഷണം ഒരു'''nucleotide''',ആയതുകൊണ്ട്, ഞങ്ങൾ'''blastn '''പ്രോഗ്രാം ഉപയോഗിക്കും,' nt '''nucleotide'' ഡാറ്റാബേസ് നെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.

|-
| 03: 39
| ഇതിനെക്കുറിച്ചുള്ള വിശദാംശങ്ങൾ NCBI BLAST '' 'വെബ്പേജിൽ ലഭ്യമാണ്.

|-
| 03:45
| '''blast output''' '' xml '' 'ഫയലിന്റെ രൂപത്തില് വേരിയബിള്' '''result'''ൽ ആണ്.

|-
| 03: 51
| അമർത്തുക '' 'Enter' ''.

|-
| 03:53
| നിങ്ങളുടെ ഇന്റർനെറ്റ് വേഗതയെ ആശ്രയിച്ച്, '' 'BLAST' '' തിരയൽ പൂർത്തിയാക്കാൻ കുറച്ച് മിനിറ്റുകൾ എടുത്തേക്കാം.

|-
| 03:59
| കൂടുതൽ പ്രവർത്തനത്തിനു മുമ്പ് ഡിസ്കിൽ '' 'xml' '' ഫയൽ സംരക്ഷിക്കേണ്ടത് പ്രധാനമാണ്.

|-
| 04: 05
| '' 'Xml ഫയൽ' '' സേവ് ചെയുക ഈ വരികളിൽ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക.

|-
| 04: 09
| ഈ കോഡിന്റെ വരികൾ '' 'home' '' ഫോൾഡറിൽ '' 'blast.xml' '' എന്ന പേരിൽ തിരയൽ ഫലത്തെ സംരക്ഷിക്കും.

|-
| 04:18
| നിങ്ങളുടെ '' 'HOME' '' ഫോൾഡറിലേക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക, ഫയൽ കണ്ടെത്തുക.

|-
| 04: 21
| ഫയലിൽ ക്ലിക്കുചെയ്ത് ഫയലിന്റെ ഉള്ളടക്കം പരിശോധിക്കുക.

|-
| 04:30
| താങ്കള് '' 'FASTA' '' ഫയല് ഒരു'''query'''. ആയി പയോഗിയ്ക്കാന് ആഗ്രഹിക്കുന്നുണ്ടെങ്കില് ഈ ടെക്സ്റ്റ് ഫയലില് കാണിച്ചിരിക്കുന്ന കോഡ് ഉപയോഗിക്കുക.

|-
| 04:36
| നിങ്ങൾ '' 'FASTA' '' ഫയലിൽ നിന്നും ഒരു ക്വാറിയിൽ ''sequence record object''' ഉപയോഗിക്കണമെങ്കിൽ കോഡ് ഇവിടെയുണ്ട്.

|-
| 04:42
| ടെർമിനൽ '' 'എന്നതിലേക്ക് തിരികെ പോകുക.

|-
| 04: 44
| അടുത്ത പടി '''extract''' ഡാറ്റ ഫയല് '' '''parse''' ചെയ്യുക എന്നതാണ്.

|-
| 04: 48
| '' 'Xml' '' ഇൻപുട്ടിനായി ഫയൽ തുറക്കുന്നതാണ് ആദ്യപാഠം.

|-
| 04: 53
| പ്രോംപ്റ്റിൽ താഴെ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. എന്റർ അമർത്തുക'''.

|-
| 04:57
| "Bio.Blast" '''package'''.ൽ നിന്ന് മൊഡ്യൂൾ '''NCBIXML''' ഇമ്പോര്ട ചെയുക

|-
| 05: 05
| അമർത്തുക '' 'Enter' ''.

|-
| 05:07
| '' BLASTറ്' '' ഔട്ട്പുട്ടിന് '''parse''' ചെയ്യാൻ താഴെപ്പറയുന്ന വരികൾ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക.
|-
| 05: 11
| 'BLAST' '' ഔട്പുട്ടിൽ നിന്ന് '''extract''' നു വേണ്ട എല്ലാ വിവരങ്ങളും blast '''record''' ൽ ഉണ്ട്.

|-
| 05:18
| ഒരു പ്രത്യേക ത്രെഷോൾഡ് നു മുകളിൽ ഉള്ള ' '''blast report''' ലെ '''hit''' ന്റെ എല്ലാ വിവരങ്ങളും പ്രിന്റ് ചെയ്യട്ടെ.

|-
| 05: 27
| താഴെ പറയുന്ന കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക.

|-
| 05: 30
| '''match'''പ്രധാനമായിരിക്കണമെങ്കിൽ, '''score''' 0.01 ൽ കുറവായിരിക്കണം.

|-
| 05:37
| ഓരോ '' 'hsp' '', അതായത്, ഹൈ സ്കോറിംഗ് പെയർ നു ''title, length, hsp score, gaps''' and '''expect value'''.
|-
| 05: 49
|'''string'''ൽ അടങ്ങിയിരിക്കുന്ന '''query'''അലൈന്ഡ് ഡാറ്റാബേസ് സീക്വൻസ്, സ്ട്രിംഗ് എന്നിവ മാച്ച് മിസ്മാച് പൊസിഷൻസ് വ്യക്തമാക്കുന്നു.

|-
| 06: 02
| ഔട്ട്പുട്ട് ലഭിക്കുന്നതിന് '' 'Enter' '' കീ രണ്ടുതവണ അമർത്തുക.

|-
| 06:05
| ഔട്ട്പുട്ട് നിരീക്ഷിക്കുക.

|-
| 06: 09
| നമുക്ക് '''length, score, gaps, evalue''' and '''strings''' ഉണ്ട്.

|-
| 06:16
| '' 'Bio.Blast' '' പാക്കേജിൽ ലഭ്യമായ മറ്റ്'''functions''' ഉപയോഗിച്ച് നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമായ വിവരങ്ങൾ പുറത്തെടുക്കാൻ കഴിയും.

|-
| 06: 24
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ അവസാന ഭാഗത്ത് എത്തിയിരിക്കുന്നു.

|-
| 06:26
| സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ,'''BLAST''' ക്വിക്ക് ന്യൂക്ലിയോഡിഡ് സീക്വൻസിനു '''GI''' 'നമ്പർ ഉപയോഗിച്ചുകൊണ്ടാണ് ഞങ്ങൾ പഠിച്ചത്.

|-
| 06: 36
| കൂടാതെ, '' 'BLAST' '' ഔട്ട്പുട്ട് Bio.Blast.Record '' 'മൊഡ്യൂൾ ഉപയോഗിച്ച് പാഴ്സ് ചെയ്യുക.

|-
| 06:43
| അസൈൻമെന്റിനായി ഒരു '' 'പ്രോട്ടീൻ' സീക്വൻസ് നായി ''' BLAST Search''' റൺ ചെയുക

|-
| 06: 50
| '' 'ഔട്ട്പുട്ട് ഫയല് സേവ് ചെയ്യുക, ഫയല് ഉള്ക്കൊള്ളുന്ന ഡാറ്റ പാഴ്സ് ചെയ്യുക.

|-
| 06: 55
| നിങ്ങളുടെ പൂർത്തിയാക്കിയ അസൈൻമെന്റിൽ താഴെ കൊടുത്തിരിക്കുന്ന കോഡ് രേഖകൾ ഉണ്ടായിരിക്കണം, ഈ ഫയലിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നത് പോലെ.

|-
| 07: 01
| കോഡ് നിരീക്ഷിക്കുക. നമ്മുടെ '''query''' ''protein''' സെക്യുഎൻസ് ആയതിനാൽ, '''blastp '''പ്രോഗ്രാം "nr", '''BLAST''' സെർച്ച് നു ഉള്ള നോൺ റീഡന്റാണ്ട് പ്രോടീൻ ടാറ്റ ബസ്

|-
| 07:16
| താഴെയുള്ള ലിങ്കിലുളള വീഡിയോ സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു.

|-
| 07: 20
| ഇത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക.

|-
| 07:22
| സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു.

|-
| 07: 30
| കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി ഞങ്ങൾക്ക് എഴുതുക.

|-
| 07:33
| സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് ഫണ്ട്, എൻ എം ഇ ഐ സി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ.

|-
| 07: 40
| ഈ ദൗത്യത്തെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്.

|-
| 07:45
| ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബേ '' 'നിന്ന് വിജി നായർ ആണ്. പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

|}

@@ Line 135: / Line 135: @@
 |-
 | 03:09
-| 'BLACK' 'വെബ്ബ് പേജിൽ നിങ്ങൾക്ക് സജ്ജമാക്കാൻ കഴിയുന്ന വിവിധ പാരാമീറ്ററുകൾക്ക് സമാനമാണ് ഈ വാദങ്ങൾ.
+| 'BLAST' 'വെബ്ബ് പേജിൽ നിങ്ങൾക്ക് സജ്ജമാക്കാൻ കഴിയുന്ന വിവിധ പാരാമീറ്ററുകൾക്ക് സമാനമാണ് ഈ വാദങ്ങൾ.
 |-

@@ Line 167: / Line 167: @@
 |-
 | 03:51
-| അമർത്തുക '' 'Enter' ''.
+|  '' 'Enter' ''അമർത്തുക.
 |-
@@ Line 203: / Line 203: @@
 |-
 | 04:42
-| ടെർമിനൽ '' 'എന്നതിലേക്ക് തിരികെ പോകുക.
+| ടെർമിനൽ  എന്നതിലേക്ക് തിരികെ പോകുക.
 |-
@@ Line 261: / Line 261: @@
 |-
 | 06:09
-| നമുക്ക്  '''length, score, gaps, evalue''' and '''strings''' ഉണ്ട്.
+| നമുക്ക്  '''length, score, gaps, evalue'''  '''strings''' ഉണ്ട്.
 |-
@@ Line 313: / Line 313: @@
 |-
 | 07:33
-| സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് ഫണ്ട്, എൻ എം ഇ ഐ സി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ.
+| സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് ഫണ്ട്, NMEICT, MHRD, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ.
 |-
@@ Line 321: / Line 321: @@
 |-
 | 07:45
-| ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബേ '' 'നിന്ന് വിജി നായർ  ആണ്. പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.
+| ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബേ ൽ നിന്ന് വിജി നായർ  ആണ്. പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.
 |}

Biopython/C2/Blast/Malayalam - Revision history

PoojaMoolya at 07:35, 13 February 2018

Vijinair at 09:13, 19 January 2018

Prena at 08:07, 9 January 2018

Prena: Created page with "{| Border=1 ! Time ! Narration |- | 00:01 | '''Biopython''' ടൂൾസ് '' 'BLAST' '' '' 'ബയോപിത്തോൺ' '' ഉപയ..."