Script | Spoken-Tutorial - User contributions [en]

UCSF-Chimera/C4/Axes-and-Planes/Gujarati

2018-02-11T08:17:46Z

Shivanigada:

{| border = 1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને કેવી રીતે બતાવવા તે ,

|-
| 00:12
| '''2D Labels''' અને '''Per-Model clipping''' વિશે શીખીશું.

|-
| 00:17
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:23
| જો તમે નથી તો તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિયલો માટે અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:28
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04

|-
| 00:34
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.1

|-
| 00:38
| '''Mozilla firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 અને એક કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેકશન.

|-
| 00:45
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.

|-
| 00:48
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો , '''open 1EMA '''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 00:55
| પેનલ ઉપર '''green fluorescent protein '''નું એક સ્ટ્રક્ચર ખુલે છે.

|-
| 01:00
| ''' Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:02
| '''Structure Analysis''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.સબ-મેનુમાંથી '''Axes, Planes, Centroids''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:11
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 01:15
| અહીં આપણી પાસે '''Define axes, Define plane, Define centroid tabs''' આવી ગયા છે.

|-
| 01:24
| '''Define axes''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.આ '''Define axes''' ડાયલોગ બોક્સ ખોલે છે.

|-
| 01:31
| અહીં આપણે એટમ સેટ્સને અને બીજા અન્ય પેરામીટર્સને સ્પષ્ટ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 01:37
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારા પસંદના થોડાક રેસિડ્યુઝને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 01:43
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:55
| '''Define Axes '''ડાયલોગ બોક્સ ઉપર , રેડિયો બટન “'''Selected atoms'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:02
| એક્સિસના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''axis1.'''

|-
|02:06
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.'''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 02:14
| એક્સિસની જાડાઈને બદલવા ;'''angstroms''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:19
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આંક બદલી 0.25 કરો અને '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:27
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે '''Axis''' દોરેલા દેખાય છે.

|-
| 02:33
| '''select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 02:37
| '''Structure Measurement''' ડાયલોગ બોક્સમાં આ એક્સિસ માટેના એક ઓબ્જેક્ટનું નિર્માણ થાય છે.

|-
| 02:43
| આ એકસીસને ડીલીટ કરવા , આ હાર ઉપર ક્લિક કરો. Click on ડાયલોગ બોક્સના નીચેના ભાગમાં રહેલ '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:51
| હવે સ્ટ્રક્ચરમાં એક '''plane''' ઉમેરવા , '''Define plane''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:57
| આ '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સમાં , પ્લેનનું નામ બદલી '''plane1''' કરો.

|-
| 03:03
| અહીં માત્ર સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે જ એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:08
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારી પસંદગીના થોડાક રેસિડ્યુઝ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:23
| '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સ ઉપર ; '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:28
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 03:34
| '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 03:39
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સને આધારે એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:44
| '''Select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 03:48
| '''plane'''ને ડીલીટ કરો , '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''plane ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:55
| '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:58
| To show '''centroid'''ને દેખાડવા કરવા , '''Define centroid''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:03
| '''Define centroid''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:07
| સેન્ટરોઇડ બનાવવા સ્ટ્રક્ચર પરના રેસિડ્યુઝ 64 અને 68ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:14
| '''Define Centroid''' ડાયલોગ બોક્સમાં; સેન્ટરોઈડના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''centroid1'''.

|-
| 04:21
| અગાઉ જોયું તે મુજબ , '''color well'''માંથી એક રંગ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:26
| '''color-editor'''ને બંધ કરો.'''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:31
| પસંદ કરેલા એટમ્સ માટેના '''Centroid''' પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| 04:36
| પસંદગીને નાબૂદ કરો અને '''centroid'''ને ડીલીટ કરો.

|-
| 04:42
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 04:45
| સ્ટ્રક્ચરમાં '''2D-Labels''' જેમકે '''text''' અને '''arrows''' પણ ઉમેરી શકાય છે.

|-
| 04:52
| ટૂલ્સ મેનુમાંથી '''Utilities''' વિકલ્પ દ્વારા '''2D labels''' ટૂલ શરુ કરો.

|-
| 04:59
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે જેમાં આ ટેબ્સ રહેલ છે : '''Labels''', '''Arrows''' અને '''color key'''.

|-
| 05:07
| લેબલ (શીર્ષક) ઉમેરવા '''Labels''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| મૂળભૂત રીતે ડાયલોગ બોક્સ પાસે નીચે રહેલ '''use mouse for label placement''' વિકલ્પ સિલેક્ટ થયેલ હોય છે.

|-
| 05:20
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો , લેબલ માટે એક રંગ સિલેક્ટ કરો. '''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 05:28
| પેનલ ઉપર જ્યાં તમે લેબલને મુકવા માંગતા હોવ ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 05:32
| ડાયલોગ બોક્સ ઉપર X અને Y કોઓર્ડીનેટસ સાથેનું '''Label id''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 05:38
| હવે '''Text''' ક્ષેત્રમાં લેબલને ટાઈપ કરો.

|-
| 05:42
| ટાઈપ કરો : '''Green Fluorescent Protein'''.એન્ટર દબાવો.

|-
| 05:49
| ડાબા માઉસ બટનને ડ્રેગ કરી લેબલને પુનઃસ્થાપિત કરી શકાય છે.

|-
| 05:56
| લેબલને ડીલીટ કરવા , ડાયલોગ બોક્સ ઉપર '''label id'''ને સિલેક્ટ કરો. '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| ઍરોઝને ઉમેરવા ડાયલોગ બોક્સમાંના '''Arrows tab''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:10
| ડાયલોગ બોક્સમાં નીચે '''Arrow weight''' ક્ષેત્રમાં,

|-
| 06:15
| ઍરોઝની જાડાઈ બદલવા આ આંકને બદલો.

|-
| 06:19
| હું એક પાતળા એરોને બનાવવા ટાઈપ કરીશ 0.5.

|-
| 06:24
| '''Arrow head''' સ્ટાઇલ બટન ઉપર ક્લિક કરો. ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી એક વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 06:30
| હું પસંદ કરીશ : '''Pointy'''.

|-
| 06:33
| પેનલ ઉપર કર્સરને મુકો , માઉસ બટનને ક્લિક કરી પકડી રાખો.

|-
| 06:39
| એરોને વિસ્તારવા ડ્રેગ કરો. હવે માઉસ બતાને છોડીદો.

|-
| 06:46
| એરોને પુનઃદિશામાન કરવા અથવા તેની લંબાઈ બદલવા છેડાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 06:54
| એરોને મધ્યમાંથી ડ્રેગ કરી તેને ખસેડો.

|-
| 06:58
| '''arrow id''' બાદ આવેલા '''color well''' ઉપર ક્લિક કરી એરોનો રંગ બદલો.

|-
| 07:04
| એક રંગ પસંદ કરો. હવે '''color-editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 07:08
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો. આ સેશનને '''File''' મેનુ દ્વારા બંધ કરો.

|-
| 07:15
| હવે નવું સેશન ખોલો.

|-
| 07:18
| '''per-model clipping'''ને સમજાવવા; હું ઉદાહરણ તરીકે '''myoglobin'''ના સ્ટ્રક્ચરનો ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 07:25
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1mbo'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 07:32
| '''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો , '''Depiction'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:37
| સબ-મેનુમાંથી , '''Per-Model clipping''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:42
| '''Per-Model clipping''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 07:46
| '''Per-Model Clipping''' જુદી-જુદી રીતે જુદા-જુદા મોડેલ્સને સાથે જોડવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 07:52
| તે એક માત્ર પ્લેન હોય છે જે મોડેલના દેખાતા અને અદ્રશ્ય ભાગોને અલગ પાડે છે.

|-
| 07:59
| દરેક મોડેલ માત્ર એક જ '''Per-Model Clipping''' પ્લેન ધરાવી શકે છે.
|-
| 08:04
| મોડેલ અને તેની સપાટી બંને અલગ-અલગ મોડેલ્સ તરીકે વર્તે છે.

|-
| 08:09
| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ. in the '''Per-Model Clipping''' ડાયલોગ બોક્સમાંનું '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ વર્તમાનનું મોડેલ બતાવે છે.

|-
| 08:18
| '''Enable clipping'''ને સિલેક્ટ કરો , તે ક્લિપિંગ પ્લેન્સને સક્રિય કરે છે.

|-
| 08:25
| મોડેલનો દેખાતો ભાગ પ્લેનની પાછળ હોય છે. '''Enable clipping'''ને અનચેક કરો.

|-
| 08:33
| મોડેલની સપાટી બનાવીએ.'''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Surface''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરીએ.
'''Show''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| હવે સ્ટ્રક્ચર એક પોકેટ દેખાડે છે જ્યાં '''Heme''' સમૂહ મજબૂત રીતે બંધાયેલું હોય છે.

|-
| 08:50
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ , બે મોડેલ્સ દેખાડે છે.મોડલ(1mbo) અને સપાટી સાથેનું મોડેલ.

|-
| 09:00
| સપાટી સાથેનું મોડેલ સિલેક્ટ કરો. '''Enable clipping'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 09:06
| પેનલ ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:10
| મોડેલની માત્ર સપાટી જ જોડાયેલી દેખાય છે.

|-
| 09:14
| '''Use slab mode with thickness''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:18
| તે તમને '''slab thickness''' પ્રમાણે જ મોડેલનો ભાગ જોવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 09:24
| '''slab thickness'''ને બદલી 0.5 કરો.

|-
| 09:28
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 0.5 અને એન્ટર દબાવો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:37
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Adjust clipping with mouse''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:43
| '''Translation''' માટે બટન 2 અને '''rotation''' માટે બટન 3ની નિમણુંક કરો.

|-
| 09:51
| '''Surface capping''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:55
| '''Surface capping''' ડાયલોગ બોક્સમાં, '''Cap surfaces at clip planes'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:02
| '''Use cap color''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:05
| '''color well'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| '''color editor'''ને બંધ કરો.'''cap style''' તરીકે '''solid'''ને સિલેક્ટ કરો. ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
|10:18
| '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર, '''Actions''' મેનુ દ્વારા સપાટીની પારદર્શકતાને 20% સુધીની કરો.

|-
| 10:26
| હવે પેનલ ધ્યાનથી જુઓ . The '''slab''' હવે રંગીત અને પારદર્શક થઇ ગયેલો દેખાય છે.

|-
| 10:33
| માઉસના વચ્ચેના બટનને દબાવીને પકડી રાખો. '''clipping plane'''ને એક દિશામાં ખસેડવા તેને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:42
| '''clipping plane'''ની જગ્યા બદલવા, જમણા માઉસ બટનને પકડી રાખી માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:50
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , '''heme''' સમૂહ ધરાવતું પોકેટ હવે ખુબ સ્પષ્ટ રીતે દેખાય રહ્યું છે.

|-
| 10:57
| ચાલો સારાંશ જોઈએ, આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખ્યા કે , કેવી રીતે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને બતાવવા,

|-
| 11:05
| '''2D Labels''' બતાવવા અને '''Arrows''' દોરવા.

|-
|11:09
| મોડેલને '''Per-Model clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડવું.

|-
| 11:13
| અભ્યાસ માટે , '''Chymotrypsin'''નું મોડેલ ખોલો.

|-
| 11:18
| '''planes''' દોરો. સ્ટ્રકચરને ''' Per-Model Clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડો.

|-
| 11:24
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે જો તમારું બેન્ડવિથ સારું ન હોય તો તમે તેને ડાઉલોડ કરી નિહાળી શકો છો.

|-
| 11:32
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
| 11:39
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| 11:45
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C4/Axes-and-Planes/Gujarati

2018-02-11T08:16:26Z

Shivanigada: Created page with "{| border = 1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં..."

{| border = 1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને કેવી રીતે બતાવવા તે ,

|-
| 00:12
| '''2D Labels''' અને '''Per-Model clipping''' વિશે શીખીશું.

|-
| 00:17
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:23
| જો તમે નથી તો તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિયલો માટે અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:28
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04

|-
| 00:34
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.1

|-
| 00:38
| '''Mozilla firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 અને એક કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેકશન.

|-
| 00:45
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.

|-
| 00:48
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો , '''open 1EMA '''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 00:55
| પેનલ ઉપર '''green fluorescent protein '''નું એક સ્ટ્રક્ચર ખુલે છે.

|-
| 01:00
| ''' Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:02
| '''Structure Analysis''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.સબ-મેનુમાંથી '''Axes, Planes, Centroids''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:11
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 01:15
| અહીં આપણી પાસે '''Define axes, Define plane, Define centroid tabs''' આવી ગયા છે.

|-
| 01:24
| '''Define axes''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.આ '''Define axes''' ડાયલોગ બોક્સ ખોલે છે.

|-
| 01:31
| અહીં આપણે એટમ સેટ્સને અને બીજા અન્ય પેરામીટર્સને સ્પષ્ટ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 01:37
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારા પસંદના થોડાક રેસિડ્યુઝને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 01:43
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:55
| '''Define Axes '''ડાયલોગ બોક્સ ઉપર , રેડિયો બટન “'''Selected atoms'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:02
| એક્સિસના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''axis1.'''

|-
|02:06
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

'''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 02:14
| એક્સિસની જાડાઈને બદલવા ;'''angstroms''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:19
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આંક બદલી 0.25 કરો અને '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:27
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે '''Axis''' દોરેલા દેખાય છે.

|-
| 02:33
| '''select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 02:37
| '''Structure Measurement''' ડાયલોગ બોક્સમાં આ એક્સિસ માટેના એક ઓબ્જેક્ટનું નિર્માણ થાય છે.

|-
| 02:43
| આ એકસીસને ડીલીટ કરવા , આ હાર ઉપર ક્લિક કરો. Click on ડાયલોગ બોક્સના નીચેના ભાગમાં રહેલ '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:51
| હવે સ્ટ્રક્ચરમાં એક '''plane''' ઉમેરવા , '''Define plane''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:57
| આ '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સમાં , પ્લેનનું નામ બદલી '''plane1''' કરો.

|-
| 03:03
| અહીં માત્ર સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે જ એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:08
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારી પસંદગીના થોડાક રેસિડ્યુઝ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:23
| '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સ ઉપર ; '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:28
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 03:34
| '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 03:39
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સને આધારે એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:44
| '''Select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 03:48
| '''plane'''ને ડીલીટ કરો , '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''plane ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:55
| '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:58
| To show '''centroid'''ને દેખાડવા કરવા , '''Define centroid''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:03
| '''Define centroid''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:07
| સેન્ટરોઇડ બનાવવા સ્ટ્રક્ચર પરના રેસિડ્યુઝ 64 અને 68ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:14
| '''Define Centroid''' ડાયલોગ બોક્સમાં; સેન્ટરોઈડના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''centroid1'''.

|-
| 04:21
| અગાઉ જોયું તે મુજબ , '''color well'''માંથી એક રંગ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:26
| '''color-editor'''ને બંધ કરો.'''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:31
| પસંદ કરેલા એટમ્સ માટેના '''Centroid''' પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| 04:36
| પસંદગીને નાબૂદ કરો અને '''centroid'''ને ડીલીટ કરો.

|-
| 04:42
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 04:45
| સ્ટ્રક્ચરમાં '''2D-Labels''' જેમકે '''text''' અને '''arrows''' પણ ઉમેરી શકાય છે.

|-
| 04:52
| ટૂલ્સ મેનુમાંથી '''Utilities''' વિકલ્પ દ્વારા '''2D labels''' ટૂલ શરુ કરો.

|-
| 04:59
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે જેમાં આ ટેબ્સ રહેલ છે : '''Labels''', '''Arrows''' અને '''color key'''.

|-
| 05:07
| લેબલ (શીર્ષક) ઉમેરવા '''Labels''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| મૂળભૂત રીતે ડાયલોગ બોક્સ પાસે નીચે રહેલ '''use mouse for label placement''' વિકલ્પ સિલેક્ટ થયેલ હોય છે.

|-
| 05:20
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો , લેબલ માટે એક રંગ સિલેક્ટ કરો. '''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 05:28
| પેનલ ઉપર જ્યાં તમે લેબલને મુકવા માંગતા હોવ ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 05:32
| ડાયલોગ બોક્સ ઉપર X અને Y કોઓર્ડીનેટસ સાથેનું '''Label id''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 05:38
| હવે '''Text''' ક્ષેત્રમાં લેબલને ટાઈપ કરો.

|-
| 05:42
| ટાઈપ કરો : '''Green Fluorescent Protein'''.એન્ટર દબાવો.

|-
| 05:49
| ડાબા માઉસ બટનને ડ્રેગ કરી લેબલને પુનઃસ્થાપિત કરી શકાય છે.

|-
| 05:56
| લેબલને ડીલીટ કરવા , ડાયલોગ બોક્સ ઉપર '''label id'''ને સિલેક્ટ કરો. '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| ઍરોઝને ઉમેરવા ડાયલોગ બોક્સમાંના '''Arrows tab''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:10
| ડાયલોગ બોક્સમાં નીચે '''Arrow weight''' ક્ષેત્રમાં,

|-
| 06:15
| ઍરોઝની જાડાઈ બદલવા આ આંકને બદલો.

|-
| 06:19
| હું એક પાતળા એરોને બનાવવા ટાઈપ કરીશ 0.5.

|-
| 06:24
| '''Arrow head''' સ્ટાઇલ બટન ઉપર ક્લિક કરો. ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી એક વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 06:30
| હું પસંદ કરીશ : '''Pointy'''.

|-
| 06:33
| પેનલ ઉપર કર્સરને મુકો , માઉસ બટનને ક્લિક કરી પકડી રાખો.

|-
| 06:39
| એરોને વિસ્તારવા ડ્રેગ કરો. હવે માઉસ બતાને છોડીદો.

|-
| 06:46
| એરોને પુનઃદિશામાન કરવા અથવા તેની લંબાઈ બદલવા છેડાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 06:54
| એરોને મધ્યમાંથી ડ્રેગ કરી તેને ખસેડો.

|-
| 06:58
| '''arrow id''' બાદ આવેલા '''color well''' ઉપર ક્લિક કરી એરોનો રંગ બદલો.

|-
| 07:04
| એક રંગ પસંદ કરો. હવે '''color-editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 07:08
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો. આ સેશનને '''File''' મેનુ દ્વારા બંધ કરો.

|-
| 07:15
| હવે નવું સેશન ખોલો.

|-
| 07:18
| '''per-model clipping'''ને સમજાવવા; હું ઉદાહરણ તરીકે '''myoglobin'''ના સ્ટ્રક્ચરનો ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 07:25
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1mbo'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 07:32
| '''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો , '''Depiction'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:37
| સબ-મેનુમાંથી , '''Per-Model clipping''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:42
| '''Per-Model clipping''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 07:46
| '''Per-Model Clipping''' જુદી-જુદી રીતે જુદા-જુદા મોડેલ્સને સાથે જોડવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 07:52
| તે એક માત્ર પ્લેન હોય છે જે મોડેલના દેખાતા અને અદ્રશ્ય ભાગોને અલગ પાડે છે.

|-
| 07:59
| દરેક મોડેલ માત્ર એક જ '''Per-Model Clipping''' પ્લેન ધરાવી શકે છે.
|-
| 08:04
| મોડેલ અને તેની સપાટી બંને અલગ-અલગ મોડેલ્સ તરીકે વર્તે છે.

|-
| 08:09
| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ. in the '''Per-Model Clipping''' ડાયલોગ બોક્સમાંનું '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ વર્તમાનનું મોડેલ બતાવે છે.

|-
| 08:18
| '''Enable clipping'''ને સિલેક્ટ કરો , તે ક્લિપિંગ પ્લેન્સને સક્રિય કરે છે.

|-
| 08:25
| મોડેલનો દેખાતો ભાગ પ્લેનની પાછળ હોય છે. '''Enable clipping'''ને અનચેક કરો.

|-
| 08:33
| મોડેલની સપાટી બનાવીએ.'''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Surface''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરીએ.
'''Show''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| હવે સ્ટ્રક્ચર એક પોકેટ દેખાડે છે જ્યાં '''Heme''' સમૂહ મજબૂત રીતે બંધાયેલું હોય છે.

|-
| 08:50
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ , બે મોડેલ્સ દેખાડે છે.

મોડલ(1mbo) અને સપાટી સાથેનું મોડેલ.

|-
| 09:00
| સપાટી સાથેનું મોડેલ સિલેક્ટ કરો. '''Enable clipping'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 09:06
| પેનલ ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:10
| મોડેલની માત્ર સપાટી જ જોડાયેલી દેખાય છે.

|-
| 09:14
| '''Use slab mode with thickness''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:18
| તે તમને '''slab thickness''' પ્રમાણે જ મોડેલનો ભાગ જોવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 09:24
| '''slab thickness'''ને બદલી 0.5 કરો.

|-
| 09:28
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 0.5 અને એન્ટર દબાવો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:37
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Adjust clipping with mouse''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:43
| '''Translation''' માટે બટન 2 અને '''rotation''' માટે બટન 3ની નિમણુંક કરો.

|-
| 09:51
| '''Surface capping''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:55
| '''Surface capping''' ડાયલોગ બોક્સમાં, '''Cap surfaces at clip planes'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:02
| '''Use cap color''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:05
| '''color well'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| '''color editor'''ને બંધ કરો.'''cap style''' તરીકે '''solid'''ને સિલેક્ટ કરો. ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
|10:18
| '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર, '''Actions''' મેનુ દ્વારા સપાટીની પારદર્શકતાને 20% સુધીની કરો.

|-
| 10:26
| હવે પેનલ ધ્યાનથી જુઓ . The '''slab''' હવે રંગીત અને પારદર્શક થઇ ગયેલો દેખાય છે.

|-
| 10:33
| માઉસના વચ્ચેના બટનને દબાવીને પકડી રાખો. '''clipping plane'''ને એક દિશામાં ખસેડવા તેને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:42
| '''clipping plane'''ની જગ્યા બદલવા, જમણા માઉસ બટનને પકડી રાખી માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:50
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , '''heme''' સમૂહ ધરાવતું પોકેટ હવે ખુબ સ્પષ્ટ રીતે દેખાય રહ્યું છે.

|-
| 10:57
| ચાલો સારાંશ જોઈએ, આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખ્યા કે , કેવી રીતે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને બતાવવા,

|-
| 11:05
| '''2D Labels''' બતાવવા અને '''Arrows''' દોરવા.

|-
|11:09
| મોડેલને '''Per-Model clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડવું.

|-
| 11:13
| અભ્યાસ માટે , '''Chymotrypsin'''નું મોડેલ ખોલો.

|-
| 11:18
| '''planes''' દોરો. સ્ટ્રકચરને ''' Per-Model Clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડો.

|-
| 11:24
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે જો તમારું બેન્ડવિથ સારું ન હોય તો તમે તેને ડાઉલોડ કરી નિહાળી શકો છો.

|-
| 11:32
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
| 11:39
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| 11:45
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C4/Animation/Gujarati

2018-02-10T08:01:38Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Chimera Interface'''ના ઉપયોગથી '''Animation''' પરના આ ટ્ય..."

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera Interface'''ના ઉપયોગથી '''Animation''' પરના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું કે કેવી રીતે '''background lighting''' અને '''effects''' વ્યવસ્થિત કરવા.

|-
|00:12
| '''animation''' માટે '''scenes''' બનાવવા.

|-
|00:15
| '''timeline'''ની સાથે '''scenes''' મુકવા .

|-
|00:17
| પરિણામરૂપે મળતા '''animation'''ની ફિલ્મ રેકોર્ડ કરવી.

|-
|00:22
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જરૂરી છો. જો તમે ન હોવ તો તે માટેના ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
|00:33
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04 , '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2 , '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 અને એક કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.

|-
|00:50
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.

|-
|00:53
| કમાંડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''Open 1MBO'''. '''Enter''' દબાવો.

|-
|01:00
| પેનલ ઉપર '''hemoglobin'''નું એક સ્ટ્રક્ચર ખુલે છે.

|-
|01:04
| પાણીના અણુઓને નાબૂદ કરવા ટાઈપ કરો '''delete solvent'''. '''Enter''' દબાવો.

|-
|01:10
| ચાલો હું તમને બતાઉં કે '''Animation''' માટે '''scenes''' કેવી રીતે બનાવવા.

|-
| 01:15
| એક '''Chimera scene'''માં હોય શકે છે - '''Orientations of models''' અને '''clipping planes'''. '''Display styles''' અને ''' colors of models'''. '''Molecular surfaces'''. '''Electron density maps''' અને '''electrostatic potential maps'''.

|-
|01:33
| '''Scene'''માં આ પણ હોય શકે છે - '''2D labels'''. '''Axis, plane''' અને '''centroid representation'''. '''CAST-P pocket display'''. '''Parameters''' જેવા કે '''background lighting''' અને '''effects''' .

|-
|01:49
| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ.

|-
|01:51
| એનિમેશન માટે દ્રશ્યો બનાવતા પહેલા , ચાલો પેહલા '''background lighting'''ને નિયંત્રિત કરતા શીખીએ.

|-
|01:59
| ટૂલ્સ મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , સબ-મેનુમાંથી '''Viewing Controls ''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Effects'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:08
|'''Viewing''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 02:11
| '''Effects''' વિભાગમાં '''depth cueing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|02:16
| તે '''front-to-back shading'''ને નિર્દેશ કરે છે.

|-
|02:20
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|02:22
| શેડિંગ માટે '''color well''' માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
|02:26
| '''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
|02:29
| આઉટલાઇન્સ બતાવવા '''Silhouettes''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|02:33
| તમે '''Width''' ક્ષેત્ર દ્વારા '''Silhouettes'''ની પહોળાઈને વધારી કે ઘટાડી શકો.

|-
|02:39
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|02:41
| '''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
|02:45
| '''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
|02:47
| હવે '''Viewing''' ડાયલોગ બોક્સ ઉપર રહેલ '''Lighting''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|02:51
| અહીં આપણે આપણી જરૂરિયાત પ્રમાણે '''lighting parameters'''ને બદલી શકીએ.

|-
|02:57
| '''Shininess''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
|03:00
| અહીં બે વિકલ્પો રહેલ છે : '''Intensity''' અને '''Shininess'''.

|-
|03:04
| '''Intensity'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
|03:07
| '''mode''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|03:10
| અગાઉથી '''two-point''' લાઇટિંગ સિલેક્ટ થયેલી હોય છે.

|-
|03:14
| વધારે તેજ માટે તેને બદલી ''' three-point''' કરીદો.

|-
|03:18
| '''brightness ''' અને '''contrast'''ને વ્યવસ્થિત કરવા સ્લાઇડરને ડ્રેગ કરો.

|-
| 03:23
| ફરી ,'''Intensity''' બટન ઉપર ક્લિક કરો, '''Shininess'''ને પસંદ કરો.

|-
|03:28
| '''sharpness''' અને '''reflectivity'''ને વ્યવસ્થિત કરવા સ્લાઇડરને ડ્રેગ કરો.

|-
| 03:33
| '''Save''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Close''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|03:37
| પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને રોટેટ કરો.

|-
|03:40
| '''Shading''' અને '''Silhouettes'''ને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
|03:43
| હવે ચાલો '''animation.''' માટે થોડાક '''scenes''' બનાવીએ.

|-
|03:47
| '''Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Utilities''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
|03:52
| સબ-મેનુમાંથી '''Animation''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|03:55
| '''Animation''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
|03:58
| એનિમેશન ડાયલોગ બોક્સ '''Scenes''', '''Actions''' અને '''Timeline''' વિભાગો ધરાવે છે.

|-
|04:06
| '''Scenes''' વિભાગમાં લીલા રંગના '''plus icon''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|04:11
| આ પેનલ ઉપર વર્તમાનમાં રહેલ આકૃતિને એક '''scene''' તરીકે સેવ કરે છે.

|-
|04:15
| તે '''Scenes''' વિભાગમાં આ '''Scene'''ની એક '''thumbnail image''' પણ બનાવે છે.

|-
|04:21
| આ આકૃતિ '''animation''' માટેનું પહેલું દ્રશ્ય છે.

|-
|04:25
| '''thumbnail''' આકૃતિ ઉપર માઉસનું જમણું બટન ક્લિક કરો ,વિકલ્પો સાથેનું એક '''context menu''' ખુલે છે જેવા કે ; '''Add to timeline,''' '''properties''', '''delete ''' વગેરે.

|-
|04:39
| બીજું '''Scene''' બનાવવા પેનલ ઉપર આ પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચરના ડિસ્પ્લેમાં બદલાવ કરીએ.

|-
|04:45
| '''Presets''' મેનુ દ્વારા ડિસ્પ્લેને '''Interactive 1'''માં બદલો.

|-
|04:50
| '''Select'''મેનુ માંથી '''ligand'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
|04:54
| '''Actions''' મેનુમાંથી '''Sphere'''ને પસંદ કરો. આ '''ligand''' ને '''CPK''' ડિસ્પ્લેમાં બદલશે.

|-
|05:03
| પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
|05:06
| '''Animation ''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''scenes''' વિભાગમાંથી લીલા '''plus icon''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|05:12
| પેનલ ઉપર આ આકૃતિને તે '''scene 2''' તરીકે ઉમેરશે.

|-
|05:16
| For '''scene 3''' માટે સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''helices''' માટે એક્સિસ ઉમેરો.

|-
|05:22
| '''Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો. '''Structure Analysis''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
|05:28
| સબ-મેનુમાંથી '''Axes, Planes, Centroids''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|05:32
| '''Structure measurement dialog box'''માં , '''Define Axes''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|05:37
| '''Define Axes ''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Each helix''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|05:43
| '''OK''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
|05:47
| આ આકૃતિને '''scene 3''' તરીકે ઉમેરો.

|-
|05:50
| '''Animation''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''plus''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|05:55
| હવે '''axes'''ને ડીલીટ કરો.

|-
| 05:58
| '''Structure measurement dialog box'''માં , બધી જ હારોને સિલેક્ટ કરો.

|-
|06:02
| '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|06:05
| '''Structure measurement dialog box'''ને બંધ કરો.

|-
|06:08
| '''scene 4''' માટે , '''Select '''મેનુ દ્વારા '''main'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
|06:15
| '''Actions''' મેનુ દ્વારા '''surface'''ને દ્રશ્યમાન કરો.

|-
|06:17
| ફરી '''Select''' મેનુમાંથી '''main'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
|06:21
| '''Actions''' મેનુ દ્વારા '''surface'''નો રંગ બદલી પીળો કરો.

|-
|06:26
| '''Ligand'''ને સિલેક્ટ કરો અને '''ligand'''નો રંગ બદલી ભૂરો કરો.

|-
|06:32
| હવે પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
|06:35
| આ દ્રશ્યને '''scene 4 ''' તરીકે '''Animation''' ડાયલોગ બોક્સ ઉપર ઉમેરો.

|-
|06:40
| '''substrate pocket''' ને વધારે સ્પષ્ટ રીતે દેખાડવા માટે , સપાટી(surface)ને પારદર્શક કરીદો.

|-
|06:46
| '''Actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''surface''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
|06:50
| સબ-મેનુમાંથી '''transparency'''ને પસંદ કરો અને 50% ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|06:58
| આ દ્રશ્યને '''scene 5''' તરીકે '''scenes section''' ઉપર ઉમેરો.

|-
|07:03
| જો તમારે '''Scenes section''' માંથી કોઈ દ્રશ્ય ડીલીટ કરવું હોય તો;

|-
|07:07
| '''thumbnail''' આકૃતિ ઉપર જમણું માઉસ બટન ક્લિક કરો ,'''delete''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
|07:13
| દ્રશ્યને ઉમેરવા , ફરી '''plus''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|07:18
| માઉસ બટન દ્વારા ડ્રેગ અને ડ્રોપ પદ્ધતિથી આ દ્રશ્યોને '''Timeline section''' ઉપર દાખલ કરો.

|-
|07:25
| '''thumbnail''' આકૃતિ ઉપર ક્લિક કરો , ડફેગ કરો અને તે આકૃતિને '''timeline''' ઉપર સ્થાપિત કરો.

|-
|07:32
| હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
|07:34
| વૈકલ્પિક રીતે આપણે '''thumbnail''' ઉપર જમણું માઉસ બટન પણ ક્લિક કરી શકીએ.

|-
|07:38
| '''context''' મેનુમાંથી '''add to timeline''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|07:43
| '''Timeline''' ઉપર બધા દૃશ્યોને ક્રમ પ્રમાણે ઉમેરો.

|-
|07:47
| '''Actions''' વિભાગમાં બે વિકલ્પો રહેલા છે;

|-
|07:51
| '''Rock - oscillating motion''' માટે અને '''Roll - continuous motion''' માટે.

|-
|07:57
| ચાલો તો '''Roll''' પસંદ કરીએ.

|-
|07:59
| તો હવે આપણે એનિમેશન રેકોડ કરવા તૈયાર છીએ.

|-
|08:03
| '''Record''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|08:06
| '''Record animation''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
|08:13
| હું ફાઈલને સેવ કરવા '''Desktop''' ને પસંદ કરીશ. ફાઈલનું નામ '''File name''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આપો.

|-
|08:17
| ફાઈલ નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''Animation hyphen one '''('''Animation-1).'''

|-
|08:21
| ફાઈલ ટાઈપ તરીકે ''' .ogv''' અથવા તમને ગમે તે કોઈ પણ ફિલ્મનું ફોર્મેટ લઇ શકો છો.

|-
|08:28
| એનિમેશનને રેકોર્ડ કરવાનું શરુ કરવા '''Record ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|08:33
| ડેસ્કટોપ ઉપર દ્રશ્યોની હારમાળા એક ફિલ્મ ફાઈલ તરીકે એનકોડ થશે.

|-
|08:42
| જો તમારે આ રેકોર્ડિંગ ક્રિયાને અટકાવવી હોય તો ; '''Animation''' ડાયલોગ બોક્સ પરના '''Record''' બટન ઉપર ફરી ક્લિક કરો.

|-
|08:49
| તે થોડી જ ક્ષણો લેશે રેકોર્ડિંગ ક્રિયા પુરી કરવા.

|-
|08:54
| ફાઈલ ડેસ્કટોપ ઉપર ''' Animation hyphen one (Animation-1)''' તરીકે સેવ થશે.

|-
|09:01
| એનિમેશનને જોવા ''' .ogv''' ફાઈલ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
|09:14
| ચાલો સારાંશ જોઈએ ,આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે કેવી રીતે '''background lighting''' અને '''effects''' વ્યવસ્થિત કરવા.'''animation''' માટે '''scenes''' બનાવવા.

|-
|09:23
| '''timeline'''ની સાથે '''scenes''' મુકવા . પરિણામરૂપે મળતા '''animation'''ની ફિલ્મ રેકોર્ડ કરવી.

|-
|09:30
| અભ્યાસ તરીકે '''Chymotrypsin (PDB code: 7GCH)'''નું મોડેલ ખોલો.

|-
|09:35
| '''background''' and '''lighting effects'''ને વ્યવસ્થિત કરો.

|-
|09:38
| પ્રોટીન સપાટીની અંદર લિગએન્ડને બતાવવા '''transparency'''ને વ્યવસ્થિત કરો.

|-
|09:43
| થોડાક દ્રશ્યો બનાવો અને તેની એક એનિમેશન ફિલ્મ બનાવો.

|-
|09:47
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે જો તમારું બેન્ડવિથ સારું ન હોય તો તમે તેને ડાઉલોડ કરી નિહાળી શકો છો.

|-
|09:55
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
|10:03
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
|10:09
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C4/Attributes/Gujarati

2018-02-08T14:28:29Z

Shivanigada:

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Attributes.''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:05
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું : એટમ્સ, રેસિડ્યુઝ અને મોડલ્સના '''attributes''' બદલવા.
|-
| 00:13
| '''B-factor''' મૂલ્યોને આધારે પ્રોટીનમાં એટમ્સને રંગ આપવા.
|-
| 00:18
| '''kdhydrophobicity''' મૂલ્યોને આધારે રેસિડયુઝને રંગ આપવા.
|-
| 00:24
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જરૂરી છો. જો તમે ન હોવ તો તે માટેના ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.
|-
| 00:33
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04 , '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2 , '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 અને એક કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.
|-
| 00:50
| અહીં મેં એક '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.
|-
| 00:54
| કમાન્ડ લાઈન દ્વારા '''Leucine zipper'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો.
|-
| 00:52
| કમાન્ડ લાઈન ટેક્સ્ટ બોકસ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1zik''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 01:05
| પેનલ ઉપર મોડેલ '''ribbons''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| 01:10
| '''Presets''' મેનુના ઉપયોગથી , ડિસ્પ્લેને '''Interactive 2'''માં બદલો.

|-
| 01:14
| પાણીના અણુઓને છુપાવવા, '''command line''' ઉપર ટાઈપ કરો '''delete solvent''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 01:22
| ડિસ્પ્લેને સ્ટીક્સમાં બદલવા ટાઈપ કરો '''rep stick''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 01:30
| સ્ટ્રક્ચરમાં હાઇડ્રોજન્સ ઉમેરો, ટાઈપ કરો '''addh '''

|-
| 01:36
| હવે ચાલો આ સ્ટ્રક્ચર માટે '''atoms''' અને '''residues'''ના '''attributes ''' કેવી રીતે બદલી શકાય તે શીખીએ.

|-
| 01:43
| '''Attributes ''' એ નામો અને મૂલ્યો ધરાવતા ગુણધર્મો છે.

|-
| 01:47
| '''Chimera'''માં , આવી વસ્તુઓ જેવીકે '''atoms, bonds, residues''' અને '''molecule models''' વગેરે '''Attributes''' ધરાવે છે.

|-
| 01:54
| '''Attributes''' બદલવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગો રહેલ છે.

|-
| 01:57
| '''Favorites''' મેનુ દ્વારા '''Model Panel'''ને ખોલો.

|-
| 02:01
| '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 02:05
| પેનલની જમણી બાજુએ આવેલા '''attributes''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:10
| '''1zik''' માટેનો '''Attributes''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 02:15
| આ ડાયલોગ બોક્સ એક '''attribute''' લિસ્ટ ધરાવે છે.

|-
| 02:18
| લિસ્ટમાં આનો સમાવેશ થાય છે : '''Molecule Attributes''' અને તેના કમ્પોનંટ્સ , '''Atom, bond ''' અને ''' residue attributes.'''

|-
| 02:28
| ''' Molecule Attributes'''ને પસંદ કરો.

|-
| 02:31
| ઉપલબ્ધ '''attributes''' વિન્ડો ઉપર સૂચિત થાય છે.

|-
| 02:35
| દાખલા તરીકે - એરોમેટિક રિંગ્સનું ડિસ્પ્લે બદલવા , '''aromatic display''' પછી દેખાતા બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:42
| ડ્રોપ-ડાઉનમાંથી '''True'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:45
| '''Aromatic ring style''' ને '''disk''' તરીકે સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| એરોમેટિક કલર પછી આવેલા '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:53
| '''color editor'''માંથી રંગને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:56
| ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 02:59
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. બધી '''aromatic rings''' તેના કેન્દ્રમાં ડિસ્ક સાથે દેખાય છે.

|-
| 03:06
| સ્ટ્રકચરના ડિસ્પ્લેને '''ball''' અને '''stick'''માં ફેરવો.

|-
| 03:10
| કમાન્ડ લાઈન ઉપર ટાઈપ કરો, '''rep bs'''

|-
| 03:16
| એટ્રીબ્યૂટ્સ ડાયલોગ બોક્સ ઉપર , એટમ્સના '''Van der Walls radii'''ને બદલો.

|-
| 03:22
| '''ball scale''' ની કિંમત બદલી 0.5 કરો.'''Enter''' પ્રેસ કરો.

|-
| 03:27
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. એટમ્સ વિશાળ એટોમેટિક રેડી સાથે હવે દેખાય છે.

|-
| 03:33
| ફરી '''Molecular Attributes ''' ચેક બોક્સ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:38
| સૂચિ માંથી , '''Component Atom Attributes''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:43
| તેની અનુરૂપ વિન્ડોમાં , '''atom style button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:48
| આ ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલા છે.

|-
| 03:51
| ડિસ્પ્લેને '''cpk'''માં બદલવા '''sphere''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:55
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 03:57
| '''sticks''' ડિસ્પ્લેને પાછું મેળવવા '''dot'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:02
| હવે '''Component Bond Attributes''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| અહીં, '''bond style'''ને '''stick''' અથવા '''wire'''માં બદલવાના વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 04:13
| '''Component Residue Attributes''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:17
| અહીં આપણી પાસે રીબન્સના સ્ટ્રીબ્યૂટ્સ બદલવાના વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 04:22
| '''presets'''મેનુના ઉપયોગથી , પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરના ડિસ્પ્લેને '''ribbons'''માં બદલો.

|-
| 04:28
| હવે '''Attribute''' ડાયલોગ બોક્સને ક્લિક કરતા.

|-
| 04:32
| હવે '''Attribute''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''ribbon color'''ની બાજુમાં આવેલા '''color well ''' ઉપર ક્લિક કરો. રિબનનો રંગ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:41
| અને '''close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો '''color editor'''ને બંધ કરવા.

|-
| 04:46
| '''ribbon''' અને '''scaling'''ના ક્રોસ-સેક્શનને બદલવા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 04:52
| ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 04:55
| ફરી , '''Presets ''' મેનુ દ્વારા ડિસ્પ્લેને '''atoms '''માં બદલો.

|-
| 05:00
| '''Tools''' મેનુ દ્વારા પણ '''Attributes''' બદલી શકાય છે.

|-
| 05:03
| '''Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Structure Analysis''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 05:09
| અને સબ-મેનુમાંથી '''Render by Attribute ''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 05:14
| '''Render by attribute''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 05:17
| અહીં આપણી પાસે '''atoms, residues, molecules, segmentation regions''' વગેરેના '''attributes ''' બદલવાના વિકલ્પ ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 05:27
| '''atoms'''ને સિલેક્ટ કરો ''' Render.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:32
| ઉપલબ્ધ વિકલ્પો ચેક કરવા '''Attribute''' સૂચિ ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 05:37
| સૂચિ બે વિકલ્પો બતાવે છે : '''bfactor''' અને '''occupancy'''

|-
| 05:43
| આ બંને '''attributes''' ઇનપુટ '''PDB''' ફાઈલમાંથી વાંચી શકાય છે.

|-
| 05:48
| '''bfactor''' પસંદ કરો.

|-
| 05:50
| રંગીન ઉભા બાર્સ સાથેનું કિંમતો ધરાવતું એક '''histogram''' દ્રશ્યમાન થશે.

|-
| 05:55
| '''B-factor''' કિંમતો એ '''macromolecule'''માં રહેલ ગતિશીલતા(mobility)નું એક માપદંડ દર્શાવે છે.

|-
|06:01
| ઓછા '''B-factor''' મૂલ્યો ધરાવતા '''Atoms''' સ્ટ્રક્ચરના એ વિભાગને અનુલક્ષે છે જે વ્યવસ્થિત રીતે અનુક્રમિત છે.

|-
|06:08
| વિશાળ '''B-factor''' મૂલ્યો ધરાવતા '''Atoms''' સ્ટ્રકચરના એ વિભાગને અનુલક્ષે છે જે ઘણું પરિવર્તનક્ષમ છે.

|-
|06:15
| '''protein''' સ્ટ્રકચરની PDB ફાઈલ B-factor વિશેની માહિતી ધરાવે છે.

|-
|06:21
| પેનલ ઉપર પાછા જઈએ.

|-
|06:23
| માઉસ દ્વારા આ ઊભા બાર્સ '''histogram'''ની સાથે સાથે ડ્રેગ કરી શકાય છે.

|-
|06:29
| '''B-factor'''નું મૂલ્ય ''' Value ''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
|06:34
| ભૂરા ઊભા બારણે શૂન્ય તરફ ડ્રેગ કરો , લાલને 100 તરફ.

|-
|06:41
| ત્યારબાદ સફેદ બારને મૂલ્ય 50 ઉપર સ્થિર કરો.

|-
|06:45
| '''Colors''' બટન ઉપર કરો.

|-
|06:48
| આ વિકલ્પો માટે ચેક કરો '''color atoms''', '''keep opaque''' અને '''color surfaces.'''

|-
|06:55
| રંગનો મૂળભૂત '''palette''' ભૂરો અને લાલ છે.

|-
|06:59
| ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ દ્વારા તમે રંગના આ '''palette'''ને બદલી શકો છો.

|-
|07:04
| '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|07:07
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. ઊંચા '''B-factor''' મૂલ્યો ધરાવતા '''Atoms''' લાલ રંગમાં અને બાકીના ભૂરા રંગમાં દેખાય છે.

|-
|07:16
| અપેક્ષા રાખી હતી તેમ,ઊંચા '''B-factor''' મૂલ્યો ધરાવતા '''atoms''' સ્ટ્રકચરની બહાર છે.

|-
|07:22
| હવે ચાલો '''Residues'''ના '''attributes''' બદલીએ.

|-
|07:26
| '''Select by Attribute''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Attributes button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|07:32
| ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી ,'''residues'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
|07:36
| '''Render''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|07:38
| '''residues'''ના '''attributes''', '''kdHydrophobicity scale'''નો સમાવેશ કરે છે.

|-
|07:44
| ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી '''kdHydrophobicity''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|07:48
| આ મૂલ્યો એક હિસ્ટોગ્રામ તરીકે પ્રકાશિત થાય છે.

|-
|07:52
|'''kdHydrophobicity scales''' એ તે મૂલ્યો છે જેઓ '''amino acid residues'''ને સંબંધિત '''hydrophobicity'''ને સૂચવે છે.

|-
|08:00
| '''KdHydrophobicity''' મૂલ્યો '''hydrophobic residues''' માટે સકારાત્મક અને '''polar residues''' માટે નકારાત્મક મૂલ્યો હોય છે.

|-
|08:09
| '''residues'''ના '''Hydrophobicity''' રંગો અથવા વર્મ્સ દ્વારા બતાવી શકાય છે.

|-
|08:15
| '''Colors'''ને પસંદ કરો. મૂળભૂત રીતે કેટલાક પેરામીટર્સ અગાઉથી જ સિલેક્ટ કરેલા હશે.

|-
|08:21
| '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
|08:26
| '''hydrophobic residues''' લાલ રંગમાં છે , અને '''polar residues''' ભૂરા રંગમાં છે.

|-
|08:33
| '''Worms''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|08:38
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
|08:41
| '''Worms''' એ ફેરફાર કરેલી રીબન્સ છે જેઓની ત્રિજ્યા(radius) બદલાય તેવી હોય છે.
|-
| 08:47
| મોટા ભાગના '''hydrophobic residues''' સ્ટ્રકચરના અંદરના ભાગ તરફ હોય છે.

|-
|08:52
| મૂળભૂત રીતે ,વધારે પડતા '''hydrophobic residues''' વિશાળ ત્રિજ્યા ધરાવતા બતાવવામાં આવશે.

|-
|09:00
| સ્ટ્રકચરને અસલના સામાન્ય '''ribbon'''માં પાછું લાવવા :

|-
|09:03
| '''worm-style''' બટનને ક્લિક કરો અને વિકલ્પ '''non-worm'''ને પસંદ કરો.

|-
|09:09
| '''OK ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|09:12
| '''Chimera''' સેશનને '''File''' મેનુ દ્વારા બંધ કરો.

|-
|09:16
| ચાલો સારાંશ જોઈએ , આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે શીખ્યા કે ,'''atoms, residues ''' અને ''' models'''ના '''attributes''' કેવી રીતે બદલવા.

|-
|09:25
| '''protein'''માં '''B-factor'''મૂલ્યોને અનુરૂપ '''atoms'''ને રંગ આપવા.

|-
|09:30
| '''residues'''ને '''kdHydrophobicity ''' મૂલ્યોને અનુરૂપ રંગ આપવા.

|-
|09:35
| અભ્યાસ માટે પેનલમાં '''hemoglobin (PDB code: 2HCO)'''નું મોડલ ખોલો. એટમ્સને '''B-factor''' મૂલ્યોને અનુરૂપ રંગ આપો.

|-
|09:44
| રેસિડયુઝને '''kdHydrophobicity '''મૂલ્યોને અનુરૂપ રંગ આપો.

|-
|09:49
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે જો તમારું બેન્ડવિથ સારું ન હોય તો તમે તેને ડાઉલોડ કરી નિહાળી શકો છો.

|-
|09:56
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
|10:04
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
|10:10
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C4/Attributes/Gujarati

2018-02-08T14:27:48Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Attributes.''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં..."

UCSF-Chimera/C3/Superimposing-and-Morphing/Gujarati

2018-01-18T18:22:50Z

Shivanigada:

{| border=1
||''' Time '''
||'''Narration'''
|-
|00:01
| '''Superimposing and Morphing''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું : '''Superimpose''' અને સમાન પ્રોટીનના જુદા જુદા સ્ટ્રક્ચર્સને સરખાવીશું.
|-
| 00:13
| '''conformations'''ને મોર્ફ કરવાનું અને એક '''trajectory''' બનાવવી.
|-
| 00:17
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera ''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જોઈએ.
|-
| 00:22
| જો તમે નથી તો તેના ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે અમારી આ વેબ સાઈટની મુલાકાત લો.
|-
| 00:27
| અહીં હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04 ,'''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2 , '''Mozilla firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 , અને એક કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.
|-
| 00:43
| અહીં મેં એક '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.
|-
| 00:46
| '''graphic access''' ઇન્ટરફેઝમાંથી, ફાઈલ '''3w7f''' કરો.
|-
| 00:53
| '''Squalin Synthase''' નું સ્ટ્રક્ચર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.
|-
| 00:57
| હવે ચાલો '''superimposing''' માટે આ સ્ટ્રક્ચર બનાવીએ.
|-
| 01:01
| તે સમાન જ '''protein'''ની બે નકલો ધરાવે છે.
|-
| 01:05
| '''command line''' નો ઉપયોગ કરી બંનેમાંથી એક ચેઇનને કાઢી નાખો.
|-
| 01:09
| હું કમાન્ડ હિસ્ટરી ઉપર ક્લિક કરી તે માટેના કમાન્ડને યાદ કરી લઉં.
|-
| 01:14
| '''command history''' ડાયલોગ બોક્સમાંથી , કમાન્ડ '''“delete:.a”'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| 01:20
| '''Enter''' દબાવો.
|-
| 01:22
| તે પછી, સ્ટ્રક્ચરમાંથી '''solvent ''' મોલેક્યુલ્સને દૂર કરવા; હું આ કમાન્ડ “'''del solvent'''”ને સિલેક્ટ કરીશ.'''Enter''' દબાવો.
|-
| 01:32
| આ સ્ટ્રક્ચર સબ્સ્ટ્રેટ એનાલોગ '''Farnesyl thiopyrophosphate'''ના નિયંત્રણમાં છે. ટૂંકમાં '''FPS'''.
|-
| 01:40
| આપણે બે સમાન પ્રોટીન્સને '''superimpose''' કરીશું તેમના ગૌણ(secondary) સ્ટ્રક્ચર્સની સરખામણી કરવા.
|-
| 01:46
| આ માટે આપણે સમાન એન્ઝાઇમનું સબ્સ્ટ્રેટે વગરનું સ્ટ્રક્ચર મેળવીશું.
|-
| 01:52
| '''command line''' ઉપર ટાઈપ કરો “'''open 2zco'''” અને એન્ટર દબાવો.
|-
| 02:02
| નવું સ્ટ્રક્ચર ભૂરા રંગનું છે.
|-
| 02:05
| હવે આ બંને સ્ટ્રક્ચર્સ '''superimposed''' થવા તૈયાર થઇ ગયા છે.
|-
| 02:10
| '''Superimposition or Structural alignment''' એ એક ટૂલ છે જે બે અથવા વધુ '''protein''' સ્ટ્રક્ચર્સની સરખામણી કરે છે.
|-
| 02:18
| આ અલાઇન્મેન્ટ તેમના આકાર અને થ્રી-ડાઈમેંશનલ રચના ઉપર આધાર રાખે છે.
|-
| 02:24
| આપણે '''superimposing''' શરુ કરીએ તે પહેલા, ચાલો ટૂલ બારમાં કેટલાક આઇકોન્સ સ્થાપિત કરીએ.
|-
| 02:30
| '''Favorites menu''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 02:32
| '''Add to favorites/Tool bar ''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.
|-
| 02:37
| '''Preferences''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| 02:40
| '''Category''' ડ્રોપ-ડાઉનમાંથી, '''Tools'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| 02:44
| “'''Settings'''” શીર્ષકની નીચે , “'''On Tool bar'''” કોલમ નીચે બોક્સીસને ચેક કરો.
|-
| 02:53
| '''Command line''' , '''Model Panel''' , '''Side View''' માટેના બોક્સીસને ચેક કરો.
|-
| 02:59
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''MatchMaker ''' અને '''Match-Align''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 03:05
| તમે તમારી પસંદગી મુજબનું ટૂલ બાર બનાવી શકો છો.
|-
| 03:08
| તમારી જરૂરિયાત મુજબ ટૂલ્સને સિલેક્ટ કરવા.
|-
| 03:12
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| 03:14
| પેનલના ટોચ ઉપર '''Tool bar'''માં આઇકોન્સ ઉમેરાઈ ગયેલ છે.
|-
| 03:19
| '''tool bar'''ની જગ્યા બદલવા માટે , '''Toolbar placement''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 03:25
| અને ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી વિકલ્પને પસંદ કરો.
|-
| 03:29
| જ્યારે તમે આઇકોન્સને ટૂલ બારમાં ઉમેરવાનું પૂર્ણ કરો ત્યારે '''Save''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 03:35
| અને આ '''dialog box'''ને બંધ કરવા '''Close''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 03:39
| સ્ટ્રક્ચર્સ હવે જુદા-જુદા સ્થાને દેખાય છે.
|-
| 03:43
| હવે ચાલો આ સ્ટ્રક્ચર્સને '''MatchMaker''' કાર્ય દ્વારા '''superimpose''' કરીએ.
|-
| 03:48
| ''' Tool bar''' ઉપરના '''MatchMaker ''' ટૂલને ક્લિક કરો.
|-
| 03:53
| એક '''MatchMaker''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| 03:56
| '''Reference structure''' તરીકે '''3w7f ''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 04:01
| હમણાં માટે, જે સેટિંગ્સ પહેલેથી રહેલી છે તેની સાથે કામ ચલાવો. '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 04:07
| '''panel'''ને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| 04:09
| બંને સ્ટ્રક્ચર્સ એક બીજા ઉપર '''superimposed''' થયેલ દેખાય છે.
|-
| 04:13
| બંને સ્ટ્રક્ચર્સ મોટાભાગે સંપૂર્ણ રીતે એક બીજા સાથે '''superimposable''' થયેલ છે.
|-
| 04:19
| માત્ર એક નાના વિભાગને છોડીને જે '''non-superimposable''' છે.
|-
| 04:23
| આ '''non-superimposable''' વિભાગમાં જે ફ્રેગમેન્ટ ભાગ ભજવે છે તે ચાલુ થાય છે : '''amino acid''' આંક 53 થી '''amino acid''' આંક 57.
|-
| 04:34
| '''The MatchMaker''', '''residue types''' અને '''secondary structure''' નો ઉપયોગ કરી '''sequence alignment''' ઉત્પન્ન કરે છે.
|-
| 04:40
| અને પછી તે '''sequence-aligned''' રેસિડ્યુઝને 3Dમાં બંધબેસાડે છે.
|-
| 04:44
| ચાલો હવે '''Match-Align''' ટૂલને ચેક કરીએ.
|-
| 04:48
| ટૂલ બારમાંથી ''' Match-Align''' ટૂલ ઉપર ક્લિક કરો. એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| 04:55
| ચેઇન્સને સિલેક્ટ કરવા , તેમના '''pdb Ids''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 04:59
| '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 05:03
| એક '''sequence alignment''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| 05:05
| આ બોક્સમાં આ '''amino acid ''' જોડીઓ અંતિમ ગોઠવણમાં ઉપયોગી થાય છે, જેઓ આછા કેસરી બોક્સ સાથે દેખાય રહ્યા છે.
|-
| 05:13
| સ્ટ્રક્ચર્સ મોટા ભાગે સમાન છે માત્ર રેસિડ્યુઝ 52-54 પાર આવેલ લૂપને છોડીને.
|-
| 05:21
| કર્સરને અનુરૂપ લાગતા એક અક્ષર ધરાવતા કોડ ઉપર મુકો.
|-
| 05:25
| રેસિડ્યુઝ '''52 to 54''' ખસેડાયેલા દેખાય છે કારણ છે ક્રમમાં અંતરાલો(gaps) હાજર હોવાથી.
|-
| 05:33
| આ વિભાગને કર્સર દ્વારા સિલેક્ટ કરો.
|-
| 05:38
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| 05:41
| ક્રમનો સિલેક્ટ કરેલો વિભાગ પ્રકાશિત થતો દેખાય છે.
|-
| 05:45
| આ સ્ટ્રકચરના '''non-superimposable''' વિભાગને અનુરૂપ છે.
|-
| 05:50
| તમે આ '''non-superimposing''' વિભાગનો રંગ '''Actions''' મેનુ દ્વારા બદલી શકો છો.
|-
| 05:55
| '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 05:57
| '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''orange-red ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 06:02
| હવે આ વિભાગ પ્રકાશિત થયેલ છે.
|-
| 06:05
| પસંદગીને સાફ કરો અને ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
|-
| 06:10
| હવે ચાલો હું ઉદાહરણ આપી સમજાવું કે '''conformations'''ને કેવી રીતે મોર્ફ કરવું અને '''trajectory''' કેવી રીતે બનાવવી.
|-
| 06:15
| '''Morphing''' એ અસલ ઇનપુટ સ્ટ્રક્ચર્સ વચ્ચે રહેલ વચગાળાના સ્ટ્રક્ચર્સના શ્રેણીઓની ગણતરીનો સમાવેશ કરે છે.
|-
| 06:23
| વચગાળાના સ્ટ્રક્ચર્સની જે શ્રેણીઓ બને છે તેને '''Molecular Dynamics Movie.''' તરીકે સેવ કરી શકાય છે ટૂંકમાં -''' MD Movie.'''
|-
| 06:32
| '''panel''' ઉપર પાછા આવીએ.
|-
| 06:34
| '''Tools''' મેનુમાંથી મોર્ફિંગ ટૂલને શરુ કરો.
|-
| 06:37
| '''Tools''' મેનુને ક્લિક કરો,'''Structure Comparison.''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.
|-
|06:42
| '''Morph conformations ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 06:46
| એક '''Morph conformations''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| 06:50
| '''Add''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 06:52
| '''conformations'''ને ઉમેરવા મોડલ્સ ડાયલોગ બોક્સના પરિણામની યાદીમાં ; મોડલ આંક ઝીરો ઉપર બે વાર ક્લિક કરો, જે છે '''3w7f'''.
|-
| 07:03
| ત્યાર બાદ મોડલ આંક 1 ઉપર ક્લિક કરો જે છે '''2zco'''.
|-
| 07:10
| પછી ફરી '''3w7f''' ઉપર ક્લિક કરો , જે મોડલ આંક ઝીરો છે.
|-
| 07:16
| આ શ્રેણી લીગૅન્ડમાંથી એક મોર્ફ '''trajectory'''ને અનુલક્ષીને છે , જે આ સ્ટ્રક્ચરથી ખાલી સ્ટ્રક્ચર સુધી બાઉન્ડ કરે છે અને પછી પાછા
|-
| 07:26
| '''model list''' ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
|-
| 07:29
| '''Morph conformations''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''Create''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 07:34
| થોડીક સેકન્ડ્સ પછી એક ''' MD Movie''' બની જશે.
|-
| 07:39
| એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર આવે છે.
|-
| 07:42
| ડાયલોગ બોક્સ બટન્સ ધરાવે છે મુવીને શરુ(play) અને અટકાવવા(pause).
|-
| 07:42
| શરુ કરવા એરો બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| 07:50
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| 07:52
| '''conformations''' નું મોર્ફિંગ એક મુવી તરીકે શરુ થયેલ છે.
|-
| 07:57
| મુવીને અટકાવી દો અને '''MD movie''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.
|-
| 08:02
| હવે ચાલો આપણે શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.
|-
| 08:05
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા , '''Superimpose''' અને સમાન પ્રોટીનના જુદા જુદા સ્ટ્રક્ચર્સને સરખાવવું.
|-
| 08:12
| '''conformations'''ને મોર્ફ કરવાનું અને એક '''trajectory''' બનાવવી.
|-
| 08:16
| '''trajectory'''ને '''Molecular Dynamics Movie''' તરીકે સેવ કરવી.
|-
| 08:20
| અભ્યાસ માટે , '''GTP binding '''પ્રોટીન્સના સ્ટ્રક્ચર્સ '''PDB code''': '''1TAG''' અને '''1TND''' સાથે ખોલો.
|-
| 08:31
| '''MatchMaker''' ટૂલ દ્વારા સ્ટ્રક્ચર્સને સુપરઇમ્પોઝ કરો.
|-
| 08:34
| '''Sequence Alignment''' ટૂલના ઉપયોગથી , '''non-identical''' રિજિયન્સ શોધો.
|-
| 08:41
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.
|-
| 08:48
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.
|-
| 08:57
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.
આ યોજના માટે વધુ માહિતી આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ છે.
|-
| 09:09
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.
|}

UCSF-Chimera/C3/Superimposing-and-Morphing/Gujarati

2018-01-18T18:22:24Z

Shivanigada: Created page with "|- | 08:02 | હવે ચાલો આપણે શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ. |- | 08:05 | આ ટ્યૂટોરિઅલ..."

|-
| 08:02
| હવે ચાલો આપણે શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 08:05
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા , '''Superimpose''' અને સમાન પ્રોટીનના જુદા જુદા સ્ટ્રક્ચર્સને સરખાવવું.

|-
| 08:12
| '''conformations'''ને મોર્ફ કરવાનું અને એક '''trajectory''' બનાવવી.

|-
| 08:16
| '''trajectory'''ને '''Molecular Dynamics Movie''' તરીકે સેવ કરવી.

|-
| 08:20
| અભ્યાસ માટે , '''GTP binding '''પ્રોટીન્સના સ્ટ્રક્ચર્સ '''PDB code''': '''1TAG''' અને '''1TND''' સાથે ખોલો.

|-
| 08:31
| '''MatchMaker''' ટૂલ દ્વારા સ્ટ્રક્ચર્સને સુપરઇમ્પોઝ કરો.

|-
| 08:34
| '''Sequence Alignment''' ટૂલના ઉપયોગથી , '''non-identical''' રિજિયન્સ શોધો.

|-
| 08:41
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 08:48
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
| 08:57
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.
આ યોજના માટે વધુ માહિતી આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 09:09
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C3/Structure-Analysis/Gujarati

2018-01-17T14:04:55Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | | 00:01 | | '''Structure Analysis''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમાર..."

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''
|-
| | 00:01
| | '''Structure Analysis''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| | 00:05
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું કે કેવી રીતે સ્ટ્રક્ચરમાં એટમ્સ વચ્ચેનું અંતર માપવું. હાઇડ્રોજન બોન્ડ્સને બતાવવા, નોન-પોલર ઈન્ટરેક્શન્સને ઓળખવા.
|-
| | 00:16
| | અને જુદા જુદા '''rotamers''' મેળવવા '''residues'''માં બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.
|-
| | 00:21
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera ''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જોઈએ. જો તેમ નથી , તેના સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.
|-
| | 00:30
| | અહીં હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04 ,'''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2 , '''Mozilla firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 , અને એક કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.
|-
| | 00:46
| | અહીં મેં એક '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.
|-
| | 00:49
| | '''command line''' દ્વારા , '''Squalene Synthase.'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો. તે એક '''Transferace''' '''enzyme''' જેનું '''pdb code''' છે '''3w7f'''.
|-
| | 01:00
| | '''command line''' ઉપર , ટાઈપ કરો ''' Open space 3w7f'''. '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 01:09
| | '''panel''' ઉપર '''enzyme'''નું મોડેલ દ્રશ્યમાન થાય છે.
|-
| | 01:12
| | '''Presets menu''' દ્વારા ડિસ્પ્લેને '''Interactive 1'''માં બદલો.
|-
| | 01:18
| | પ્રોટીન બે નકલો રૂપે દ્રશ્યમાન થાય છે.
|-
| | 01:21
| | બંને નકલોમાંથી કોઈ એકને નાબૂદ કરવા , ટાઈપ કરો '''delete colon dot a''' , '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 01:29
| | સોલ્વન્ટ(દ્રાવક) મોલેક્યુલ્સને સ્ટ્રક્ચરમાંથી નાબૂદ કરવા , ટાઈપ કરો '''delete solvent''' , '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 01:37
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાં , '''ligand''' છે '''farnesyl thiopyrophosphate. '''
|-
| | 01:43
| | Label the '''ligand residues'''ને '''commands''' દ્વારા લેબલ આપો. ટાઈપ કરો '''rlabel '''space''' ligand''' , '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 01:53
| | અહીં બે ''' farnesyl thiopyrophosphate:''' છે જેઓ સ્ટ્રક્ચરમાં ટુકાં રીતે '''FPS ''' તરીકે છે.
|-
| | 02:01
| | સ્ટ્રક્ચર્સ '''sticks''' ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે.
|-
| | 02:05
| | સ્ટ્રક્ચરને રોટેટ કરો અને ઝૂમ-ઈન કરો.
|-
| | 02:08
| | એવી કેટલીક સાઈડ-ચેઇન્સ છે, જે '''FPS''' ના '''phosphate oxygens'''ને '''hydrogen bonds'''નું દાન કરે છે.
|-
| | 02:15
| | સાઈડ-ચેઇન રેસિડ્યુઝમાં એટમ્સ ઉપર કર્સર મુકો.
|-
| | 02:21
| | '''Serine 21''' રેસિડ્યુનું સ્થાન મેળવો .
|-
| | 02:23
| | હવે, ચાલો '''Serine 21'''ના '''oxygen ''' અને સૌથી નજીકના '''FPS.'''ના '''phosphate oxygen''' વચ્ચેનું અંતર માપીએ.
|-
| | 02:32
| | અંતર માપવા ,'''Serine 21''' રેસિડયુના '''oxygen '''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 02:37
| | '''CTRL''' કીને દબાવી રાખો તે દરમ્યાન '''Serine 21.'''ની સાઈડ ચેઇન '''oxygen'''ને ક્લિક કરો.
|-
| | 02:43
| | '''CTRL''' અને '''Shift''' કીઝને એકસાથે દબાવી રાખો તે દરમ્યાન , '''FPS'''ના સૌથી નજીકના '''phosphate oxygen ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.
|-
| | 02:52
| | '''context menu''' માંના '''Show Distance ''' ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 02:56
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. બંને એટમ્સ વચ્ચેનું અંતર દ્રશ્યમાન થયું છે. હવે પસંદગીને સાફ કરો.
|-
| | 03:04
| | આજ પ્રમાણે , '''Tyrosine '''ની સાઈડ ચેઇન '''oxygen''' અને તે જ '''FPS.'''ના '''phosphate oxygen ''' વચ્ચેનું પણ અંતર માપો.
|-
| | 03:15
| | '''hydrogen bonds''' સાથે અંતર એકધારું જ રહે છે.
|-
| | 03:20
| | દાતા અને સ્વીકારનાર સાથેના '''Hydrogen bonds''' ના અંતરો જે 2.2 to 2.5 '''Angstroms''' હોય તેને મજબૂત તરીકે , 2.5 to 3.2 ને મધ્યમ અને 3.2 to 4.0ને નબળા તરીકે વર્ગીકૃત કરવામાં આવેલ છે.
|-
| | 03:36
| | હવે , '''Select''' મેનુ દ્વારા '''ligand'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 03:40
| | રેસિડયુ વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો , સબ-મેનુમાંથી '''FPS''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 03:46
| | '''FPS''' દ્વારા બનતા '''hydrogen bonds''' ને શોધવાનો સૌથી સરળ માર્ગ છે :'''Tools''' મેનુમાંથી '''Find Hydrogen bond''' વિશેષતાનો ઉપયોગ કરવો .
|-
| | 03:55
| | ''' Structure Analysis''' વિકલ્પમાં '''FindHbond''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 04:01
| | એક ''' H-Bond Parameters''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| | 04:05
| | '''colored box''' ઉપર ક્લિક કરી '''hydrogen bond'''નો રંગ નક્કી કરો.
|-
| | 04:09
| | થોડી જાડી લાઈન માટે લાઈનની પહોળાઈ 3.0 નક્કી કરો.
|-
| | 04:13
| | '''Label Hydrogen bond with distance'''ની સામે રહેલ ચેક બોક્સ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 04:21
| | '''Only find H-bonds with at least one end selected.''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 04:26
| | અને '''Write information to reply log''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 04:31
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 04:33
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ . '''Hydrogen bonds''' હવે '''pseudo bonds''' તરીકે આપણે દર્શાવેલ રંગ અને લાઈનની પહોળાઈ સાથે દેખાય છે.
|-
| | 04:42
| | આ બોન્ડ્સ વિશેની માહિતીઓ '''Reply log''' ઉપર જોઈ શકાય છે.
|-
| | 04:45
| | ''' Favorites menu''' દ્વારા '''Reply log '''ને ખોલો.
|-
| | 04:49
| | પ્રત્યેક '''hydrogen bond''' વિશેની માહિતી અહીં આપેલ છે.
|-
| | 04:53
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
|-
| |04:55
| | જો તમે સ્ટ્રક્ચરમાંથી '''hydrogen bonds''' ને કાઢી નાખવા માનતા હોવ તો ,કમાન્ડ લાઈન ઉપર ટાઈપ કરો : '''The Tilda symbol ''' તે પછી '' hbond ''' '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 05:07
| | વિકલ્પની નીચે આવેલા ''' Tools''' મેનુમાં બીજી અન્ય વિશેષતા રહેલ છે .
|-
| | 05:13
| | તે છે '''Findclashes/contacts'''.એક '''dialog box''' ખુલે છે.
|-
| | 05:19
| | આ વિશેષતા નોન-પોલર ઈન્ટરેક્શન્સ(ક્રિયા-પ્રતિક્રિયાઓ) જેવી કે '''Clashes''' અને '''Contacts'''ને ઓળખી આપે છે.
|-
| | 05:26
| | '''''Clashes''''' એવા પ્રતિકૂળ ઈન્ટરેક્શન્સ છે જ્યાં એટમ્સ એકબીજાની ખુબ જ નજીક હોય છે.
|-
| | 05:33
| | '''''Contacts''''' સીધા ઈન્ટરેક્શન્સ છે : પોલર અને નોન-પોલર , અનુકૂળ અને પ્રતિકૂળ(કલેશીસને સમાવતા)
|-
| | 05:43
| | ચાલો બીજા બધા એટમ્સ સાથે '''FPS ''' રેસિડયુઝના '''contacts'''ને ઓળખીએ.
|-
| | 05:48
| | '''FPS''' રેસિડયુને '''Select''' મેનુ દ્વારા સિલેક્ટ કરીએ.
|-
| | 05:52
| | '''Find Clashes/Contacts''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''Designate''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 05:58
| | તે '''48 atoms designated.'''બતાવે છે.
|-
| | 06:02
| | “'''All other atoms'''”ની સામે આવેલા રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 06:06
| | '''Clash/Contact Parameters''' ને ડિફોલ્ટ '''Contact.'''માં સેટ કરો.
|-
| | 06:11
| | '''Treatment of Clash/Contact Atoms,''' ની નીચે આવેલા ચેક બોક્સમાંથી આ મુજબ ક્લિક કરો : '''Select''' '''Draw pseudo-bonds''' '''If endpoint atom hidden''' '''And Write information to reply log'''
|-
| | 06:27
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| | 06:32
| | ''' FPS ''' રેસિડ્યુઝના બધા જ કોન્ટેક્ટ્સ દેખાય છે.
|-
| | 06:37
| | '''Reply Log.'''ને ખોલો. '''Atom-atom contacts''' અહીં સૂચિત થાય છે.
|-
| | 06:44
| | '''dialog box'''ને બંધ કરો.
|-
| | 06:46
| | હવે ચાલો થોડા '''clashes.'''ને દ્રશ્યમાન કરીએ.
|-
| | 06:49
| | ચાલો આ રેસિડયુ '''Tyrosine 248''' ઉપર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરીએ.
|-
| | 06:54
| | '''command line''' ઉપર ટાઈપ કરો : '''focus space colon 248''', '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 07:03
| | પસંદગીને સાફ કરો.
|-
| | 07:06
| | હવે '''Tyrosine 248 residue.'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 07:10
| | '''CTRL''' કી ને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન,'''Tyrosine 248.'''માં કોઈ પણ એટમને ક્લિક કરો.
|-
| | 07:15
| | સંપૂર્ણ મોલેક્યુલને સિલેક્ટ કરવા '''keyboard''' ઉપર '''up arrow '''ને દબાવો.
|-
| | 07:20
| | હવે આપણે સાઈડ-ચેઇન '''Tyrosine 248'''ને ઈન્ટરેક્ટીવલી રોટેટ કરીશું અને '''Clashes''' માટે ચેક કરીશું.
|-
| | 07:27
| | '''Tyrosine 248'''ના રેસિડ્યુઝને 4 '''Angstroms'''ની અંદર દ્રશ્યમાન કરો.
|-
| | 07:32
| | તે દ્રશ્યમાન કરવા '''command line''' ઉપર ટાઈપ કરો :'''disp space colon 248 space z less than four. ''' (disp :248 z<4) , '''Enter''' દબાવો.
|-
| | 07:45
| | '''clashes'''ને દ્રશ્યમાન કરવા , '''Tools''' મેનુમાંથી '''FindClashes/Contacts''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 07:53
| | '''Designate''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 07:55
| | “'''All other atoms'''”ની સામે આવેલા બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 07:59
| | '''Clash/Contact Parameters''' ને '''Clash'''માં સેટ કરો. '''Treatment of Clash/Contact Atoms''' ને '''Select''' , '''Draw pseudobonds''' , '''If end point atom hidden'''.
|-
| | 08:11
| | અને '''Frequency of Checking''' ને '''Continuously'''માં સેટ કરો.
|-
| | 08:15
| | ડાયલોગ બોક્સને છુપાવી દો.
|-
| | 08:18
| | '''Tyrosine 248'''ની સાઈડ-ચેઇનને ઈન્ટરેક્ટીવલી રોટેટ કરવા;
|-
| | 08:22
| | '''CTRL''' કી દબાવી રાખી હોય ત્યારે આ '''ribbon''' સાથે જોડાયેલ બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:29
| | '''context menu'''માંથી '''rotate bond ''' વિકલ્પને પસંદ કરો.
|-
| | 08:33
| | એક '''Build structure''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
|-
| | 08:36
| | પોઇન્ટરને '''dial''' ઉપર ડ્રેગ કરી બોન્ડને રોટેટ કરો.
|-
| | 08:41
| | વૈકલ્પિક રીતે , કાળા એરોહેડસને ખૂણાના માપ બદલવા ક્લિક કરો.
|-
| | 08:47
| | '''panel'''ને ધ્યાનથી જુઓ. જેવી સાઈડ-ચેઇન ખસે છે , નવા '''pseudo-bonds''' બને છે અથવા અદ્રશ્ય થાય છે.
|-
| | 08:55
| | બોન્ડને તેની અસલ જગ્યાએ પાછું રાખવા : '''Bond''' નીચેની ઇન્ટરી ઉપર ક્લિક કરો. '''Revert'''ને પસંદ કરો.
|-
| | 09:03
| | ફરી વખત બોન્ડ ઉપર ક્લિક કરો પછી બોન્ડ રોટેટ ન થઇ શકે તે કરવા તેને '''Deactivate''' કરો.
|-
| | 09:09
| | '''dialog box'''ને બંધ કરો.
|-
| | 09:11
| | '''Tools''' મનુમાં રહેલ વિકલ્પોનો ઉપયોગ કરી આપણે '''Tyrosine 248'''ના બધા ''' rotamers'''ને સરખાવી શકીએ.
|-
| | 09:18
| | પ્રથમ તો '''Tryrosine 248.'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 09:22
| | '''Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Structure editing''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.
|-
| | 09:26
| | '''Rotamers''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 09:29
| | ''' Rotamer''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''rotamer library'''માંથી '''Dunbrack'''ને સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 09:36
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 09:38
| | પેનલ ઉપર '''rotamers''', ''' wire ''' તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.
|-
| | 09:43
| | અન્ય બીજો ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે. '''rotamer'''ને દ્રશ્યમાન કરવા ડાયલોગ બોક્સમાં લાઇન્સ ઉપર ક્લિક કરો. '''panel'''ને ધ્યાનથી જુઓ.
|-
| | 09:52
| | આપણે '''rotamers''' માટે '''Clash''' અને '''hydrogen bonds'''ને પણ શોધી શકીએ છીએ.
|-
| | 09:58
| | '''Columns''' ઉપર ક્લિક કરો ,પછી '''Add'''. '''Clashes''' સિલેક્ટ કરો.
|-
| | 10:03
| | ડાયલોગ બોક્સમાં '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 10:06
| | હવે હાઇડ્રોજન બોન્ડ્સને ઉમેરવા : '''Columns''' ઉપર ક્લિક કરો , '''Add, and select hydrogen bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.
|-
| | 10:15
| | '''Hydrogen bonds''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''OK''' ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 10:19
| | ડાયલોગ બોક્સને ધ્યાનથી જુઓ , બે નવી કૉલમ્સ ઉમેરાયેલી છે.
|-
| | 10:24
| | હવે પ્રત્યેક '''rotamer ''' કેટલાક '''Clashes''' બનાવે છે પણ '''hydrogen bonds''' નથી બનાવતા.
|-
| | 10:30
| | જુદા-જુદા રેસિડયુમાં બોન્ડ્સને રોટેટ કરી '''rotamers'''ને શોધવાનો પ્રયત્ન કરો.
|-
| | 10:35
| | ચાલો સારાંશ જોઈએ . આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા - સ્ટ્રક્ચરમાં એટમ્સ વચ્ચેનું અંતર માપવું.
|-
| | 10:43
| | હાઇડ્રોજન બોન્ડ્સને બતાવવા, નોન-પોલર ઈન્ટરેક્શન્સને ઓળખવા.
|-
| | 10:48
| | '''clashes''' અને '''contacts'''ને મેળવવા રેસિડ્યુઝમાં બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા અને જુદા જુદા '''rotamers'''ની સરખામણી કરી.
|-
| | 10:56
| | અભ્યાસ માટે , '''Squalene Synthase''' ખોલો , '''pdb code 3w7f .'''
|-
| | 11:03
| | '''Tyrosine 41''' રેસિડયુમાં '''Clashes''' અને '''Contacts'''ને મેળવવા બોન્ડ્સને રોટેટ કરો. અને '''rotamers'''ને સરખાવો.
|-
| | 11:11
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.
|-
| |11:17
| | અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.
|-
| |11:27
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.
આ યોજના માટે વધુ માહિતી આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ છે.
|-
| | 11:37
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.
|}

UCSF-Chimera/C3/Build-Structures/Gujarati

2018-01-04T12:37:59Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | | 00:01 | | કાઇમેરાનાં આ '''Build Structures''' પરના ટ્યુટોર..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરાનાં આ '''Build Structures''' પરના ટ્યુટોરીઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| | 00:05
| | આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે શીખીશું : નાના મોલેક્યુલ્સના સ્ટ્રક્ચર્સ બનાવવાનું ,'''peptides'''અને '''DNA''' ફ્રેગમેન્ટ્સ વિષે જોઈશું.

|-
| | 00:13
| | સ્ટ્રકચરમાં સુધારા કરવાનું, ઊર્જાને મિનિમાઈઝ કરવી અને મોડેલ્સને જોડવાનું.

|-
| | 00:19
| | આ ટ્યુટોરીઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera Interface''' ના જાણકાર હોવા જરૂરી છો, જો ન હોવ તો અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| | 00:30
| | આ ટ્યુટોરીઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu''' OS version. 14.04 ,'''Chimera''' version 1.10.2 ,'''Mozilla firefox''' browser 42.0 . અને એક કાર્યરત '''Internet ''' કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:48
| | અહીં મેં એક '''Chimera graphics window''' ખોલી છે.

|-
| | 00:52
| | ચાલો હવે '''Build Structure''' નો ઉપયોગ કરી એક કેમિકલ સ્ટ્રકચરની રચના કરવાનું શરુ કરીએ.

|-
| | 00:58
| | '''Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Structure editing''' વિકલ્પ સુધી સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 01:04
| | સબ-મેનુમાંથી, '''Build Structure''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:08
| | સ્ક્રીન ઉપર એક '''Build Structure''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 01:12
| | ડાયલોગ બોક્સમાં ટોચ ઉપર આવેલ '''Start Structure''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:18
| | અહીં આપણી પાસે એકદમ શરૂઆતથી સ્ટ્રક્ચર બનાવવાના વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| | 01:23
| | આપણે અગાઉથી ઉપલબ્ધ રહેલ સ્ટ્રકચરમાં ફેરફારો પણ કરી શકીએ, ટોર્શન્સ(મૃદુતા) એડજસ્ટ કરી શકીએ, મોડેલ્સ જોઈન કરી શકીએ વગેરે..

|-
| | 01:33
| | ચાલો તો '''Start Structure''' વિકલ્પને પસંદ કરીએ.

|-
| | 01:37
| | અહીં, સ્ટ્રકચરને શરુ કરવાના ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| | 01:41
| | આપણે '''atom''', '''fragment'''ને ઉમેરી શકીએ, '''Pubchem''' ડેટાબેઝમાંથી સ્ટ્રક્ચરને મેળવી શકીએ.

|-
| | 01:48
| | '''peptide''', '''DNA''', '''RNA''' વગેરેને બનાવો.

|-
| | 01:53
| | નાના મોલેક્યુલ્સને બનાવવા, '''atom ''' રેડિયો બટનને ક્લિક કરો. '''Atom parameters''' વિભાગ ખુલે છે.

|-
| | 02:01
| | મૂળભૂત રીતે સ્ટ્રક્ચર '''helium''' એટમ તરીકે શરુ થાય છે.

|-
| | 02:05
| | '''helium''' એટમને પેનલના કેન્દ્રમાં રાખવા માટે, '''Center of the view''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:12
| | આપણી પાસે '''X , Y ''' અને ''' Z''' કોઓર્ડિનેટસને ઇનપુટ કરવાના પણ વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| | 02:17
| | '''Select placed atom''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:21
| | '''named''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં સેશનનું નામ '''Sample1''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 02:26
| | '''Color new atoms by element''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:30
| | '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| | 02:33
| | પેનલ ઉપર એક માત્ર '''Helium''' એટમ દૃશ્યમાન થશે.

|-
| | 02:37
| | હવે આપણે આ એટમને બીજા અન્ય મોલેક્યુલમાં '''Modify Structure''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી ફેરવી શકીએ.

|-
| | 02:44
| | મૈન ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી '''Modify Structure''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| | 02:49
| | ચાલો હવે '''helium'''ને '''methane''' મોલેક્યુલમાં ફેરવવાનો પ્રયત્ન કરીએ.

|-
| | 02:53
| | ચાલો હવે '''selection''' માં helium એટમને રાખીએ.

|-
| | 02:57
| | '''Build Structure''' ડાયલોગ બોક્સમાં;

|-
| | 03:00
| | એલિમેન્ટને '''carbon'''માં બદલો , '''bonds''' ને 4 અને જીઓમેટ્રીને '''tetrahedral'''માં બદલો.

|-
| | 03:08
| | સંતુલન(valency) જાળવવા હાઇડ્રોજન્સને જરૂરત મુજબ જોડવામાં આવે છે.

|-
| | 03:13
| | મૂળભૂત રીતે પેરામિટર્સમાંના કેટલાક પહેલેથી જ સિલેક્ટ કરેલા હોય છે, તેને તેમજ જ છોડી દો.

|-
| | 03:20
| | '''Apply button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:23
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. '''Helium''' એટમ બદલાયને હવે '''Methane''' મોલેક્યુલ થઇ ગયું છે.

|-
| | 03:29
| | '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| | 03:33
| | આ મોલેક્યુલને હજી આગળ '''Methyl amine'''માં બદલવા , કોઈ પણ હાઇડ્રોજન એટમને સિલેક્ટ કરો.

|-
| | 03:39
| | '''CTRL''' કીને પકડી રાખો અને '''methane''' સ્ટ્રક્ચર પરના કોઈ એક હાઇડ્રોજન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:46
| | '''Hydrogen''' એટમ હવે સિલેક્ટ થયું છે.

|-
| | 03:49
| | '''Modify Structure''' ડાયલોગ બોક્સમાં ; એલિમેન્ટને બદલી '''nitrogen''', '''bonds''' ને 3 , જીઓમેટ્રીને '''trigonal''' કરો.

|-
| | 03:59
| | '''Apply button''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:02
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. અમીનો એસિડ હવે '''methane''' મોલેક્યુલમાં ઉમેરાયું છે.

|-
| | 04:07
| | '''Select''' મેનુ દ્વારા આ પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| | 04:10
| | જો તમે સ્ટ્રક્ચરમાંથી કોઈ પણ એટમ અથવા બોન્ડને ડીલીટ કરવા ઇચ્છતા હોવ તો ; તે એટમ અથવા બોન્ડને સિલેક્ટ કરો , '''Build Structure''' ડાયલોગ બોક્સમાંના '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:22
| | સ્ટ્રકચરને મૂળ સ્વરૂપમાં પાછું ફેરવવા , '''Tools''' મેનુ દ્વારા હાઇડ્રોજન્સને ઉમેરો.

|-
| | 04:28
| | માઉસના વચ્ચેના બટન દ્વારા આ મોડેલને ડ્રેગ કરી તેને પેનલના ખૂણે રાખો.

|-
| | 04:35
| | '''Build Structure''' ડાયલોગ બોક્સમાં; ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ ઉપર ક્લિક કરો અને '''Start Structure option'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| | 04:43
| | હવે '''fragment radio button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:47
| | વિવિધ '''cyclic ''' કમ્પાઉન્ડ્સ(સંયોજનો)ની એક ફ્રેગમેન્ટ લાઈબ્રેરી અહીં સૂચિત થાય છે.

|-
| | 04:52
| | '''5-membered rings''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:55
| | સુચીમાંથી ફ્રેગમેન્ટને પસંદ કરો.

|-
| | 04:58
| | હું '''imidazole'''ને પસંદ કરીશ .

|-
| | 05:01
| | '''Apply button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:04
| | સ્ક્રીન ઉપર '''Imidazole''' મોલેક્યુલ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 05:09
| | ''' imidazole''' મોલેક્યુલને '''methyl amine''' મોડેલની નજીક ખસેડો.

|-
| | 05:13
| | '''Active model''' સ્ટેટસ બાર ઉપરના '''model number zero''' માટેના બોક્સને અનચેક કરો.

|-
| | 05:19
| | આ '''amine model'''ને સ્ક્રીન ઉપર ઇનએક્ટિવ કરી દેશે.

|-
| | 05:23
| | માઉસના વચ્ચેના બટન દ્વારા '''imidazole'''ને '''amine model'''ના નજીક ખસેડો.

|-
| | 05:29
| | '''Build structure''' ડાયલોગ બોક્સમાંના '''Join Models''' વિકલ્પના ઉપયોગથી આપણે બે મોડેલ્સને પેનલ ઉપર જોડી પણ શકીએ.

|-
| | 05:37
| | જ્યાં તમે બોન્ડને ઘાટ આપવા માંગતા હોવ તે પ્રત્યેક મોડેલમાંથી એક '''hydrogen''' એટમને સિલેક્ટ કરો.

|-
| |05:44
| | Hold''' CTRL''' અને '''Shift''' કીને પકડી રાખો અને તે જ સમયે હાઇડ્રોજન ઉપર કોઈક કરો.

|-
| | 05:52
| | હવે '''hydrogens''' સિલેક્ટ થયા છે.

|-
| | 05:55
| | '''other bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:58
| | બોન્ડ્સને સંબંધિત માહિતી આ ડાયલોગ બોક્સ ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 06:03
| | '''Apply button''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 06:05
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , બંને મોડલ્સ જોડાઈ ગયા છે.

|-
| | 06:10
| | આ '''session '''ને ''' File menu''' દ્વારા બંધ કરો.

|-
| | 06:15
| | '''graphics''' વિન્ડોને પાછું મેળવવા માટે વિન્ડોમાં નીચે આવેલ '''lighting bolt icon''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 06:22
| | ત્યારબાદ ચાલો હવે '''peptide''' ચૈન બનાવીએ.

|-
| | 06:25
| | '''Build Structure''' ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Start Structure.'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| | 06:30
| | '''peptide ''' રેડિયો બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 06:33
| | '''Peptide''' '''Sequence''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં , અમીનો એસિડ્સ માટેનો એક અક્ષરનો કોડ ટાઈપ કરો.

|-
| | 06:39
| | ચાલો કોઈ પણ એક અમીનો એસિડ સિક્વન્સને ટાઈપ કરીએ.

|-
| | 06:43
| | ટાઈપ કરો '''ACDEFGH''' .N થી C ટર્મિનસ સુધી રેસિડ્યુઝ ઉમેરાઈ ગયા છે.

|-
| | 06:52
| | સેશન નેમ તરીકે '''Sample2.''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 06:56
| | '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 06:59
| | '''Add Peptide Sequence ''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 07:03
| | આ ડાયલોગ બોક્સ '''phi ''' અને '''psi''' ખૂણાઓને સ્પષ્ટ કરવા માટે છે.

|-
| | 07:08
| | મૂળભૂત રીતે '''phi''' અને '''psi''' ખૂણાઓ -57 અને -47 દૃશ્યમાન થયેલ હોય છે.

|-
| | 07:15
| | આ મૂલ્યો '''peptide fragment''' માટે '''alpha-helix structure'''ને સુસંગત રહેલ છે.

|-
| | 07:21
| | જો તમે આ મૂલ્યો સેટ કરવા માંગતા હોવ તો તમે તે જાતે કરી શકો છો.

|-
| | 07:29
| | હાલ પૂરતું આપણે phi\psi મૂલ્યોને બદલ્યા વગર જ છોડી દઈશું.

|-
| | 07:30
| | OK બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:33
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. તો હવે આપણી પાસે '''helix''' તરીકે દૃશ્યમાન થતી '''peptide''' ચૈન છે.

|-
| |07:39
| | સ્ટ્રકચરની એનર્જી ન્યુનત્તમ કરવા , '''command text box''' ઉપર ટાઈપ કરો '''minimize'''.એન્ટર દબાવો.

|-
| | 07:48
| | મોડલના નામ સાથેનો એક '''Dock Prep''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 07:53
| | મૂળભૂત રીતે કેટલાક પેરામીટર્સ પહેલેથી જ સિલેક્ટ થયેલા હોય છે.

|-
| | 07:57
| | હાલ પૂરતું આપણે કશું પણ બદલીશું નહીં. '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:02
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાઇડ્રોજન્સ ઉમેરવા માટે બીજું અન્ય ડાયલોગ બોક્સ ખોલે છે.

|-
| | 08:07
| | કેટલાક પેરામીટર્સ પગાઉથી સિલેક્ટ થયેલ છે. '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:13
| | પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , સ્ટ્રક્ચરમાં હાઇડ્રોજન્સ ઉમેરાઈ ગયા છે.

|-
| | 08:18
| | અન્ય ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે, '''force field package'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 08:24
| | મૂળભૂત રીતે સ્ટાન્ડર્ડ રેસિડ્યુઝ માટે '''AMBER ff14SB''' સિલેક્ટ થયેલું હોય છે.

|-
| | 08:31
| | '''OK ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:34
| | તે સ્ટ્રકચરને ન્યુનત્તમ કરવા થોડીક જ મિનિટો લેશે.

|-
| | 08:38
| | હવે આપણી પાસે સ્ક્રીન ઉપર સૌથી વધારેલ પસંદ થયેલ બનાવટ સાથેનું સ્ટ્રક્ચર રહેલ છે.

|-
| | 08:45
| | '''File '''મેનુ દ્વારા આ સેશનને બંધ કરો અને '''Graphics''' વિન્ડોને ખોલો.

|-
| | 08:51
| | '''Build stucture''' ટૂલ દ્વારા, આપણે બે પેચવાળું (double helical) DNA/RNA બનાવી શકીએ.

|-
| | 08:57
| | '''helical DNA/RNA''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| |09:01
| | '''Sequence''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં , '''DNA fragment''' માટેનો એક અક્ષરનો '''nucleotide code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 09:08
| | તેને પ્રદર્શિત કરવા હું ટાઈપ કરીશ : '''ATGCATGC'''.

|-
| | 09:16
| | ''' DNA''' ઉપર ક્લિક કરો , '''B-form''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:22
| | '''Sample3''' તરીકે નામને એડિટ કરો.

|-
| | 09:25
| | '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:28
| | '''double helix''' તરીકે પ્રદર્શિત થતું '''DNA'''નું મોડલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 09:34
| | તેને '''presets''' મેનુ દ્વારા એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં બદલો.

|-
| | 09:39
| | સારાંશ જોઈએ , આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા નાના મોલેક્યુલ્સના સ્ટ્રક્ચર્સ કેવી રીતે બનાવવા ,'''peptides'''અને '''DNA''' ફ્રેગમેન્ટ્સ વિષે જોયું.

|-
| | 09:49
| | સ્ટ્રકચરને બદલ્યું.

|-
| | 09:51
| | એનર્જી ને ન્યુનત્તમ કર્યું અને મોડલ્સને જોડ્યા.
|-
| | 09:55
| | અભ્યાસ માટે , '''biphenyl molecule'''ને રચવા બે '''benzene''' મોલેક્યુલ્સને જોડો.

|-
| | 10:02
| | તમારી પોતાની પસંદગી પ્રમાણેના '''amino acid sequence'''સાથેના '''peptide''' ફ્રેગમેન્ટની રચના કરો .

|-
| | 10:08
| | કોઈ પણ '''nucleotide sequence''' ધરાવતા '''RNA fragment'''ની રચના કરો.

|-
| | 10:13
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 10:21
| | અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. અમને સંપર્ક કરો.

|-
| | 10:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 10:35
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Surface-Properties/Gujarati

2017-11-29T11:54:50Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''માં '''Surface Properties''' પરના આ સ્પોકન ટ્યુટોરીઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યુટોરીઅલમાં,આપણે શીખીશું કે પ્રોટીન અને '''DNA''' સ્ટ્રક્ચર્સ માટેના સરફેસિસ(સપાટીઓ) કેવી રીતે બતાવાય.

|-
| 00:12
| પ્રોટીન સરફેસની ઈમેજીસ બનાવો જે '''Amino acid hydrophobicity''' અને '''Electrostatic Potential''' દ્વારા રંગેલા હોય.

|-
| 00:22
| આ ટ્યુટોરીઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera interface'''ના જાણકાર હોવા જરૂરી છો. જો તમે ન હોવ,તો તેને લગતા ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:33
| અહીં હું ઉપયોગમાં લઇ રહી છું : '''Ubuntu OS version ''' 14.04, '''Chimera''' 1.10.2

|-
| 00:42
| '''Mozilla firefox browser''' 42.0 અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.

|-
| 00:49
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી રાખી છે.

|-
| 00:52
| કમાન્ડ લાઈનના ઉપયોગથી '''RTX CPD toxin''' નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો.

|-
| 00:58
| '''Favorites''' મેનુ દ્વારા '''command line''' ખોલો.

|-
|01:02
| On the '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો : '''Open space 3eeb'''

|-
| 01:10
| '''3eeb ''' એ ''' RTX CPD toxin''' માટેનો ''' pdb code ''' છે. એન્ટર દબાવો.

|-
| 01:18
| પેનલ ઉપર તેનું પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન થાય છે. તે પ્રોટીનની બે કોપીઝ ધરાવે છે.

|-
| 01:26
| Type on the બંને કોપિઝમાંથી એક, જે છે '''chain A''',એ ને નાબૂદ(ડીલીટ) કરવા '''command line''' ઉપર ''' commands''' દાખલ કરો.

|-
| 01:33
| કમાન્ડ લાઈન ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો '''delete colon dot a''' અને એન્ટર દબાવો.

|-
| 01:43
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , '''enzyme'''ની બંને માંથી એક કોપી નાબૂદ થઇ ગઈ છે.

|-
| 01:48
| પ્રોટીએઝ ડોમેઈન લીગૅન્ડ '''inositol hexakisphosphate'''ને બાઉન્ડ થયેલ છે
ટુંકાણમાં ''' IHP ''' અને '''Sodium ion.'''

|-
| 01:58
| તે પછી સોલ્વન્ટ મોલેક્યુલ્સને નાબૂદ કરીએ, જે લીગૅન્ડની નજીક લાલ ટપકા તરીકે પ્રસ્તુત થયેલ છે. ટાઈપ કરો : '''delete space solvent'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 02:09
| લીગૅન્ડ સાથે હાજર રહેલ સોડિયમ આયર્નને નાબૂદ કરવા, ટાઈપ કરો : '''delete ions'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 02:19
| હવે આપણે પ્રોટીનના સ્ટ્રકચરને '''Presets ''' વિકલ્પના ઉપયોગથી દૃશ્યમાન કરી શકીએ.

|-
| 02:25
| મેનુ બારમાંના ''' Presets''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
|02:29
| '''Interactive 3'''સિલેક્ટ કરો, hydrophobicity surface.

|-
| 02:34
| આ મોલેક્યુલર સરફેસને '''amino acid hydrophobicity'''ના કલર-કોડ દ્વારા દૃશ્યમાન કરશે. // Daubt

|-
| 02:41
| મોટા ભાગના '''polar residues''' માટે ભૂરો રંગ.

|-
| 02:45
| મોટા ભાગના '''hydrophobic''' માટે કેસરી-લાલ અને '''neutral residues''' માટે સફેદ.

|-
| 02:52
| પ્રોટીન્સ સામાન્ય રીતે અન્ય પ્રોટીન્સ અને મોલેક્યુલ સાથે તેમના સરફેસ રિજિયન્સ દ્વારા પરસ્પર પ્રક્રિયા કરે છે.

|-
| 02:59
| પ્રોટીનને તેમના મોલેક્યુલર સરફેસ દ્વારા પ્રસ્તુત કરવું એ પ્રોટીન ફોલ્ડિંગના અભ્યાસ માટે

|-
| 03:06
| '''biomolecular recognition'''ના અનુમાન માટે,

|-
| 03:09
| '''drug binding cavities''' અને '''Molecular Graphics'''ની તપાસ કરવા માટે મદદરૂપ થાય છે.

|-
| 03:15
| '''Chimera ''' વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 03:18
| ત્યાર બાદ પ્રોટીનના '''electrostatic potential surface'''ને દૃશ્યમાન કરવા :

|-
| 03:24
| ટૂલ્સ મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Surface\Binding Analysis''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો

|-
| 03:30
| સબ-મેનુ માંથી , '''coulombic surface coloring''ને પસંદ કરો .

|-
| 03:36
| '''Coulombic Surface Coloring''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 03:41
| રંગો અને તેની સાથે સંક્યાયેલ કિંમતો બદલી શકાય છે.

|-
| 03:45
| સામાન્ય રીતે ડિફોલ્ટ સેટિંગ જ કામ આવી જાય છે. '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:51
| પેનલ ઉપર આપણી પાસે પ્રોટીન છે જે '''electrostatic potential surface'''બતાવી રહેલ છે.

|-
| 03:57
| '''negative potential''' માટે લાલ રંગ. '''positive potential''' માટે ભૂરો રંગ. અને સફેદ ન્યુટ્રલ માટે.

|-
| 04:07
| ચાલો હવે જોઈએ કે પબ્લિકેશન, પ્રેઝંટેશન્સ વગેરે માટે ઉચ્ચત્તમ ગુણવત્તાવાળી ઈમેજીસ કેવી રીતે બનાવી શકાય.

|-
| 04:14
| '''inositol''' લીગૅન્ડની સ્ટીક્સને થોડી જાડી બનાવો તે માટે આ કમાન્ડ સેટ એટ્રિબ્યુટનો ઉપયોગ કરો : '''setattr space m space stickScale 2''' અને '''Press enter''' દબાવો.

|-
| 04:35
| ઈમેજના સારા સેટિંગ માટે પબ્લિકેશન પ્રિસેટનો ઉપયોગ કરો.

|-
| 04:40
| ફરી નીચે '''Presets''' મેનુ સુધી સ્ક્રોલ કરો , '''Publication 1'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:45
| તે એક સફેદ બેકગ્રાઉન્ડ સાથેની ઇમેજ બનાવશે , તેની આઉટલાઇન્સ કાળી અને ખૂણાઓ વધુ સ્મૂધ થયેલ દેખાશે.

|-
| 04:54
| આ ક્ષણે આપણે બીજા અન્ય પેરામીટર્સ જેવાકે લાઈનની જાડાઈ, લાઇટિંગ વગેરે પણ વ્યવસ્થિત કરી શકીએ છીએ.

|-
| 05:02
| '''Tools menu''' ઉપર ક્લિક કરો , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Viewing Controls''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:08
| સબ-મેનુમાંથી '''lighting''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| એક '''Viewing''' વિન્ડો વ્યૂઇંગ સેટિંગ્સને અલગ-અલગ રીતે બદલવાના ટેબ્સ સાથે ખુલે છે :

|-
| 05:16
| જેવાકે '''Camera, Sideview, Rotation, Effects, Lighting'''.

|-
| 05:23
| '''lightings''' વિકલ્પની નીચે : એક સરળ '''line drawing ''' દૃશ્યને જોવા ,'''mode''' બટન ઉપર ક્લિક કરો ,સુચીમાંથી '''ambient'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 05:34
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:36
| ડિફોલ્ટ લાઇટિંગ મોડને પુનઃસ્થાપિત કરવા : '''Two-point ''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 05:42
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' close ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:46
| ઇમેજને સેવ કરવા '''File ''' મેનુમાંના '''Save image''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરો.

|-
| 05:51
| ચાલો હવે એક DNA સ્ટ્રકચરના સરફેસ રિપ્રેઝન્ટેશનને જોઈએ.

|-
| 05:56
| વર્તમાનના સેશનને બંધ કરો. '''File menu''' ઉપર ક્લિક કરો નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Close Session ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:04
| ગ્રાફિક્સ વિન્ડોને ખોલો . '''DNA'''ના સ્ટ્રકચરને '''command line'''નો ઉપયોગ કરી મેળવો.

|-
| 06:11
| કમાન્ડ લાઈન ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો : '''open 1d86 '''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 06:20
| આ સ્ટ્રક્ચર '''double helical DNA''', મોલેક્યુઅલ '''netropsin '''થી બાઉન્ડ થયેલ છે.

|-
| 06:27
| '''Netropsin''' એ '''antibiotic''' અને '''antiviral''' જેવા ગુણધર્મો ધરાવતું એક '''polyamide''' છે.

|-
| 06:34
| શરૂઆતમાં આ સ્ટ્રક્ચર '''ribbons''' તરીકે બતાવાય છે.

|-
| 06:39
| '''nucleic acid sugars''' અને '''bases''', '''tube and slab representations''' તરીકે બતાવાય છે.

|-
| 06:46
| ''' presets menu '''માં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''interactive 2''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 06:53
| આ '''DNA''' ને '''wire''' તરીકે અને '''netropsin''' ને '''spheres''' તરીકે દેખાડે છે.

|-
| 06:59
| સોલ્વન્ટને નાબૂદ કરવા કમાન્ડ ટાઈપ કરો :'''delete space solvent''' અને એન્ટર દબાવો.

|-
| 07:09
| આ સ્ટ્રક્ચર માટેની સરફેસ બતાવવા , '''Actions menu''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો , સબ-મેનુમાંથી '''surface'''ને સિલેક્ટ કરો,
'''show'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:20
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. The '''DNA''' સ્ટ્રક્ચર હવે '''surface''' સાથેનું દેખાય છે.

|-
| 07:27
| '''Major groove''' અને '''minor groove''' ચિત્રમાં ચોખ્ખા દેખાય છે.

|-
| 07:33
| '''ligand, netropsin''' એ '''minor groove'''માં બાઉન્ડ થેયલ દેખાય છે.

|-
| 07:38
| સરફેસિસને દેખાડવાના 3 જુદા-જુદા માર્ગો રહેલ છે.

|-
| 07:41
| '''Action menu'''માં નીચે સ્ક્રોલ કરો , '''Surface'''ને સિલેક્ટ કરો. સબ-મેનુ 3 વિકલ્પો ધરાવે છે : '''Solid''', '''mesh''' અને '''dot'''.

|-
| 07:52
| મૂળભૂત રીતે સરફેસ '''solid''' તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:57
| મેષ સરફેસ બતાવવા '''mesh''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:02
| ડોટ સરફેસ બતાવવા '''dot''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:07
| સોલિડ સરફેસ પાછી મેળવવા '''solid''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:11
| આપણે સોલિડ સરફેસ માટે પારદર્શિતાનું પ્રમાણ પણ ગોઠવી શકીએ.

|-
| 08:16
| '''Actions''' મેનુ ઉપર પાછા જાઓ અને '''Surface''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:20
| '''Transparency''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''percentage'''વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 08:25
| તે પ્રદર્શિત કરવા હું 50% પસંદ કરીશ.

|-
| 08:29
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 08:31
| સરફેસને જુદો રંગ આપવા : '''Actions''' મેનુમાં '''Color ''' વિકલ્પને ક્લિક કરો,નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''all options''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:41
| એક '''color Actions''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:45
| “'''coloring applies to'''” સેટિંગને '''surfaces.'''માં બદલો.

|-
| 08:51
| '''surfaces''' પછીના રેડીઓ બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:55
| કલર પેનલમાંના તમને ગમતા કોઈ પણ રંગ ઉપર ક્લિક કરો. હું પસંદ કરીશ '''dim gray'''.

|-
| 09:02
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ . સરફેસનો રંગ હવે '''dim gray.'''માં બદલાય ગયો છે. ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 09:11
| '''File '''મેનુમાંના '''Save Image''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી ઇમેજને સેવ કરો.

|-
| 09:16
| ચાલો હવે સારાંશ જોઈએ . આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે પ્રોટીન અને DNA સ્ટ્રક્ચર્સ માટેના '''Amino acid hydrophobicity ''' સરફેસ અને '''Electrostatic Potential ''' સરફેસને બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:30
| વિભિન્ન વ્યૂઇંગ સેટિંગ્સનો ઉપયોગ કરી પબ્લિકેશન માટે ઉચ્ચત્તમ ગુણવત્તાવાળી ઈમેજીસ બનાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:37
| હવે અભ્યાસ માટે : '''human hemoglobin''' ('''pdb code: 2dn1''') સ્ટ્રક્ચર માટે ''' amino acid hydrophobicity surface''' અને '''electrostatic potential surface''' બતાવો.

|-
| 09:51
| '''hem ligand''' ને લીલા રંગમાં ફેરવો. તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:11
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:18
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, આ લિંક ''contact@spoken-tutorial.org'' ઉપર લખો.

|-
| 10:28
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:39
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું.અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Surface-Properties/Gujarati

2017-11-29T11:54:13Z

Shivanigada:

UCSF-Chimera/C2/Surface-Properties/Gujarati

2017-11-29T11:52:48Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Chimera'''માં '''Surface Properties''' પરના આ સ્પોકન ટ્યુ..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''માં '''Surface Properties''' પરના આ સ્પોકન ટ્યુટોરીઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યુટોરીઅલમાં,આપણે શીખીશું કે પ્રોટીન અને '''DNA''' સ્ટ્રક્ચર્સ માટેના સરફેસિસ(સપાટીઓ) કેવી રીતે બતાવાય.

|-
| 00:12
| પ્રોટીન સરફેસની ઈમેજીસ બનાવો જે '''Amino acid hydrophobicity''' અને '''Electrostatic Potential''' દ્વારા રંગેલા હોય.

|-
| 00:22
| આ ટ્યુટોરીઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera interface'''ના જાણકાર હોવા જરૂરી છો. જો તમે ન હોવ,તો તેને લગતા ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:33
| અહીં હું ઉપયોગમાં લઇ રહી છું : '''Ubuntu OS version ''' 14.04, '''Chimera''' 1.10.2

|-
| 00:42
| '''Mozilla firefox browser''' 42.0 અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શન.

|-
| 00:49
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી રાખી છે.

|-
| 00:52
| કમાન્ડ લાઈનના ઉપયોગથી '''RTX CPD toxin''' નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો.

|-
| 00:58
| '''Favorites''' મેનુ દ્વારા '''command line''' ખોલો.

|-
|01:02
| On the '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો : '''Open space 3eeb'''

|-
| 01:10
| '''3eeb ''' એ ''' RTX CPD toxin''' માટેનો ''' pdb code ''' છે. એન્ટર દબાવો.

|-
| 01:18
| પેનલ ઉપર તેનું પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન થાય છે. તે પ્રોટીનની બે કોપીઝ ધરાવે છે.

|-
| 01:26
| Type on the બંને કોપિઝમાંથી એક, જે છે '''chain A''',એ ને નાબૂદ(ડીલીટ) કરવા '''command line''' ઉપર ''' commands''' દાખલ કરો.

|-
| 01:33
| કમાન્ડ લાઈન ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો '''delete colon dot a''' અને એન્ટર દબાવો.

|-
| 01:43
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , '''enzyme'''ની બંને માંથી એક કોપી નાબૂદ થઇ ગઈ છે.

|-
| 01:48
| પ્રોટીએઝ ડોમેઈન લીગૅન્ડ '''inositol hexakisphosphate'''ને બાઉન્ડ થયેલ છે
ટુંકાણમાં ''' IHP ''' અને '''Sodium ion.'''

|-
| 01:58
| તે પછી સોલ્વન્ટ મોલેક્યુલ્સને નાબૂદ કરીએ, જે લીગૅન્ડની નજીક લાલ ટપકા તરીકે પ્રસ્તુત થયેલ છે. ટાઈપ કરો : '''delete space solvent'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 02:09
| લીગૅન્ડ સાથે હાજર રહેલ સોડિયમ આયર્નને નાબૂદ કરવા, ટાઈપ કરો : '''delete ions'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 02:19
| હવે આપણે પ્રોટીનના સ્ટ્રકચરને '''Presets ''' વિકલ્પના ઉપયોગથી દૃશ્યમાન કરી શકીએ.

|-
| 02:25
| મેનુ બારમાંના ''' Presets''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
|02:29
| '''Interactive 3'''સિલેક્ટ કરો, hydrophobicity surface.

|-
| 02:34
| આ મોલેક્યુલર સરફેસને '''amino acid hydrophobicity'''ના કલર-કોડ દ્વારા દૃશ્યમાન કરશે. // Daubt

|-
| 02:41
| મોટા ભાગના '''polar residues''' માટે ભૂરો રંગ.

|-
| 02:45
| મોટા ભાગના '''hydrophobic''' માટે કેસરી-લાલ અને '''neutral residues''' માટે સફેદ.

|-
| 02:52
| પ્રોટીન્સ સામાન્ય રીતે અન્ય પ્રોટીન્સ અને મોલેક્યુલ સાથે તેમના સરફેસ રિજિયન્સ દ્વારા પરસ્પર પ્રક્રિયા કરે છે.

|-
| 02:59
| પ્રોટીનને તેમના મોલેક્યુલર સરફેસ દ્વારા પ્રસ્તુત કરવું એ પ્રોટીન ફોલ્ડિંગના અભ્યાસ માટે
|-
| 03:06
| '''biomolecular recognition'''ના અનુમાન માટે,

|-
| 03:09
| '''drug binding cavities''' અને '''Molecular Graphics'''ની તપાસ કરવા માટે મદદરૂપ થાય છે.

|-
| 03:15
| '''Chimera ''' વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 03:18
| ત્યાર બાદ પ્રોટીનના '''electrostatic potential surface'''ને દૃશ્યમાન કરવા :

|-
| 03:24
| ટૂલ્સ મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Surface\Binding Analysis''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો

|-
| 03:30
| સબ-મેનુ માંથી , '''coulombic surface coloring''ને પસંદ કરો .

|-
| 03:36
| '''Coulombic Surface Coloring''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 03:41
| રંગો અને તેની સાથે સંક્યાયેલ કિંમતો બદલી શકાય છે.

|-
| 03:45
| સામાન્ય રીતે ડિફોલ્ટ સેટિંગ જ કામ આવી જાય છે. '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:51
| પેનલ ઉપર આપણી પાસે પ્રોટીન છે જે '''electrostatic potential surface'''બતાવી રહેલ છે.

|-
| 03:57
| '''negative potential''' માટે લાલ રંગ. '''positive potential''' માટે ભૂરો રંગ. અને સફેદ ન્યુટ્રલ માટે.

|-
| 04:07
| ચાલો હવે જોઈએ કે પબ્લિકેશન, પ્રેઝંટેશન્સ વગેરે માટે ઉચ્ચત્તમ ગુણવત્તાવાળી ઈમેજીસ કેવી રીતે બનાવી શકાય.

|-
| 04:14
| '''inositol''' લીગૅન્ડની સ્ટીક્સને થોડી જાડી બનાવો તે માટે આ કમાન્ડ સેટ એટ્રિબ્યુટનો ઉપયોગ કરો : '''setattr space m space stickScale 2''' અને '''Press enter''' દબાવો.

|-
| 04:35
| ઈમેજના સારા સેટિંગ માટે પબ્લિકેશન પ્રિસેટનો ઉપયોગ કરો.

|-
| 04:40
| ફરી નીચે '''Presets''' મેનુ સુધી સ્ક્રોલ કરો , '''Publication 1'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:45
| તે એક સફેદ બેકગ્રાઉન્ડ સાથેની ઇમેજ બનાવશે , તેની આઉટલાઇન્સ કાળી અને ખૂણાઓ વધુ સ્મૂધ થયેલ દેખાશે.

|-
| 04:54
| આ ક્ષણે આપણે બીજા અન્ય પેરામીટર્સ જેવાકે લાઈનની જાડાઈ, લાઇટિંગ વગેરે પણ વ્યવસ્થિત કરી શકીએ છીએ.

|-
| 05:02
| '''Tools menu''' ઉપર ક્લિક કરો , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Viewing Controls''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:08
| સબ-મેનુમાંથી '''lighting''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| એક '''Viewing''' વિન્ડો વ્યૂઇંગ સેટિંગ્સને અલગ-અલગ રીતે બદલવાના ટેબ્સ સાથે ખુલે છે :

|-
| 05:16
| જેવાકે '''Camera, Sideview, Rotation, Effects, Lighting'''.

|-
| 05:23
| '''lightings''' વિકલ્પની નીચે : એક સરળ '''line drawing ''' દૃશ્યને જોવા ,'''mode''' બટન ઉપર ક્લિક કરો ,સુચીમાંથી '''ambient'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 05:34
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:36
| ડિફોલ્ટ લાઇટિંગ મોડને પુનઃસ્થાપિત કરવા : '''Two-point ''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 05:42
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' close ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:46
| ઇમેજને સેવ કરવા '''File ''' મેનુમાંના '''Save image''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરો.

|-
| 05:51
| ચાલો હવે એક DNA સ્ટ્રકચરના સરફેસ રિપ્રેઝન્ટેશનને જોઈએ.

|-
| 05:56
| વર્તમાનના સેશનને બંધ કરો. '''File menu''' ઉપર ક્લિક કરો નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Close Session ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:04
| ગ્રાફિક્સ વિન્ડોને ખોલો . '''DNA'''ના સ્ટ્રકચરને '''command line'''નો ઉપયોગ કરી મેળવો.

|-
| 06:11
| કમાન્ડ લાઈન ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો : '''open 1d86 '''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 06:20
| આ સ્ટ્રક્ચર '''double helical DNA''', મોલેક્યુઅલ '''netropsin '''થી બાઉન્ડ થયેલ છે.

|-
| 06:27
| '''Netropsin''' એ '''antibiotic''' અને '''antiviral''' જેવા ગુણધર્મો ધરાવતું એક '''polyamide''' છે.

|-
| 06:34
| શરૂઆતમાં આ સ્ટ્રક્ચર '''ribbons''' તરીકે બતાવાય છે.

|-
| 06:39
| '''nucleic acid sugars''' અને '''bases''', '''tube and slab representations''' તરીકે બતાવાય છે.

|-
| 06:46
| ''' presets menu '''માં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''interactive 2''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 06:53
| આ '''DNA''' ને '''wire''' તરીકે અને '''netropsin''' ને '''spheres''' તરીકે દેખાડે છે.

|-
| 06:59
| સોલ્વન્ટને નાબૂદ કરવા કમાન્ડ ટાઈપ કરો :'''delete space solvent''' અને એન્ટર દબાવો.

|-
| 07:09
| આ સ્ટ્રક્ચર માટેની સરફેસ બતાવવા , '''Actions menu''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો , સબ-મેનુમાંથી '''surface'''ને સિલેક્ટ કરો,
'''show'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:20
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. The '''DNA''' સ્ટ્રક્ચર હવે '''surface''' સાથેનું દેખાય છે.

|-
| 07:27
| '''Major groove''' અને '''minor groove''' ચિત્રમાં ચોખ્ખા દેખાય છે.

|-
| 07:33
| '''ligand, netropsin''' એ '''minor groove'''માં બાઉન્ડ થેયલ દેખાય છે.

|-
| 07:38
| સરફેસિસને દેખાડવાના 3 જુદા-જુદા માર્ગો રહેલ છે.

|-
| 07:41
| '''Action menu'''માં નીચે સ્ક્રોલ કરો , '''Surface'''ને સિલેક્ટ કરો. સબ-મેનુ 3 વિકલ્પો ધરાવે છે : '''Solid''', '''mesh''' અને '''dot'''.

|-
| 07:52
| મૂળભૂત રીતે સરફેસ '''solid''' તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:57
| મેષ સરફેસ બતાવવા '''mesh''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:02
| ડોટ સરફેસ બતાવવા '''dot''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:07
| સોલિડ સરફેસ પાછી મેળવવા '''solid''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:11
| આપણે સોલિડ સરફેસ માટે પારદર્શિતાનું પ્રમાણ પણ ગોઠવી શકીએ.

|-
| 08:16
| '''Actions''' મેનુ ઉપર પાછા જાઓ અને '''Surface''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:20
| '''Transparency''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''percentage'''વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 08:25
| તે પ્રદર્શિત કરવા હું 50% પસંદ કરીશ.

|-
| 08:29
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 08:31
| સરફેસને જુદો રંગ આપવા : '''Actions''' મેનુમાં '''Color ''' વિકલ્પને ક્લિક કરો,નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''all options''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:41
| એક '''color Actions''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:45
| “'''coloring applies to'''” સેટિંગને '''surfaces.'''માં બદલો.

|-
| 08:51
| '''surfaces''' પછીના રેડીઓ બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:55
| કલર પેનલમાંના તમને ગમતા કોઈ પણ રંગ ઉપર ક્લિક કરો. હું પસંદ કરીશ '''dim gray'''.

|-
| 09:02
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ . સરફેસનો રંગ હવે '''dim gray.'''માં બદલાય ગયો છે. ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 09:11
| '''File '''મેનુમાંના '''Save Image''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી ઇમેજને સેવ કરો.

|-
| 09:16
| ચાલો હવે સારાંશ જોઈએ . આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે પ્રોટીન અને DNA સ્ટ્રક્ચર્સ માટેના '''Amino acid hydrophobicity ''' સરફેસ અને '''Electrostatic Potential ''' સરફેસને બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:30
| વિભિન્ન વ્યૂઇંગ સેટિંગ્સનો ઉપયોગ કરી પબ્લિકેશન માટે ઉચ્ચત્તમ ગુણવત્તાવાળી ઈમેજીસ બનાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:37
| હવે અભ્યાસ માટે : '''human hemoglobin''' ('''pdb code: 2dn1''') સ્ટ્રક્ચર માટે ''' amino acid hydrophobicity surface''' અને '''electrostatic potential surface''' બતાવો.

|-
| 09:51
| '''hem ligand''' ને લીલા રંગમાં ફેરવો. તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:11
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:18
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, આ લિંક ''contact@spoken-tutorial.org'' ઉપર લખો.

|-
| 10:28
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:39
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું.અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Writing-Commands/Gujarati

2017-11-27T05:23:29Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Chimera'''માં '''Writing Commands ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યુ..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''માં '''Writing Commands ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યુટોરીઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યુટોરીઅલમાં, '''display'''ને એટમ્સમાં ફેરવવા આપણે કમાન્ડ ટાઈપ કરીશું.

|-
| 00:12
| '''ribbons'''ને કેવી રીતે દેખાડવા અને અદૃશ્ય કરવા.

|-
| 00:14
| '''amino acid residues'''ના રંગ કેવી રીતે બદલવા

|-
| 00:18
| પ્રત્યેક '''residues'''ને કેવી રીતે લેબલ આપવા.

|-
| 00:21
| '''solvent''' મોલેક્યુલ્સને કેવી રીતે દૂર કરવા. અને ફાઇલ્સને જુદાજુદા ફોર્મેટમાં કેવી રીતે સેવ કરવી.

|-
| 00:28
| આ ટ્યુટોરીઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જોઈએ.

|-
| 00:34
| તમે '''Structural Biology ''' અને '''Chimera interface'''ના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:40
| આને સંબંધિત ટ્યુટોરીઅલ્સ માટે,અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:44
| આ ટ્યુટોરીઅલને રેકોર્ડ કરવા ,હું '''Ubuntu OS version''' 14.04

|-
| 00:50
| '''Chimera''' '''version''' 1.10.2

|-
| 00:53
| '''Mozilla firefox browser''' 42.0 અને એક કાર્યરત '''Internet connection'''નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:00
| '''Chimera''' વિન્ડોને ખોલવા '''Chimera''' આઇકોન ઉપર બે વખત ક્લિક કરો.

|-
| 01:06
| '''graphics window''' ખોલવા '''lightning bolt icon''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:10
| આ ટ્યુટોરીઅલમાં , હું તમને સમજાવીશ કે કેવી રીતે '''commands'''નો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રકચરનો કૂશળતાપૂર્વક ઉપયોગ કરવો.

|-
| 01:16
| '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command Line''' ખોલો.

|-
| 01:20
| '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે એક '''command text box''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 01:25
| જે પણ કાર્યો '''menus ''' દ્વારા અમલમાં મુકાય છે તે બધા જ '''commands''' દ્વારા પણ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| '''Chimera Commands''' વિષે જોઈએ.

|-
| 01:34
| '''Chimera commands''' ને ''' Command line''' ઉપર દાખલ કરવામાં આવે છે.

|-
| 01:38
| એક સાથે ઘણા '''commands '''ને '''semicolon''' વિભાજકો દ્વારા એક લાઈનમાં જોડી શકાય છે.

|-
| 01:43
| '''command'''ને અમલમાં મુકવા '''Enter key''' દબાવો.

|-
| 01:47
| અગાઉના '''commands''', '''command History'''માંથી મેળવી શકાય છે.

|-
| 01:51
| '''commands''' વિશે વધુ માહિતી આ આપેલ લિંક ઉપરથી મેળવી શકાય છે.

|-
| 01:56
| '''Chimera''' '''window''' ઉપર પાછા આવો. ચાલો '''leucine zipper'''નું મોડેલ '''command''' ટાઈપ કરીને ખોલીએ.

|-
| 02:03
| આ '''command''' એક '''command word''' સાથે શરુ થાય છે.

|-
| 02:06
| '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર , ટાઈપ કરો '''open space 1zik'''.

|-
| 02:13
| તમને આ પગલાં માટે એક કાર્યરત '''Internet connection'''ની જરૂર પડશે.

|-
| 02:17
| '''command'''ને અમલમાં મુકવા ''' Enter''' દબાવો.

|-
| 02:20
| સ્ક્રીન ઉપર એક સ્ટ્રક્ચર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:23
| '''ribbons''' ડિસ્પ્લેને '''atoms'''માં ફેરવવા , '''command line text box'''માં ટાઈપ કરો : '''command word''' ''' display '''. અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 02:34
| તો હવે આપણે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર '''atoms display'''માં મેળવ્યું છે.

|-
| 02:38
| સ્ટ્રક્ચર આંશિક રૂપે '''ribbons''' તરીકે રજુ થાય છે.

|-
| 02:42
| '''ribbons'''ને અદૃશ્ય કરવા - '''ribbon''' '''command word'''ની આગળ '''wave symbol'''ટાઈપ કરો , જે '''tilda''' તરીકે પણ ઓળખાય છે.

|-
| 02:51
| '''tilda'''સાથેનો કોઈ પણ '''command''' વિપરીત કાર્ય સૂચવે છે.

|-
| 02:55
| અહીં '''tilda''' ચિન્હ જે રિબન કીવર્ડ સાથે રહેલ છે તે '''ribbons'''ને અદૃશ્ય કરે છે.
'''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:03
| આપણે '''color command'''નો ઉપયોગ કરી '''atoms, bonds, surfaces''' વગેરેના રંગો સેટ કરી શકીએ.

|-
| 03:10
| દાખલા તરીકે , બધા '''leucines'''ના રંગો બદલવા , ટાઈપ કરો :

'''Color space yellow space colon''' તે પછી '''amino acid'''(અમીનો એસિડ) માટેના પ્રથમ ત્રણ અક્ષર એબ્રીવીએશન તરીકે.

|-
| 03:24
| '''leucine''' માટે , હું ટાઈપ કરીશ '''leu'''.

|-
| 03:28
| અહીં '''color''' એક '''command word''' છે જે '''argument''' તરીકે '''yellow''' અને '''target''' તરીકે સ્ટ્રકચરના બધા જ ''' leucines''' સાથે છે.

|-
| 03:37
| જો તમે કોઈ ટાર્ગેટ સ્પષ્ટ ન કરો તો આખું જ સ્ટ્રક્ચર પીળા રંગમાં પરિવર્તીત થઇ જશે. '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:45
| '''panel'''ને ધ્યાનથી જુઓ . બધા જ '''leucines''' પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 03:51
| ચોક્કસ સ્થાને રહેલ '''amino acid'''ને આપણે વિશિષ્ટ રીતે રંગીન કરી શકીએ.

|-
| 03:56
| દાખલા તરીકે ''' histidine'''નો રંગ બદલવા,જે '''chain B'''ના 18માં સ્થાને રહેલ છે, ટાઈપ કરો '''color space red space colon18.B'''. '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:13
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. '''histidine''' હવે ''લાલ'' રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 04:19
| સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરના દેખાવને '''CPK spacefill'''માં બદલવા , ટાઈપ કરો '''rep'''

|-
| 04:26
|'''rep''' એ '''represent''' કીવર્ડ માટેનું કાપીને ટૂંકું કરેલ સ્વરૂપ છે. '''rep space sphere''' ; '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 04:39
| સ્ટ્રકચરને '''stick''' ડિસ્પ્લેમાં પાછું લાવવા માટે, ફરી ટાઈપ કરો '''rep space stick'''અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:50
| સ્ટ્રક્ચરમાંથી '''solvent''' મોલેક્યુલ્સને અદૃશ્ય કરવા, ટાઈપ કરો - '''del''' (delete માટે) '''space solvent''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:02
| પસંદગી માટે '''residues'''ને સક્રિય કરવા, '''select''' '''command word'''નો ઉપયોગ કરો .

|-
| 05:08
| '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો , '''select space colon ''' તે પછી નંબર અને રેસિડયુની '''chain'''.

|-
| 05:18
| દાખલા તરીકે ''' chain B''' ઉપર, 28 સ્થાને રહેલ '''lysine'''ને સક્રિય કરવા ટાઈપ કરો - '''select space colon ''' તે પછી ''' 28 dot B '''. '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:34
| હવે સિલેક્ટ કરેલ '''residue'''ના '''label'''ને બતાવવા, ટાઈપ કરો - '''rlabel space sel'''.'''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:44
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલા '''residue''' માટેનું '''residue label''' હવે દેખાય છે.

|-
| 05:51
| અગાઉ સિલેક્ટ કરેલા '''residue'''ને નાપસઁદ કરવા, '''select command'''ને મેળવવા '''અપ એરો કી'''ને દબાવો.

|-
| 05:59
| '''command'''ની શરૂઆતમાં '''tilda symbol''' ટાઈપ કરો. '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:05
| '''keywords''' અને '''command index''' ની સૂચિ '''Help menu''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 06:09
| '''Help menu''' ઉપર ક્લિક કરો , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Commands index''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:16
| એક '''web-page ''' ખુલે છે જે '''commands''' લખવા માટેના '''keywords'''ની સૂચિ બતાવે છે.

|-
| 06:22
| '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર પાછા આવીએ.

|-
| 06:25
| જો તમે બેકગ્રાઉંગનો રંગ કાળા માંથી ભૂરામાં બદલવા માંગતા હોવ તો ટાઈપ કરો : '''background space solid space blue'''.'''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:38
| પેનલ હવે ભૂરા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 06:41
| '''Command history''' જોવા ,'''Command line'''ની જમણી બાજુએ આવેલ કાળા રંગના ત્રિકોણ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:48
| '''Command history''' અગાઉ ઉપયોગમાં લીધેલ '''commands'''ની સૂચિ આપે છે.

|-
| 06:53
| '''Commands'''ને તે '''command''' ઉપર ક્લિક કરીને ફરી અમલમાં મૂકી શકાય છે.

|-
| 06:57
| To hide the '''command line'''ને અદૃશ્ય કરવા , ડ્રોપ ડાઉનમાંના '''Hide command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:03
|તમે બનાવેલ સ્ટ્રકચરને સેવ કરવા ઘણા વિકલ્પો ઉપલબ્ધ છે. '''File menu''' ખોલો.

|-
| 07:09
| તમે '''Restore a Session''' , '''Save a Session'''

|-
| 07:14
| ઇમેજને '''JPEG''' અથવા '''PNG''' ફોર્મેટ્સમાં સેવ કરી શકો.

|-
| 07:19
| ઇમેજને '''PDB''' અથવા '''Mol2''' ફાઇલ્સ તરીકે સેવ કરો , '''Export scene'''વગેરે.

|-
| 07:27
| સમજાવવા , ચાલુ હું આ ઇમેજને '''JPEG''' ફોર્મેટમાં સેવ કરું.

|-
| 07:33
| '''Save image''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. એક '''Save image''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 07:40
| ફાઈલ લોકેશન તરીકે '''Desktop''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:44
| '''File name ''' તરીકે '''1zik''' ટાઈપ કરો. '''File type''' તરીકે '''JPEG''' પસંદ કરો.

|-
| 07:52
| ઈમેજનું માપ તમારી જરુરીઆત તરીકે નિશ્ચિત કરો.

|-
| 07:56
| તે સમજાવવા , હું વીડ્થ 800 અને હાઈટ 600 ટાઈપ કરીશ.

|-
| 08:05
| '''Save''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. ઇમેજ '''1zik.jpg''' તરીકે '''Desktop''' ઉપર સેવ થઇ છે.

|-
| 08:15
| ચાલો આપણે શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
|08:17
|આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે ડિસ્પ્લેને એટમ્સમાં ફેરવવા '''commands''' ટાઈપ કર્યા.

|-
| 08:22
| '''ribbons'''ને દેખાડ્યા અને અદૃશ્ય કર્યા.

|-
| 08:25
| '''amino acid residues.'''ના રંગ બદલ્યા.

|-
| 08:28
| પ્રત્યેક '''residues'''ના '''Label ''' આપ્યા.

|-
| 08:31
| '''solvent molecules'''ને દૂર કર્યા. ઇમેજને જુદા જુદા ફોર્મેટમાં સેવ કરી.

|-
|08:38
|હવે અભ્યાસ તરીકે '''Human oxy-hemoglobin''' ('''PDB code: 2dn1''')ના સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવા '''commands''' ટાઈપ કરો.

|-
| 08:48
| ડિસ્પ્લે ને '''atoms'''માં ફેરવો અને '''ribbons'''ને અદ્રશ્ય કરો.

|-
| 08:52
| બધા '''histidine residues''' ને લીલા રંગમાં બદલો.

|-
| 08:56
| '''solvent molecules'''ને દૂર કરો અને ઇમેજને '''JPEG''' ફોર્મેટમાં સેવ કરો.

|-
| 09:03
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 09:12
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 09:19
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અમને આ લિંક( contact@spoken-tutorial.org) ઉપર લખો.

|-
| 09:29
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| 09:35
| આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક ("સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો") ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 09:40
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-24T19:21:37Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-પણ
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત કરશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-પણ
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ અમીનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46પણ
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04પણ
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30પણ
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47પણ
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ પણ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-24T18:44:09Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત કરશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ અમીનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-24T18:38:28Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત કરશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ એમિનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .(spelling mistake)

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-24T18:09:33Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત દેશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ એમિનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .(spelling mistake)

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T20:28:05Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક વિન્ડોડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-વિન્ડો
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબિન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના અણુંઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના અણુંઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના અણુંઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL''' કીને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં contact@spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T20:01:40Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક વિન્ડોડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-વિન્ડો
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબિન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના અણુંઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના અણુંઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના અણુંઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL''' કીને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T19:44:10Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક વિન્ડોડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-વિન્ડો
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબિન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના અણુંઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના અણુંઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના અણુંઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T19:43:22Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક વિન્ડોડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-વિન્ડો
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબિન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના અણુંઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T19:28:09Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક વિન્ડોડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-વિન્ડો
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબિન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T18:10:48Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું '''graphics ''' વિન્ડો પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબોન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T17:45:09Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેક્શનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું પર વિન્ડો '''graphics '''પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબોન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-22T17:44:28Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0 અને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કન્નેકશનનો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું પર વિન્ડો '''graphics '''પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબોન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-22T08:14:10Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું નો ઉપયોગ કરી રહી છું : '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાણ.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત દેશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ એમિનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .(spelling mistake)

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Picking-and-Selection/Gujarati

2017-11-22T08:13:16Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ન..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| કાઇમેરાના ઉપયોગ દ્વારા '''Picking and Selection''' ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખીશું.

|-
| 00:12
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરવા.

|-
| 00:17
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલવા.

|-
| 00:21
| '''atoms''' ઉમેરવા,કાઢવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ કરવા.

|-
| 00:27
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલવા. મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરવા.

|-
| 00:34
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને '''Undergraduate Biochemistry'''નું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે

|-
| 00:40
| અથવા તમે '''structural biology'''ના જાણકાર હોવા જોઈએ . તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિઅલ્સ માટે , અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:47
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું નો ઉપયોગ કરી રહી છું : '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04,

|-
| 00:52
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,

|-
| 00:57
| '''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0.

|-
| 01:01
| અને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાણ.

|-
| 01:04
| અહીં મેં '''Chimera window''' ખોલી છે.

|-
| 01:07
| '''rapid access window''' ઉપર,તાજેતરમાં ઉપયોગમાં લીધેલ ડેટાની સૂચિમાંથી '''1zik ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:15
| '''Leucine zipper'''નું મોડેલ '''graphics window''' ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:20
| સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) જેવાકે : residues, atoms, bonds વગેરેમાં '''Chimera'''માં ઉપલબ્ધ રહેલ ટૂલ્સ દ્વારા બદલાવ કરી શકાય છે.

|-
| 01:31
| પ્રથમ પગલું છે સિલેક્શન.

|-
| 01:34
| સિલેક્શન કરવાના ઘણા જુદા-જુદા માર્ગ છે : મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુનો ઉપયોગ કરી.

|-
| 01:40
| '''graphics window''' માંથી '''Picking''' કરી .

|-
| 01:43
| કમાન્ડ લાઈનમાં કમાન્ડ ટાઈપ કરી . અથવા '''Favorites''' મેનુમાં રહેલ '''Model Panel''' અને '''Sequence''' વિકલ્પને પસંદ કરી .

|-
| 01:53
| કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 01:55
| '''Leucine zipper''' મોટિફ(થીમ), '''leucine''' રેસિડ્યુઝ(અવશેષો)ના સામયિક પુનરાવર્તનનો સમાવેશ કરે છે.

|-
| 02:02
| હવે હું નિર્દેશ કરીશ કે આ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ '''leucine''' રેસિડ્યુઝ કેવી રીતે હાઈલાઈટ કરવા.

|-
| 02:08
| પ્રિસેટ મેનુમાંથી '''interactive 2''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:12
| આ સ્ટ્રક્ચરને એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં પરિવર્તિત દેશે. ''' Select''' મેનુમાંથી '''Residue''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 02:20
| સબ-મેનુમાં ઘણા વિકલ્પો રહેલ છે.

|-
| 02:23
| અમીનો એસિડ કેટેગરી મેનુ અમીનો સમૂહ ધરાવે છે જેમકે : '''aliphatic''', '''aromatic''', '''hydrophobic''', '''polar''' વગેરે.

|-
| 02:34
| મૂળભૂત અમીનો એસિડ મેનુ સ્ટ્રક્ચરમાં હાજર રહેલ એમિનો એસિડ રેસિડ્યુઝની સૂચિ ધરાવે છે.'''leucine''' ઉપર ક્લિક કરો .(spelling mistake)

|-
| 02:42
| બધા '''leucine''' રેસિડ્યુઝ હવે પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 02:46
| '''actions ''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''color''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:49
| હું રંગોની સૂચિમાંથી પીળો રંગ સિલેક્ટ કરીશ.બધા જ '''leucines''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| 02:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરવા , '''Select''' મેનુને ક્લિક કરો. પછી '''Clear selection''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:03
| '''Leucine''' એ એક '''hydrophobic''' હોવાથી તે પ્રોટીનના '''hydrophobic''' કોરમાં પેક થઇ જાય છે.

|-
| 03:09
| હવે પ્રિસેટ વિકલ્પ દ્વારા દેખાવને રિબિનસમાં બદલીએ.'''Interactive 1''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:17
| સ્ક્રીન ઉપરથી '''residue''' ચૂંટવા : સ્ટ્રક્ચર ઉપર કર્સરને લઇ જઈ ફરાવો.

|-
| 03:22
| ઓળખાણ આપતી માહિતી સાથે એક '''pop-up balloon''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:26
| તે માહિતી જેવી કે '''residue name''' , '''residue number''' અને '''Chain''' ધરાવે છે.

|-
| 03:32
| કર્સર ખસેડતા જ આ '''balloon''' ગાયબ થઇ જાય છે.

|-
| 03:36
| '''chain A''' ઉપરના પ્રથમ '''residue'''ઉપર કર્સરને લઇ આવો , જે છે '''arginine'''.

|-
| 03:41
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો અને ડાબા માઉસ બટનને ક્લિક કરો. CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 03:49
| '''residue'''ની આઉટલાઈન(રૂપરેખા) હાઈલાઈટ થાય છે. મૂળભૂત રીતે આ આઉટલાઇનની પસંદગી લીલા રંગની થયેલ હોય છે.

|-
| 03:57
| જો તમે એક કરતા વધુ '''residue'''ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો ; કીબોર્ડ ઉપર CTRL અને shift આ બંને કીઝને પ્રેસ કરી પકડી રાખો.

|-
| 04:04
| પેપ્ટાઈડ ચૈન ઉપર માઉસ ને ફેરવો. તમે જે પણ '''residues'''ને ચૂંટવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:10
| કિબોર્ડ ઉપરના CTRL અને Shift કીઝને હવે છોડી દો.

|-
| 04:14
| તો હવે તમે રેસિડ્યુઝને પીક કરી દીધા છે તેમાં બદલાવ કરવા.

|-
| 04:18
| '''Actions''' મેનુમાંથી વિકલ્પ પસંદ કરો. '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:23
| ઉદાહરણ તરીકે એટમ્સને ડિસ્પ્લે માટે , '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો. '''Show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| સિલેક્ટ કરેલા રેસિડ્યુઝ હવે એટમ્સ ડિસ્પ્લેમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 04:36
| '''Picking''' દ્વારા આપણે સ્ટ્રક્ચરમાં રહેલા એટમ્સ અથવા બોન્ડ્સમાં પણ બદલાવ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 04:42
| કર્સરને કોઈ પદાર્થ જેવા કે એક એટમ અથવા બોન્ડ ઉપર મુકો.

|-
| 04:47
| તે '''atomspec balloon'''માં તેની લેબલ ઇન્ફોર્મેશન બતાવશે.

|-
| 04:52
| એટમ માટેના '''Atomspec balloon''' આ પ્રમાણે માહિતી ધરાવે છે જેવી કે : '''Residue''' name, number, chain અને atom name.

|-
| 05:01
| એટમને સિલેક્ટ કરવા, કિબોર્ડ ઉપર CTRL કીને દબાવી પકડી રાખો.

|-
| 05:06
| જ્યારે તમે CTRL કીને પકડી રાખી હોય દરમ્યાન તમે એટમને બદલવા માંગતા હોવ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| હવે તે એટમ હાઈલાઈટ થાય છે. તે એટમમાં ફેરફાર કરવા માટે CTRL કી પકડી રાખી તેના ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 05:20
| વિકલ્પો સાથે નું એક '''''context menu ''''' ખુલે છે.

|-
| 05:24
| '''Modify-atom''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. CTRL કીને છોડી દો.

|-
| 05:30
| એક '''Build Structure''' વિન્ડો ખુલે છે.

|-
| 05:33
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ Nitrogenને methyl groupમાં બદલીએ.

|-
| 05:38
| '''Build Structure''' વિન્ડોમાં , એલિમેન્ટ તરીકે carbon, બોન્ડ્સને 4 તરીકે પસંદ કરો અને '''apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:49
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 05:51
| વર્તમાન સ્ટ્રક્ચરમાં હવે methyl group ઉમેરાયેલું દેખાય છે. વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 05:57
| બોન્ડ્સને ફેરવવાનું વિકલ્પ છે.

|-
| 06:00
| તમારે જે બોન્ડને ફેરવવું છે તેના ઉપર કર્સરને લઇ જઈ પકડી રાખો.

|-
| 06:04
| આ બોન્ડ વિશેની માહિતી '''atomspec balloon'''માં દેખાય છે.

|-
| 06:09
| બોન્ડને સિલેક્ટ કરવા, કર્સરને તે બોન્ડ ઉપર રાખો.

|-
| 06:13
| CTRL કીને પ્રેસ કરી પકડી રાખો. ડાબું માઉસ બટન ક્લિક કરો.

|-
| 06:18
| સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હાઈલાઈટ થતો દેખાય છે.CTRL કીને પકડી રાખી હોય તે દરમ્યાન બોન્ડ ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:26
| કિબોર્ડ ઉપર CTRL કી ને છોડી દો.

|-
| 06:29
| એક '''context-menu''' ખુલે છે. '''rotate bond''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:35
| સ્ક્રીન ઉપર ''' Build Structure ''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:39
| ડાયલોગ બોક્સમાં હાજર રહેલ રોટેટિંગ ટૂલ ઉપર ક્લિક કરી ફેરવો.

|-
| 06:46
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલ બોન્ડ હવે ફરતો દેખાય છે.

|-
| 06:51
| તમે નક્કી કરેલા ખૂણાએ જ્યારે તે પોહચી જાય ત્યારે તેને ફેરવવાનું બંધ કરો. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 06:57
| પસંદગીને નાબૂદ કરો. ચેઇન્સને હાઈલાઈટ કરવા આપણે ટૂલ્સમાંના '''Sequence ''' વિકલ્પનો પણ ઉપયોગ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:05
| ટૂલ્સ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Sequence''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:10
| સબ-મેનુ માંથી '''Sequence''' ને પસંદ કરો.

|-
| 07:13
| એક'''Show model sequence''' ડાયલોગ બોક્સ દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:17
| જો તમે chain A ને સિલેક્ટ કરવા માંગતા હોવ તો '''chain A ''' ઉપર ક્લિક કરો. પછી '''show''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:23
| ડિસ્પ્લે સ્ક્રીન ઉપર અમીનો એસિડ સિક્વન્સિસ સાથેનો અન્ય ડાયલોગ બોક્સ દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:28
| '''amino acid residues'''એક અક્ષરના સંક્ષેપ તરીકે પ્રસ્તુત થાય છે.

|-
| 07:34
| સિક્વન્સને સિલેક્ટ કરવા તેને ક્લિક કરો .

|-
| 07:37
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ, '''Chain A''' હવે હાઈલાઈટ થયેલ છે.

|-
| 07:41
| વિન્ડોને બંધ કરવા ''' quit ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:44
| '''Actions menu''' ઉપર જાઓ , '''Color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો. yellow વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 07:50
| '''Chain A''' હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે. પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 07:55
| '''Chimera window'''માં આપણે એક કરતા વધુ સ્ટ્રક્ચર પણ ખોલી શકીએ છીએ.

|-
| 07:59
| બીજું સ્ટ્રક્ચર ખોલવા : ફાઈલ મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 08:03
| '''Fetch by ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| '''Fetch structure by ID''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 08:11
| '''PDB''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો. પછી ચાર અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો. ઉદાહરણ તરીકે '''human insulin'''ને મેળવવા , ટાઈપ કરો 4ex1.

|-
| 08:23
| ''' fetch ''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 08:25
| પેનલ ઉપર બે પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર્સ ઓવરલેપ થયેલ દેખાય છે.

|-
| 08:29
| ઓવરલેપ થયેલ બંને સ્ટ્રક્ચર્સને છુટા પાડવા : આપણે એક મોડેલને બરાબર સિલેક્ટ કરી પેનલ ઉપર ખસેડવું પડશે.

|-
| 08:36
| '''favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી '''Command line''' ખોલો.

|-
| 08:39
| વીન્ડોના નીચે '''Command line''' દ્યશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:43
| model zeroને અનચેક કરવા ક્લિક કરો , જે '''leucine zipper''' પ્રસ્તુત કરે છે .

|-
| 08:48
| કર્સરને '''insulin''' સ્ટ્રક્ચર ઉપર લાવો : માઉસનું વચ્ચેનું બટન પકડી રાખો.

|-
| 08:54
| પછી તમે નક્કી કરેલ સ્થાને પેનલમાં '''insulin''' મોડેલને ડ્રેગ કરી ખસેડો. માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 09:01
| કોઈ મોડેલને સિલેક્ટ કરી તેને સ્ક્રીનમાંથી કાઢી નાખવું હોય તો : '''Favorites''' મેનુનો ઉપયોગ કરી મોડેલ પેનલ ખોલો.

|-
| 09:08
| એક '''Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 09:11
| '''model ID'''ને ક્લિક કરી જે મોડેલને તમે કાઢવા માંગતા હોવ તેને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:16
| ઉદાહરણ તરીકે મારે '''insulin''' મોડેલને સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નાખવું છે.

|-
| 09:21
| '''model ID'''ને ક્લિક કરો. close વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| 09:26
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.'''insulin'''નું મોડેલ હવે સ્ક્રીન ઉપરથી કાઢી નખાયું છે.

|-
| 09:32
| મોડેલ પેનલ વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| 09:34
| તો અહીં આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 09:37
| ચાલો આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.

|-
| 09:40
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''atoms''' અને '''residues'''ના લેબલ્સ બતાવતા શીખ્યા.

|-
| 09:46
| '''atoms''' અને '''residues''' ને '''Select menu''' દ્વારા અથવા '''Picking''' દ્વારા સિલેક્ટ કરતા શીખ્યા.

|-
| 09:51
| '''residues'''ના રંગ અને દેખાવ બદલ્યા.

|-
| 09:55
| '''atoms''' ઉમેરવા,નાબૂદ કરવા અથવા બદલવા , બોન્ડ્સને રોટેટ(ગોળ ફેરવવા)કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:00
| ડિસ્પ્લે વિન્ડોમાં એક કરતા વધુ મોડેલ ખોલતા અને મોડેલને સિલેક્ટ અને મુવ કરતા શીખ્યા.

|-
| 10:06
| અભ્યાસ માટે '''human insulin'''નું સ્ટ્રક્ચર ખોલો, કાઇમેરા વિન્ડો ઉપર '''pdb code 4ex1''' દ્વારા.

|-
| 10:14
| બધા જ '''hydrophobic''' અમીનો એસિડ '''residues'''ના રંગ બદલી ભૂરા કરો.

|-
| 10:19
| બધા '''polar residues'''ના રંગ બદલી લાલ કરો.

|-
| 10:23
| પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| 10:29
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| 10:36
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 10:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. આ પ્રોજેક્ટ માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:55
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા બદલ આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-21T12:28:55Z

Shivanigada:

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું પર વિન્ડો '''graphics '''પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

|-
| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબોન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
| | ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

UCSF-Chimera/C2/Structure-Manipulation/Gujarati

2017-11-21T12:27:22Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | | 00:01 | | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation '''..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| | 00:01
| | કાઇમેરા નોઉપયોગ કરીને '''Structure Manipulation ''' પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| |00:06
| | આ ટ્યૂટોરિઅલમાં, આપણે એક સ્ટ્રક્ચરને કાઇમેરા વિન્ડોમાં ખોલતા શીખીશું.

|-
| | 00:12
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરીશું. સ્કેલ અને કલીપ કરીશું અને તેનો દેખાવ બદલીશું.

|-
| | 00:20
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમને અંડરગ્રેજ્યુએટ બાયોકેમેસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જરૂરી છે અથવા તો તમે સ્ટ્રક્ચરલ બાયોલોજીના જાણકાર હોવા જોઈએ.

|-
| | 00:29
| | આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું '''Ubuntu Linux''' OS આવૃત્તિ 14.04, '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.2,
'''Mozilla Firefox''' બ્રાઉઝર 35.0નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| | 00:47
| | '''UCSF Chimera''' એક ઇન્ટરેક્ટીવ વિઝયુલાઈઝેશન અને મોલેક્યુલર સ્ટ્રક્ચરનું એનાલિસિસ કરતુ એક સોફ્ટવેર છે.

|-
| | 00:55
| | '''Chimera'''ના રચેતા છે : '''Resource for Biocomputing, Visualization and Informatics at the University of California, San Francisco.'''

|-
| | 01:05
| | વધુ માહિતી આ લિંક'''http://www.cgl.ucsf.edu/chimera''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| | 01:09
| | '''Chimera''' વિન્ડો ખોલવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલ '''Chimera''' આઇકોન ઉપર એક વાર અથવા બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:16
| | એક '''Rapid access''' ઇન્ટરફેઝ ખુલે છે.

|-
| | 01:20
| | '''Rapid access''' વિન્ડો, તમને વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા ડેટા અને ટૂલ્સને સરળતાથી ખોલવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 01:27
| | વિન્ડોમાં નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં આવેલ ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 01:32
| | આ '''graphics''' વિન્ડોને પ્રદર્શિત કરશે. '''3D structures''' અને બીજા અન્ય ડેટા આ વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 01:40
| | ચળકતી વીજળી ના આકારના આઇકન ઉપર ક્લિક કરી આ બંને વિન્ડોઝ વચ્ચે ટોગલ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:45
| | ચાલો હું પર વિન્ડો '''graphics '''પર પાછી જાઉં

|-
| | 01:48
| | '''Chimera'''માં ઘણા કર્યો બે પદ્ધતિઓ દ્વારા પૂર્ણ કરી શકાય છે.

|-
| | 01:53
| | પ્રથમ છે, '''menu bar'''નો ઉપયોગ કરી, જે '''Chimera''' વિન્ડોના ટોચ ઉપર રહેલ છે.

|-
| | 01:59
| | બીજી પદ્ધતિ છે '''command line''' ઉપર '''commands''' દાખલ કરીને.

|-
| | 02:03
| | '''command line'''ને બતાવવા , '''Favorites''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:06
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''command line''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:10
| | '''Chimera''' વિન્ડોમાં નીચે '''command''' ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| | 02:15
| | કોઈ યોગ્ય કાર્ય માટેના '''Commands''' આ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં લખવામાં આવે છે.

|-
| | 02:21
| | હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે આ વિશેષતા વિશે વધુ શીખીશું.

|-
| |02:25
| | વિન્ડોનું માપ બદલવા , વિન્ડો ના કોઈ પણ ખૂણા ને ડ્રેગ કરો.

|-
| | 02:30
| | ચાલો હવે જોઈએ કે '''protein''' સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલાય.

|-
| | 02:34
| | 3 રીતે તમે તે કરી શકો. જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલા હોવ તો, '''File''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:40
| | નીચે સ્ક્રોલ કરો અને “'''Fetch by ID'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 02:45
| | સ્ક્રીન ઉપર એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 02:48
| | સ્ટ્રક્ચરને મેળવવા તમે વિવિધ ડેટાબેઝીસ સાથે જોડાય શકો છો.

|-
| | 02:53
| | ઉદાહરણ તરીકે પ્રદર્શિત કરવા ,મને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર દૃશ્યમાન કરવું છે.

|-
| | 02:58
| | હું વિકલ્પો માંથી '''PDB '''ને પસંદ કરીશ, તમે જે '''protein''' અણું (મોલેક્યુલ)ને પ્રદર્શિત કરવા માંગો છો તેનો 4 અક્ષરનો '''PDB code''' ટાઈપ કરો.

|-
| | 03:08
| | હું ટાઈપ કરીશ '''1zik''' (one z i k)

|-
| | 03:12
| | આ '''Leucine zipper ''' પ્રોટીન માટેનો '''pdb''' કોડ છે . '''Fetch ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:19
| | મૂળભૂત રીતે, '''protein'''નું રિબિન્સ(પટ્ટીવાળું) દૃશ્ય આ ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર પ્રદર્શિત થાય છે.

|-
| | 03:25
| | સ્ટ્રકચરને મેળવવા આપણે '''command''' પણ ટાઈપ કરી શકીએ છીએ.

|-
| | 03:29
| | '''command line''' ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “'''open 1zik'''”

|-
| | 03:35
| | ડિસ્પ્લે વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરને ખોલવા '''Enter''' દબાવો.

|-
| | 03:40
| | જો તમે ઇન્ટરનેટ સાથે જોડાયેલ નથી તો તમે અગાઉથી ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલી શકો છો.

|-
| | 03:46
| | સ્ક્રીન ઉપર રહેલ સ્ટ્રકચરને સાફ કરવા : '''Favorites''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Model Panel''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 03:55
| | એક ''' Model Panel''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 03:58
| | '''model id''' ઉપર ક્લિક કરો, પછી '''Close''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:04
| | '''model panel ''' વિન્ડો બંધ કરો.

|-
| | 04:07
| | હવે હું પ્રદર્શિત કરીશ કે '''PDB''' ફાઈલ કેવી રીતે ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 04:12
| | '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવા તમને કાર્યરત ઇન્ટરનેટ જોડાણની જરૂર પડશે .

|-
| | 04:17
| | '''File''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Fetch by ID''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:23
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 04:26
| | ડાયલોગ બોક્સમાં એકદમ નીચે સ્ક્રોલ કરો .

|-
| | 04:30
| | '''web page''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:33
| | બાઉઝરમાં '''PDB database''' વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| | 04:37
| | જો તમે '''protein'''નો '''pdb''' code જાણતા હોવ તો જે ટેક્સ્ટ બોક્સ મળે છે તેમાં ટાઈપ કરો . અથવા '''protein'''નું નામ ટાઈપ કરો.

|-
| | 04:46
| | '''leucine zipper'''માટેનો '''pdb''' કોડ જાણું છું , તેથી હું ટેક્સ્ટ બોક્સમાં “'''1zik”''' ટાઈપ કરીશ.

|-
| | 04:54
| | '''Go''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 04:57
| | પેજને નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 04:59
| | આ પેજના જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ '''Download files''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| | 05:06
| | ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી '''PDB-file-text''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:12
| | એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| | 05:14
| | '''Save File''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:17
| | '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:20
| | ડાઉનલોડ થઇ ગયેલ '''pdb''' ફાઈલ હવે '''Downloads''' ફોલ્ડરમાં સેવ થઇ ગઈ હશે.

|-
| | 05:25
| | પાછા '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર આવીએ.

|-
| | 05:27
| | ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| | 05:30
| | અગાઉ ડાઉનલોડ કરેલ '''pdb''' ફાઈલ ખોલવા , '''File'''માંના '''Open ''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:37
| | '''Downloads''' ફોલ્ડર ઉપર જાઓ . '''1zik.pdb''' ફાઈલ પસંદ કરો.

|-
| | 05:44
| | “'''Open'''” બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 05:47
| | '''leucine zipper'''નું મોડેલ પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| | 05:51
| | મૂળભૂત રીતે , આ બંને '''peptide chains''' એ ભૂખરા રંગની રિબિન્સ(પટ્ટીઓ) તરીકે દૃશ્યમાન થાય છે .

|-
| | 05:57
| | પેનલ ઉપર સ્ટ્રકચરને ખસેડવા માઉસ બટનનો ઉપયોગ કરો.

|-
| | 06:01
| | રોટેશન(પરિભ્રમણ) માટે ડાબુ માઉસ બટન .

|-
| | 06:04
| | વચ્ચેનું માઉસ બટન '''xy translation''' નિયંત્રિત કરે છે.

|-
| | 06:08
| | જમણું બટન અથવા માઉસનું પૈડું ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ માટે.

|-
| | 06:13
| | સ્ટ્રકચરના ઇન્ટરેક્ટિવ સ્કેલિંગ અને ક્લિપિંગ માટે : '''Favorites menu'''માંના '''Side View''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવો.

|-
| | 06:20
| | એક '''viewing window ''' ખુલે છે.

|-
| | 06:22
| | વિન્ડો ઉપર સ્ટ્રક્ચરનું ઝીણું સ્વરૂપ દેખાય છે.

|-
| | 06:27
| | ડાબી બાજુનું પીળું ચોરસ viewer's eye positionદર્શાવે છે.

|-
| | 06:32
| | ડાબા માઉસ બટનના ઉપયોગથી તે નાના ચોરસને ખસેડવાનો પ્રયત્ન કરો.

|-
| | 06:36
| | તેને આડું ડ્રેગ કરો, '''scale factor''' વ્યવસ્થિત કરો.

|-
| | 06:41
| | ''' eye position ''' બે વાર ક્લિક કરતા તે કેમેરા મોડ બદલવાનું એક મેનુ દેખાડે છે.

|-
| | 06:46
| | ડાબા માઉસ બટન દ્વારા આ બે ઉભી રેખાઓથી '''clipping planes''' ખસેડાશે.

|-
| | 06:53
| | વિન્ડોઝ ઉપર બીજા ઘણા વ્યૂઇંગ કંટ્રોલ્સ છે, જે તમે જાતે શોધી શકશો.

| | 06:58
| | '''viewing window.'''ને બંધ કરો.

|-
| | 07:01
| | ચાલો હવે આ સ્ટ્રકચરનો કુશળતા પૂર્વક ઉપયોગ(manipulate) કરતા શીખીએ.

|-
| | 07:04
| | પ્રથમ પગલું છે સ્ટ્રકચરના તે ભાગને પસંદ કરવો જેને તમે બદલવા માંગો છો.

|-
| | 07:09
| | હમણાં માટે, હું સંપૂર્ણ '''protein''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' તરીકે બતાવવા માંગુ છું.

|-
| | 07:15
| | મેનુ બારમાંના '''Select''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:19
| | મેનુ બારમાંનો '''Select''' મેનુ આપણને સ્ટ્રકચરના અલગ-અલગ કમ્પોનંટ્સને પસંદ કરવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| | 07:25
| | જેવાકે '''chain, element, residue, ligand''' વગેરે.

|-
| | 07:31
| | જોકે , “'''Select'''” મેનુમાંથી કાંઈ પણ પસંદ ન કર્યું હોય તો તેનો અર્થ એ થાય છે કે આપણે સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરને જ બદલવા માંગીએ છીએ.

|-
| | 07:39
| | હવે '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , અને વિકલ્પોમાંથી '''atoms/bonds'''ને પસંદ કરો.

|-
| | 07:46
| | સબ મેનુમાંના '''show ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 07:49
| | સ્ક્રીન ઉપર આપણે એટમ્સ અને તેની સાથે સાથે સ્ટ્રકચરના ભાગને રિબિન્સ તરીકે જોઈ શકીએ છીએ .

|-
| | 07:55
| | હવે રિબોન્સને કાઢી નાખવા , '''Action''' મેનુ માંથી રિબિન્સને પસંદ કરો.
|-
|-
| | 08:00
| | પછી '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
|-
| | 08:03
| | સંપૂર્ણ સ્ટ્રક્ચર હવે '''sticks display''' તરીકે દેખાય છે.

|-
| | 08:08
| | ચાલો હવે આગળ વધીએ અને સ્ટ્રક્ચરનો હજી વધુ ઉપયોગ કરતા શીખીએ .

|-
| | 08:13
| | નીચેના પગલાંઓ સ્ટ્રકચરને બોલ અને સ્ટિક ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 08:18
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:21
| | atoms/bonds સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:24
| | સબ મેનુમાંથી '''ball and stick'''ને પસંદ કરો .

|-
| | 08:28
| | નોંધ લો કે સ્ટ્રક્ચર '''hydrogen''' એટમ્સ વગરનું છે.

|-
| | 08:33
| | હાઇડ્રોજન એટમ્સ ઉમેરવા ,'''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| | 08:37
| | '''Structure Editing''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:40
| | સબ મેનુમાંથી '''Add hydrogens''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| | 08:45
|ડાઈલોગ બોક્સ માં દેખાડ્યા પ્રમાણે પસંદગી કરો.

|-
| | 08:49
| | '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 08:52
| | ધ્યાનથી જુઓ સ્ટ્રક્ચર હવે '''hydrogen''' એટમ્સ સાથે દેખાય છે.

|-
| | 08:57
| | સામાન્ય રીતે '''protein'''નું સ્ટ્રક્ચર પાણીના પરમાણુઓ(molecules)થી સંકળાયેલ હોય છે.

|-
| | 09:02
| | પાણીના પરમાણુઓને છુપાવવા માટે, '''Select ''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''Residue''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો, વિકલ્પ '''HOH''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:13
| | સ્ક્રીનને ધ્યાનથી જુઓ ; બધા જ પાણીના પરમાણુઓ પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| | 09:18
| | '''actions''' મેનુ ઉપર જાઓ , '''Atoms\bonds''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''hide''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 09:26
| | આ સ્ટ્રક્ચરમાંથી પાણીના અણુંઓને છુપાવી દેશે.

|-
| | 09:30
| | મેનુ બારમાંનો '''Presets''' વિકલ્પ સ્ટ્રકચરના દેખાવને બદલવાના બીજા ઘણા વિકલ્પો ધરાવે છે.

|-
| | 09:36
| | જયારે તમે '''Interactive 1''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો છો : સ્ટ્રક્ચર રિબિનસ તરીકે દેખાશે ,
અને બંને '''peptide chains''' જુદા રંગોમાં દેખાશે.

|-
| | 09:45
| | '''Interactive 2''' સ્ટ્રકચરને '''atoms''' ડિસ્પ્લેમાં રૂપાંતરિત કરે છે.

|-
| | 09:50
| | પાછા '''Interactive 1''' ડિસ્પ્લે ઉપર જાઓ.

|-
| | 09:53
| | આપણે '''peptide chains'''ના રંગ પસંદગીથી બદલી શકીએ.

|-
| | 09:57
| | '''Select''' મેનુમાં નીચે જાઓ અને '''chain A'''ને સબ મેનુમાંથી પસંદ કરો.

|-
| | 10:02
| | Chain A હવે પ્રકાશિત થયેલ છે.

|-
| | 10:05
| | '''Actions''' મેનુ ઉપર જાઓ, '''color''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને yellow પસંદ કરો.

|-
| | 10:11
| | Chain A હવે પીળા રંગમાં દેખાય છે.

|-
| | 10:15
| | પસંદગીને નાબૂદ કરવા , કિબોર્ડની '''CTRL'''ને પકડી રાખો . અને '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર ખાલી જગ્યા(empty space) ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| | 10:23
| | તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| | 10:26
| | '''Chimera''' વિન્ડોની બહાર નીકળવા , '''File''' મેનુ ઉપર જાઓ અને '''Quit''' વિકલ્પને ક્લિક કરો.

|-
| | 10:32
| | ચાલો તો હવે સારાંશ જોઈએ, આ ટુરોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા કે '''Chimera''' વિન્ડોમાં સ્ટ્રક્ચર કેવી રીતે ખોલવું. અને '''protein''' સ્ટ્રક્ચર માટે '''PDB''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરવી.

|-
| | 10:43
| | સ્ટ્રક્ચરને મુવ, રોટેટ અને ઝૂમ કરવું . તેને સ્કેલ અને કલીપ કરવાનું.

|-
| | 10:49
| | મેનુ બારમાંના મેનુઝનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રક્ચરનો દેખાવ બદલવો .

|-
| | 10:53
| | પાણીના પરમાણુઓને નાબૂદ કરવા. અને '''hydrogens'''ને ઉમેરવા.

|-
| |10:57
| | અભ્યાસ માટે '''PDB''' ડેટાબેઝમાંથી '''Leucine zipper''' માટેની '''pdb''' ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.

|-
| | 11:04
| | '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર '''File''' માંના '''Open''' વિકલ્પનો ઉપયોગ કરી '''pdb''' ફાઈલ ખોલો.

|-
| | 11:10
| | એટમ્સના દેખાવને '''wire'''માં બદલો અને બધી જ '''aromatic rings''' ને '''disks'''માં બદલો.

|-
| | 11:16
| | તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.

|-
| | 11:21
| | આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.

|-
| | 11:26
| | તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.

|-
| | 11:28
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| | 11:34
| | વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| | 11:38
| | સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| | 11:44
| | આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| |11:48
| | ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Gujarati

2017-11-07T10:50:28Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ '''‘Customizing Diagram Layout’''' માં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું કે કેવી રીતે : '''Reaction line'''નો '''color, shape''' અને '''width''' બદલી શકાય,

|-
| 00:19
| '''Reaction line'''માં '''Anchor points''' ઉમેરવા , '''Components'''ને સંરેખિત કરવા, '''Reaction ids''' બતાવવા / છુપાવવા.

|-
| 00:30
| આપણે આ પણ શીખીશું કે કેવી રીતે : '''Components'''માં '''Notes'''(નોંધ) ઉમેરવી, '''Protein'''ને એડિટ કરવું, '''information''' ને એડિટ કરવી.

|-
|00:39
| અને ડાઇગ્રામનું '''bird’s eye view''' મેળવવું.

|-
| 00:44
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું '''Ubuntu Linux OS 14.04''' ,'''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7'''નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:01
| આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:12
| જો તમે ન જાણતા હોવ,તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' અમારી વેબસાઈટ ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 01:20
| તો ચાલુ શરૂઆત કરીએ.

|-
| 01:22
| અગાઉના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાંના એક માટે અભ્યાસ હતો કે - '''Methionine Biosynthesis''' માટે એક '''process diagram ''' બનાવવો.

|-
| 01:32
| હું તે જ ડાયગ્રામને અહીં ઉદાહરણ તરીકે વાપરી રહી છું . અને તેને કેવી રીતે કસ્ટમાઇઝ(ફેરફાર કરવા) કરવું તે તમને સમજાવીશ.

|-
| 01:43
| ચોલો તો મને '''CellDesigner''' ઇન્ટરફેઝ ઉપર જતા રહેવા દો.

|-
| 01:47
| અહીં તમે જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Methionine Biosynthesis''' માટે નો '''process diagram ''' છે.

|-
| 01:53
| અહીં તમે આ ટ્યૂટોરિઅલને અટકાવી દો અને જે '''Methionine Biosynthesis process diagram ''' તમે બનાવ્યો છે તે ખોલો.

|-
| 02:01
| જો તમારી પાસે સેવ કરેલી ફાઈલ ન હોય તો તમને આપવામાં આવેલ '''code file'''ને ખોલી શકો છો.

|-
| 02:08
| તો ચાલો હું આ '''diagram'''માં ફેરફાર કરવાનું શરુ કરું.

|-
| 02:12
| ચાલો પાછા ''' Cell designer '''ઇન્ટરફેઝ ઉપર જઈએ.

|-
| 02:16
| હું '''Reaction line'''ના '''width અને color''' બદલવાથી શરુ કરું .

|-
| 02:22
| તે કરવા માટે , હું ''' Homoserine ''' અને '''Succinyl homoserine''' વચ્ચેના '''State Transition'''ને સિલેક્ટ કરી રહી છું .

|-
| 02:30
| હવે '''main menu''' બારમાંના “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 02:35
| અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:39
| અથવા તો , તમે '''Reaction line''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:47
| “'''Change color & shape”''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે .

|-
| 02:53
| થોડી જાડી '''Reaction line''' માટે ,'''Line Width '''ને 1.0 થી ઉચ્ચ સંખ્યામાં બદલો .

|-
| 03:02
| હું તેને બદલીને 3.0 કરીશ.

|-
| 03:06
| '''Reaction line'''નો રંગ બદલવા ,''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:12
| ''' Color panel''' માં એક '''color wheel''' દેખાય છે,જેમાં હેન્ડલ જેવું પોઇન્ટર છે.

|-
| 03:19
| પોઇન્ટરને ક્લિક કરી પકડી રાખો અને પછી તમને યોગ્ય ગમતો રંગ સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:25
| હું ભૂરા રંગનો એક શેડ પસંદ કરીશ.

|-
| 03:28
| ત્યાર બાદ , ''''color triangle''''ની અંદર ક્યાંય પણ ક્લિક કરો.

|-
| 03:34
| ત્યાર બાદ, આ નાનું સર્કલ ક્લિક કરો અને આ પોઇન્ટર તરફ ડ્રોપ કરો.

|-
| 03:40
| બધા જ ફેરફારો કાર્ય બાદ , '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:48
| ધ્યાનથી જુઓ આ '''Reaction line ''' હવે થોડી જાડી દેખાય છે અને તેનો રંગ ભૂરા શેડનો દેખાય છે.

|-
| 03:55
| ત્યાર બાદ આપણે શીખીશું કે '''Reaction line''' ઉપર '''Anchor points ''' કેવી રીતે ઉમેરવા.

|-
| 04:01
| અને એન્કર પોઇન્ટ શા માટે '''Reaction lines''' ના ફરતે ફરવા માટે ઉપયોગી છે.

|-
| 04:09
| તેમને વ્યવસ્થિત આકાર આપવા અને '''draw area''' ઉપર તેમને વ્યવસ્થિત સ્થિતિમાં મુકવા.

|-
| 04:16
| ચાલો '''CellDesigner interface''' ઉપર પાછા આવીએ .

|-
| 04:20
| કોઈ પણ '''Reaction line''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:23
| હું'''Homoserine''' અને '''Succinyl Homoserine''' વચ્ચેની તે જ '''State Transition reaction line''' સિલેક્ટ કરીશ.

|-
| 04:31
| કર્સર દ્વારા, આ લાઈન ઉપર, એ ચોક્કસ સ્થળ પસંદ કરો જ્યાં '''Anchor point''' મુકાવો જોઈએ.

|-
| 04:39
| ચોક્કસ પોઇન્ટનું સિલેક્શન કાર્ય પછી , રાઈટ - ક્લિક કરી અને '''Add Anchor Point''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:47
| તમે '''Reaction line''' ઉપર પાસાં કરેલા ચોક્કસ સ્થળે એક નવો '''Anchor point''' ઉમેરાયેલો જોઈ શકશો.

|-
| 04:55
| ચાલો હું તમને બતાઉં કે એક રિએક્શન લાઈનમાં ફેરફાર કરવા '''Anchor Points ''' કેવી રીતે મદદ કરે છે.

|-
| 05:03
| ચાલો હું એક નવી વીન્ડો ખોલું અને તેને નામ આપું '''Anchor''' અને ''' OK''' ઉપર ક્લિક કરું.

|-
| 05:11
| હવે '''GTP/GDP''' માટે આ આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:18
| અને '''draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્યાંય પણ ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:22
| ''' Reaction line''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ અને ''' Add Anchor point''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:29
| ''' Reaction line'''ને '''draw''' વિસ્તારમાં ક્યાં પણ ડ્રેગ કરો અને ડ્રોપ કરો.

|-
| 05:37
| ત્યાર બાદ આપણે જોઈશું કે આ કમ્પોનંટ્સને '''draw area''' ઉપર કેવી રીતે '''align''' કરવા.

|-
| 05:44
| ચાલો આપણે પાછા ''' Methionine biosynthesis process diagram''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ.

|-
| 05:50
| પ્રકાશિત થયેલ '''Reaction line''' ને અનચેક કરવા '''draw area''' ઉપર ક્યાંય પણ ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:56
| હવે , ''''Shift'''' કી ને પડકી રાખો અને '''draw area'''માં રહેલ વિવિધ '''Species''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:04
| '''Edit''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Alignment'''ને સિલેક્ટ કરો અને પછી '''Alignment type''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 06:15
| વૈકલ્પિક રીતે ટૂલબાર ઉપરના આઇકોન '''Alignment ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| ટૂલ બાર ઉપરના અન્ય બીજા '''Alignment''' વિકલ્પો તમારી જાતે શોધો.

|-
| 06:27
| ચાલો આપણે આ '''alignment''' ને હવે '''undo''' કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 06:31
| જ્યારે '''Reaction''' ઉપર કામ કરતા હોઈએ ત્યારે , '''process diagram''' ઉપર આપણે '''Reaction ids '''ને કેવી રીતે '''show/hide''' કરી શકીએ ?

|-
| 06:39
| ચાલો તે શીખીએ.

|-
| 06:41
| ''''View'''' ઉપર જઈએ , નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને ''''Show Reaction Id''''ને અનચેક કરીએ.

|-
| 06:48
| જુઓ હવે '''draw area''' ઉપરના રિએક્શનને સંબંધિત '''Reaction ids''' દેખાશે નહીં.

|-
| 06:55
| જો તમારે આ '''Reaction Id'''ને બતાવવા હોય તો આ પ્રમાણે કરો.

|-
| 07:01
| ''''View'''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''''Show Reaction Id'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:08
| '''draw area''' ઉપર '''reactions'''ને સંબંધિત '''Reaction ids''' દ્રશ્યમાન થઇ જશે.

|-
| 07:15
| '''draw area''' ઉપર આપણે બધા '''Components''' (Compartment, Species or Reaction) માં નોટ્સ(નોંધણીઓ) પણ ઉમેરી શકીએ છીએ.

|-
| 07:21
| ચાલો શીખીએ કે તે કેવી રીતે કરાય.

|-
| 07:24
| '''draw area''' ઉપરના એક '''Species''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 07:28
| હું '''CoA''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 07:32
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ‘'''Species Notes'''’ ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 07:35
| એક '''Pop Up''' મેનુ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 07:38
| એક ''''Species Notes'''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે . '''Species'''ને સંબંધિત લખાણ ટાઈપ કરો.

|-
| 07:46
| હું આ મુજબ ટાઈપ કરીશ.

|-
| 07:49
| ''''OK'''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 07:51
| ધ્યાનથી જુઓ કે '''Notes Area'''માં '''notes information ''' દેખાય છે.

|-
| 07:58
| વૈકલ્પિક રીતે એક '''Species'''માં નોટ્સ ઉમેરવા , '''draw area''' ઉપર તે '''Species''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| હું ''' Succinate''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:09
| પછી , '''Edit Notes''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો , જે '''CellDesigner ''' વીન્ડોવના નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં છે.

|-
| 08:18
| એક પૉપ અપ વીન્ડોવ ખુલશે.

|-
| 08:21
| '''Species'''-ને સંબંધિત લખાણ ટાઈપ કરો.

|-
| 08:25
| હું ટાઈપ કરીશ અને ''''OK'''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:30
| તે જ પ્રમાણે આપણે '''Protein'''ને પણ એડિટ કરી શકીએ.

|-
| 08:35
| તે કરવા '''draw area''' ઉપરના આ કમ્પોનન્ટ ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો.

|-
| 08:40
| હું '''Homoserine succinyl transferase''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:46
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Edit Protein'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:51
| '''Protein''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દેખાશે.

|-
| 08:55
| '''name box'''માં '''Protein '''નું નામ એન્ટર કરો.

|-
| 09:00
| હું '''name box'''માં ટાઈપ કરીશ '''O-succinyltransferase '''.

|-
| 09:06
| '''‘Update’''' ઉપર ક્લિક કરો અને ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 09:11
| આપણે '''Protein'''માં '''regions''' પણ ઉમેરી શકીએ.

|-
| 09:15
| '''draw area''' ઉપર રહેલ એક '''Protein''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
| 09:19
| હું '''O-succinyltransferase.''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીશ.

|-
| 09:24
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Edit Protein''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:29
| એક ડાયલોગ બોક્સ,'''Protein''' સ્ક્રીન ઉપર દેખાય છે.

|-
| 09:33
| ‘'''residues/regions'''’ ટેબ નીચે, ''''Add'''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:40
| ડાયલોગ બોક્સ-''' ModificationResidue/Bindingregion'''માં :

|-
| 09:46
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી '''‘Type’''' ને ‘'''Binding region''' તરીકે સિલેક્ટ કરીએ.

|-
| 09:52
| આવશ્યક વેલ્યુ પર કર્સર ખસેડીને સાઈઝ અને એન્ગલ બદલો.

|-
| 09:59
| તેના ડેમો તરીકે, હું '''Size '''ને 15 અને '''Angle''' ને 38 સિલેક્ટ કરીશ.

|-
| 10:09
| પછી ‘'''Close'''’ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:12
| '''Update''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:14
| અને આ બોક્સને બંધ કરીએ.

|-
| 10:17
| જો કે આપણને '''Methionine Biosynthesis '''માં '''region''' ઉમેરવાની જરૂર નથી એટલે હું આ ફેરફારોને '''undo''' કરું છું.

|-
| 10:25
| ત્યાર બાદ માહિતીઓને કેવી રીતે એડિટ કરાય તે શીખીએ .

|-
| 10:30
| '''draw area''' ઉપર રહેલા '''component ''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:33
| હું ''' Homoserine ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 10:37
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ‘'''Edit Information’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:41
| સ્ક્રીન ઉપર '''‘Edit Information’''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 10:46
| ડાયલોગ બોક્સમાં આ મુજબ કરો '''- ''' ‘'''state'''’ ટેબની નીચે '''Open''' ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:54
| ‘'''prefix'''’ ટેબ નીચેના '''mt. '''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:59
| '''‘label’ ''' ટેબ નીચેના '''dna.'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 11:04
| '''‘Ok’.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 11:07
| તમે '''draw area''' ઉપર દેખાઈ રહેલી માહિતી '''mt:dna''' જોઈ શકો છો.

|-
| 11:15
| હું '''Edit Information'''ને undo કરીશ કારણકે મને તેની '''Methionine Biosynthesis'''માં જરૂર નથી.

|-
| 11:23
| કેટલાક કેસીસમાં , '''process diagram''' અટપટો(જટિલ) હોય શકે છે.

|-
| 11:28
| આવા કેસીસમાં , '''Bird's eye view''' મદદરૂપ થાય છે કારણકે તેનાથી મોટા મોડેલની અંદર નેવિગેટ કરવું અનુકૂળ રહે છે.

|-
| 11:37
| આઇકોન '''Bird's eye view ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:41
| લાલ ચોરસને '''Bird’s Eye View'''ની અંદર લઇ જાઓ.

|-
| 11:46
| નોંધ લો કે '''draw area'''ઉપર દેખાતું દૃશ્ય તે મુજબ ખસે છે.

|-
| 11:52
| તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 11:56
| ચાલો સારાંશ જોઈએ. આ ટ્યૂટોરિઅલમાં,આપણે શીખ્યા કે કેવી રીતે : '''Reaction line'''ના color, shape અને width બદલી શકાય

|-
| 12:07
| '''Reaction line'''માં '''Anchor points''' ઉમેરતા , '''Components'''ને સંરેખિત કરતા, '''Reaction ids''' બતાડતાં / છુપાવતા.

|-
| 12:18
| આપણે આ પણ શીખ્યા કે કેવી રીતે - '''Components'''માં '''Notes'''(નોંધ) ઉમેરવી.

|-
| 12:23
| '''Protein'''ને એડિટ કરવું, '''information''' ને એડિટ કરવી.

|-
| 12:27
| ડાયગ્રામનું એકદમ બારીકાઇ('''Bird’s Eye View ''')થી નિરીક્ષણ કરવું.

|-
| 12:32
| અભ્યાસ માટે CellDesignerના ટૂલ્સની મદદથી '''Glycolysis Process Diagram''' બનાવો.

|-
| 12:41
| '''Reaction line'''ના જુદા જુદા આકારો(shapes) શોધો.

|-
| 12:47
| આ લિંક :'''www.spoken-tutorial.org''' ઉપરનો વિડીયો નિહાળો તે આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:52
| જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 12:57
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે.જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| 13:06
| વધુ માહિતી માટે અમને અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 13:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 13:29
| અનુવાદ કરનાર હું છું શિવાની ગડા. આભાર.

|}

CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Gujarati

2017-11-07T10:38:33Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિ..."

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ '''‘Customizing Diagram Layout’''' માં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું કે કેવી રીતે : '''Reaction line'''નો '''color, shape''' અને '''width''' બદલી શકાય,

|-
| 00:19
| '''Reaction line'''માં '''Anchor points''' ઉમેરવા , '''Components'''ને સંરેખિત કરવા, '''Reaction ids''' બતાવવા / છુપાવવા.

|-
| 00:30
| આપણે આ પણ શીખીશું કે કેવી રીતે : '''Components'''માં '''Notes'''(નોંધ) ઉમેરવી, '''Protein'''ને એડિટ કરવું, '''information''' ને એડિટ કરવી.

|-
|00:39
| અને ડાઇગ્રામનું '''bird’s eye view''' મેળવવું.

|-
| 00:44
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું '''Ubuntu Linux OS 14.04''' ,'''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7'''નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 01:01
| આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:12
| જો તમે ન જાણતા હોવ,તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' અમારી વેબસાઈટ ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 01:20
| તો ચાલુ શરૂઆત કરીએ.

|-
| 01:22
| અગાઉના ટ્યૂટોરિઅલ્સમાંના એક માટે અભ્યાસ હતો કે - '''Methionine Biosynthesis''' માટે એક '''process diagram ''' બનાવવો.

|-
| 01:32
| હું તે જ ડાયગ્રામને અહીં ઉદાહરણ તરીકે વાપરી રહી છું . અને તેને કેવી રીતે કસ્ટમાઇઝ(ફેરફાર કરવા) કરવું તે તમને સમજાવીશ.

|-
| 01:43
| ચોલો તો મને '''CellDesigner''' ઇન્ટરફેઝ ઉપર જતા રહેવા દો.

|-
| 01:47
| અહીં તમે જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Methionine Biosynthesis''' માટે નો '''process diagram ''' છે.

|-
| 01:53
| અહીં તમે આ ટ્યૂટોરિઅલને અટકાવી દો અને જે '''Methionine Biosynthesis process diagram ''' તમે બનાવ્યો છે તે ખોલો.

|-
| 02:01
| જો તમારી પાસે સેવ કરેલી ફાઈલ ન હોય તો તમને આપવામાં આવેલ '''code file'''ને ખોલી શકો છો.

|-
| 02:08
| તો ચાલો હું આ '''diagram'''માં ફેરફાર કરવાનું શરુ કરું.

|-
| 02:12
| ચાલો પાછા ''' Cell designer '''ઇન્ટરફેઝ ઉપર જઈએ.

|-
| 02:16
| હું '''Reaction line'''ના '''width અને color''' બદલવાથી શરુ કરું .

|-
| 02:22
| તે કરવા માટે , હું ''' Homoserine ''' અને '''Succinyl homoserine''' વચ્ચેના '''State Transition'''ને સિલેક્ટ કરી રહી છું .

|-
| 02:30
| હવે '''main menu''' બારમાંના “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 02:35
| અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:39
| અથવા તો , તમે '''Reaction line''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:47
|   “'''Change color & shape”''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે .

|-
| 02:53
| થોડી જાડી '''Reaction line''' માટે ,'''Line Width '''ને 1.0 થી ઉચ્ચ સંખ્યામાં બદલો .

|-
| 03:02
| હું તેને બદલીને 3.0 કરીશ.

|-
| 03:06
| '''Reaction line'''નો રંગ બદલવા ,''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:12
| ''' Color panel''' માં એક '''color wheel''' દેખાય છે,જેમાં હેન્ડલ જેવું પોઇન્ટર છે.

|-
| 03:19
| પોઇન્ટરને ક્લિક કરી પકડી રાખો અને પછી તમને યોગ્ય ગમતો રંગ સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:25
| હું ભૂરા રંગનો એક શેડ પસંદ કરીશ.

|-
| 03:28
| ત્યાર બાદ , ''''color triangle''''ની અંદર ક્યાંય પણ ક્લિક કરો.

|-
| 03:34
| ત્યાર બાદ, આ નાનું સર્કલ ક્લિક કરો અને આ પોઇન્ટર તરફ ડ્રોપ કરો.

|-
| 03:40
| બધા જ ફેરફારો કાર્ય બાદ , '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:48
| ધ્યાનથી જુઓ આ '''Reaction line ''' હવે થોડી જાડી દેખાય છે અને તેનો રંગ ભૂરા શેડનો દેખાય છે.

|-
| 03:55
| ત્યાર બાદ આપણે શીખીશું કે '''Reaction line''' ઉપર '''Anchor points ''' કેવી રીતે ઉમેરવા.

|-
| 04:01
| અને એન્કર પોઇન્ટ શા માટે '''Reaction lines''' ના ફરતે ફરવા માટે ઉપયોગી છે.
|-
| 04:09
| તેમને વ્યવસ્થિત આકાર આપવા અને '''draw area''' ઉપર તેમને વ્યવસ્થિત સ્થિતિમાં મુકવા.

|-
| 04:16
| ચાલો '''CellDesigner interface''' ઉપર પાછા આવીએ .

|-
| 04:20
| કોઈ પણ '''Reaction line''' સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:23
| હું'''Homoserine''' અને '''Succinyl Homoserine''' વચ્ચેની તે જ '''State Transition reaction line''' સિલેક્ટ કરીશ.

|-
| 04:31
| કર્સર દ્વારા, આ લાઈન ઉપર, એ ચોક્કસ સ્થળ પસંદ કરો જ્યાં '''Anchor point''' મુકાવો જોઈએ.

|-
|   04:39
| ચોક્કસ પોઇન્ટનું સિલેક્શન કાર્ય પછી , રાઈટ - ક્લિક કરી અને '''Add Anchor Point''' સિલેક્ટ કરો.

|-
|   04:47
|   તમે '''Reaction line''' ઉપર પાસાં કરેલા ચોક્કસ સ્થળે એક નવો '''Anchor point''' ઉમેરાયેલો જોઈ શકશો.

|-
| 04:55
| ચાલો હું તમને બતાઉં કે એક રિએક્શન લાઈનમાં ફેરફાર કરવા '''Anchor Points ''' કેવી રીતે મદદ કરે છે.

|-
|   05:03
| ચાલો હું એક નવી વીન્ડો ખોલું અને તેને નામ આપું '''Anchor''' અને ''' OK''' ઉપર ક્લિક કરું.

|-
|   05:11
| હવે '''GTP/GDP''' માટે આ આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:18
| અને '''draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્યાંય પણ ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:22
| ''' Reaction line''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ અને ''' Add Anchor point''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:29
| ''' Reaction line'''ને '''draw''' વિસ્તારમાં ક્યાં પણ ડ્રેગ કરો અને ડ્રોપ કરો.

|-
| 05:37
| ત્યાર બાદ આપણે જોઈશું કે આ કમ્પોનંટ્સને '''draw area''' ઉપર કેવી રીતે '''align''' કરવા.

|-
| 05:44
| ચાલો આપણે પાછા ''' Methionine biosynthesis process diagram''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ.

|-
| 05:50
| પ્રકાશિત થયેલ '''Reaction line''' ને અનચેક કરવા '''draw area''' ઉપર ક્યાંય પણ ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:56
| હવે , ''''Shift'''' કી ને પડકી રાખો અને '''draw area'''માં રહેલ વિવિધ '''Species''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:04
| '''Edit''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Alignment'''ને સિલેક્ટ કરો અને પછી '''Alignment type''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 06:15
| વૈકલ્પિક રીતે ટૂલબાર ઉપરના આઇકોન '''Alignment ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| ટૂલ બાર ઉપરના અન્ય બીજા '''Alignment''' વિકલ્પો તમારી જાતે શોધો.

|-
| 06:27
| ચાલો આપણે આ '''alignment''' ને હવે '''undo''' કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 06:31
| જ્યારે '''Reaction''' ઉપર કામ કરતા હોઈએ ત્યારે , '''process diagram''' ઉપર આપણે '''Reaction ids '''ને કેવી રીતે '''show/hide''' કરી શકીએ ?

|-
| 06:39
| ચાલો તે શીખીએ.

|-
| 06:41
| ''''View'''' ઉપર જઈએ , નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને ''''Show Reaction Id''''ને અનચેક કરીએ.

|-
| 06:48
| જુઓ હવે '''draw area''' ઉપરના રિએક્શનને સંબંધિત '''Reaction ids''' દેખાશે નહીં.

|-
| 06:55
| જો તમારે આ '''Reaction Id'''ને બતાવવા હોય તો આ પ્રમાણે કરો.

|-
| 07:01
| ''''View'''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''''Show Reaction Id'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   07:08
| '''draw area''' ઉપર '''reactions'''ને સંબંધિત '''Reaction ids''' દ્રશ્યમાન થઇ જશે.

|-
| 07:15
| '''draw area''' ઉપર આપણે બધા '''Components''' (Compartment, Species or Reaction) માં નોટ્સ(નોંધણીઓ) પણ ઉમેરી શકીએ છીએ.

|-
|   07:21
| ચાલો શીખીએ કે તે કેવી રીતે કરાય.

|-
| 07:24
| '''draw area''' ઉપરના એક '''Species''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
|   07:28
| હું '''CoA''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 07:32
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ‘'''Species Notes'''’ ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 07:35
| એક '''Pop Up''' મેનુ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   07:38
| એક ''''Species Notes'''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે . '''Species'''ને સંબંધિત લખાણ ટાઈપ કરો.

|-
|   07:46
| હું આ મુજબ ટાઈપ કરીશ.

|-
| 07:49
| ''''OK'''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 07:51
| ધ્યાનથી જુઓ કે '''Notes Area'''માં '''notes information ''' દેખાય છે.

|-
| 07:58
| વૈકલ્પિક રીતે એક '''Species'''માં નોટ્સ ઉમેરવા , '''draw area''' ઉપર તે '''Species''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:06
| હું ''' Succinate''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:09
| પછી , '''Edit Notes''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો , જે '''CellDesigner ''' વીન્ડોવના નીચે જમણી બાજુના ખૂણામાં છે.

|-
| 08:18
| એક પૉપ અપ વીન્ડોવ ખુલશે.

|-
| 08:21
| '''Species'''-ને સંબંધિત લખાણ ટાઈપ કરો.

|-
| 08:25
| હું ટાઈપ કરીશ અને ''''OK'''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:30
| તે જ પ્રમાણે આપણે '''Protein'''ને પણ એડિટ કરી શકીએ.

|-
| 08:35
| તે કરવા '''draw area''' ઉપરના આ કમ્પોનન્ટ ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો.

|-
| 08:40
| હું '''Homoserine succinyl transferase''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:46
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Edit Protein'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:51
| '''Protein''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દેખાશે.

|-
| 08:55
| '''name box'''માં '''Protein '''નું નામ એન્ટર કરો.

|-
| 09:00
| હું '''name box'''માં ટાઈપ કરીશ '''O-succinyltransferase '''.

|-
| 09:06
| '''‘Update’''' ઉપર ક્લિક કરો અને ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.

|-
| 09:11
| આપણે '''Protein'''માં '''regions''' પણ ઉમેરી શકીએ.

|-
| 09:15
| '''draw area''' ઉપર રહેલ એક '''Protein''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
| 09:19
| હું '''O-succinyltransferase.''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીશ.

|-
| 09:24
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Edit Protein''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:29
| એક ડાયલોગ બોક્સ,'''Protein''' સ્ક્રીન ઉપર દેખાય છે.

|-
| 09:33
| ‘'''residues/regions'''’ ટેબ નીચે, ''''Add'''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:40
| ડાયલોગ બોક્સ-''' ModificationResidue/Bindingregion'''માં :

|-
| 09:46
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી '''‘Type’''' ને ‘'''Binding region''' તરીકે સિલેક્ટ કરીએ.

|-
| 09:52
| આવશ્યક વેલ્યુ પર કર્સર ખસેડીને સાઈઝ અને એન્ગલ બદલો.

|-
| 09:59
| તેના ડેમો તરીકે, હું '''Size '''ને 15 અને '''Angle''' ને 38 સિલેક્ટ કરીશ.

|-
| 10:09
| પછી ‘'''Close'''’ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:12
| '''Update''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:14
| અને આ બોક્સને બંધ કરીએ.

|-
| 10:17
| જો કે આપણને '''Methionine Biosynthesis '''માં '''region''' ઉમેરવાની જરૂર નથી એટલે હું આ ફેરફારોને '''undo''' કરું છું.

|-
| 10:25
| ત્યાર બાદ માહિતીઓને કેવી રીતે એડિટ કરાય તે શીખીએ .

|-
| 10:30
| '''draw area''' ઉપર રહેલા '''component ''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:33
| હું ''' Homoserine ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 10:37
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ‘'''Edit Information’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:41
| સ્ક્રીન ઉપર '''‘Edit Information’''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 10:46
| ડાયલોગ બોક્સમાં આ મુજબ કરો '''- ''' ‘'''state'''’ ટેબની નીચે '''Open''' ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:54
| ‘'''prefix'''’ ટેબ નીચેના '''mt. '''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:59
| '''‘label’ ''' ટેબ નીચેના '''dna.'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 11:04
| '''‘Ok’.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 11:07
| તમે '''draw area''' ઉપર દેખાઈ રહેલી માહિતી '''mt:dna''' જોઈ શકો છો.

|-
| 11:15
| હું '''Edit Information'''ને undo કરીશ કારણકે મને તેની '''Methionine Biosynthesis'''માં જરૂર નથી.

|-
| 11:23
| કેટલાક કેસીસમાં , '''process diagram''' અટપટો(જટિલ) હોય શકે છે.

|-
| 11:28
| આવા કેસીસમાં , '''Bird's eye view''' મદદરૂપ થાય છે કારણકે તેનાથી મોટા મોડેલની અંદર નેવિગેટ કરવું અનુકૂળ રહે છે.

|-
| 11:37
| આઇકોન '''Bird's eye view ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:41
| લાલ ચોરસને '''Bird’s Eye View'''ની અંદર લઇ જાઓ.

|-
| 11:46
| નોંધ લો કે '''draw area'''ઉપર દેખાતું દૃશ્ય તે મુજબ ખસે છે.

|-
| 11:52
| તો અહીં આપણું આ ટ્યૂટોરિઅલ સમાપ્ત થાય છે.

|-
| 11:56
| ચાલો સારાંશ જોઈએ. આ ટ્યૂટોરિઅલમાં,આપણે શીખ્યા કે કેવી રીતે : '''Reaction line'''ના color, shape અને width બદલી શકાય

|-
| 12:07
| '''Reaction line'''માં '''Anchor points''' ઉમેરતા , '''Components'''ને સંરેખિત કરતા, '''Reaction ids''' બતાડતાં / છુપાવતા.

|-
| 12:18
| આપણે આ પણ શીખ્યા કે કેવી રીતે - '''Components'''માં '''Notes'''(નોંધ) ઉમેરવી.

|-
| 12:23
| '''Protein'''ને એડિટ કરવું, '''information''' ને એડિટ કરવી.

|-
| 12:27
| ડાયગ્રામનું એકદમ બારીકાઇ('''Bird’s Eye View ''')થી નિરીક્ષણ કરવું.

|-
| 12:32
| અભ્યાસ માટે CellDesignerના ટૂલ્સની મદદથી '''Glycolysis Process Diagram''' બનાવો.

|-
| 12:41
| '''Reaction line'''ના જુદા જુદા આકારો(shapes) શોધો.

|-
| 12:47
| આ લિંક :'''www.spoken-tutorial.org''' ઉપરનો વિડીયો નિહાળો તે આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:52
| જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 12:57
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે.જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| 13:06
| વધુ માહિતી માટે અમને અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 13:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 13:29
| અનુવાદ કરનાર હું છું શિવાની ગડા. આભાર.

|}

CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Gujarati

2017-11-03T13:31:37Z

Shivanigada:

'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’

'''Author''' : બેલા ટોની

'''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis,
Generic Protein, Aminotransferase

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ ''''Build and Modify Process Diagram''''માં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : '''Macros'''નો ઉપયોગ, '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Components'''ને move કરવું, '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' જોડવી.

|-
| 00:18
| '''reaction line'''ને સંરેખિત(Align) અને વિસ્તૃત(extend) કરવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ને ઉમેરવા.

|-
| 00:23
| આ ટ્યૂટોરિઅલ માટે , હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
| આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:43
| જો તમે ન જાણતા હોવ,તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' અમારી વેબસાઈટ ઉપર ઉપલબ્ધ છે. ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’

|-
| 00:51
| ચાલો તો શરુ કરીએ.

|-
| 00:53
| તમે અહીં જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Alanine Biosynthesis '''માટેનું એક કન્વેનશનલ (પ્રણાલીગત) ડાયાગ્રામ(આકૃતિ) છે.

|-
| 00:58
| હવે આપણે '''CellDesigner'''ની મદદથી આ પ્રોસેસ ડાયાગ્રામને બનાવીશું.

|-
| 01:02
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:09
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:20
| '''CellDesigner ''' વીન્ડો તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:24
| હવે નવી ફાઈલ ''' CTRL+N''' દબાવી ખોલીએ અને તેને '''Build and Modify Process Diagram'''નામ આપીએ.

|-
| 01:34
| '''width''' અને '''length''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખીશું અને '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 01:39
| હવે આપણે જોઈએ કે ‘'''Macros’''' શું છે!

|-
| 01:42
| '''Macros''' એ વારંવાર વપરાતા ''' Components sets''' છે જે ડાયાગ્રામને સરળતાપૂર્વક બનાવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 01:47
| ટૂલબાર ઉપર, '''Catalysis ''' માટે '''Macros''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 01:57
| હવે આપણી પાસે '''draw''' વિસ્તારમાં '''Macros-Catalysis reaction ''' આવી ગયું છે.

|-
| 02:02
| ચાલો હવે બધા કમ્પોનંટ્સને '''Draw''' વિસ્તારની બીજી બાજુએ ખસેડતા શીખીએ.

|-
| 02:08
| તે માટે ''''Edit'''' menu ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''' 'Select All' ''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:16
| વિલ્કપ વૈકલ્પિક રીતે ''Ctrl + A ''' કીઝ પણ ક્લિક કરી શકો છો.

|-
| 02:21
| બધા '''Components''' હવે પ્રકાશિત છે.

|-
| 02:24
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''Components''' ઉપર કશે પણ ક્લિક કરીએ અને યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરીએ .

|-
| 02:30
| ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 02:32
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર કશે પણ ક્લિક કરી પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરીએ.

|-
| 02:37
| પાછા Draw વિસ્તારમાં ,''' Generic Protein S1''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:43
| પછી ''''Change Identity'''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:47
| ''''class'''' બોક્સમાં , '''Protein''' ને ''' Simple Molecule'''માં બદલીએ.

|-
| 02:53
| ''' Name '''માં ટાઇપ કરો : '''2-keto-isovalerate'''.

|-
| 02:58
| ત્યાર બાદ '''‘Apply’''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:02
| ડાયલોગ બોક્સમાં ‘'''The Same Species Exists'''’ માટે '''‘No’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:10
| જો તમે આ બદલાવને સ્પીશિશના બધા જ કમ્પોનંટ્સ ઉપર જોવા માંગતા હોવ તો ‘'''Yes'''’ ઉપર ક્લિક કરો. અહીં,હું ''' ‘No’''' ક્લિક કરીશ.

|-
| 03:20
| નોંધ લો કે ''' Generic Protein S1, ''' એ '''simple molecule ''' બન્યું છે જેનું નામ છે '''2-keto-isovalerate''' છે.

|-
| 03:30
| નામનો સમાવેશ કરવા હું મોલેક્યુલને ડ્રેગ કરીશ.

|-
| 03:34
| ''' end-point'''ના કેન્દ્રમાં રાઈટ-ક્લિક કરો , '''Generic protein'''-'''S1 ''' જે એક '''product''' છે.

|-
| 03:42
| '''identity''' ને ''' Simple Molecule '''માં બદલો અને '''name ''' આપો '''Valine.'''

|-
| 03:50
| '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:52
| draw વિસ્તારમાં તમારીએ પાસે ''' Valine''' આવી ગયું છે.

|-
| 03:36
| ત્યાર બાદ, catalyst''' S2.'''ને ફરીનામ આપો, તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને '''Edit Protein'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:06
| '''‘name’''' ક્ષેત્રમાં , ટાઈપ કરો '''Aminotransferase.'''

|-
| 04:11
| '''Update''' ઉપર ક્લિક કરીએ અને ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરીએ.

|-
| 04:16
| નામનો સમાવેશ કરવા મોલેક્યુલના ખૂણાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 04:21
| ત્યાર બાદ, ચાલો હવે આ જોડાયેલા રિએક્શનનું સ્થાન બદલીએ .

|-
| 04:25
| ''''end-point'''' '''species''' ના કેન્દ્ર ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Valine ''' અને પસંદ કરેલ યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરી ત્યાં તેને ડ્રોપ કરો.

|-
| 04:33
| '''Aminotransferase''' સાથે પણ તે પુનરાવર્તિત કરો.

|-
| 04:37
| નોંધ લો કે ‘'''end-point’ Species ''' જ્યાં પણ જાય છે તેની સાથે જોડાયેલ રિએક્શન તેને '''અનુસરે''' છે.

|-
| 04:44
| હવે આપણે શીખીશું કે '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' કેવી રીતે જોડવી.

|-
| 04:49
| '''Reaction line ''' એ '''Species'''ની ફરતે કોઈ પણ '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' ને જોડાઈ શકે છે.

|-
| 04:56
| હું તમને બતાઉં તે કેવી રીતે કરવું.

|-
| 04:59
| ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ ખોલીએ.

|-
| 05:04
| આ ક્ષેત્રને નામ આપીએ : ''' Connection points '''

|-
| 05:08
| '''width''' and '''height''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખો અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 05:14
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , બે '''generic proteins ''' ડ્રો કરો અને તેમને નામ આપો '''Protein 1 ''' અને '''Protein 2.'''

|-
| 05:23
| '''main menu'''માં ,'''State Transition''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:28
| પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , ‘'''start-point'''' '''Species,Protein 1''' ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 05:36
| હવે નોંધ લો કે બધા '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' તમને ભૂખરા રંગમાં પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 05:42
| નોંધ લો કે આ કનેક્શન પોઈન્ટ્સમાંથી કોઈ પણ એક પોઇન્ટ ઉપર જ્યારે કર્સર આવે છે, ત્યારે તે પોઇન્ટ ભૂરા રંગમાં ફેરવાઈ જશે.

|-
| 05:49
| ચાલો હવે કોઈ એક કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:53
| આ જ પ્રમાણે , ‘'''end-point'''' '''Species ''' જે '''Protein 2''' છે તેના ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 06:00
| ફરી,જેમ અગાઉ સમજાવ્યું તે મુજબ, તમને યોગ્ય લાગતા કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| તમારા પસંદ કરેલ કનેક્શન પોઈન્ટ્સ વચ્ચે એક '''State Transition ''' રિએક્શન લાઈન સર્જાય છે.

|-
| 06:12
| ત્યાર બાદ, આપણે ચાલો '''Reaction line'''ને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 06:16
| '''Protein 1 '''and '''Protein 2''' વચ્ચે રહેલ '''State transition reaction line ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:21
| નોંધ લો '''reaction line''' ઉપરના બે '''process nodes''' પ્રકાશિત થાય છે.

|-
| 06:27
| જો આપણે આ બંને '''process nodes'''માંથી એક ઉપર માઉસ ફેરવીએ છીએ, તો એક ‘'''plus’''' ચિહન દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:34
| કોઈ એક '''process nodes''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:37
| હવે પોઇન્ટર ને પસંદિત '''connection point''' ઉપર ડ્રેગ કરી સ્થાપિત કરો.

|-
| 06:43
| પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરવા ડ્રો વિસ્તારમાં ગમે ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 06:49
| '''reaction line'''ને વિસ્તારવા કે લંબાવવા , ક્લિક કરો.

|-
| 06:54
| હવે '''start-point''' અથવા '''end-point Species''' ઉપર રહેલા બંને માંથી એક '''process nodes ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:01
| હવે '''reaction line '''ને, પસંદ કરેલા યોગ્ય કનેક્શન પોઇન્ટ સુધી લંબાવવા માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| અહીંથી આપણે , આપણે '''Process diagram''' સાથે આગળ વધીશું.

|-
| 07:12
| ચાલો આપણે '''Build and Modify Process Diagram''' વીન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 07:16
| ચાલો આ અહીં દેખાતા(વર્તમાન) રિએક્શન ઉપર એક '''Reactant '''અને એક '''Product''' ઉમેરીએ .

|-
| 07:21
| ટૂલ બારમાંથી બે '''simple molecules''' ક્લિક કરી તેને '''draw''' વિસ્તાર ઉપર સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:27
| તેઓને નામ આપીએ : '''Glutamate''' અને ''' 2-Oxoglutarate'''.

|-
| 07:36
| હવે તેને ડ્રેગ કરીને '''Simple molecules:''' '''2-keto-isovalerate ''' અને '''Valine'''ને અડીને સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:44
| અગાઉ સમજાવ્યું એ મુજબ , draw વિસ્તાર ઉપર આ કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 07:49
| અગાઉ જે સમજાવ્યુ છે તે મુજબ , મેં કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત કરી દીધા છે.

|-
| 07:55
| ટૂલબાર ઉપરથી, આઇકોન ''' ‘Add Product’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:00
| હવે માઉસને ''' 2-keto-isovalerate '''અને '''Valine''' વચ્ચે રહેલા ''' State Transition ''' રિએક્શન ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:07
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:10
| ત્યાર બાદ માઉસને '''2-Oxoglutarate''' ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:17
| 16 પ્રકાશિત થયેલ '''process nodes'''માંથી કોઈ પણ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:21
| નોંધ લો કે'''State Transition ''' અને '''2-Oxoglutarate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:29
| હવે તે જ પ્રમાણે '''‘Add Reactant’''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:34
| '''Glutamate''' ઉપર માઉસ ફેરવો અને 16 પ્રકાશિત થયેલ ''' process nodes'''માંથી કોઈ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:40
| ત્યાર બાદ , ''' State Transition '''રિએક્શન ઉપર માઉસ ફેરવો અને '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ધ્યાનથી જુઓ ,'''State Transition ''' અને ''' Glutamate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:55
| હવે એક '''Reactant''' અને એક '''Product'''ની સાથેનું એક સંપૂર્ણ '''Catalysis '''રિએક્શન આપણી પાસે આવી ગયું છે .

|-
| 09:01
| હું આ '''reaction'''ને સંરેખિત કરીશ જેથી પ્રોસેસ ડાયાગ્રામમાં બીજા '''components'''નો સમાવેશ થઇ શકે.

|-
| 09:09
| ટૂલબાર માંથી આ આઇકોન્સનો ઉપયોગ કરો : '''State Transition''' '''Simple Molecule''' '''Generic Protein''' અને '''Catalysis'''

|-
| 09:18
| આ એક સંપૂર્ણ '''Process Diagram ''' છે.

|-
| 09:22
| તેને બરાબર જોવા માટે , '''main menu''' બારમાં '''View ''' ઉપર જાઓ અને ''' Zoom Fit''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:32
| હવે તમે આ સંપૂર્ણ '''Process Diagram''' જુઓ.

|-
| 09:36
| ચાલો હવે સારાંશ જોઈએ. આ ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આ શીખ્યા : '''Macros'''નો ઉપયોગ,

|-
| 09:42
| '''draw''' વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સ ને Move કરવું, speciesની ફરતે કેનેક્શન લાઇનને જોડવી.

|-
| 09:48
| રિએક્શન લાઈનને સંરેખિત કરવી અને વિસ્તારવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ઉમેરવા.

|-
| 09:54
| અભ્યાસ માટે : '''CellDesigner'''ના ટૂલ્સનો ઉપયોગ કરી '''Methionine Biosynthesis''' માટે નો પ્રોસેસ ડાયાગ્રામ બનાવો # '''GTP/GD''' માટે '''Macros''' શોધો # ’Curve’ રિએક્શન લાઈન કેવી રીતે બનાવાય તે શોધો.

|-
| 10:11
| આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના વિષે જાણવા

|-
| 10:14
| આ લિંક :'''www.spoken-tutorial.org''' ઉપરનો વિડીયો નિહાળો તે આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 10:19
| જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 09:24
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે.

|-
| 09:29
| જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| 10:34
| વધુ માહિતી માટે અમને અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 10:40
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટ એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:54
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Gujarati

2017-11-03T13:31:06Z

Shivanigada: Created page with "'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ '''Author''' : બેલા ટોની '''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Bio..."

'''Title of the Script''' : ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’

'''Author''' : બેલા ટોની

'''Keywords''' : Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis,
Generic Protein, Aminotransferase

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો.''' CellDesigner’'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ ''''Build and Modify Process Diagram''''માં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : '''Macros'''નો ઉપયોગ, '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Components'''ને move કરવું, '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' જોડવી.

|-
| 00:18
| '''reaction line'''ને સંરેખિત(Align) અને વિસ્તૃત(extend) કરવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ને ઉમેરવા.

|-
| 00:23
| આ ટ્યૂટોરિઅલ માટે , હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
| આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:43
| જો તમે ન જાણતા હોવ,તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' અમારી વેબસાઈટ ઉપર ઉપલબ્ધ છે. ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’

|-
| 00:51
| ચાલો તો શરુ કરીએ.

|-
| 00:53
| તમે અહીં જે જોઈ રહ્યા છો તે '''Alanine Biosynthesis ''' માટેનું એક કન્વેનશનલ (પ્રણાલીગત) ડાયાગ્રામ(આકૃતિ) છે.

|-
| 00:58
| હવે આપણે '''CellDesigner'''ની મદદથી આ પ્રોસેસ ડાયાગ્રામને બનાવીશું.

|-
| 01:02
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:09
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:20
| '''CellDesigner ''' વીન્ડો તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:24
| હવે નવી ફાઈલ ''' CTRL+N''' દબાવી ખોલીએ અને તેને '''Build and Modify Process Diagram'''નામ આપીએ.

|-
| 01:34
| '''width''' અને '''length''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખીશું અને '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 01:39
| હવે આપણે જોઈએ કે ‘'''Macros’''' શું છે!

|-
| 01:42
| '''Macros''' એ વારંવાર વપરાતા ''' Components sets''' છે જે ડાયાગ્રામને સરળતાપૂર્વક બનાવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 01:47
| ટૂલબાર ઉપર, '''Catalysis ''' માટે '''Macros''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 01:57
| હવે આપણી પાસે '''draw''' વિસ્તારમાં '''Macros-Catalysis reaction ''' આવી ગયું છે.

|-
| 02:02
| ચાલો હવે બધા કમ્પોનંટ્સને '''Draw''' વિસ્તારની બીજી બાજુએ ખસેડતા શીખીએ.

|-
| 02:08
| તે માટે ''''Edit'''' menu ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''' 'Select All' ''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:16
| વિલ્કપ વૈકલ્પિક રીતે ''Ctrl + A ''' કીઝ પણ ક્લિક કરી શકો છો.

|-
| 02:21
| બધા '''Components''' હવે પ્રકાશિત છે.

|-
| 02:24
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''Components''' ઉપર કશે પણ ક્લિક કરીએ અને યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરીએ .

|-
| 02:30
| ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 02:32
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર કશે પણ ક્લિક કરી પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરીએ.

|-
| 02:37
| પાછા Draw વિસ્તારમાં ,''' Generic Protein S1''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:43
| પછી ''''Change Identity'''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:47
| ''''class'''' બોક્સમાં , '''Protein''' ને ''' Simple Molecule'''માં બદલીએ.

|-
| 02:53
| ''' Name '''માં ટાઇપ કરો : '''2-keto-isovalerate'''.

|-
| 02:58
| ત્યાર બાદ '''‘Apply’''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:02
| ડાયલોગ બોક્સમાં ‘'''The Same Species Exists'''’ માટે '''‘No’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:10
| જો તમે આ બદલાવને સ્પીશિશના બધા જ કમ્પોનંટ્સ ઉપર જોવા માંગતા હોવ તો ‘'''Yes'''’ ઉપર ક્લિક કરો. અહીં,હું ''' ‘No’''' ક્લિક કરીશ.

|-
| 03:20
| નોંધ લો કે ''' Generic Protein S1, ''' એ '''simple molecule ''' બન્યું છે જેનું નામ છે '''2-keto-isovalerate''' છે.

|-
| 03:30
| નામનો સમાવેશ કરવા હું મોલેક્યુલને ડ્રેગ કરીશ.

|-
| 03:34
| ''' end-point'''ના કેન્દ્રમાં રાઈટ-ક્લિક કરો , '''Generic protein'''-'''S1 ''' જે એક '''product''' છે.

|-
| 03:42
| '''identity''' ને ''' Simple Molecule '''માં બદલો અને '''name ''' આપો '''Valine.'''

|-
| 03:50
| '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:52
| draw વિસ્તારમાં તમારીએ પાસે ''' Valine''' આવી ગયું છે.

|-
| 03:36
| ત્યાર બાદ, catalyst''' S2.'''ને ફરીનામ આપો, તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને '''Edit Protein'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:06
| '''‘name’''' ક્ષેત્રમાં , ટાઈપ કરો '''Aminotransferase.'''

|-
| 04:11
| '''Update''' ઉપર ક્લિક કરીએ અને ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરીએ.

|-
| 04:16
| નામનો સમાવેશ કરવા મોલેક્યુલના ખૂણાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 04:21
| ત્યાર બાદ, ચાલો હવે આ જોડાયેલા રિએક્શનનું સ્થાન બદલીએ .

|-
| 04:25
| ''''end-point'''' '''species''' ના કેન્દ્ર ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Valine ''' અને પસંદ કરેલ યોગ્ય સ્થાન ઉપર ડ્રેગ કરી ત્યાં તેને ડ્રોપ કરો.

|-
| 04:33
| '''Aminotransferase''' સાથે પણ તે પુનરાવર્તિત કરો.

|-
| 04:37
| નોંધ લો કે ‘'''end-point’ Species ''' જ્યાં પણ જાય છે તેની સાથે જોડાયેલ રિએક્શન તેને '''અનુસરે''' છે.

|-
| 04:44
| હવે આપણે શીખીશું કે '''species'''ની ફરતે '''reaction line''' કેવી રીતે જોડવી.

|-
| 04:49
| '''Reaction line ''' એ '''Species'''ની ફરતે કોઈ પણ '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' ને જોડાઈ શકે છે.

|-
| 04:56
| હું તમને બતાઉં તે કેવી રીતે કરવું.

|-
| 04:59
| ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ ખોલીએ.

|-
| 05:04
| આ ક્ષેત્રને નામ આપીએ : ''' Connection points '''

|-
| 05:08
| '''width''' and '''height''' જે ડિફોલ્ટ છે તે જ રાખો અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો .

|-
| 05:14
| '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , બે '''generic proteins ''' ડ્રો કરો અને તેમને નામ આપો '''Protein 1 ''' અને '''Protein 2.'''

|-
| 05:23
| '''main menu'''માં ,'''State Transition''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:28
| પછી '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર , ‘'''start-point'''' '''Species,Protein 1''' ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 05:36
| હવે નોંધ લો કે બધા '''16 કનેક્શન પોઈન્ટ્સ''' તમને ભૂખરા રંગમાં પ્રકાશિત થતા દેખાય છે.

|-
| 05:42
| નોંધ લો કે આ કનેક્શન પોઈન્ટ્સમાંથી કોઈ પણ એક પોઇન્ટ ઉપર જ્યારે કર્સર આવે છે, ત્યારે તે પોઇન્ટ ભૂરા રંગમાં ફેરવાઈ જશે.

|-
| 05:49
| ચાલો હવે કોઈ એક કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:53
| આ જ પ્રમાણે , ‘'''end-point'''' '''Species ''' જે '''Protein 2''' છે તેના ઉપર માઉસ ફેરવો.

|-
| 06:00
| ફરી,જેમ અગાઉ સમજાવ્યું તે મુજબ, તમને યોગ્ય લાગતા કનેક્શન પોઇન્ટ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| તમારા પસંદ કરેલ કનેક્શન પોઈન્ટ્સ વચ્ચે એક '''State Transition ''' રિએક્શન લાઈન સર્જાય છે.

|-
| 06:12
| ત્યાર બાદ, આપણે ચાલો '''Reaction line'''ને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 06:16
| '''Protein 1 '''and '''Protein 2''' વચ્ચે રહેલ '''State transition reaction line ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:21
| નોંધ લો '''reaction line''' ઉપરના બે '''process nodes''' પ્રકાશિત થાય છે.

|-
| 06:27
| જો આપણે આ બંને '''process nodes'''માંથી એક ઉપર માઉસ ફેરવીએ છીએ, તો એક ‘'''plus’''' ચિહન દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 06:34
| કોઈ એક '''process nodes''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 06:37
| હવે પોઇન્ટર ને પસંદિત '''connection point''' ઉપર ડ્રેગ કરી સ્થાપિત કરો.

|-
| 06:43
| પ્રકાશિત કમ્પોનંટ્સને અનચેક કરવા ડ્રો વિસ્તારમાં ગમે ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 06:49
| '''reaction line'''ને વિસ્તારવા કે લંબાવવા , ક્લિક કરો.

|-
| 06:54
| હવે '''start-point''' અથવા '''end-point Species''' ઉપર રહેલા બંને માંથી એક '''process nodes ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:01
| હવે '''reaction line '''ને, પસંદ કરેલા યોગ્ય કનેક્શન પોઇન્ટ સુધી લંબાવવા માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| અહીંથી આપણે , આપણે '''Process diagram''' સાથે આગળ વધીશું.

|-
| 07:12
| ચાલો આપણે '''Build and Modify Process Diagram''' વીન્ડો ઉપર પાછા જઈએ.

|-
| 07:16
| ચાલો આ અહીં દેખાતા(વર્તમાન) રિએક્શન ઉપર એક '''Reactant '''અને એક '''Product''' ઉમેરીએ .

|-
| 07:21
| ટૂલ બારમાંથી બે '''simple molecules''' ક્લિક કરી તેને '''draw''' વિસ્તાર ઉપર સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:27
| તેઓને નામ આપીએ : '''Glutamate''' અને ''' 2-Oxoglutarate'''.

|-
| 07:36
| હવે તેને ડ્રેગ કરીને '''Simple molecules:''' '''2-keto-isovalerate ''' અને '''Valine'''ને અડીને સ્થાપિત કરીએ.

|-
| 07:44
| અગાઉ સમજાવ્યું એ મુજબ , draw વિસ્તાર ઉપર આ કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત(align) કરીએ.

|-
| 07:49
| અગાઉ જે સમજાવ્યુ છે તે મુજબ , મેં કમ્પોનંટ્સને સંરેખિત કરી દીધા છે.

|-
| 07:55
| ટૂલબાર ઉપરથી, આઇકોન ''' ‘Add Product’''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:00
| હવે માઉસને ''' 2-keto-isovalerate '''અને '''Valine''' વચ્ચે રહેલા ''' State Transition ''' રિએક્શન ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:07
| હવે પ્રકાશિત થયેલા '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:10
| ત્યાર બાદ માઉસને '''2-Oxoglutarate''' ઉપર ફેરવો.

|-
| 08:17
| 16 પ્રકાશિત થયેલ '''process nodes'''માંથી કોઈ પણ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:21
| નોંધ લો કે'''State Transition ''' અને '''2-Oxoglutarate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:29
| હવે તે જ પ્રમાણે '''‘Add Reactant’''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:34
| '''Glutamate''' ઉપર માઉસ ફેરવો અને 16 પ્રકાશિત થયેલ ''' process nodes'''માંથી કોઈ એક ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:40
| ત્યાર બાદ , ''' State Transition '''રિએક્શન ઉપર માઉસ ફેરવો અને '''process node''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ધ્યાનથી જુઓ ,'''State Transition ''' અને ''' Glutamate'''ની વચ્ચે એક '''reaction line ''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 08:55
| હવે એક '''Reactant''' અને એક '''Product'''ની સાથેનું એક સંપૂર્ણ '''Catalysis '''રિએક્શન આપણી પાસે આવી ગયું છે .

|-
| 09:01
| હું આ '''reaction'''ને સંરેખિત કરીશ જેથી પ્રોસેસ ડાયાગ્રામમાં બીજા '''components'''નો સમાવેશ થઇ શકે.

|-
| 09:09
| ટૂલબાર માંથી આ આઇકોન્સનો ઉપયોગ કરો : '''State Transition''' '''Simple Molecule''' '''Generic Protein''' અને '''Catalysis'''

|-
| 09:18
| આ એક સંપૂર્ણ '''Process Diagram ''' છે.

|-
| 09:22
| તેને બરાબર જોવા માટે , '''main menu''' બારમાં '''View ''' ઉપર જાઓ અને ''' Zoom Fit''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:32
| હવે તમે આ સંપૂર્ણ '''Process Diagram''' જુઓ.

|-
| 09:36
| ચાલો હવે સારાંશ જોઈએ. આ ‘’’Build and Modify Process Diagram’’’ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આ શીખ્યા : '''Macros'''નો ઉપયોગ,

|-
| 09:42
| '''draw''' વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સ ને Move કરવું, speciesની ફરતે કેનેક્શન લાઇનને જોડવી.

|-
| 09:48
| રિએક્શન લાઈનને સંરેખિત કરવી અને વિસ્તારવી, '''Product''' અને '''Reactant''' ઉમેરવા.

|-
| 09:54
| અભ્યાસ માટે : '''CellDesigner'''ના ટૂલ્સનો ઉપયોગ કરી '''Methionine Biosynthesis''' માટે નો પ્રોસેસ ડાયાગ્રામ બનાવો # '''GTP/GD''' માટે '''Macros''' શોધો # ’Curve’ રિએક્શન લાઈન કેવી રીતે બનાવાય તે શોધો.

|-
| 10:11
| આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના વિષે જાણવા

|-
| 10:14
| આ લિંક :'''www.spoken-tutorial.org''' ઉપરનો વિડીયો નિહાળો તે આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 10:19
| જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 09:24
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે.

|-
| 09:29
| જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે.

|-
| 10:34
| વધુ માહિતી માટે અમને અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 10:40
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટ એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 10:54
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Gujarati

2017-10-30T07:29:38Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : અગાઉથી સેવ કરેલી .xml ફાઈલને '''Draw''' વિસ્તારમાં ખોલવી.

|-
| 00:15
| '''compartment'''માં આ મુજબના ફેરફારો કરવા : બોર્ડરના shape, size, color અને thickness.

|-
| 00:22
| ''' CellDesigner'''માં વિવિધ પ્રકારની ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''Species'''ની ઓળખ(identity) બદલવી.

|-
| 00:28
| આપણે આ પણ શીખીશું કે '''Species'''ને કેવી રીતે કટ , કોપી અને પેસ્ટ કરવું, '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ વિષે જાણીશું.

|-
| 00:37
| ''' Species'''ને કેવી રીતે સક્રિય(activate) કરવું અને તેનો રંગ બદલવો,''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(properties) કેવી રીતે બદલવા અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 00:47
| અહીં હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:57
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરણ માટે તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના સાથે પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:05
| જો તમે ન જાણતા હોવ, તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' માટે અમારી વેબસાઈટ ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’ ની મુલાકાત લો .

|-
| 01:16
| શીખનારાઓ ખાસ નોંધ લો : આ શ્રેણીના અગાઉના થોડાક ટ્યૂટોરિઅલ્સ ''' Windows OS''' ઉપર બનાવેલ છે.

|-
| 01:24
| જો કે હવે , અહીંથી, આ શ્રેણી ''' Ubuntu Linux OS''' ઉપર પૂર્ણ થશે.

|-
| 01:30
| ચાલો હવે '''CellDesigner'''માં ''' કોમ્પોનન્ટ્સ (components)ને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએ.

|-
| 01:35
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:41
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:52
| '''CellDesigner ''' વીન્ડોવ (window)તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:56
| આપણે અગાઉથી બનાવેલ ફાઈલ '''Create and Edit '''ને ચાલો હવે ખોલીએ.

|-
| 02:02
| તો '''File''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Open''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:07
| ''' Open'''નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:11
| અહીં, આપણને ‘'''Folders’ ''' શીર્ષક નીચેથી આપણું ફોલ્ડર સિલેક્ટ કરવું પડશે.

|-
| 02:15
| ‘'''File’''' શીર્ષક નીચેના ''''Create_and_Edit.xml'''' ફાઈલ ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી ‘'''Ok’''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| આપણી ફાઈલ '''Create_and_Edit.xml ''' હવે Draw વિસ્તારમાં ખુલે છે.

|-
| 02:35
| કમ્પાર્ટમેન્ટને સિલેક્ટ કરો.''' Main Menu ''' બારમાંના '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:43
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Change to OVAL'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:48
| Draw વિસ્તારની ઉપર, આપણી પાસે હવે '''Oval''' Compartment છે.

|-
| 02:54
| color અથવા thickness બદલવા ,main menu બારમાં “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 03:00
| “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:05
| બીજી રીતે , કમ્પાર્ટમેન્ટની સીમારેખા(boundary) ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| ''''Change color & shape'''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:20
| એકદમ પાતળી સીમારેખા માટે, '''Membrane Thickness'''ને 12 થી 8 અથવા તેનાથી પણ ઓછી રાખો.

|-
| 03:29
| color બદલવા , ''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:34
| ''' Color panel''' માં એક હૅન્ડલ જેવા પોઇન્ટર સાથેનું એક '''Color wheel''' છે.

|-
| 03:39
| પોઇન્ટર ઉપર ક્લિક કરી તેને પકડી રાખો અને તમને ગમતા રંગને સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:46
| તમામ ફેરફારો થઇ ગયા બાદ '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''''Ok'''' ક્લિક કરો.

|-
| 03:53
| હવે '''Reaction ''' ટૂલબાર ઉપર વિવિધ ''' Compartments''' ડ્રો કરવા બીજા વિકલ્પો વિષે તમે જાતે જ શોધ કરો.

|-
| 04:00
| હવે આપણે ''' Species'''ના '''change the identity''' વિશે શીખીશું .

|-
| 04:05
| તો પહેલા આપણે ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ (window) ખોલીશુ.

|-
| 04:11
| ચાલો આ ફાઈલને નામ આપીએ , જેમકે '''Change Species'''.

|-
| 04:16
| આપણે '''width''' અને '''height'''ને ડિફોલ્ટ જ રાખીશું. અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:22
| હવે ટૂલ બારમાંના ''''Generic protein'''' આઇકનને ક્લિક કરીશું. '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| ડાયલોગ બોક્સમાં , ટાઈપ કરો ''' Pectin''' અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:37
| હવે ''' Generic protein Pectin''' ઉપર રાઈટ ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:41
| અને વિકલ્પ '''Change Identity''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:46
| ''''Change identity of the species'''' નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 04:53
| ''' Class box ''' માં નીચે જતા એરો ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:58
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી કોઈ પણ વિકલ્પ સિલેક્ટ કરીએ , ઉદાહરણ તરીકે , ''' simple molecule'''.

|-
| 05:05
| હવે આ ''' simple molecule''' ને ''' Name''' boxમાં નામ આપીએ.

|-
| 05:10
| તેને કહો ''' Fructose.''' '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ધ્યાનથી જુઓ આપણું ''' Protein Pectin''' હવે '''Fructose''' નામના ''' simple molecule'''માં પરિવર્તન પામી ગયું છે.

|-
| 05:25
| ચાલો હવે ''' Cut, Copy''' અને ''' Paste''' વિશે શીખીએ.

|-
| 05:29
| હું '''Draw''' વિસ્તારમાં પહેલેથી રહેલા '''Fructose'''નો જ ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 05:34
| ''' Species'''ને '''cut''' કરવા, પહેલા ''' Species Fructose''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:40
| '''Edit menu''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Cut''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:47
| યાદ રાખો કે '''Cut ''' માટેનું શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+X'''.

|-
| 05:53
| ''' Species Fructose ''' કટ થઇ જાય છે.

|-
| 05:56
| '''species'''ને '''paste ''' કરવા , પાછા ''''Edit'''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Paste''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:03
| નોંધ લો ''' Paste'''ની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+V'''.

|-
| 06:08
| ''' Species Fructose''' પાછી '''Draw''' વિસ્તારમાં દેખાય છે.

|-
| 06:12
| ''' Species'''ની કોપી બનાવવા , "main menu" બારના ''' Edit''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:18
| ''' Copy''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| નોંધ લો Copy માટેની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+C''' કોપી ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:31
| આ વખતે , ચાલો પેસ્ટ કરવા ''' Ctrl + V''' દબાવીએ .

|-
| 06:36
| હવે આપણી પાસે '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Fructose'''ની એક કોપી આવી ગઈ છે.

|-
| 06:40
| કોઈ પણ ક્રિયાને '''Undo''' કરવા '''Ctrl+Z''' અને કોઈ ક્રિયાને '''Redo''' કરવા '''Ctrl+Y''' દબાવો.

|-
| 06:51
| જો કે આ બધા મર્યાદિત ઉપયોગમાં આવે છે.

|-
| 06:55
| ચાલો હવે ''' Fructose molecules''' એસિડ ને '''Draw''' વિસ્તાર પર "drag'" અને "Move" કરીએ.

|-
| 07:00
| તે કરવા, ''' Fructose''' ઉપર ક્લિક કરો અને તેને નિશ્ચિત જગ્યાએ ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| આગળ આપણે શીખીશું , '''start-point''' અને '''end-point''' '''species''' શું છે અને '''species''' ને '''activate''' કેવી રીતે કરવું?

|-
| 07:13
| તે માટે , મેં અગાઉથી જ બે ''' generic proteins''' વચ્ચે ''' state transition reaction''' ડ્રો કર્યું છે.

|-
|   07:21
| મેં તેમને '''Protein 1''' અને '''Protein 2''' નામ આપ્યા છે.

|-
|   07:25
| યાદ કરો ,''' reaction''' કેવી રીતે ડ્રો કરવું તે આપણે અગાઉં જ શીખી લીધું છે.

|-
| 07:29
| ન જાણતા હોવ તો આ શ્રેણીના અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલ્સ નિહાળો. ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 07:35
| આ રિએક્શનમાં , ''' ‘Protein 1’''' એ ''' ‘start point’''' અને ''' Protein 2''' એ ''' ‘end point’''' છે.

|-
|   07:43
| ''' species''' ને એક્ટિવેટ કરવા ''' Species''' ઉપર ક્લિક કરો જે ''' Reaction'''નો ''' 'end-point'''' છે.

|-
| 07:50
| આપણા કેસમાં , તે ''' Protein 2''' છે.

|-
|   07:53
| તો ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરો અને કીબોર્ડપર '''A''' દબાવો.

|-
|   07:59
| હું આ ફેરફારને ''' Ctrl + Z''' કીઝ વડે '''undo''' કરી દઉં.

|-
|   08:05
| વૈકલ્પિક રીતે ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:09
| હવે પછી , '''main menu''' બાર ઉપર , '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 08:13
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Set Active''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:18
| ધ્યાનથી જુઓ ''' activated species''' આવા '''dashed line''' વડે આવરિત થયેલ છે.

|-
| 08:24
| ચાલો હવે ''' species, Protein 2'''ના '''color''' બદલીએ.

|-
| 08:29
| તો તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને ''''Change color and shape''''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:35
| અગાઉં જોયું તેમ , ''' Color''' પેનલમાં એક '''color wheel''' રહેલ છે.

|-
| 08:40
| તમને ગમતો રંગ પસંદ કરવા '''pointer '''ને ક્લિક કરી તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 08:44
| પછી '''Apply''' અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ''' species '''નો બદલાતો રંગ ધાયનથી જુઓ.

|-
| 08:53
| હવે આપણે જોઈશું કે ''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(Properties) કેવી રીતે બદલી શકાય.

|-
| 08:57
| ચાલો આપણે આપણા '''Draw ''' વિસ્તારમાં રહેલા ''' state transition reaction ''' ઉપર પાછા ફરીએ.

|-
| 09:03
| બે '''species'''ની વચ્ચે રહેલા '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
|   09:08
| હવે '''Change Identity''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|   09:13
| એક '''Change Properties of the Reaction''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   09:18
| '''Name''' બોક્સને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએમાં રિએક્શનનું નામ આપો , ધારોકે ''' Reaction1'''

|-
|   09:26
| '''Type''' બોક્સ ડ્રોપ ડાઉન મેનુ માંથી તમને યોગ્ય લાગતું રિએક્શન પસંદ કરો , જેમકે ''' Transcription'''. ''''Ok'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   09:38
| ધ્યાનથી જુઓ '''draw''' વિસ્તારમાં ''' reaction''' બદલાઈ જાય છે.

|-
|   09:42
| આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં રિએક્શન એર્રોવ ઉપર આપેલ નામ હવે નથી જોઈ શકતા.

|-
|   09:47
| ચિંતા ન કરશો,તે વિશે આપણે હવેના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં શીખીશું.

|-
|   09:53
| ચાલો ફરી એકવાર '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને ''' Change Identity''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   10:00
| જો તે એક '''Reversible''' રિએક્શન હોય તો , ''' TRUE''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''Ok''' ક્લિક કરો.

|-
|   10:09
| તમે જોઈ શકશો કે રિએક્શન વિપરીત થઇ ગયું હશે.

|-
|   10:14
| ''' CellDesigner''' માંથી બહાર આવવા , ''' File''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Exit''' વિકલ્પ પસંદ કરો.

|-
| 10:20
| અથવા તો, તમે ''' Ctrl + Q''' દબાવો.

|-
| 10:25
| '''Confirmation''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલશે, જે તમને તમેં કરેલા ફેરફારોને સેવ કરવા માટે પૂછશે.

|-
| 10:32
| '''Yes''' ક્લિક કરો અને '''Ok''' બટન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 10:38
| તે કહેશે કે તમારી ફાઈલમાં બદલાવ થયેલ છે.

|-
| 10:41
| '''Save the changes?''' '''Yes''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 10:42
| સારાંશ જોઈએ : આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા :

|-
| 10:50
| '''draw''' વિસ્તારમાં અગાઉંથી સેવ કરેલ .xml ફાઈલ કેવી રીતે ખોલવી

|-
| 10:55
| ''' Compartment'''ના બોર્ડરના '''shape''', '''size''', '''color''' and '''thickness''' કેવી રીતે બદલવા

|-
| 11:01
| '''CellDesigner'''માં વિવિધ ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''identity'''માં ફેરફાર કરવા.

|-
| 11:07
| અને '''Species''' ને '''Cut''', '''Copy''' અને '''Paste''' કરવા

|-
| 11:10
| આપણે આ પણ શીખ્યા : '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ.

|-
| 11:15
| ''' Species'''ને કેવી રીતે '''Activate''' કરવું, ''' Species''' નો '''Color''' કેવી રીતે બદલવો, ''' Reaction'''ની '''Properties''' કેવી રીતે બદલવી અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 11:25
| તમારા અભ્યાસ માટે : એક ''' complex''' બનાવો અને ''' Complex''' માં ''' Species''' મુકો.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ 2: ટૂલબાર નું અન્વેષણ કરો અને રિએક્શન માં રિએક્ટન્ટ (reactant ) અને પ્રોડક્ટ (પ્રોડક્ટ) કેવી રીતે ઉમેવા તે શોધો.
|-
| 11:41
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાવો જોઈએ.

|-
| 11:45
| તમારો પૂર્ણ થયેલ પ્રથમ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાશે : એક ''' complex''' અને ''' Complex''' માં મુકેલા ''' Species'''.

|-
| 11:55
| અભ્યાસ 2 આ પ્રમાણે દેખાશે : ''' reactant''' અને ''' product''' સાથેનું એક '''state-transition reaction'''.

|-
| 12:00
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિશે જાણવા

|-
| 12:05
| આ લિંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો ડાઉનલોડ કરો અને નિહાળો. તે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 12:23
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 12:35
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Gujarati

2017-10-30T07:28:36Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : અગાઉથી સેવ કરેલી .xml ફાઈલને '''Draw''' વિસ્તારમાં ખોલવી.

|-
| 00:15
| '''compartment'''માં આ મુજબના ફેરફારો કરવા : બોર્ડરના shape, size, color અને thickness.

|-
| 00:22
| ''' CellDesigner'''માં વિવિધ પ્રકારની ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''Species'''ની ઓળખ(identity) બદલવી.

|-
| 00:28
| આપણે આ પણ શીખીશું કે '''Species'''ને કેવી રીતે કટ , કોપી અને પેસ્ટ કરવું, '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ વિષે જાણીશું.

|-
| 00:37
| ''' Species'''ને કેવી રીતે સક્રિય(activate) કરવું અને તેનો રંગ બદલવો,''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(properties) કેવી રીતે બદલવા અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 00:47
| અહીં હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:57
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરણ માટે તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના સાથે પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:05
| જો તમે ન જાણતા હોવ, તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' માટે અમારી વેબસાઈટ ની મુલાકાત ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’લો .

|-
| 01:16
| શીખનારાઓ ખાસ નોંધ લો : આ શ્રેણીના અગાઉના થોડાક ટ્યૂટોરિઅલ્સ ''' Windows OS''' ઉપર બનાવેલ છે.

|-
| 01:24
| જો કે હવે , અહીંથી, આ શ્રેણી ''' Ubuntu Linux OS''' ઉપર પૂર્ણ થશે.

|-
| 01:30
| ચાલો હવે '''CellDesigner'''માં ''' કોમ્પોનન્ટ્સ (components)ને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએ.

|-
| 01:35
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:41
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:52
| '''CellDesigner ''' વીન્ડોવ (window)તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:56
| આપણે અગાઉથી બનાવેલ ફાઈલ '''Create and Edit '''ને ચાલો હવે ખોલીએ.

|-
| 02:02
| તો '''File''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Open''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:07
| ''' Open'''નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:11
| અહીં, આપણને ‘'''Folders’ ''' શીર્ષક નીચેથી આપણું ફોલ્ડર સિલેક્ટ કરવું પડશે.

|-
| 02:15
| ‘'''File’''' શીર્ષક નીચેના ''''Create_and_Edit.xml'''' ફાઈલ ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી ‘'''Ok’''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| આપણી ફાઈલ '''Create_and_Edit.xml ''' હવે Draw વિસ્તારમાં ખુલે છે.

|-
| 02:35
| કમ્પાર્ટમેન્ટને સિલેક્ટ કરો.''' Main Menu ''' બારમાંના '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:43
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Change to OVAL'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:48
| Draw વિસ્તારની ઉપર, આપણી પાસે હવે '''Oval''' Compartment છે.

|-
| 02:54
| color અથવા thickness બદલવા ,main menu બારમાં “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 03:00
| “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:05
| બીજી રીતે , કમ્પાર્ટમેન્ટની સીમારેખા(boundary) ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| ''''Change color & shape'''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:20
| એકદમ પાતળી સીમારેખા માટે, '''Membrane Thickness'''ને 12 થી 8 અથવા તેનાથી પણ ઓછી રાખો.

|-
| 03:29
| color બદલવા , ''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:34
| ''' Color panel''' માં એક હૅન્ડલ જેવા પોઇન્ટર સાથેનું એક '''Color wheel''' છે.

|-
| 03:39
| પોઇન્ટર ઉપર ક્લિક કરી તેને પકડી રાખો અને તમને ગમતા રંગને સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:46
| તમામ ફેરફારો થઇ ગયા બાદ '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''''Ok'''' ક્લિક કરો.

|-
| 03:53
| હવે '''Reaction ''' ટૂલબાર ઉપર વિવિધ ''' Compartments''' ડ્રો કરવા બીજા વિકલ્પો વિષે તમે જાતે જ શોધ કરો.

|-
| 04:00
| હવે આપણે ''' Species'''ના '''change the identity''' વિશે શીખીશું .

|-
| 04:05
| તો પહેલા આપણે ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ (window) ખોલીશુ.

|-
| 04:11
| ચાલો આ ફાઈલને નામ આપીએ , જેમકે '''Change Species'''.

|-
| 04:16
| આપણે '''width''' અને '''height'''ને ડિફોલ્ટ જ રાખીશું. અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:22
| હવે ટૂલ બારમાંના ''''Generic protein'''' આઇકનને ક્લિક કરીશું. '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| ડાયલોગ બોક્સમાં , ટાઈપ કરો ''' Pectin''' અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:37
| હવે ''' Generic protein Pectin''' ઉપર રાઈટ ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:41
| અને વિકલ્પ '''Change Identity''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:46
| ''''Change identity of the species'''' નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 04:53
| ''' Class box ''' માં નીચે જતા એરો ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:58
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી કોઈ પણ વિકલ્પ સિલેક્ટ કરીએ , ઉદાહરણ તરીકે , ''' simple molecule'''.

|-
| 05:05
| હવે આ ''' simple molecule''' ને ''' Name''' boxમાં નામ આપીએ.

|-
| 05:10
| તેને કહો ''' Fructose.''' '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ધ્યાનથી જુઓ આપણું ''' Protein Pectin''' હવે '''Fructose''' નામના ''' simple molecule'''માં પરિવર્તન પામી ગયું છે.

|-
| 05:25
| ચાલો હવે ''' Cut, Copy''' અને ''' Paste''' વિશે શીખીએ.

|-
| 05:29
| હું '''Draw''' વિસ્તારમાં પહેલેથી રહેલા '''Fructose'''નો જ ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 05:34
| ''' Species'''ને '''cut''' કરવા, પહેલા ''' Species Fructose''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:40
| '''Edit menu''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Cut''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:47
| યાદ રાખો કે '''Cut ''' માટેનું શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+X'''.

|-
| 05:53
| ''' Species Fructose ''' કટ થઇ જાય છે.

|-
| 05:56
| '''species'''ને '''paste ''' કરવા , પાછા ''''Edit'''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Paste''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:03
| નોંધ લો ''' Paste'''ની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+V'''.

|-
| 06:08
| ''' Species Fructose''' પાછી '''Draw''' વિસ્તારમાં દેખાય છે.

|-
| 06:12
| ''' Species'''ની કોપી બનાવવા , "main menu" બારના ''' Edit''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:18
| ''' Copy''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| નોંધ લો Copy માટેની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+C''' કોપી ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:31
| આ વખતે , ચાલો પેસ્ટ કરવા ''' Ctrl + V''' દબાવીએ .

|-
| 06:36
| હવે આપણી પાસે '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Fructose'''ની એક કોપી આવી ગઈ છે.

|-
| 06:40
| કોઈ પણ ક્રિયાને '''Undo''' કરવા '''Ctrl+Z''' અને કોઈ ક્રિયાને '''Redo''' કરવા '''Ctrl+Y''' દબાવો.

|-
| 06:51
| જો કે આ બધા મર્યાદિત ઉપયોગમાં આવે છે.

|-
| 06:55
| ચાલો હવે ''' Fructose molecules''' એસિડ ને '''Draw''' વિસ્તાર પર "drag'" અને "Move" કરીએ.

|-
| 07:00
| તે કરવા, ''' Fructose''' ઉપર ક્લિક કરો અને તેને નિશ્ચિત જગ્યાએ ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| આગળ આપણે શીખીશું , '''start-point''' અને '''end-point''' '''species''' શું છે અને '''species''' ને '''activate''' કેવી રીતે કરવું?

|-
| 07:13
| તે માટે , મેં અગાઉથી જ બે ''' generic proteins''' વચ્ચે ''' state transition reaction''' ડ્રો કર્યું છે.

|-
|   07:21
| મેં તેમને '''Protein 1''' અને '''Protein 2''' નામ આપ્યા છે.

|-
|   07:25
| યાદ કરો ,''' reaction''' કેવી રીતે ડ્રો કરવું તે આપણે અગાઉં જ શીખી લીધું છે.

|-
| 07:29
| ન જાણતા હોવ તો આ શ્રેણીના અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલ્સ નિહાળો. ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 07:35
| આ રિએક્શનમાં , ''' ‘Protein 1’''' એ ''' ‘start point’''' અને ''' Protein 2''' એ ''' ‘end point’''' છે.

|-
|   07:43
| ''' species''' ને એક્ટિવેટ કરવા ''' Species''' ઉપર ક્લિક કરો જે ''' Reaction'''નો ''' 'end-point'''' છે.

|-
| 07:50
| આપણા કેસમાં , તે ''' Protein 2''' છે.

|-
|   07:53
| તો ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરો અને કીબોર્ડપર '''A''' દબાવો.

|-
|   07:59
| હું આ ફેરફારને ''' Ctrl + Z''' કીઝ વડે '''undo''' કરી દઉં.

|-
|   08:05
| વૈકલ્પિક રીતે ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:09
| હવે પછી , '''main menu''' બાર ઉપર , '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 08:13
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Set Active''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:18
| ધ્યાનથી જુઓ ''' activated species''' આવા '''dashed line''' વડે આવરિત થયેલ છે.

|-
| 08:24
| ચાલો હવે ''' species, Protein 2'''ના '''color''' બદલીએ.

|-
| 08:29
| તો તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને ''''Change color and shape''''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:35
| અગાઉં જોયું તેમ , ''' Color''' પેનલમાં એક '''color wheel''' રહેલ છે.

|-
| 08:40
| તમને ગમતો રંગ પસંદ કરવા '''pointer '''ને ક્લિક કરી તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 08:44
| પછી '''Apply''' અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ''' species '''નો બદલાતો રંગ ધાયનથી જુઓ.

|-
| 08:53
| હવે આપણે જોઈશું કે ''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(Properties) કેવી રીતે બદલી શકાય.

|-
| 08:57
| ચાલો આપણે આપણા '''Draw ''' વિસ્તારમાં રહેલા ''' state transition reaction ''' ઉપર પાછા ફરીએ.

|-
| 09:03
| બે '''species'''ની વચ્ચે રહેલા '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
|   09:08
| હવે '''Change Identity''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|   09:13
| એક '''Change Properties of the Reaction''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   09:18
| '''Name''' બોક્સને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએમાં રિએક્શનનું નામ આપો , ધારોકે ''' Reaction1'''

|-
|   09:26
| '''Type''' બોક્સ ડ્રોપ ડાઉન મેનુ માંથી તમને યોગ્ય લાગતું રિએક્શન પસંદ કરો , જેમકે ''' Transcription'''. ''''Ok'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   09:38
| ધ્યાનથી જુઓ '''draw''' વિસ્તારમાં ''' reaction''' બદલાઈ જાય છે.

|-
|   09:42
| આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં રિએક્શન એર્રોવ ઉપર આપેલ નામ હવે નથી જોઈ શકતા.

|-
|   09:47
| ચિંતા ન કરશો,તે વિશે આપણે હવેના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં શીખીશું.

|-
|   09:53
| ચાલો ફરી એકવાર '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને ''' Change Identity''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   10:00
| જો તે એક '''Reversible''' રિએક્શન હોય તો , ''' TRUE''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''Ok''' ક્લિક કરો.

|-
|   10:09
| તમે જોઈ શકશો કે રિએક્શન વિપરીત થઇ ગયું હશે.

|-
|   10:14
| ''' CellDesigner''' માંથી બહાર આવવા , ''' File''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Exit''' વિકલ્પ પસંદ કરો.

|-
| 10:20
| અથવા તો, તમે ''' Ctrl + Q''' દબાવો.

|-
| 10:25
| '''Confirmation''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલશે, જે તમને તમેં કરેલા ફેરફારોને સેવ કરવા માટે પૂછશે.

|-
| 10:32
| '''Yes''' ક્લિક કરો અને '''Ok''' બટન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 10:38
| તે કહેશે કે તમારી ફાઈલમાં બદલાવ થયેલ છે.

|-
| 10:41
| '''Save the changes?''' '''Yes''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 10:42
| સારાંશ જોઈએ : આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા :

|-
| 10:50
| '''draw''' વિસ્તારમાં અગાઉંથી સેવ કરેલ .xml ફાઈલ કેવી રીતે ખોલવી

|-
| 10:55
| ''' Compartment'''ના બોર્ડરના '''shape''', '''size''', '''color''' and '''thickness''' કેવી રીતે બદલવા

|-
| 11:01
| '''CellDesigner'''માં વિવિધ ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''identity'''માં ફેરફાર કરવા.

|-
| 11:07
| અને '''Species''' ને '''Cut''', '''Copy''' અને '''Paste''' કરવા

|-
| 11:10
| આપણે આ પણ શીખ્યા : '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ.

|-
| 11:15
| ''' Species'''ને કેવી રીતે '''Activate''' કરવું, ''' Species''' નો '''Color''' કેવી રીતે બદલવો, ''' Reaction'''ની '''Properties''' કેવી રીતે બદલવી અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 11:25
| તમારા અભ્યાસ માટે : એક ''' complex''' બનાવો અને ''' Complex''' માં ''' Species''' મુકો.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ 2: ટૂલબાર નું અન્વેષણ કરો અને રિએક્શન માં રિએક્ટન્ટ (reactant ) અને પ્રોડક્ટ (પ્રોડક્ટ) કેવી રીતે ઉમેવા તે શોધો.
|-
| 11:41
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાવો જોઈએ.

|-
| 11:45
| તમારો પૂર્ણ થયેલ પ્રથમ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાશે : એક ''' complex''' અને ''' Complex''' માં મુકેલા ''' Species'''.

|-
| 11:55
| અભ્યાસ 2 આ પ્રમાણે દેખાશે : ''' reactant''' અને ''' product''' સાથેનું એક '''state-transition reaction'''.

|-
| 12:00
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિશે જાણવા

|-
| 12:05
| આ લિંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો ડાઉનલોડ કરો અને નિહાળો. તે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 12:23
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 12:35
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Gujarati

2017-10-30T07:21:19Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : અગાઉથી સેવ કરેલી .xml ફાઈલને '''Draw''' વિસ્તારમાં ખોલવી.

|-
| 00:15
| '''compartment'''માં આ મુજબના ફેરફારો કરવા : બોર્ડરના shape, size, color અને thickness.

|-
| 00:22
| ''' CellDesigner'''માં વિવિધ પ્રકારની ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''Species'''ની ઓળખ(identity) બદલવી.

|-
| 00:28
| આપણે આ પણ શીખીશું કે '''Species'''ને કેવી રીતે કટ , કોપી અને પેસ્ટ કરવું, '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ વિષે જાણીશું.

|-
| 00:37
| ''' Species'''ને કેવી રીતે સક્રિય(activate) કરવું અને તેનો રંગ બદલવો,''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(properties) કેવી રીતે બદલવા અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 00:47
| અહીં હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:57
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરણ માટે તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના સાથે પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:05
| જો તમે ન જાણતા હોવ, તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' માટે અમારી વેબસાઈટ ની મુલાકાત ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’લો .

|-
| 01:16
| શીખનારાઓ ખાસ નોંધ લો : આ શ્રેણીના અગાઉના થોડાક ટ્યૂટોરિઅલ્સ ''' Windows OS''' ઉપર બનાવેલ છે.

|-
| 01:24
| જો કે હવે , અહીંથી, આ શ્રેણી ''' Ubuntu Linux OS''' ઉપર પૂર્ણ થશે.

|-
| 01:30
| ચાલો હવે '''CellDesigner'''માં ''' કોમ્પોનન્ટ્સ (components)ને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએ.

|-
| 01:35
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:41
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:52
| '''CellDesigner ''' વીન્ડોવ (window)તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:56
| આપણે અગાઉથી બનાવેલ ફાઈલ '''Create and Edit '''ને ચાલો હવે ખોલીએ.

|-
| 02:02
| તો '''File''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Open''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:07
| ''' Open'''નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:11
| અહીં, આપણને ‘'''Folders’ ''' શીર્ષક નીચેથી આપણું ફોલ્ડર સિલેક્ટ કરવું પડશે.

|-
| 02:15
| ‘'''File’''' શીર્ષક નીચેના ''''Create_and_Edit.xml'''' ફાઈલ ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી ‘'''Ok’''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| આપણી ફાઈલ '''Create_and_Edit.xml ''' હવે Draw વિસ્તારમાં ખુલે છે.

|-
| 02:35
| કમ્પાર્ટમેન્ટને સિલેક્ટ કરો.''' Main Menu ''' બારમાંના '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:43
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Change to OVAL'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:48
| Draw વિસ્તારની ઉપર, આપણી પાસે હવે '''Oval''' Compartment છે.

|-
| 02:54
| color અથવા thickness બદલવા ,main menu બારમાં “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 03:00
| “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:05
| બીજી રીતે , કમ્પાર્ટમેન્ટની સીમારેખા(boundary) ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| ''''Change color & shape'''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:20
| એકદમ પાતળી સીમારેખા માટે, '''Membrane Thickness'''ને 12 થી 8 અથવા તેનાથી પણ ઓછી રાખો.

|-
| 03:29
| color બદલવા , ''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:34
| ''' Color panel''' માં એક હૅન્ડલ જેવા પોઇન્ટર સાથેનું એક '''Color wheel''' છે.

|-
| 03:39
| પોઇન્ટર ઉપર ક્લિક કરી તેને પકડી રાખો અને તમને ગમતા રંગને સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:46
| તમામ ફેરફારો થઇ ગયા બાદ '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''''Ok'''' ક્લિક કરો.

|-
| 03:53
| હવે '''Reaction ''' ટૂલબાર ઉપર વિવિધ ''' Compartments''' ડ્રો કરવા બીજા વિકલ્પો વિષે તમે જાતે જ શોધ કરો.

|-
| 04:00
| હવે આપણે ''' Species'''ના '''change the identity''' વિશે શીખીશું .

|-
| 04:05
| તો પહેલા આપણે ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ (window) ખોલીશુ.

|-
| 04:11
| ચાલો આ ફાઈલને નામ આપીએ , જેમકે '''Change Species'''.

|-
| 04:16
| આપણે '''width''' અને '''height'''ને ડિફોલ્ટ જ રાખીશું. અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:22
| હવે ટૂલ બારમાંના ''''Generic protein'''' આઇકનને ક્લિક કરીશું. '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| ડાયલોગ બોક્સમાં , ટાઈપ કરો ''' Pectin''' અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:37
| હવે ''' Generic protein Pectin''' ઉપર રાઈટ ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:41
| અને વિકલ્પ '''Change Identity''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:46
| ''''Change identity of the species'''' નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 04:53
| ''' Class box ''' માં નીચે જતા એરો ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:58
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી કોઈ પણ વિકલ્પ સિલેક્ટ કરીએ , ઉદાહરણ તરીકે , ''' simple molecule'''.

|-
| 05:05
| હવે આ ''' simple molecule''' ને ''' Name''' boxમાં નામ આપીએ.

|-
| 05:10
| તેને કહો ''' Fructose.''' '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ધ્યાનથી જુઓ આપણું ''' Protein Pectin''' હવે '''Fructose''' નામના ''' simple molecule'''માં પરિવર્તન પામી ગયું છે.

|-
| 05:25
| ચાલો હવે ''' Cut, Copy''' અને ''' Paste''' વિશે શીખીએ.

|-
| 05:29
| હું '''Draw''' વિસ્તારમાં પહેલેથી રહેલા '''Fructose'''નો જ ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 05:34
| ''' Species'''ને '''cut''' કરવા, પહેલા ''' Species Fructose''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:40
| '''Edit menu''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Cut''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:47
| યાદ રાખો કે '''Cut ''' માટેનું શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+X'''.

|-
| 05:53
| ''' Species Fructose ''' કટ થઇ જાય છે.

|-
| 05:56
| '''species'''ને '''paste ''' કરવા , પાછા ''''Edit'''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Paste''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:03
| નોંધ લો ''' Paste'''ની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+V'''.

|-
| 06:08
| ''' Species Fructose''' પાછી '''Draw''' વિસ્તારમાં દેખાય છે.

|-
| 06:12
| ''' Species'''ની કોપી બનાવવા , "main menu" બારના ''' Edit''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:18
| ''' Copy''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| નોંધ લો Copy માટેની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+C''' કોપી ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:31
| આ વખતે , ચાલો પેસ્ટ કરવા ''' Ctrl + V''' દબાવીએ .

|-
| 06:36
| હવે આપણી પાસે '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Fructose'''ની એક કોપી આવી ગઈ છે.

|-
| 06:40
| કોઈ પણ ક્રિયાને '''Undo''' કરવા '''Ctrl+Z''' અને કોઈ ક્રિયાને '''Redo''' કરવા '''Ctrl+Y''' દબાવો.

|-
| 06:51
|જો કે આ બધા મર્યાદિત ઉપયોગમાં આવે છે.

|-
| 06:55
| ચાલો હવે ''' Fructose molecules''' એસિડ ને '''Draw''' વિસ્તાર પર "drag'" અને "Move" કરીએ.

|-
| 07:00
| તે કરવા, ''' Fructose''' ઉપર ક્લિક કરો અને તેને નિશ્ચિત જગ્યાએ ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| આગળ આપણે શીખીશું , '''start-point''' અને '''end-point''' '''species''' શું છે અને '''species''' ને '''activate''' કેવી રીતે કરવું?

|-
| 07:13
| તે માટે , મેં અગાઉથી જ બે ''' generic proteins''' વચ્ચે ''' state transition reaction''' ડ્રો કર્યું છે.

|-
|   07:21
| મેં તેમને '''Protein 1''' અને '''Protein 2''' નામ આપ્યા છે.

|-
|   07:25
| યાદ કરો ,''' reaction''' કેવી રીતે ડ્રો કરવું તે આપણે અગાઉં જ શીખી લીધું છે.

|-
| 07:29
| ન જાણતા હોવ તો આ શ્રેણીના અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલ્સ નિહાળો. ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 07:35
| આ રિએક્શનમાં , ''' ‘Protein 1’''' એ ''' ‘start point’''' અને ''' Protein 2''' એ ''' ‘end point’''' છે.

|-
|   07:43
| ''' species''' ને એક્ટિવેટ કરવા ''' Species''' ઉપર ક્લિક કરો જે ''' Reaction'''નો ''' 'end-point'''' છે.

|-
| 07:50
| આપણા કેસમાં , તે ''' Protein 2''' છે.

|-
|   07:53
| તો ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરો અને કીબોર્ડપર '''A''' દબાવો.

|-
|   07:59
| હું આ ફેરફારને ''' Ctrl + Z''' કીઝ વડે '''undo''' કરી દઉં.

|-
|   08:05
| વૈકલ્પિક રીતે ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:09
| હવે પછી , '''main menu''' બાર ઉપર , '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 08:13
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Set Active''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:18
| ધ્યાનથી જુઓ ''' activated species''' આવા '''dashed line''' વડે આવરિત થયેલ છે.

|-
| 08:24
| ચાલો હવે ''' species, Protein 2'''ના '''color''' બદલીએ.

|-
| 08:29
| તો તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને ''''Change color and shape''''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:35
| અગાઉં જોયું તેમ , ''' Color''' પેનલમાં એક '''color wheel''' રહેલ છે.

|-
| 08:40
| તમને ગમતો રંગ પસંદ કરવા '''pointer '''ને ક્લિક કરી તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 08:44
| પછી '''Apply''' અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ''' species '''નો બદલાતો રંગ ધાયનથી જુઓ.

|-
| 08:53
| હવે આપણે જોઈશું કે ''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(Properties) કેવી રીતે બદલી શકાય.

|-
| 08:57
| ચાલો આપણે આપણા '''Draw ''' વિસ્તારમાં રહેલા ''' state transition reaction ''' ઉપર પાછા ફરીએ.

|-
| 09:03
| બે '''species'''ની વચ્ચે રહેલા '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
|   09:08
| હવે '''Change Identity''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|   09:13
| એક '''Change Properties of the Reaction''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   09:18
| '''Name''' બોક્સમાં રિએક્શનનું નામ આપો , ધારોકે ''' Reaction1'''

|-
|   09:26
| '''Type''' બોક્સ ડ્રોપ ડાઉન મેનુ માંથી તમને યોગ્ય લાગતું રિએક્શન પસંદ કરો , જેમકે ''' Transcription'''. ''''Ok'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   09:38
| ધ્યાનથી જુઓ '''draw''' વિસ્તારમાં ''' reaction''' બદલાઈ જાય છે.

|-
|   09:42
| આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં રિએક્શન એર્રોવ ઉપર આપેલ નામ હવે નથી જોઈ શકતા.

|-
|   09:47
| ચિંતા ન કરશો,તે વિશે આપણે હવેના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં શીખીશું.

|-
|   09:53
| ચાલો ફરી એકવાર '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને ''' Change Identity''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   10:00
| જો તે એક '''Reversible''' રિએક્શન હોય તો , ''' TRUE''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''Ok''' ક્લિક કરો.

|-
|   10:09
| તમે જોઈ શકશો કે રિએક્શન વિપરીત થઇ ગયું હશે.

|-
|   10:14
| ''' CellDesigner''' માંથી બહાર આવવા , ''' File''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Exit''' વિકલ્પ પસંદ કરો.

|-
| 10:20
| અથવા તો, તમે ''' Ctrl + Q''' દબાવો.

|-
| 10:25
| '''Confirmation''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલશે, જે તમને તમેં કરેલા ફેરફારોને સેવ કરવા માટે પૂછશે.

|-
| 10:32
| '''Yes''' ક્લિક કરો અને '''Ok''' બટન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 10:38
| તે કહેશે કે તમારી ફાઈલમાં બદલાવ થયેલ છે.

|-
| 10:41
| '''Save the changes?''' '''Yes''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 10:42
| સારાંશ જોઈએ : આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા :
|-
| 10:50
| '''draw''' વિસ્તારમાં અગાઉંથી સેવ કરેલ .xml ફાઈલ કેવી રીતે ખોલવી
|-
| 10:55
| ''' Compartment'''ના બોર્ડરના '''shape''', '''size''', '''color''' and '''thickness''' કેવી રીતે બદલવા

|-
| 11:01
| '''CellDesigner'''માં વિવિધ ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''identity'''માં ફેરફાર કરવા.

|-
| 11:07
| અને '''Species''' ને '''Cut''', '''Copy''' અને '''Paste''' કરવા
|-
| 11:10
| આપણે આ પણ શીખ્યા : '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ.

|-
| 11:15
| ''' Species'''ને કેવી રીતે '''Activate''' કરવું, ''' Species''' નો '''Color''' કેવી રીતે બદલવો, ''' Reaction'''ની '''Properties''' કેવી રીતે બદલવી અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 11:25
| તમારા અભ્યાસ માટે : એક ''' complex''' બનાવો અને ''' Complex''' માં ''' Species''' મુકો.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ 2: ટૂલબાર નું અન્વેષણ કરો અને રિએક્શન માં રિએક્ટન્ટ (reactant ) અને પ્રોડક્ટ (પ્રોડક્ટ) કેવી રીતે ઉમેવા તે શોધો.
|-
| 11:41
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાવો જોઈએ.

|-
| 11:45
| તમારો પૂર્ણ થયેલ પ્રથમ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાશે : એક ''' complex''' અને ''' Complex''' માં મુકેલા ''' Species''' .
|-
| 11:55
| અભ્યાસ 2 આ પ્રમાણે દેખાશે : ''' reactant''' અને ''' product''' સાથેનું એક '''state-transition reaction''' .

|-
| 12:00
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિશે જાણવા

|-
| 12:05
| આ લિંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો ડાઉનલોડ કરો અને નિહાળો. તે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 12:23
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 12:35
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Gujarati

2017-10-30T07:19:47Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : અગાઉથી સેવ કરેલી .xml ફાઈલને '''Draw''' વિસ્તારમાં ખોલવી.

|-
| 00:15
| '''compartment'''માં આ મુજબના ફેરફારો કરવા : બોર્ડરના shape, size, color અને thickness.

|-
| 00:22
| ''' CellDesigner'''માં વિવિધ પ્રકારની ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''Species'''ની ઓળખ(identity) બદલવી.

|-
| 00:28
| આપણે આ પણ શીખીશું કે '''Species'''ને કેવી રીતે કટ , કોપી અને પેસ્ટ કરવું, '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ વિષે જાણીશું.

|-
| 00:37
| ''' Species'''ને કેવી રીતે સક્રિય(activate) કરવું અને તેનો રંગ બદલવો,''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(properties) કેવી રીતે બદલવા અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 00:47
| અહીં હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:57
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરણ માટે તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના સાથે પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:05
| જો તમે ન જાણતા હોવ, તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' માટે અમારી વેબસાઈટ ની મુલાકાત ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’લો .

|-
| 01:16
| શીખનારાઓ ખાસ નોંધ લો : આ શ્રેણીના અગાઉના થોડાક ટ્યૂટોરિઅલ્સ ''' Windows OS''' ઉપર બનાવેલ છે.

|-
| 01:24
| જો કે હવે , અહીંથી, આ શ્રેણી ''' Ubuntu Linux OS''' ઉપર પૂર્ણ થશે.

|-
| 01:30
| ચાલો હવે '''CellDesigner'''માં ''' કોમ્પોનેન્ટ્સ (components) ને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએ.

|-
| 01:35
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:41
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:52
| '''CellDesigner ''' વીન્ડોવ (window)તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:56
| આપણે અગાઉથી બનાવેલ ફાઈલ '''Create and Edit '''ને ચાલો હવે ખોલીએ.

|-
| 02:02
| તો '''File''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Open''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:07
| ''' Open'''નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:11
| અહીં, આપણને ‘'''Folders’ ''' શીર્ષક નીચેથી આપણું ફોલ્ડર સિલેક્ટ કરવું પડશે.

|-
| 02:15
| ‘'''File’''' શીર્ષક નીચેના ''''Create_and_Edit.xml'''' ફાઈલ ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી ‘'''Ok’''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| આપણી ફાઈલ '''Create_and_Edit.xml ''' હવે Draw વિસ્તારમાં ખુલે છે.

|-
| 02:35
| કમ્પાર્ટમેન્ટને સિલેક્ટ કરો.''' Main Menu ''' બારમાંના '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:43
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Change to OVAL'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:48
| Draw વિસ્તારની ઉપર, આપણી પાસે હવે '''Oval''' Compartment છે.

|-
| 02:54
| color અથવા thickness બદલવા ,main menu બારમાં “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 03:00
| “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:05
| બીજી રીતે , કમ્પાર્ટમેન્ટની સીમારેખા(boundary) ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| ''''Change color & shape'''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:20
| એકદમ પાતળી સીમારેખા માટે, '''Membrane Thickness'''ને 12 થી 8 અથવા તેનાથી પણ ઓછી રાખો.

|-
| 03:29
| color બદલવા , ''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:34
| ''' Color panel''' માં એક હૅન્ડલ જેવા પોઇન્ટર સાથેનું એક '''Color wheel''' છે.

|-
| 03:39
| પોઇન્ટર ઉપર ક્લિક કરી તેને પકડી રાખો અને તમને ગમતા રંગને સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:46
| તમામ ફેરફારો થઇ ગયા બાદ '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''''Ok'''' ક્લિક કરો.

|-
| 03:53
| હવે '''Reaction ''' ટૂલબાર ઉપર વિવિધ ''' Compartments''' ડ્રો કરવા બીજા વિકલ્પો વિષે તમે જાતે જ શોધ કરો.

|-
| 04:00
| હવે આપણે ''' Species'''ના '''change the identity''' વિશે શીખીશું .

|-
| 04:05
| તો પહેલા આપણે ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ (window) ખોલીશુ.

|-
| 04:11
| ચાલો આ ફાઈલને નામ આપીએ , જેમકે '''Change Species'''.

|-
| 04:16
| આપણે '''width''' અને '''height'''ને ડિફોલ્ટ જ રાખીશું. અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:22
| હવે ટૂલ બારમાંના ''''Generic protein'''' આઇકનને ક્લિક કરીશું. '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| ડાયલોગ બોક્સમાં , ટાઈપ કરો ''' Pectin''' અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:37
| હવે ''' Generic protein Pectin''' ઉપર રાઈટ ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:41
| અને વિકલ્પ '''Change Identity''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:46
| ''''Change identity of the species'''' નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 04:53
| ''' Class box ''' માં નીચે જતા એરો ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:58
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી કોઈ પણ વિકલ્પ સિલેક્ટ કરીએ , ઉદાહરણ તરીકે , ''' simple molecule'''.

|-
| 05:05
| હવે આ ''' simple molecule''' ને ''' Name''' boxમાં નામ આપીએ.

|-
| 05:10
| તેને કહો ''' Fructose.''' '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ધ્યાનથી જુઓ આપણું ''' Protein Pectin''' હવે '''Fructose''' નામના ''' simple molecule'''માં પરિવર્તન પામી ગયું છે.

|-
| 05:25
| ચાલો હવે ''' Cut, Copy''' અને ''' Paste''' વિશે શીખીએ.

|-
| 05:29
| હું '''Draw''' વિસ્તારમાં પહેલેથી રહેલા '''Fructose'''નો જ ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 05:34
| ''' Species'''ને '''cut''' કરવા, પહેલા ''' Species Fructose''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:40
| '''Edit menu''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Cut''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:47
| યાદ રાખો કે '''Cut ''' માટેનું શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+X'''.

|-
| 05:53
| ''' Species Fructose ''' કટ થઇ જાય છે.

|-
| 05:56
| '''species'''ને '''paste ''' કરવા , પાછા ''''Edit'''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Paste''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:03
| નોંધ લો ''' Paste'''ની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+V'''.

|-
| 06:08
| ''' Species Fructose''' પાછી '''Draw''' વિસ્તારમાં દેખાય છે.

|-
| 06:12
| ''' Species'''ની કોપી બનાવવા , "main menu" બારના ''' Edit''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:18
| ''' Copy''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| નોંધ લો Copy માટેની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+C''' કોપી ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:31
| આ વખતે , ચાલો પેસ્ટ કરવા ''' Ctrl + V''' દબાવીએ .

|-
| 06:36
| હવે આપણી પાસે '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Fructose'''ની એક કોપી આવી ગઈ છે.

|-
| 06:40
| કોઈ પણ ક્રિયાને '''Undo''' કરવા '''Ctrl+Z''' અને કોઈ ક્રિયાને '''Redo''' કરવા '''Ctrl+Y''' દબાવો.

|-
| 06:51
|જો કે આ બધા મર્યાદિત ઉપયોગમાં આવે છે.

|-
| 06:55
| ચાલો હવે ''' Fructose molecules''' એસિડ ને '''Draw''' વિસ્તાર પર "drag'" અને "Move" કરીએ.

|-
| 07:00
| તે કરવા, ''' Fructose''' ઉપર ક્લિક કરો અને તેને નિશ્ચિત જગ્યાએ ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| આગળ આપણે શીખીશું , '''start-point''' અને '''end-point''' '''species''' શું છે અને '''species''' ને '''activate''' કેવી રીતે કરવું?

|-
| 07:13
| તે માટે , મેં અગાઉથી જ બે ''' generic proteins''' વચ્ચે ''' state transition reaction''' ડ્રો કર્યું છે.

|-
|   07:21
| મેં તેમને '''Protein 1''' અને '''Protein 2''' નામ આપ્યા છે.

|-
|   07:25
| યાદ કરો ,''' reaction''' કેવી રીતે ડ્રો કરવું તે આપણે અગાઉં જ શીખી લીધું છે.

|-
| 07:29
| ન જાણતા હોવ તો આ શ્રેણીના અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલ્સ નિહાળો. ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 07:35
| આ રિએક્શનમાં , ''' ‘Protein 1’''' એ ''' ‘start point’''' અને ''' Protein 2''' એ ''' ‘end point’''' છે.

|-
|   07:43
| ''' species''' ને એક્ટિવેટ કરવા ''' Species''' ઉપર ક્લિક કરો જે ''' Reaction'''નો ''' 'end-point'''' છે.

|-
| 07:50
| આપણા કેસમાં , તે ''' Protein 2''' છે.

|-
|   07:53
| તો ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરો અને કીબોર્ડપર '''A''' દબાવો.

|-
|   07:59
| હું આ ફેરફારને ''' Ctrl + Z''' કીઝ વડે '''undo''' કરી દઉં.

|-
|   08:05
| વૈકલ્પિક રીતે ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:09
| હવે પછી , '''main menu''' બાર ઉપર , '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 08:13
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Set Active''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:18
| ધ્યાનથી જુઓ ''' activated species''' આવા '''dashed line''' વડે આવરિત થયેલ છે.

|-
| 08:24
| ચાલો હવે ''' species, Protein 2'''ના '''color''' બદલીએ.

|-
| 08:29
| તો તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને ''''Change color and shape''''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:35
| અગાઉં જોયું તેમ , ''' Color''' પેનલમાં એક '''color wheel''' રહેલ છે.

|-
| 08:40
| તમને ગમતો રંગ પસંદ કરવા '''pointer '''ને ક્લિક કરી તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 08:44
| પછી '''Apply''' અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ''' species '''નો બદલાતો રંગ ધાયનથી જુઓ.

|-
| 08:53
| હવે આપણે જોઈશું કે ''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(Properties) કેવી રીતે બદલી શકાય.

|-
| 08:57
| ચાલો આપણે આપણા '''Draw ''' વિસ્તારમાં રહેલા ''' state transition reaction ''' ઉપર પાછા ફરીએ.

|-
| 09:03
| બે '''species'''ની વચ્ચે રહેલા '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
|   09:08
| હવે '''Change Identity''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|   09:13
| એક '''Change Properties of the Reaction''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   09:18
| '''Name''' બોક્સમાં રિએક્શનનું નામ આપો , ધારોકે ''' Reaction1'''

|-
|   09:26
| '''Type''' બોક્સ ડ્રોપ ડાઉન મેનુ માંથી તમને યોગ્ય લાગતું રિએક્શન પસંદ કરો , જેમકે ''' Transcription'''. ''''Ok'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   09:38
| ધ્યાનથી જુઓ '''draw''' વિસ્તારમાં ''' reaction''' બદલાઈ જાય છે.

|-
|   09:42
| આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં રિએક્શન એર્રોવ ઉપર આપેલ નામ હવે નથી જોઈ શકતા.

|-
|   09:47
| ચિંતા ન કરશો,તે વિશે આપણે હવેના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં શીખીશું.

|-
|   09:53
| ચાલો ફરી એકવાર '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને ''' Change Identity''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   10:00
| જો તે એક '''Reversible''' રિએક્શન હોય તો , ''' TRUE''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''Ok''' ક્લિક કરો.

|-
|   10:09
| તમે જોઈ શકશો કે રિએક્શન વિપરીત થઇ ગયું હશે.

|-
|   10:14
| ''' CellDesigner''' માંથી બહાર આવવા , ''' File''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Exit''' વિકલ્પ પસંદ કરો.

|-
| 10:20
| અથવા તો, તમે ''' Ctrl + Q''' દબાવો.

|-
| 10:25
| '''Confirmation''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલશે, જે તમને તમેં કરેલા ફેરફારોને સેવ કરવા માટે પૂછશે.

|-
| 10:32
| '''Yes''' ક્લિક કરો અને '''Ok''' બટન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 10:38
| તે કહેશે કે તમારી ફાઈલમાં બદલાવ થયેલ છે.

|-
| 10:41
| '''Save the changes?''' '''Yes''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 10:42
| સારાંશ જોઈએ : આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા :
|-
| 10:50
| '''draw''' વિસ્તારમાં અગાઉંથી સેવ કરેલ .xml ફાઈલ કેવી રીતે ખોલવી
|-
| 10:55
| ''' Compartment'''ના બોર્ડરના '''shape''', '''size''', '''color''' and '''thickness''' કેવી રીતે બદલવા

|-
| 11:01
| '''CellDesigner'''માં વિવિધ ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''identity'''માં ફેરફાર કરવા.

|-
| 11:07
| અને '''Species''' ને '''Cut''', '''Copy''' અને '''Paste''' કરવા
|-
| 11:10
| આપણે આ પણ શીખ્યા : '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ.

|-
| 11:15
| ''' Species'''ને કેવી રીતે '''Activate''' કરવું, ''' Species''' નો '''Color''' કેવી રીતે બદલવો, ''' Reaction'''ની '''Properties''' કેવી રીતે બદલવી અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 11:25
| તમારા અભ્યાસ માટે : એક ''' complex''' બનાવો અને ''' Complex''' માં ''' Species''' મુકો.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ 2: ટૂલબાર નું અન્વેષણ કરો અને રિએક્શન માં રિએક્ટન્ટ (reactant ) અને પ્રોડક્ટ (પ્રોડક્ટ) કેવી રીતે ઉમેવા તે શોધો.
|-
| 11:41
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાવો જોઈએ.

|-
| 11:45
| તમારો પૂર્ણ થયેલ પ્રથમ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાશે : એક ''' complex''' અને ''' Complex''' માં મુકેલા ''' Species''' .
|-
| 11:55
| અભ્યાસ 2 આ પ્રમાણે દેખાશે : ''' reactant''' અને ''' product''' સાથેનું એક '''state-transition reaction''' .

|-
| 12:00
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિશે જાણવા

|-
| 12:05
| આ લિંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો ડાઉનલોડ કરો અને નિહાળો. તે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 12:23
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 12:35
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Gujarati

2017-10-30T07:18:18Z

Shivanigada: Created page with " {| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટ..."

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| નમસ્તે મિત્રો. '''Create and Edit Components in CellDesigner'''ના આ ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં , આપણે શીખીશું : અગાઉથી સેવ કરેલી .xml ફાઈલને '''Draw''' વિસ્તારમાં ખોલવી.

|-
| 00:15
| '''compartment'''માં આ મુજબના ફેરફારો કરવા : બોર્ડરના shape, size, color અને thickness.

|-
| 00:22
| ''' CellDesigner'''માં વિવિધ પ્રકારની ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''Species'''ની ઓળખ(identity) બદલવી.

|-
| 00:28
| આપણે આ પણ શીખીશું કે '''Species'''ને કેવી રીતે કટ , કોપી અને પેસ્ટ કરવું, '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ વિષે જાણીશું.

|-
| 00:37
| ''' Species'''ને કેવી રીતે સક્રિય(activate) કરવું અને તેનો રંગ બદલવો,''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(properties) કેવી રીતે બદલવા અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 00:47
| અહીં હું '''Ubuntu Linux OS version 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:57
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરણ માટે તમે undergraduate ''' Biochemistry'''ના અને '''CellDesigner ''' ઇન્ટરફેઝના સાથે પરિચિત હોવા જરૂરી છો.

|-
| 01:05
| જો તમે ન જાણતા હોવ, તો તેને સંબંધિત ''' CellDesigner tutorials''' માટે અમારી વેબસાઈટ ની મુલાકાત ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’લો .

|-
| 01:16
| શીખનારાઓ ખાસ નોંધ લો : આ શ્રેણીના અગાઉના થોડાક ટ્યૂટોરિઅલ્સ ''' Windows OS''' ઉપર બનાવેલ છે.

|-
| 01:24
| જો કે હવે , અહીંથી, આ શ્રેણી ''' Ubuntu Linux OS''' ઉપર પૂર્ણ થશે.

|-
|01:30
| ચાલો હવે '''CellDesigner'''માં ''' કોમ્પોનેન્ટ્સ (components) ને ઉમેરીએ અને ફેરફાર કરીએ.

|-
| 01:35
| '''Ctrl+Alt+T''' કીઝ એકસાથે દબાવી '''terminal''' ને ખોલીએ.

|-
| 01:41
| હવે ટાઈપ કરીએ '''./runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવીએ.

|-
| 01:52
| '''CellDesigner ''' વીન્ડોવ (window)તમારા કોમ્પ્યુટર સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 01:56
| આપણે અગાઉથી બનાવેલ ફાઈલ '''Create and Edit '''ને ચાલો હવે ખોલીએ.

|-
| 02:02
| તો '''File''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Open''' ક્લિક કરો.

|-
| 02:07
| ''' Open'''નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 02:11
| અહીં, આપણને ‘'''Folders’ ''' શીર્ષક નીચેથી આપણું ફોલ્ડર સિલેક્ટ કરવું પડશે.

|-
| 02:15
| ‘'''File’''' શીર્ષક નીચેના ''''Create_and_Edit.xml'''' ફાઈલ ઉપર ક્લિક કરીએ અને પછી ‘'''Ok’''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| આપણી ફાઈલ '''Create_and_Edit.xml ''' હવે Draw વિસ્તારમાં ખુલે છે.

|-
| 02:35
| કમ્પાર્ટમેન્ટને સિલેક્ટ કરો.''' Main Menu ''' બારમાંના '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:43
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Change to OVAL'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 02:48
| Draw વિસ્તારની ઉપર, આપણી પાસે હવે '''Oval''' Compartment છે.

|-
| 02:54
| color અથવા thickness બદલવા ,main menu બારમાં “'''Component'''” ઉપર જાઓ.

|-
| 03:00
| “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:05
| બીજી રીતે , કમ્પાર્ટમેન્ટની સીમારેખા(boundary) ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને “'''Change color & shape'''” વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| ''''Change color & shape'''' નામનું એક ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 03:20
| એકદમ પાતળી સીમારેખા માટે, '''Membrane Thickness'''ને 12 થી 8 અથવા તેનાથી પણ ઓછી રાખો.

|-
| 03:29
| color બદલવા , ''' Color panel''' ઉપર જાઓ.

|-
| 03:34
| ''' Color panel''' માં એક હૅન્ડલ જેવા પોઇન્ટર સાથેનું એક '''Color wheel''' છે.

|-
| 03:39
| પોઇન્ટર ઉપર ક્લિક કરી તેને પકડી રાખો અને તમને ગમતા રંગને સિલેક્ટ કરવા તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 03:46
| તમામ ફેરફારો થઇ ગયા બાદ '''Apply''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી ''''Ok'''' ક્લિક કરો.

|-
| 03:53
| હવે '''Reaction ''' ટૂલબાર ઉપર વિવિધ ''' Compartments''' ડ્રો કરવા બીજા વિકલ્પો વિષે તમે જાતે જ શોધ કરો.

|-
| 04:00
| હવે આપણે ''' Species'''ના '''change the identity''' વિશે શીખીશું .

|-
| 04:05
| તો પહેલા આપણે ''' CTRL+N''' દબાવી નવી વીન્ડોવ (window) ખોલીશુ.

|-
| 04:11
| ચાલો આ ફાઈલને નામ આપીએ , જેમકે '''Change Species'''.

|-
| 04:16
| આપણે '''width''' અને '''height'''ને ડિફોલ્ટ જ રાખીશું. અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:22
| હવે ટૂલ બારમાંના ''''Generic protein'''' આઇકનને ક્લિક કરીશું. '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:30
| ડાયલોગ બોક્સમાં , ટાઈપ કરો ''' Pectin''' અને '''Ok''' બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:37
| હવે ''' Generic protein Pectin''' ઉપર રાઈટ ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:41
| અને વિકલ્પ '''Change Identity''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:46
| ''''Change identity of the species'''' નામનું ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે.

|-
| 04:53
| ''' Class box ''' માં નીચે જતા એરો ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:58
| ડ્રોપ ડાઉન મેનુમાંથી કોઈ પણ વિકલ્પ સિલેક્ટ કરીએ , ઉદાહરણ તરીકે , ''' simple molecule'''.

|-
| 05:05
| હવે આ ''' simple molecule''' ને ''' Name''' boxમાં નામ આપીએ.

|-
| 05:10
| તેને કહો ''' Fructose.''' '''Apply''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ધ્યાનથી જુઓ આપણું ''' Protein Pectin''' હવે '''Fructose''' નામના ''' simple molecule'''માં પરિવર્તન પામી ગયું છે.

|-
| 05:25
| ચાલો હવે ''' Cut, Copy''' અને ''' Paste''' વિશે શીખીએ.

|-
| 05:29
| હું '''Draw''' વિસ્તારમાં પહેલેથી રહેલા '''Fructose'''નો જ ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 05:34
| ''' Species'''ને '''cut''' કરવા, પહેલા ''' Species Fructose''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:40
| '''Edit menu''' ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Cut''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:47
| યાદ રાખો કે '''Cut ''' માટેનું શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+X'''.

|-
| 05:53
| ''' Species Fructose ''' કટ થઇ જાય છે.

|-
| 05:56
| '''species'''ને '''paste ''' કરવા , પાછા ''''Edit'''' મેનુ ઉપર જાઓ , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Paste''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:03
| નોંધ લો ''' Paste'''ની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+V'''.

|-
| 06:08
| ''' Species Fructose''' પાછી '''Draw''' વિસ્તારમાં દેખાય છે.

|-
| 06:12
| ''' Species'''ની કોપી બનાવવા , "main menu" બારના ''' Edit''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:18
| ''' Copy''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:21
| નોંધ લો Copy માટેની શોર્ટકટ કી છે ''' Ctrl+C''' કોપી ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Draw''' વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:31
| આ વખતે , ચાલો પેસ્ટ કરવા ''' Ctrl + V''' દબાવીએ .

|-
| 06:36
| હવે આપણી પાસે '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Fructose'''ની એક કોપી આવી ગઈ છે.

|-
| 06:40
| કોઈ પણ ક્રિયાને '''Undo''' કરવા '''Ctrl+Z''' અને કોઈ ક્રિયાને '''Redo''' કરવા '''Ctrl+Y''' દબાવો.

|-
| 06:51
|જો કે આ બધા મર્યાદિત ઉપયોગમાં આવે છે.

|-
| 06:55
| ચાલો હવે ''' Fructose molecules''' એસિડ ને '''Draw''' વિસ્તાર પર "drag'" અને "Move" કરીએ.

|-
| 07:00
| તે કરવા, ''' Fructose''' ઉપર ક્લિક કરો અને તેને નિશ્ચિત જગ્યાએ ડ્રેગ કરો.

|-
| 07:07
| આગળ આપણે શીખીશું , '''start-point''' અને '''end-point''' '''species''' શું છે અને '''species''' ને '''activate''' કેવી રીતે કરવું?

|-
| 07:13
| તે માટે , મેં અગાઉથી જ બે ''' generic proteins''' વચ્ચે ''' state transition reaction''' ડ્રો કર્યું છે.

|-
|   07:21
| મેં તેમને '''Protein 1''' અને '''Protein 2''' નામ આપ્યા છે.

|-
|   07:25
| યાદ કરો ,''' reaction''' કેવી રીતે ડ્રો કરવું તે આપણે અગાઉં જ શીખી લીધું છે.

|-
| 07:29
| ન જાણતા હોવ તો આ શ્રેણીના અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલ્સ નિહાળો. ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 07:35
| આ રિએક્શનમાં , ''' ‘Protein 1’''' એ ''' ‘start point’''' અને ''' Protein 2''' એ ''' ‘end point’''' છે.

|-
|   07:43
| ''' species''' ને એક્ટિવેટ કરવા ''' Species''' ઉપર ક્લિક કરો જે ''' Reaction'''નો ''' 'end-point'''' છે.

|-
| 07:50
| આપણા કેસમાં , તે ''' Protein 2''' છે.

|-
|   07:53
| તો ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરો અને કીબોર્ડપર '''A''' દબાવો.

|-
|   07:59
| હું આ ફેરફારને ''' Ctrl + Z''' કીઝ વડે '''undo''' કરી દઉં.

|-
|   08:05
| વૈકલ્પિક રીતે ''' Protein 2''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:09
| હવે પછી , '''main menu''' બાર ઉપર , '''Component''' ઉપર જાઓ.

|-
| 08:13
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Set Active''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:18
| ધ્યાનથી જુઓ ''' activated species''' આવા '''dashed line''' વડે આવરિત થયેલ છે.

|-
| 08:24
| ચાલો હવે ''' species, Protein 2'''ના '''color''' બદલીએ.

|-
| 08:29
| તો તેના ઉપર રાઈટ ક્લિક કરો અને ''''Change color and shape''''ને ક્લિક કરો.

|-
| 08:35
| અગાઉં જોયું તેમ , ''' Color''' પેનલમાં એક '''color wheel''' રહેલ છે.

|-
| 08:40
| તમને ગમતો રંગ પસંદ કરવા '''pointer '''ને ક્લિક કરી તેને ગોળ ફેરવો.

|-
| 08:44
| પછી '''Apply''' અને '''Ok''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:49
| ''' species '''નો બદલાતો રંગ ધાયનથી જુઓ.

|-
| 08:53
| હવે આપણે જોઈશું કે ''' Reaction'''ના ગુણધર્મો(Properties) કેવી રીતે બદલી શકાય.

|-
| 08:57
| ચાલો આપણે આપણા '''Draw ''' વિસ્તારમાં રહેલા ''' state transition reaction ''' ઉપર પાછા ફરીએ.

|-
| 09:03
| બે '''species'''ની વચ્ચે રહેલા '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો.

|-
|   09:08
| હવે '''Change Identity''' વિકલ્પ સિલેક્ટ કરો.

|-
|   09:13
| એક '''Change Properties of the Reaction''' નામનો ડાયલોગ બોક્સ દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
|   09:18
| '''Name''' બોક્સમાં રિએક્શનનું નામ આપો , ધારોકે ''' Reaction1'''

|-
|   09:26
| '''Type''' બોક્સ ડ્રોપ ડાઉન મેનુ માંથી તમને યોગ્ય લાગતું રિએક્શન પસંદ કરો , જેમકે ''' Transcription'''. ''''Ok'''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   09:38
| ધ્યાનથી જુઓ '''draw''' વિસ્તારમાં ''' reaction''' બદલાઈ જાય છે.

|-
|   09:42
| આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં રિએક્શન એર્રોવ ઉપર આપેલ નામ હવે નથી જોઈ શકતા.

|-
|   09:47
| ચિંતા ન કરશો,તે વિશે આપણે હવેના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં શીખીશું.

|-
|   09:53
| ચાલો ફરી એકવાર '''reaction arrow''' ઉપર રાઈટ-ક્લિક કરો અને ''' Change Identity''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
|   10:00
| જો તે એક '''Reversible''' રિએક્શન હોય તો , ''' TRUE''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો અને '''Ok''' ક્લિક કરો.

|-
|   10:09
| તમે જોઈ શકશો કે રિએક્શન વિપરીત થઇ ગયું હશે.

|-
|   10:14
| ''' CellDesigner''' માંથી બહાર આવવા , ''' File''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Exit''' વિકલ્પ પસંદ કરો.

|-
| 10:20
| અથવા તો, તમે ''' Ctrl + Q''' દબાવો.

|-
| 10:25
| '''Confirmation''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલશે, જે તમને તમેં કરેલા ફેરફારોને સેવ કરવા માટે પૂછશે.

|-
| 10:32
| '''Yes''' ક્લિક કરો અને '''Ok''' બટન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 10:38
| તે કહેશે કે તમારી ફાઈલમાં બદલાવ થયેલ છે.

|-
| 10:41
| '''Save the changes?''' '''Yes''' ને ક્લિક કરો.

|-
| 10:42
| સારાંશ જોઈએ : આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા :
|-
| 10:50
| '''draw''' વિસ્તારમાં અગાઉંથી સેવ કરેલ .xml ફાઈલ કેવી રીતે ખોલવી
|-
| 10:55
| ''' Compartment'''ના બોર્ડરના '''shape''', '''size''', '''color''' and '''thickness''' કેવી રીતે બદલવા

|-
| 11:01
| '''CellDesigner'''માં વિવિધ ફાઇલ્સ બનાવવી અને '''identity'''માં ફેરફાર કરવા.

|-
| 11:07
| અને '''Species''' ને '''Cut''', '''Copy''' અને '''Paste''' કરવા
|-
| 11:10
| આપણે આ પણ શીખ્યા : '''Species'''ના સ્ટાર્ટ-પોઇન્ટ અને એન્ડ-પોઇન્ટ.

|-
| 11:15
| ''' Species'''ને કેવી રીતે '''Activate''' કરવું, ''' Species''' નો '''Color''' કેવી રીતે બદલવો, ''' Reaction'''ની '''Properties''' કેવી રીતે બદલવી અને ''' File'''ને બંધ કેવી રીતે કરવી.

|-
| 11:25
| તમારા અભ્યાસ માટે : એક ''' complex''' બનાવો અને ''' Complex''' માં ''' Species''' મુકો.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ 2: ટૂલબાર નું અન્વેષણ કરો અને રિએક્શન માં રિએક્ટન્ટ (reactant ) અને પ્રોડક્ટ (પ્રોડક્ટ) કેવી રીતે ઉમેવા તે શોધો.
|-
| 11:41
| તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાવો જોઈએ.

|-
| 11:45
| તમારો પૂર્ણ થયેલ પ્રથમ અભ્યાસ આ પ્રમાણે દેખાશે : એક ''' complex''' અને ''' Complex''' માં મુકેલા ''' Species''' .
|-
| 11:55
| અભ્યાસ 2 આ પ્રમાણે દેખાશે : ''' reactant''' અને ''' product''' સાથેનું એક '''state-transition reaction''' .

|-
| 12:00
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિશે જાણવા

|-
| 12:05
| આ લિંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો ડાઉનલોડ કરો અને નિહાળો. તે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ વિષે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં લખો : [mail માટે :contact@spoken-tutorial.org]

|-
| 12:23
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટ એ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 12:35
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Getting-Started-with-CellDesigner/Gujarati

2017-10-10T08:14:37Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
| ‘’’ Getting started with CellDesigner ‘’’ પરના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું : સેલડિઝાઈનર ''' Menu ''' અને ''' Tool ''' બાર્સ.

|-
| 00:13
| સેલડિઝાઈનરમાં કાર્યકારવાની જગ્યામાં રહેલા જુદા જુદા ''' areas '''.

|-
| 00:17
| સેલડિઝાઈનરના Components જેમાં સમાવેશ થાય છે : ''' Species ''' અને ''' Reactions '''.

|-
|00:23
| એક સામાન્ય નેટવર્ક કેવી રીતે બનાવવું તે પણ આપણે જોઈશું.

|-
| 00:27
|નેટવર્કસેવ કેવી રીતે કરવું તે

|-
| 00:29
| એક આકૃતિની નિકાસ કેવી રીતે કરવી

|-
| 00:30
| નેટવર્કને કેવી રીતે ઝૂમ કરવું.

|-
| 00:33
| CellDesigner એ જિન-રેગ્યૂલેટ્રી અને બાયોકેમિકલ નેટવર્ક દોરવા માટેનું એક પ્રક્રિયા આધારિત રેખાકૃતિ સંપાદક(પ્રોસેસ ડાયેગ્રામ એડિટર)છે.

|-
| 00:40
|પ્રક્રિયા આધારિત રેખાકૃતિ કિટાનોએ સૂચવેલ છે. આ રેખાકૃતિઓ ''' Systems Biology Markup Language ''' (SBML) દ્વારા સંગ્રહિત કરવામાં આવે છે.

|-
| 00:50
| હું વિન્ડોવ્સ એક્સપી અને સેલડિઝાઈનર 4.2 વાપરી રહી છું. સેલડિઝાઈનર લીનક્સ અને મેક ઓએસ એક્સ ઉપર પણ કામ કરે છે.

|-
| 01:00
| સેલડિઝાઈનરને ખોલવા કરવા, ડેસ્કટોપ ઉપર રહેલા સેલડિઝાઈનર શોર્ટકટના આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|આ સેલડિઝાઈનરને ખોલશે,હવે ચાલો આનું નિરીક્ષણ કરીએ.

|-
| 01:12
| ''' Menu ''' બાર ઉપર તમે વિવિધ મેનુ વિકલ્પો જોઈ શકો છો, જેવાકે ''' File, Edit, Component ,View, Database ''' અને બીજા અન્ય.

|-
| 01:24
|''' Main Menu''' ની નીચે તમે વિવિધ ''' Toolbars ''' જોઈ શકો છો.

|-
| 01:30
| આ ''' Toolbars ''' છે જે ''' editing, species, reactions, compartments ''' વગેરે.

|-
| 01:38
| જેમ જેમ આગળ જઈશું આપણે એમાંના થોડા ક વિશે શીખીશું.

|-
| 01:42
| ચાલો સેલડિઝાઈનરના કાર્ય કરવાની જગ્યાના વિવિધ વિસ્તારો વિશે શીખીએ.

|-
| 01:48
| જેવું કે તમે અહીં જુઓ છો અહીં 5 વિસ્તાર છે.

|-
| 01:52
| જે જમણા હાથ તરફ છે તે છે ''' Draw ''' વિસ્તાર(Area).

|-
| 01:55
| આ એ જગ્યા છે જ્યાં આપણે નેટવર્કો આલેખિત કરીશું.

|-
| 01:58
|જે પણ આકારો તમે Draw વિસ્તાર માં જુઓ છો, દાખલ તરીકે - લંબચોરસ,લંબગોળ અથવા રેખાખંડ , એને ''' Component ''' કહેવાય છે.

|-
| 02:08
| ''' Component ''' એ એક સામાન્ય શબ્દ છે જે ''' species, reactions ''' અથવા ''' compartment ''' સૂચવે છે.

|-
| 02:14
| સેલડિઝાઈનર વેબસાઈટ પરથી કોઈ પણ આ બધા ચિહ્નો અને તેના અર્થ ની યાદી જોઈ શકે છે- જે છે www.celldesigner.org

|-
| 02:29
|હું ''' Documents ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:33
|હવે ચાલો સ્ટાર્ટઅપ ગાઈડ ઉપર ક્લિક કરીએ. જે પણ બીજા ટેબ ઉપર છે.

|-
| 02:40
|હું સીધી પૃષ્ઠ આંક 82 ઉપર જઈશ.

|-
| 02:45
|અહીં તમે વિવિધ ચિહ્નો અને તેના અર્થ જોઈ શકો છો.

|-
| 02:51
|ચાલો પાછા સેલડિઝાઈનર વિન્ડો ઉપર જઈએ.

|-
|02:55
| ''' Draw ''' વિસ્તારની નીચે છે ''' List ''' વિસ્તાર.

|-
| 02:59
|અહીં તમે મોડેલના કમ્પોનંટ્સ(ઘટકો) અને ફંક્શન્સ(ક્રિયાઓ)ની સૂચિ દર્શાવી તથા તેમાં ફેરફાર કરી શકો છો.

|-
| 03:06
|''' Notes ''' વિસ્તારનો ઉપયોગ ''' component ''' ની નોંધ બતાવવા અને તેમાં ફેરફાર કરવા વપરાય છે.

|-
| 03:12
| ડાબા હાથ તરફ, એક ''' Tree ''' વિસ્તાર છે જે ઘટકોને એક વૃક્ષની રચનારૂપે સૂચિત કરે છે.

|-
| 03:21
| તેના નીચે Layer વિસ્તાર છે જે મોડેલના બધા સ્તરો પ્રદર્શિત કરે છે.

|-
| 03:27
| આ વિસ્તારોના માપ આપણે બોર્ડરલાઇનને ખેંચીને નાના-મોટા કરી શકીએ છીએ .

|-
| 03:33
| હું આ બોર્ડરલાઈન ઉપર મારુ કર્સર મુકું છું. તમે બે માથા વાળો એરો જોઈ શકો છો. વિસ્તારને મેક્સિમાઈઝ અને મિનિમાઈઝ કરવા માટે ડ્રેગ કરો.

|-
| 03:45
| ''' List ''' અને ''' Notes ''' વિસ્તારોના સ્થળ બદલવા

|-
| 03:50
| ''' View ''' વિકલ્પમાં જાઓ >>''' List ''' ને ક્લિક કરો અને ''' Right ''' ને પસંદ કરો.

|-
| 03:56
| તે યાદીને જમણી તરફ બદલી કાઢશે. નીચેની તરફ હોવું એ ડિફોલ્ટ છે.

|-
| 04:00
|ચાલો આપણે પાછા સ્લાઈડ ઉપર જઈએ.

|-
| 04:05
|આ એક સામાન્ય નેટવર્ક છે જે આપણે બનાવીશું.

|-
| 04:10
| આ નેટવર્કમાં પ્રોટીન A, પ્રોટીન C નાં કેટાલિસિસ (ઉદ્દીપન) અંતર્ગત પ્રોટીન B ની સ્ટેટ ટ્રાન્ઝીશન (સંક્રમણ અવસ્થા) માંથી પસાર થાય છે.

|-
| 04:21
| પ્રોટીન B બદલામાં પ્રોટીન Dની સ્ટેટ ટ્રાન્ઝીશન માંથી પસાર થાય છે.

|-
| 04:27
| આ ટ્રાન્ઝીશન પ્રોટીન E દ્વારા ઈન્હિબિટેડ(અવરોધાય) થાય છે.

|-
| 04:32
| ચાલો આ નેટવર્ક બનાવીએ.

|-
| 04:34
| હું પાછી સેલડિઝાઈનર વિન્ડો ઉપર જઈશ.

|-
| 04:39
| હવે '' File '' અને ત્યારબાદ ''' New ''' પર ક્લિક કરો.

|-
| 04:43
| ''' New Document ''' નામનો એક નાનો ડાયલોગ બોક્સ ખુલશે.

|-
| 04:48
| આ ''' name ''' વિભાગ છે.

|-
| 04:50
| હું ટાઈપ કરીશ ''' simple network '''.

|-
| 04:53
| અહીં કોઈ ઊંચાઈ અને પહોળાઈ જોઈએ એ મુજબ બદલી શકે છે. જોકે હું જે ડિફોલ્ટ ઊંચાઈ અને પહોળાઈ છે તે જ રાખું છું.

|-
| 05:03
|"OK " ક્લિક કરીએ. તમે ઉપર ''' Draw ''' વિસ્તારના ડાબી બાજુએ ખૂણામાં નામ જોઈ શકો છો.

|-
| 05:12
|હવે,''' Edit ''' ઉપર જાઓ,અને ''' Grid snap ''' અને''' Grid visible ''' ને એનેબલ(કાર્યરત) કરો.

|-
| 05:21
| એક ગ્રીડ(જાળી) તમને ''' Draw ''' વિસ્તારમાં દ્રશ્યમાન થશે.

|-
| 05:25
|''' Grid snap ''' કમ્પોનંટ્સને ગ્રીડ સાથે યોગ્ય રીતે સંરેખિત કરશે.

|-
| 05:29
| એકવાર નેટવર્ક તૈયાર થઇ જાય પછી તમે ''' Grid visible'''' ને ના પસંદ કરી શકો છો.

|-
| 05:34
| કમ્પોનંટ્સ ઉમેરવાનું શરુ કરતા પહેલા,ચાલો હું તમને સ્પીશિસ અને રિએક્શન્સના થોડાક ઉદાહરણો બતાવું.

|-
| 05:42
| ચાલો પહેલા જોઈએ સ્પીશિસ.

|-
| 05:45
| અહીં જે ચિહ્નો છે તે છે '''generic protein, receptor, ion channel, truncated protein, gene, RNA ''' વગેરે.

|-
| 05:58
| હવે રિએક્શન્સ(પ્રતિક્રિયાઓ) જોઈએ જેમાં પ્રથમ છે''' State transition, Heterodimer association, Dissociation, Catalysis, Inhibition ''' વગેરે.

|-
| 06:11
| આપણે ''' Species ''' ટૂલ બારમાનો પ્રથમ આઇકોન તેને ક્લિક કરીને પસંદ કરીશું. આ આઇકોન પ્રોટીન માટે છે.

|-
| 06:22
| ''' Draw ''' વિસ્તારમાં ક્યાં પણ ક્લિક કરો જ્યાં તમારે આ સ્પીશિસ મૂકવું છે.

|-
| 06:28
| હું તેને '' Draw ''' વિસ્તારની ડાબી બાજુએ મુકીશ.

|-
| 06:33
| એન નાનો ડાયલોગ બોક્સ ખુલશે જે સ્પીશિસના નામ માટે પૂછશે.

|-
| 06:39
| હું તે નવા સ્પીશિસને ''' A ''' નામ આપીશ અને ''' OK ''' ક્લિક કરીશ..

|-
| 06:46
| List વિસ્તારમાં થયેલો ફેરફાર પણ જુઓ.

|-
| 06:50
| તમે જોઈ શકો છો કે આપણે ''' Draw ''' વિસ્તારમાં નવું સ્પીશિસ ઉમેર્યું. તે જ રીતે હું''' B ''' ઉમેરીશ.

|-
| 06:58
| તમારે કમ્પોનન્ટને એડિટ (બદલવા) અથવા મુવ(ખસેડતા) કરતા પહેલા તેને સિલેક્ટ કરવો પડશે.

|-
| 07:03
| કમ્પોનન્ટને પસંદ કરવા તેને ક્લિક કરો. પૂરું ધ્યાન રાખજો કે સિલેક્ટ કરેલ આઇકોન ON હોય તમે કરો તે પહેલા.

|-
| 07:12
| મારે A ની બાજુમાં B મૂકવું છે. તેથી B ઉપર ક્લિક કરી તેને સિલેક્ટ કરીએ.

|-
| 07:17
| હવે તેને ડ્રેગ અને A પછી મુકો.

|-
| 07:21
| હવે આપણે જોઈશું કે કમ્પોનન્ટનું માપ કેવી રીતે બદલવું.

|-
| 07:24
| હું ''' A ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.. આપણે તેના ઉપર નાના ચોકઠાંઓ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 07:29
| આ માપ બદલવાના હેન્ડલર્સ(હાથાઓ) છે.

|-
| 07:32
| હું આ કિનારી ઉપર કર્સર મૂકી તેને ડ્રેગ કરીશ.

|-
| 07:36
| આપણે ''' A ''' નું માપ બદલાયેલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 07:39
| કમ્પોનન્ટનું માપ બદલવાની બીજી અન્ય રીત પણ છે જે આપણે પછી બીજા ટ્યૂટોરિઅલમાં જોઈશું.

|-
| 07:46
| તમે તેને પહેલા જેવી પરિસ્થિતિમાં પાછું લાવી શકો છો ''' Ctrl-Z ''' દબાવીને.

|-
| 07:52
| જો પાછું મોટું કરવું હોય તો ''' Ctrl-Y ''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:54
| તમે આ સીધા ''' undo ''' અને ''' re-do ''' ના આઇકોન્સ ક્લિક કરીને પણ કરી શકો છો.

|-
| 08:03
| હવે ચાલો રિએક્શન્સ ઉમેરીએ.

|-
| 08:06
| રિએક્શન એ બે વસ્તુઓ વચ્ચે થતી પારસ્પરિક ક્રિયા છે.

|-
| 08:09
| આ છે સ્ટેટ ટ્રાન્સીશન રિએક્શન(અવસ્થા સંક્રમણ પ્રતિક્રિયા)

|-
| 08:12
|તો હું ''' Reaction '''ટૂલ બાર માના ''' State transition ''' ના આઇકોન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 08:18
| ''' A ''' અને ''' B''' ની કોઈ પણ કિનારી ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 08:23
| આમ તમે જોઈ શકો છો કે રિએક્શન બાતવતું તીર A અને B ને જોડે છે.

|-
| 08:30
| જે કમ્પોનન્ટ પહેલા પસંદ કરેલ છે તેને રિએક્ટન્ટ તરીકે મનાય છે.

|-
| 08:35
| તેથી હંમેશા રિએક્ટન્ટસને પહેલા પસંદ કરવું યાદ રાખો.

|-
| 08:39
| ડિફોલ્ટ રિએક્શનનો આઈડી ''' re1 ''' તરીકે આવે છે.

|-
| 08:43
| હવે ચાલો સ્પીશિસ ''' C ''' ઉમેરીએ અને તેને યોગ્ય જગ્યાએ સ્લાઈડમાં અગાઉ જોયું એ પ્રમાણે મૂકીએ.

|-
| 08:54
| હું ''' Reaction ''' ટૂલ બારમાંથી આ આઇકોનને સિલેક્ટ કરું છું. તે ''' Catalysis ''' માટે છે.

|-
|09:00
|હું ''' C''' ની કિનારી ઉપર ક્લિક કરીશ., અને ''' State transition ''' રિએક્શનના આ ચોરસ ચિહન ઉપર.

|-
| 09:08
| હવે હું સ્પીશિસ ''' D ''' ઉમેરીશ અને તેને ''' B ''' ની બાજુમાં મુકીશ.

|-
| 09:15
| ચાલો હવે ''' B ''' થી ''' D ''' માટે ''' State transition ''' રિએક્શન ઉમેરીએ ડિફોલ્ટ રિએક્શન આઈડી ''' re2 ''' છે.

|-
| 09:26
| હવે હું સ્પીશિસ E ઉમેરીશ અને તેને તેની યોગ્ય જગ્યા એ મુકીશ અગાઉ સ્લાઈડમાં જોયું તે પ્રમાણે.

|-
| 09:35
| હવે હું આ ''' Reaction ''' ટૂલ બારમાના આ આઇકોનને પસંદ કરીશ, જે ''' Inhibition reaction ''' ને દર્શાવે છે.

|-
| 09:44
| હું હવે Eની કિનારીને ક્લિક કરીશ. અને આ State transitionના આ ચોરસ ચિહનને. જે આ બંને બિંદુઓને જોડશે.

|-
| 09:54
| હવે આપણે આ સામાન્ય નેટવર્ક જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 09:57
|ચાલો આપણું કામ સેવ કરીએ.

|-
| 10:00
| '''File''' ઉપર જાઓ. '''Save as''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:04
| હું તેને “'''Simple Network”''' નામ આપીશ.

|-
| 10:06
|આ આપણા કામને '''.xml ''' ફોર્મેટથી સેવ કરશે. '''Save.''' ક્લિક કરો.

|-
| 10:12
|હવે આપણે શીખીશું કે કોઈ આકૃતિને કેવી રીતે સમાવવી. તે કરવા, ''' File > Export Image ''' માં જાઓ.

|-
| 10:22
| તમે આકૃતિને વિવિધ બંધારણોમાં સેવ કરી શકો છો જેવાકે pdf, png, jpeg વગેરે..

|-
| 10:29
| હું તેને ''' jpeg ''' આકૃતિ તરીકે સેવ કરીશ. '''Save''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 10:35
| ચાલો જોઈએ કે નેટવર્કને ઝૂમ( ઝીણવટ પૂર્વક) કરીને કેવી રીતે જોઈ શકાય!

|-
| 10:38
| આપણી પાસે ચાર વિકલ્પો છે ઝૂમ માટે - ''' Zoom In, Zoom Out, Zoom Fit. Zoom Reset '''.

|-
| 10:47
|હું ''' Zoom In ''' આઇકોન ઉપર બે વખત ક્લિક કરીશ.। આપણે મોટી થયેલી આકૃતિ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 10:54
| હવે ''' Zoom Reset ''' ઉપર ક્લિક કરીએ નેટવર્ક તેની અગાઉની સામાન્ય સ્થિતિમાં પાછું આવી જાય છે.

|-
| 11:02
| તો આની સાથે આપણે આ ''' Getting started with CellDesigner ''' ટ્યૂટોરિઅલના અંતે પોહચી ગયા.

|-
| 11:08
| સારાંશમાં, આપણે સેલડિઝાઇનરના ''' Menu ''' અને ''' Tool Bar ''' વિષે શીખ્યા.

|-
| 11:14
| સેલડિઝાઇનર માં જુદાજુદા વિસ્તારો. કમ્પોનંટ્સ જેવાકે "સ્પીશિસ" અને "રિએક્શન્સ".

|-
| 11:20
|આપણે એક સામાન્ય નેટવર્ક બનાવ્યું સ્પીશિસ અને કમ્પોનંટ્સની મદદથી.

|-
| 11:26
| આપણે ઝૂમ કરવાનું,નેટવર્કસેવ કરવાનું તથા આકૃતિના નિકાસ વિષે પણ શીખ્યા.

|-
| 11:32
| અસાઈન્મેન્ટ તરીકે CellDesigner 4.2 ના મદદથી એક નેટવર્ક બનાવો.

|-
| 11:39
| આ નેટવર્કમાં, કેટલિસ્ટ પ્રોટીન C ની હાજરીમાં, A અને B પ્રોટીનનો સહયોગ થઈને કોમપ્લેક્ષ (Complex1) નિર્માણ થાય છે.

|-
| 11:51
| આ કોમ્પ્લેક્સ ખરાબ થઇ જાય જ્યારે તેમાં કેટલિસ્ટ પ્રોટીન D રહેલ હોય.

|-
| 11:58
| તમને આ પ્રમાણેનું નેટવર્ક મળવું જોઈએ.

|-
| 12:01
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 12:13
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 12:28
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.

|-
| 12:41
| આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:53
|ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર।

|}

CellDesigner/C2/Getting-Started-with-CellDesigner/Gujarati

2017-10-10T08:13:27Z

Shivanigada:

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T11:05:21Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|નમસ્તે મિત્રો. '''Installation of CellDesigner on Linux OS'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''CellDesigner 4.3'''ને '''Ubuntu Linux Operating System'''માં ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવાનું શીખીશું.

|-
| 00:18
|અને '''CellDesigner'''ના '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Compartment''' બનાવવાનું પણ જોઈશું.

|-
| 00:23
| અહીં હું '''Ubuntu Operating System 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
|આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમેં '''Linux Operating System'''ના બેઝિક ઓપરેશનોના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:42
| જો તમે ન હોવ,તો તેને સંબંધિત '''Linux tutorials''' અમારી વેબસાઈટ '''www.spoken-tutorial.org''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 00:51
| '''CellDesigner'''ને ઇન્સ્ટોલ કરવા, તમારું વેબ બ્રાઉઝર(Web Browser) ખોલો અને જે '''URL''' દેખાય છે તેના ઉપર જાઓ.

|-
| 01:00
| જમણા હાથ તરફ રહેલ '''Download CellDesigner''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|એક નવું વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:09
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Download'''ને શોધો.

|-
| 01:13
| તે '''Download for Linux 64 bit''' અને '''Download for Linux 32 bit''' બતાવે છે.

|-
| 01:20
| હવે, આપણે જોઈએ કે તમારા મશીનના '''OS type'''ની વિગતો કેવી રીતે શોધાય.

|-
| 01:26
| આ માટે,તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:34
| '''System Settings'''ને ક્લિક કરતા એક પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:40
| પેનલ ''''System''''ની નીચે, ''''Details'''' આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:48
| અહીં નવી વીન્ડોવ ''''Details'''' ખુલે છે. તમારા મશીનની '''OS type'''’ ચેક કરો કે શું તે '''64-bit''' છે કે '''32-bit'''.

|-
| 02:00
| મારુ મશીન '''64 bit'''નું છે. હવે આ વીન્ડોવને બંધ કરી પાછા બ્રાઉઝર ઉપર જઈએ.

|-
| 02:07
| જો તમારું મશીન '''32 bit'''નું હોય તો '''32 bit version''' ડાઉનલોડ કરવાનું.

|-
| 02:14
| હું લિંક'''Download for Linux 64 bit ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:19
| તરત જ એક નવી વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 02:22
| હું એક નવી યુઝર હોવાથી, વિકલ્પ '''First Time User ''' ઉપર હું ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:26
| અને પછી '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 02:29
| હવે આપણને થોડીક વ્યક્તિગત વિગતો ભરવા માટે પૂછવામાં આવે છે.

|-
| 02:33
| તે ભર્યા પછી, '''Download ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:37
| એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.અહીં '''Save File''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| આ થોડીક ક્ષણ લેશે જે તમારા ઈન્ટરનેટની ગતિ ઉપર આધાર રાખે છે.

|-
| 02:49
| જેવી ફાઈલ ડાઉનલોડ થઇ જાય,'''Ctrl+Alt+T ''' કીઝ દબાવી '''terminal''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:58
| મેં પહેલેથી જ આ ફાઈલ ડાઉનલોડ કરી રાખી છે જે ડિફોલ્ટ ફોલ્ડર '''Downloads '''માં છે.

|-
| 03:04
| તો પહેલા હું તે ફોલ્ડરમાં જાઉં, ટાઈપ કરો '''cd space Downloads ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:15
| ટાઈપ કરો '''ls ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:20
| અહીં આ રહી આપણે ડાઉનલોડ કરેલી ફાઈલ.

|-
| 03:25
| જો તમે '''32 bit ''' ઇન્સ્ટોલર ડાઉનલોડ કરી હોત તો ફાઈલનું નામ '''64'''ની જગ્યા એ '''32''' હોત.

|-
| 03:32
| હવેથી ટર્મિનલ કમાન્ડમાં તમારા '''32 bit installer '''ના ફાઈલનું નામ વાપરવાનું યાદ રાખો.

|-
| 03:39
| હવે આપણે ફાઈલ પરમિશનને બદલવી પડશે તો ટાઈપ કરો.

|-
| 03:43
| '''sudo space chmod space 777 space hyphen capital R space CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run'''

|-
| 04:08
| '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:12
| '''admin''' પાસવર્ડ ટાઈપ કરો અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:19
| હવે આપણે ફાઈલને રન કરવા ટાઈપ કરીશું '''dot forward slash CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run ''' અને '''Enter''' દબાવીશું.

|-
| 04:39
| '''Setup wizard''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:43
| બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:47
| '''I accept the agreement ''' વિકલ્પ ક્લિક કરીએ અને પછી '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:54
| '''Installation Directory ''' ડાયલોગ આ ડાયરેક્ટરી બતાવે છે જ્યાં '''CellDesigner ''' ઇન્સ્ટોલ થશે.

|-
| 05:00
| તે આ રીતે દેખાશે '''<nowiki>/home/<your username>/CellDesigner4.3</nowiki>''' હવે '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:10
| તે કહે છે '''Ready to Install'''. પાછું '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ઈન્સ્ટોલેશન ચાલુ થશે.

|-
| 05:20
| જેવું પૂરું થાય, '''‘View Readme File’''' ને અનચેક કરો અને '''Finish''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 05:29
| હવે '''Ctrl + Alt + T ''' કીઝ દબાવી નવું '''terminal ''' ખોલો.

|-
| 05:34
| ટાઈપ કરો '''ls''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:39
| અહીં આપણે '''runCellDesigner4.3 ''' ફાઈલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 05:44
| '''CellDesigner'''ને ખોલવા આપણને આ ફાઈલ એગઝીક્યૂટ(execute) કરવી પડશે.

|-
| 05:48
| તો ટાઈપ કરો '''dot forward slash runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:00
| '''CellDesigner''' વીન્ડોવ આપણા '''Linux''' મશીનમાં હવે ખુલ્યું છે .

|-
| 06:05
| તમે ધ્યાનથી જુઓ કે આપણે '''Main menu''' બાર બરાબર જોઈ શકતા નથી. તેને જોવા માટે , આપણને '''system settings''' બદલવા પડશે.

|-
| 06:15
| તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 06:23
| ક્લિક કરતા '''System Settings''' પેજ ખુલે છે.

|-
| 06:28
| પેનલ ''''Personal'''' ની નીચે ''''Appearance'''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:34
| ''''Appearance'''' નામની વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 06:38
| ટેબ ''''Look''''ની નીચેના , '''Theme''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:43
| ''''Theme'''' બોક્સના ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી, ''''Radiance''''ને સિલેક્ટ કરો અને વીન્ડોવ બંધ કરો.

|-
| 06:53
| હવે ધ્યાનથી જુઓ '''Main menu''' બાર બરાબર દેખાય છે. ચાલો આગળ વધીએ હવે.

|-
| 07:01
| નવા ડોક્યુમેન્ટને ખોલવા , '''File''' ક્લિક કરો અને પછી '''New''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:07
| વૈકલ્પિક રીતે , મેનુ બાર ના '''New''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો અથવા '''Ctrl + N''' કીઝ દબાવો.

|-
| 07:16
| '''New Document''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે જે આપણેને કહે છે કે ફાઈલ નું નામ આપો.

|-
| 07:23
| ફાઈલનું નામ ''''Create and Edit'''' ટાઈપ કરો.

|-
| 07:30
| '''Width''' ને 900, '''Height''' ને 800 સેટ કરો.

|-
| 07:36
| નીચે રહેલા '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:40
| એક માહિતી આપતું બોક્સ(information box) ખુલે છે.

|-
| 07:43
| અને નામમાં આપણે આપેલ બધા સ્પેસીસ , બદલાઈને '''underscore''' થઇ જાય છે.

|-
| 07:48
| તો ખરેખર ફાઈલનું નામ થશે ''''Create underscore and underscore Edit''''. '''Ok''' ક્લિક કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 07:58
| કેન્દ્રમાં દેખાતો સફેદ વિભાગ છે તેને આપણે Draw વિભાગ તરીકે બોલીશું.

|-
| 08:02
| આપણે menu bars, toolbars અને વિવિધ panels ને હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખીશું.

|-
| 08:09
| ટૂલ બારના બીજા અન્ય આઇકોનને સિલેક્ટ કરતા પહેલા , '''Select Mode''' બટનને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:16
| તે એક સિલેક્શન ટૂલ તરીકે વર્તશે.આ સિલેક્શન ટૂલની મદદથી ,આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં કમ્પોનન્ટને Select ,Draw અને move કરી શકીએ.

|-
| 08:25
| કમ્પોનન્ટ ડ્રો કરતા પહેલા , આપણે ખાતરી કરીશું કે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાના '''Grid Snap''' અને '''Grid Visible''' એનેબલ છે કે નથી .

|-
| 08:35
| તે માટે "Main Menu " બારના '''Edit'''ને ક્લિક કરીએ .

|-
| 08:39
| નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને '''Grid Snap'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| પાછા '''Edit''' ઉપર જઈએ અને '''Grid Visible'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:49
| '''Grids''' આપણને Draw વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સને સરખું સંરેખિત રીતે ગોઠવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 08:54
| ચાલો હવે '''List '''અને '''Notes''' વિસ્તારના સ્થાન બદલીએ.

|-
| 08:59
| યાદ કરો કે આપણે '''List''' વિસ્તાર, '''Notes''' વિસ્તાર અને Draw વિસ્તાર અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલમાં જ શીખી લીધા છે.

|-
| 09:06
| જો તમને યાદ ન હોય તો આ શ્રેણીના તે ટ્યૂટોરિઅલને તમે નિહાળી શકો છો.

|-
| 09:12
| ચાલો આગળ વધીએ અને '''List''' વિસ્તારનું સ્થાન બદલીએ.

|-
| 09:15
| '''View''' વિકલ્પ ઉપર જાઓ, '''List '''ને ક્લિક કરો અને ‘'''Right’''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:24
| તે ‘'''List’'''ને '''Draw''' વિસ્તારની જમણી બાજુએ ખસેડે છે.

|-
| 09:30
| આ વિસ્તારોના માપ તેની બોર્ડરલાઈંસને ડ્રેગ કરી બદલી શકાય છે.

|-
| 09:35
| આપણે આ બોર્ડરલાઇન ઉપર કર્સર ખસેડીશું .

|-
| 09:38
| તમે બે મસ્તકવાળો એરો જોઈ શકો છો. તેને '''Draw''' વિસ્તારના મહત્તમ અથવા લઘુત્તમમાં ડ્રેગ કરો.

|-
| 09:45
| હવે આપણે '''Draw''' વિસ્તારમાં કામ કરવા ઉપર આગળ વધીશું.

|-
| 09:49
| તે પહેલા , આપણે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાં બધા જ આઇકોન્સને જોઈ શકીએ તેવું હોવું જોઈએ.

|-
| 09:55
| તે માટે, ''' Main Menu ''' બારમાંના '''View ''' ઉપર જાઓ.

|-
| 10:00
| '''Change Toolbar Visible''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Show All''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| હવે તમે '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર બધા જ આઇકોન્સ જોઈ શકો છો . ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 10:17
| એક '''cell''' અથવા એક '''intracellular compartment'''ને દર્શાવવા , આપણે ટૂલ બારમાંના '''Square''' આઇકોનનો ઉપયોગ કરીશું .તો પ્રથમ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:28
| પછી Draw વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ। અને માઉસનું બટન ચોદતા પહેલા, તેને ડ્રેગ કરો જેથી એક ચોરસ બનશે. હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 10:38
| જે ''''Property of Compartment'''' ડાયલોગ ખુલે છે તેમાં,'''Name'''ને '''Cell''' તરીકે લખો અને '''Size'''ને 1.0 આપી '''Ok.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:52
| નામ કમ્પાર્ટમેન્ટના નીચેના ભાગમાં દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 10:57
| તમે કમ્પાર્ટમેન્ટના નામનું સ્થાન પણ બદલી શકો.

|-
| 11:01
| તે કરવા, કમ્પાર્ટમેન્ટ નામને સિલેક્ટ કરો,જે આપણા કેસમાં '''Cell''' છે.

|-
| 11:07
| હવે તેને ડ્રેગ અને ડ્રોપ કરો જ્યાં તમને મૂકવું હોય.

|-
| 11:14
| હવે આ ફાઈલને સેવ કરવા '''File''' ઉપર ક્લિક કરીએ તેના '''Save As''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:22
| હવે તમારે કાયા ફોલ્ડરમાં સેવ કરવું છે તે પસંદ કરો.

|-
| 11:26
| મારે તેને મારા '''Desktop''' ઉપર જ સેવ કરવું છે.

|-
| 11:28
| તો હું ફોલ્ડર તરીકે '''Desktop ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીશ જેમાં મારે ફાઈલને સેવ કરવી છે.

|-
| 11:34
| અને પછી નીચે જમણી બાજુના '''Ok ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 11:38
| હજી પાછું એક વાર, નીચે જમણી બાજુના '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ। આપણી ફાઈલ હવે સેવ થઇ ગઈ છે.

|-
| 11:46
| '''CellDesigner'''ને બંધ કરવા , '''File ''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Exit'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 11:52
| હવે આપણે તે ફોલ્ડરમાં જઈએ જ્યાં આપણે ફાઈલને સેવ કરી છે. તો હું મારા '''Desktop''' ઉપર જાઉં .આ રહી મારી ફાઈલ.

|-
| 12:00
| નોંધ લો કે આ ફાઈલ '''.xml ''' ફોર્મેટમાં સેવ થઇ છે . તે '''CellDesigner '''ની ડિફોલ્ટ ફાઈલ ફોર્મેટ છે.

|-
| 12:08
| તે પણ નોંધ લો કે આ ફાઈલ માત્ર '''CellDesigner'''માં જ ખુલી શકે.

|-
| 12:12
| ચાલો સારાંશ લઈએ આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા : કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને

|-
| 12:17
| '''CellDesigner ''' આવૃત્તિ 4.3ને '''Ubuntu Linux OS ''' ઉપર ઇન્સ્ટોલ કરવું, '''CellDesigner '''માં '''Compartment''' બનાવવું

|-
| 12:27
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:35
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં '''spoken-tutorial.org''' ઉપર લખો.

|-
| 12:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી '''spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:57
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T11:04:54Z

Shivanigada:

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T11:02:59Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|નમસ્તે મિત્રો. '''Installation of CellDesigner on Linux OS'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''CellDesigner 4.3'''ને '''Ubuntu Linux Operating System'''માં ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવાનું શીખીશું.

|-
| 00:18
|અને '''CellDesigner'''ના '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Compartment''' બનાવવાનું પણ જોઈશું.

|-
| 00:23
| અહીં હું '''Ubuntu Operating System 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
|આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમેં '''Linux Operating System'''ના બેઝિક ઓપરેશનોના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:42
| જો તમે ન હોવ,તો તેને સંબંધિત '''Linux tutorials''' અમારી વેબસાઈટ '''www.spoken-tutorial.org''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 00:51
| '''CellDesigner'''ને ઇન્સ્ટોલ કરવા, તમારું વેબ બ્રાઉઝર(Web Browser) ખોલો અને જે '''URL''' દેખાય છે તેના ઉપર જાઓ.

|-
| 01:00
| જમણા હાથ તરફ રહેલ '''Download CellDesigner''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|એક નવું વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:09
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Download'''ને શોધો.

|-
| 01:13
| તે '''Download for Linux 64 bit''' અને '''Download for Linux 32 bit''' બતાવે છે.

|-
| 01:20
| હવે, આપણે જોઈએ કે તમારા મશીનના '''OS type'''ની વિગતો કેવી રીતે શોધાય.

|-
| 01:26
| આ માટે,તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:34
| '''System Settings'''ને ક્લિક કરતા એક પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:40
| પેનલ ''''System''''ની નીચે, ''''Details'''' આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:48
| અહીં નવી વીન્ડોવ ''''Details'''' ખુલે છે. તમારા મશીનની '''OS type'''’ ચેક કરો કે શું તે '''64-bit''' છે કે '''32-bit'''.

|-
| 02:00
| મારુ મશીન '''64 bit'''નું છે. હવે આ વીન્ડોવને બંધ કરી પાછા બ્રાઉઝર ઉપર જઈએ.

|-
| 02:07
| જો તમારું મશીન '''32 bit'''નું હોય તો '''32 bit version''' ડાઉનલોડ કરવાનું.

|-
| 02:14
| હું લિંક'''Download for Linux 64 bit ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:19
| તરત જ એક નવી વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 02:22
| હું એક નવી યુઝર હોવાથી, વિકલ્પ '''First Time User ''' ઉપર હું ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:26
| અને પછી '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 02:29
| હવે આપણને થોડીક વ્યક્તિગત વિગતો ભરવા માટે પૂછવામાં આવે છે.

|-
| 02:33
| તે ભર્યા પછી, '''Download ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:37
| એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.અહીં '''Save File''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| આ થોડીક ક્ષણ લેશે જે તમારા ઈન્ટરનેટની ગતિ ઉપર આધાર રાખે છે.

|-
| 02:49
| જેવી ફાઈલ ડાઉનલોડ થઇ જાય,'''Ctrl+Alt+T ''' કીઝ દબાવી '''terminal''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:58
| મેં પહેલેથી જ આ ફાઈલ ડાઉનલોડ કરી રાખી છે જે ડિફોલ્ટ ફોલ્ડર '''Downloads '''માં છે.

|-
| 03:04
| તો પહેલા હું તે ફોલ્ડરમાં જાઉં, ટાઈપ કરો '''cd space Downloads ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:15
| ટાઈપ કરો '''ls ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:20
| અહીં આ રહી આપણે ડાઉનલોડ કરેલી ફાઈલ.

|-
| 03:25
| જો તમે '''32 bit ''' ઇન્સ્ટોલર ડાઉનલોડ કરી હોત તો ફાઈલનું નામ '''64'''ની જગ્યા એ '''32''' હોત.

|-
| 03:32
| હવેથી ટર્મિનલ કમાન્ડમાં તમારા '''32 bit installer '''ના ફાઈલનું નામ વાપરવાનું યાદ રાખો.

|-
| 03:39
| હવે આપણે ફાઈલ પરમિશનને બદલવી પડશે તો ટાઈપ કરો.

|-
| 03:43
| '''sudo space chmod space 777 space hyphen capital R space CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run'''

|-
| 04:08
| '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:12
| '''admin''' પાસવર્ડ ટાઈપ કરો અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:19
| હવે આપણે ફાઈલને રન કરવા ટાઈપ કરીશું '''dot forward slash CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run ''' અને '''Enter''' દબાવીશું.

|-
| 04:39
| '''Setup wizard''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:43
| બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:47
| '''I accept the agreement ''' વિકલ્પ ક્લિક કરીએ અને પછી '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:54
| '''Installation Directory ''' ડાયલોગ આ ડાયરેક્ટરી બતાવે છે જ્યાં '''CellDesigner ''' ઇન્સ્ટોલ થશે.

|-
| 05:00
| તે આ રીતે દેખાશે '''<nowiki>/home/<your username>/CellDesigner4.3</nowiki>''' હવે '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:10
| તે કહે છે '''Ready to Install'''. પાછું '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ઈન્સ્ટોલેશન ચાલુ થશે.

|-
| 05:20
| જેવું પૂરું થાય, '''‘View Readme File’''' ને અનચેક કરો અને '''Finish''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 05:29
| હવે '''Ctrl + Alt + T ''' કીઝ દબાવી નવું '''terminal ''' ખોલો.

|-
| 05:34
| ટાઈપ કરો '''ls''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:39
| અહીં આપણે '''runCellDesigner4.3 ''' ફાઈલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 05:44
| '''CellDesigner'''ને ખોલવા આપણને આ ફાઈલ એગઝીક્યૂટ(execute) કરવી પડશે.

|-
| 05:48
| તો ટાઈપ કરો '''dot forward slash runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:00
| '''CellDesigner''' વીન્ડોવ આપણા '''Linux''' મશીનમાં હવે ખુલ્યું છે .

|-
| 06:05
| તમે ધ્યાનથી જુઓ કે આપણે '''Main menu''' બાર બરાબર જોઈ શકતા નથી. તેને જોવા માટે , આપણને '''system settings''' બદલવા પડશે.

|-
| 06:15
| તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 06:23
| ક્લિક કરતા '''System Settings''' પેજ ખુલે છે.

|-
| 06:28
| પેનલ ''''Personal'''' ની નીચે ''''Appearance'''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:34
| ''''Appearance'''' નામની વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 06:38
| ટેબ ''''Look''''ની નીચેના , '''Theme''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:43
| ''''Theme'''' બોક્સના ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી, ''''Radiance''''ને સિલેક્ટ કરો અને વીન્ડોવ બંધ કરો.

|-
| 06:53
| હવે ધ્યાનથી જુઓ '''Main menu''' બાર બરાબર દેખાય છે. ચાલો આગળ વધીએ હવે.

|-
| 07:01
| નવા ડોક્યુમેન્ટને ખોલવા , '''File''' ક્લિક કરો અને પછી '''New''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:07
| વૈકલ્પિક રીતે , મેનુ બાર ના '''New''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો અથવા '''Ctrl + N''' કીઝ દબાવો.

|-
| 07:16
| '''New Document''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે જે આપણેને કહે છે કે ફાઈલ નું નામ આપો.

|-
| 07:23
| ફાઈલનું નામ ''''Create and Edit'''' ટાઈપ કરો.

|-
| 07:30
| '''Width''' ને 900, '''Height''' ને 800 સેટ કરો.

|-
| 07:36
| નીચે રહેલા '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:40
| એક માહિતી આપતું બોક્સ(information box) ખુલે છે.

|-
| 07:43
| અને નામમાં આપણે આપેલ બધા સ્પેસીસ , બદલાઈને '''underscore''' થઇ જાય છે.

|-
| 07:48
| તો ખરેખર ફાઈલનું નામ થશે ''''Create underscore and underscore Edit''''. '''Ok''' ક્લિક કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 07:58
| કેન્દ્રમાં દેખાતો સફેદ વિભાગ છે તેને આપણે Draw વિભાગ તરીકે બોલીશું.

|-
| 08:02
| આપણે menu bars, toolbars અને વિવિધ panels ને હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખીશું.

|-
| 08:09
| ટૂલ બારના બીજા અન્ય આઇકોનને સિલેક્ટ કરતા પહેલા , '''Select Mode''' બટનને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:16
| તે એક સિલેક્શન ટૂલ તરીકે વર્તશે.આ સિલેક્શન ટૂલની મદદથી ,આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં કમ્પોનન્ટને Select ,Draw અને move કરી શકીએ.

|-
| 08:25
| કમ્પોનન્ટ ડ્રો કરતા પહેલા , આપણે ખાતરી કરીશું કે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાના '''Grid Snap''' અને '''Grid Visible''' એનેબલ છે કે નથી .

|-
| 08:35
| તે માટે "Main Menu " બારના '''Edit'''ને ક્લિક કરીએ .

|-
| 08:39
| નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને '''Grid Snap'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| પાછા '''Edit''' ઉપર જઈએ અને '''Grid Visible'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:49
| '''Grids''' આપણને Draw વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સને સરખું સંરેખિત રીતે ગોઠવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 08:54
| ચાલો હવે '''List '''અને '''Notes''' વિસ્તારના સ્થાન બદલીએ.

|-
| 08:59
| યાદ કરો કે આપણે '''List''' વિસ્તાર, '''Notes''' વિસ્તાર અને Draw વિસ્તાર અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલમાં જ શીખી લીધા છે.

|-
| 09:06
| જો તમને યાદ ન હોય તો આ શ્રેણીના તે ટ્યૂટોરિઅલને તમે નિહાળી શકો છો.

|-
| 09:12
| ચાલો આગળ વધીએ અને List વિસ્તારનું સ્થાન બદલીએ.

|-
| 09:15
| '''View''' વિકલ્પ ઉપર જાઓ, '''List '''ને ક્લિક કરો અને ‘'''Right’''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:24
| તે ‘'''List’'''ને Draw વિસ્તારની જમણી બાજુએ ખસેડે છે.

|-
| 09:30
| આ વિસ્તારોના માપ તેની બોર્ડરલાઈંસને ડ્રેગ કરી બદલી શકાય છે.

|-
| 09:35
| આપણે આ બોર્ડરલાઇન ઉપર કર્સર ખસેડીશું .

|-
| 09:38
| તમે બે મસ્તકવાળો એરો જોઈ શકો છો. તેને Draw વિસ્તારના મહત્તમ અથવા લઘુત્તમમાં ડ્રેગ કરો.

|-
| 09:45
| હવે આપણે Draw વિસ્તારમાં કામ કરવા ઉપર આગળ વધીશું.

|-
| 09:49
| તે પહેલા , આપણે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાં બધા જ આઇકોન્સને જોઈ શકીએ તેવું હોવું જોઈએ.

|-
| 09:55
| તે માટે, ''' Main Menu ''' બારમાંના '''View ''' ઉપર જાઓ.

|-
| 10:00
| '''Change Toolbar Visible''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Show All''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| હવે તમે '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર બધા જ આઇકોન્સ જોઈ શકો છો . ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 10:17
| એક cell અથવા એક intracellular compartmentને દર્શાવવા , આપણે ટૂલ બારમાંના '''Square''' આઇકોનનો ઉપયોગ કરીશું .તો પ્રથમ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:28
| પછી Draw વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ। અને માઉસનું બટન ચોદતા પહેલા, તેને ડ્રેગ કરો જેથી એક ચોરસ બનશે. હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 10:38
| જે ''''Property of Compartment'''' ડાયલોગ ખુલે છે તેમાં, '''Name'''ને '''Cell''' તરીકે લખો અને '''Size'''ને 1.0 આપી '''Ok.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:52
| નામ કમ્પાર્ટમેન્ટના નીચેના ભાગમાં દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 10:57
| તમે કમ્પાર્ટમેન્ટના નામનું સ્થાન પણ બદલી શકો.

|-
| 11:01
| તે કરવા, કમ્પાર્ટમેન્ટ નામને સિલેક્ટ કરો,જે આપણા કેસમાં '''Cell''' છે.

|-
| 11:07
| હવે તેને ડ્રેગ અને ડ્રોપ કરો જ્યાં તમને મૂકવું હોય.

|-
| 11:14
| હવે આ ફાઈલને સેવ કરવા '''File''' ઉપર ક્લિક કરીએ તેના '''Save As''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:22
| હવે તમારે કાયા ફોલ્ડરમાં સેવ કરવું છે તે પસંદ કરો.

|-
| 11:26
| મારે તેને મારા '''Desktop''' ઉપર જ સેવ કરવું છે.

|-
| 11:28
| તો હું ફોલ્ડર તરીકે '''Desktop ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીશ જેમાં મારે ફાઈલને સેવ કરવી છે.

|-
| 11:34
| અને પછી નીચે જમણી બાજુના '''Ok ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 11:38
| હજી પાછું એક વાર, નીચે જમણી બાજુના '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ। આપણી ફાઈલ હવે સેવ થઇ ગઈ છે.

|-
| 11:46
| '''CellDesigner'''ને બંધ કરવા , '''File ''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Exit'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 11:52
| હવે આપણે તે ફોલ્ડરમાં જઈએ જ્યાં આપણે ફાઈલને સેવ કરી છે. તો હું મારા '''Desktop''' ઉપર જાઉં .આ રહી મારી ફાઈલ.

|-
| 12:00
| નોંધ લો કે આ ફાઈલ '''.xml ''' ફોર્મેટમાં સેવ થઇ છે . તે '''CellDesigner '''ની ડિફોલ્ટ ફાઈલ ફોર્મેટ છે.

|-
| 12:08
| તે પણ નોંધ લો કે આ ફાઈલ માત્ર '''CellDesigner'''માં જ ખુલી શકે.

|-
| 12:12
| ચાલો સારાંશ લઈએ આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યા : કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને

|-
| 12:17
| '''CellDesigner ''' આવૃત્તિ 4.3ને '''Ubuntu Linux OS ''' ઉપર ઇન્સ્ટોલ કરવું, '''CellDesigner '''માં '''Compartment''' બનાવવું

|-
| 12:27
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:35
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં '''spoken-tutorial.org''' ઉપર લખો.

|-
| 12:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી '''spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:57
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા આભાર।

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner/Gujarati

2017-10-09T10:57:57Z

Shivanigada:

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| ''' Installation of CellDesigner'''ને સમજાવતા આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું: ''' CellDesigner 4.3 ''' ને ''' Windows ''' ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 00:14
|આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું ''' Windows XP ''' અને ''' CellDesigner 4.3''' નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 00:21
|ખાસ ધ્યાન રાખો કે ''' CellDesigner ''' એ ''' Linux ''' અને ''' Mac OS X ''' ઉપર પણ કાર્ય કરે છે.

|-
| 00:27
|ધ્યાન રાખો કે જો તમારે કોઈ પણ સોફ્ટવેર ઇન્સ્ટોલ કરવું હોય તો તમે એક એડમીન યુઝર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:34
|તમે ''' www.celldesigner.org ''' વેબસાઈટ ઉપરથી ''' CellDesigner ''' ડાઉનલોડ કરી શકો છો.

|-
| 00:42
| હોમ પેજ ઉપર તમને ''' downloads ''' નામનું ટેબ મળશે. તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:48
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે. નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 00:53
| ''' Download CellDesigner ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:56
| નીચે સ્ક્રોલ કરો. ''' Download ''' શીર્ષક નીચે, ચાર લિંક્સ દેખાઈ રહી છે.

|-
| 01:03
| પ્રથમ લિંક ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Download for windows 32 bit ''' .

|-
| 01:09
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે.

|-
| 01:11
| અહીં આ બે વિકલ્પો છે - ''' Registered User ''' અને ''' First Time User '''.

|-
| 01:17
| તમે હમણાં પહેલીવારના વપરાશકર્તા (user) છો.

|-
| 01:21
| તો ''' First Time User ''' ઉપર ક્લિક કરો. ''' Continue ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:25
| હવે તમારે તમારી વિગતો અહીં ભરવાની છે.

|-
| 01:27
| ચાલો હું અહીં વિગતો ભરું.

|-
| 01:30
| એકવાર જો તમે વિગતો ભરો છો ત્યારબાદ નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Download ''' પર ક્લિક કરો.

|-
| 01:37
|તમારે આ વિગતો એક જ વાર ભરવી પડશે.

|-
| 01:41
|પછીથી તમારે જો કોઈ બીજી નવી આવૃત્તિ ઇન્સ્ટોલ કરવી હોય તો તમારે ''' Registered user ''' ઉપર ક્લિક કરવું પડશે.

|-
| 01:48
| ઈમેલ એડ્રેસ અને પાસવર્ડ લખો અને તમને આ પ્રમાણે સેટ અપ ફાઈલ મળશે.

|-
| 01:53
| હવે ''' Save File''' ઉપર ક્લિક કરો

|-
| 01:56
| તે સેટ અપ ફાઈલ ડાઉનલોડ થવાનું શરુ કરશે . તે માત્ર થોડીક ક્ષણ લેશે

|-
| 02:02
|ડાઉનલોડિંગ ખતમ થયા પછી set-up ફાઈલ ખોલીએ,

|-
| 02:07
| તેના ઉપર ક્લિક કરો. હવે Run ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:12
| Next બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:14
| આ વિકલ્પ ''' I accept the agreement ''' ને પસંદ કરીએ.

|-
| 02:17
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:20
| ''' CellDesigner ''' તમારા કોમ્પ્યુટર ઉપર ક્યાં ઇન્સ્ટોલ કરવું છે તે માટે યોગ્ય ફોલ્ડર પસંદ કરો.

|-
| 02:25
| ''' Next '''બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:31
| ઈન્સ્ટોલેશન ક્રિયાને પૂર્ણ કરવા ''' Finish ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:36
| તમને કેટલીક સૂચનાઓ મળશે. તેને ધ્યાનથી વાંચો.

|-
| 02:40
| અને પછી ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| હવે સેલડિઝાઈનરને ખોલવા ડેસ્કટોપ પરના shortcut CellDesigner icon ને ક્લિક કરો .
|-
| 02:52
| આ ''' CellDesigner Interface ''' છે.

|-
| 02:56
| હવે પછીના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે મેનુ બાર્સ,ટૂલ બાર્સ અને વિવિધ પેનલ્સ વિશે શીખીશું.

|-
| 03:02
|આ મોડેલ ''' CellDesigner '''ની મદદથી દોરેલું છે.

|-
| 03:07
|અહીં આ સબસ્ટ્રેટ(નીચેનો થર) આ એન્ઝાઇમ(પાચક રસ) સાથે જોડાય છે અને એક એન્ઝાઇમ-સબસ્ટ્રેટ કોમ્પ્લેક્સની રચના થાય છે. આ સબસ્ટ્રેટ એક બનાવટમાં રૂપાંતરિત થાય છે.

|-
| 03:17
|ચાલો આ મોડેલ ''' CellDesigner ''' માં જોઈએ

|-
| 03:20
|આપણે આવા ઘણા જૈવિક(બાયોલોજીકલ) નેટવર્ક્સ CellDesigner દ્વારા બનાવી શકીએ છીએ.

|-
| 03:25
| ઈન્સ્ટોલેશન બરાબર થયું છે કે નહિ તેની ચકાસણી કરવા.

|-
| 03:30
| ચાલો પાછા ''' CellDesigner ''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ .

|-
| 03:34
| ચાલો અહીં એક ''' Protein ''' ઉમેરીએ.

|-
| 03:37
| ચાલો ફાઈલમાં જઈએ,''' New ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:41
| હું એને ''' trial ''' નામ આપીશ. ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરીએ

|-
| 03:45
| હું ''' protein ''' ને પસંદ કરું.

|-
| 03:48
| અહીં ક્લિક કરો અને એને નામ આપો ''' A '''.

|-
| 03:52
| અને ''' OK ''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:55
| હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આની સાથે ચાલુ રાખીશું અને આ મોડેલ બનાવીશું.

|-
| 04:01
| તો આ આપણને '''Installation-of-CellDesigner''' પરના સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલના અંતે લઇ જાય છે.

|-
| 04:07
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યું કે સેલડિઝાઈનર 4.3ને વિન્ડોવ્સ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 04:15
|આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 04:27
|સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 04:44
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 05:06
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner/Gujarati

2017-10-09T10:57:21Z

Shivanigada:

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| ''' Installation of CellDesigner'''ને સમજાવતા આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું: ''' CellDesigner 4.3 ''' ને ''' Windows ''' ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 00:14
|આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું ''' Windows XP ''' અને ''' CellDesigner 4.3''' નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 00:21
|ખાસ ધ્યાન રાખો કે ''' CellDesigner ''' એ ''' Linux ''' અને ''' Mac OS X ''' ઉપર પણ કાર્ય કરે છે.

|-
| 00:27
|ધ્યાન રાખો કે જો તમારે કોઈ પણ સોફ્ટવેર ઇન્સ્ટોલ કરવું હોય તો તમે એક એડમીન યુઝર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:34
|તમે ''' www.celldesigner.org ''' વેબસાઈટ ઉપરથી ''' CellDesigner ''' ડાઉનલોડ કરી શકો છો.

|-
| 00:42
| હોમ પેજ ઉપર તમને ''' downloads ''' નામનું ટેબ મળશે. તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:48
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે. નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 00:53
| ''' Download CellDesigner ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:56
| નીચે સ્ક્રોલ કરો. ''' Download ''' શીર્ષક નીચે, ચાર લિંક્સ દેખાઈ રહી છે.

|-
| 01:03
| પ્રથમ લિંક ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Download for windows 32 bit ''' .

|-
| 01:09
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે.

|-
| 01:11
| અહીં આ બે વિકલ્પો છે - ''' Registered User ''' અને ''' First Time User '''.

|-
| 01:17
| તમે હમણાં પહેલીવારના વપરાશકર્તા (user) છો.

|-
| 01:21
| તો ''' First Time User ''' ઉપર ક્લિક કરો. ''' Continue ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:25
| હવે તમારે તમારી વિગતો અહીં ભરવાની છે.

|-
| 01:27
| ચાલો હું અહીં વિગતો ભરું.

|-
| 01:30
| એકવાર જો તમે વિગતો ભરો છો ત્યારબાદ નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Download ''' પર ક્લિક કરો.

|-
| 01:37
|તમારે આ વિગતો એક જ વાર ભરવી પડશે.

|-
| 01:41
|પછીથી તમારે જો કોઈ બીજી નવી આવૃત્તિ ઇન્સ્ટોલ કરવી હોય તો તમારે ''' Registered user ''' ઉપર ક્લિક કરવું પડશે.

|-
| 01:48
| ઈમેલ એડ્રેસ અને પાસવર્ડ લખો અને તમને આ પ્રમાણે સેટ અપ ફાઈલ મળશે.

|-
| 01:53
| હવે ''' Save File''' ઉપર ક્લિક કરો

|-
| 01:56
| તે સેટ અપ ફાઈલ ડાઉનલોડ થવાનું શરુ કરશે . તે માત્ર થોડીક ક્ષણ લેશે

|-
| 02:02
|ડાઉનલોડિંગ ખતમ થયા પછી set-up ફાઈલ ખોલીએ,

|-
| 02:07
| તેના ઉપર ક્લિક કરો. હવે Run ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:12
| Next બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:14
| આ વિકલ્પ ''' I accept the agreement ''' ને પસંદ કરીએ.

|-
| 02:17
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:20
| ''' CellDesigner ''' તમારા કોમ્પ્યુટર ઉપર ક્યાં ઇન્સ્ટોલ કરવું છે તે માટે યોગ્ય ફોલ્ડર પસંદ કરો.

|-
| 02:25
| ''' Next '''બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:31
| ઈન્સ્ટોલેશન ક્રિયાને પૂર્ણ કરવા ''' Finish ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:36
| તમને કેટલીક સૂચનાઓ મળશે. તેને ધ્યાનથી વાંચો.

|-
| 02:40
| અને પછી ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| હવે સેલડિઝાઈનરને ખોલવા ડેસ્કટોપ પરના shortcut CellDesigner icon ને ક્લિક કરો .
|-
| 02:52
| આ ''' CellDesigner Interface ''' છે.

|-
| 02:56
| હવે પછીના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે મેનુ બાર્સ,ટૂલ બાર્સ અને વિવિધ પેનલ્સ વિશે શીખીશું.

|-
| 03:02
|આ મોડેલ ''' CellDesigner '''ની મદદથી દોરેલું છે.

|-
| 03:07
|અહીં આ સબસ્ટ્રેટ(નીચેનો થર) આ એન્ઝાઇમ(પાચક રસ) સાથે જોડાય છે અને એક એન્ઝાઇમ-સબસ્ટ્રેટ કોમ્પ્લેક્સની રચના થાય છે. આ સબસ્ટ્રેટ એક બનાવટમાં રૂપાંતરિત થાય છે.

|-
| 03:17
|ચાલો આ મોડેલ ''' CellDesigner ''' માં જોઈએ

|-
| 03:20
|આપણે આવા ઘણા જૈવિક(બાયોલોજીકલ) નેટવર્ક્સ CellDesigner દ્વારા બનાવી શકીએ છીએ.

|-
| 03:25
| ઈન્સ્ટોલેશન બરાબર થયું છે કે નહિ તેની ચકાસણી કરવા.

|-
| 03:30
| ચાલો પાછા ''' CellDesigner ''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ .

|-
| 03:34
| ચાલો અહીં એક ''' Protein ''' ઉમેરીએ.

|-
| 03:37
| ચાલો ફાઈલમાં જઈએ,''' New ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:41
| હું એને ''' trial ''' નામ આપીશ. ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરીએ

|-
| 03:45
| હું ''' protein ''' ને પસંદ કરું.

|-
| 03:48
| અહીં ક્લિક કરો અને એને નામ આપો ''' A '''.

|-
| 03:52
| અને ''' OK ''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:55
| હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આની સાથે ચાલુ રાખીશું અને આ મોડેલ બનાવીશું.

|-
| 04:01
| તો આ આપણને Installation-of-CellDesigner પરના સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલના અંતે લઇ જાય છે.

|-
| 04:07
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યું કે સેલડિઝાઈનર 4.3ને વિન્ડોવ્સ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 04:15
|આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 04:27
|સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 04:44
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 05:06
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner/Gujarati

2017-10-09T10:56:54Z

Shivanigada:

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| ''' Installation of CellDesigner'''ને સમજાવતા આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું: ''' CellDesigner 4.3 ''' ને ''' Windows ''' ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 00:14
|આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું ''' Windows XP ''' અને ''' CellDesigner 4.3''' નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 00:21
|ખાસ ધ્યાન રાખો કે ''' CellDesigner ''' એ ''' Linux ''' અને ''' Mac OS X ''' ઉપર પણ કાર્ય કરે છે.

|-
| 00:27
|ધ્યાન રાખો કે જો તમારે કોઈ પણ સોફ્ટવેર ઇન્સ્ટોલ કરવું હોય તો તમે એક એડમીન યુઝર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:34
|તમે ''' www.celldesigner.org ''' વેબસાઈટ ઉપરથી ''' CellDesigner ''' ડાઉનલોડ કરી શકો છો.

|-
| 00:42
| હોમ પેજ ઉપર તમને ''' downloads ''' નામનું ટેબ મળશે. તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:48
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે. નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 00:53
| ''' Download CellDesigner ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:56
| નીચે સ્ક્રોલ કરો. ''' Download '' શીર્ષક નીચે, ચાર લિંક્સ દેખાઈ રહી છે.

|-
| 01:03
| પ્રથમ લિંક ઉપર ક્લિક કરો જે છે ''' Download for windows 32 bit ''' .

|-
| 01:09
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે.

|-
| 01:11
| અહીં આ બે વિકલ્પો છે - ''' Registered User ''' અને ''' First Time User '''.

|-
| 01:17
| તમે હમણાં પહેલીવારના વપરાશકર્તા (user) છો.

|-
| 01:21
| તો ''' First Time User ''' ઉપર ક્લિક કરો. ''' Continue ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:25
| હવે તમારે તમારી વિગતો અહીં ભરવાની છે.

|-
| 01:27
| ચાલો હું અહીં વિગતો ભરું.

|-
| 01:30
| એકવાર જો તમે વિગતો ભરો છો ત્યારબાદ નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ''' Download ''' પર ક્લિક કરો.

|-
| 01:37
|તમારે આ વિગતો એક જ વાર ભરવી પડશે.

|-
| 01:41
|પછીથી તમારે જો કોઈ બીજી નવી આવૃત્તિ ઇન્સ્ટોલ કરવી હોય તો તમારે ''' Registered user ''' ઉપર ક્લિક કરવું પડશે.

|-
| 01:48
| ઈમેલ એડ્રેસ અને પાસવર્ડ લખો અને તમને આ પ્રમાણે સેટ અપ ફાઈલ મળશે.

|-
| 01:53
| હવે ''' Save File''' ઉપર ક્લિક કરો

|-
| 01:56
| તે સેટ અપ ફાઈલ ડાઉનલોડ થવાનું શરુ કરશે . તે માત્ર થોડીક ક્ષણ લેશે

|-
| 02:02
|ડાઉનલોડિંગ ખતમ થયા પછી set-up ફાઈલ ખોલીએ,

|-
| 02:07
| તેના ઉપર ક્લિક કરો. હવે Run ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:12
| Next બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:14
| આ વિકલ્પ ''' I accept the agreement ''' ને પસંદ કરીએ.

|-
| 02:17
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:20
| ''' CellDesigner ''' તમારા કોમ્પ્યુટર ઉપર ક્યાં ઇન્સ્ટોલ કરવું છે તે માટે યોગ્ય ફોલ્ડર પસંદ કરો.

|-
| 02:25
| ''' Next '''બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:27
| ''' Next ''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:31
| ઈન્સ્ટોલેશન ક્રિયાને પૂર્ણ કરવા ''' Finish ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:36
| તમને કેટલીક સૂચનાઓ મળશે. તેને ધ્યાનથી વાંચો.

|-
| 02:40
| અને પછી ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| હવે સેલડિઝાઈનરને ખોલવા ડેસ્કટોપ પરના shortcut CellDesigner icon ને ક્લિક કરો .
|-
| 02:52
| આ ''' CellDesigner Interface ''' છે.

|-
| 02:56
| હવે પછીના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે મેનુ બાર્સ,ટૂલ બાર્સ અને વિવિધ પેનલ્સ વિશે શીખીશું.

|-
| 03:02
|આ મોડેલ ''' CellDesigner '''ની મદદથી દોરેલું છે.

|-
| 03:07
|અહીં આ સબસ્ટ્રેટ(નીચેનો થર) આ એન્ઝાઇમ(પાચક રસ) સાથે જોડાય છે અને એક એન્ઝાઇમ-સબસ્ટ્રેટ કોમ્પ્લેક્સની રચના થાય છે. આ સબસ્ટ્રેટ એક બનાવટમાં રૂપાંતરિત થાય છે.

|-
| 03:17
|ચાલો આ મોડેલ ''' CellDesigner ''' માં જોઈએ

|-
| 03:20
|આપણે આવા ઘણા જૈવિક(બાયોલોજીકલ) નેટવર્ક્સ CellDesigner દ્વારા બનાવી શકીએ છીએ.

|-
| 03:25
| ઈન્સ્ટોલેશન બરાબર થયું છે કે નહિ તેની ચકાસણી કરવા.

|-
| 03:30
| ચાલો પાછા ''' CellDesigner ''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ .

|-
| 03:34
| ચાલો અહીં એક ''' Protein ''' ઉમેરીએ.

|-
| 03:37
| ચાલો ફાઈલમાં જઈએ,''' New ''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:41
| હું એને ''' trial ''' નામ આપીશ. ''' OK ''' ઉપર ક્લિક કરીએ

|-
| 03:45
| હું ''' protein ''' ને પસંદ કરું.

|-
| 03:48
| અહીં ક્લિક કરો અને એને નામ આપો ''' A '''.

|-
| 03:52
| અને ''' OK ''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:55
| હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આની સાથે ચાલુ રાખીશું અને આ મોડેલ બનાવીશું.

|-
| 04:01
| તો આ આપણને Installation-of-CellDesigner પરના સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલના અંતે લઇ જાય છે.

|-
| 04:07
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યું કે સેલડિઝાઈનર 4.3ને વિન્ડોવ્સ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 04:15
|આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 04:27
|સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં spoken-tutorial.org ઉપર લખો.

|-
| 04:44
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો" ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 05:06
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર.

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T07:58:03Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|કેમ છો બધા. '''Installation of CellDesigner on Linux OS'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''CellDesigner 4.3'''ને '''Ubuntu Linux Operating System'''માં ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવાનું શીખીશું.

|-
| 00:18
|અને '''CellDesigner'''ના '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Compartment''' બનાવવાનું પણ જોઈશું.

|-
| 00:23
| અહીં હું '''Ubuntu Operating System 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
|આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમેં '''Linux Operating System'''ના બેઝિક ઓપરેશનોના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:42
| જો તમે ન હોવ,તો તેને સંબંધિત '''Linux tutorials''' અમારી વેબસાઈટ '''www.spoken-tutorial.org''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 00:51
| '''CellDesigner'''ને ઇન્સ્ટોલ કરવા, તમારું વેબ બ્રાઉઝર(Web Browser) ખોલો અને જે '''URL''' દેખાય છે તેના ઉપર જાઓ.

|-
| 01:00
| જમણા હાથ તરફ રહેલ '''Download CellDesigner''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|એક નવું વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:09
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Download'''ને શોધો.

|-
| 01:13
| તે '''Download for Linux 64 bit''' અને '''Download for Linux 32 bit''' બતાવે છે.

|-
| 01:20
| હવે, આપણે જોઈએ કે તમારા મશીનના '''OS type'''ની વિગતો કેવી રીતે શોધાય.

|-
| 01:26
| આ માટે,તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:34
| '''System Settings'''ને ક્લિક કરતા એક પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:40
| પેનલ ''''System''''ની નીચે, ''''Details'''' આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:48
| અહીં નવી વીન્ડોવ ''''Details'''' ખુલે છે. તમારા મશીનની '''OS type'''’ ચેક કરો કે શું તે '''64-bit''' છે કે '''32-bit'''.

|-
| 02:00
| મારુ મશીન '''64 bit'''નું છે. હવે આ વીન્ડોવને બંધ કરી પાછા બ્રાઉઝર ઉપર જઈએ.

|-
| 02:07
| જો તમારું મશીન '''32 bit'''નું હોય તો '''32 bit version''' ડાઉનલોડ કરવાનું.

|-
| 02:14
| હું લિંક'''Download for Linux 64 bit ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:19
| તરત જ એક નવી વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 02:22
| હું એક નવી ઉઝર હોવાથી, વિકલ્પ '''First Time User ''' ઉપર હું ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:26
| અને પછી '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 02:29
| હવે આપણને થોડીક વ્યક્તિગત વિગતો ભરવા માટે પૂછવામાં આવે છે.

|-
| 02:33
| તે ભર્યા પછી, '''Download ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:37
| એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.અહીં '''Save File''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| આ થોડીક ક્ષણ લેશે જે તમારા ઈન્ટરનેટની ગતિ ઉપર આધાર રાખે છે.

|-
| 02:49
| જેવી ફાઈલ ડાઉનલોડ થઇ જાય,'''Ctrl+Alt+T ''' કીઝ દબાવી '''terminal''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:58
| મેં પહેલેથી જ આ ફાઈલ ડાઉનલોડ કરી રાખી છે જે ડિફોલ્ટ ફોલ્ડર '''Downloads '''માં છે.

|-
| 03:04
| તો પહેલા હું તે ફોલ્ડરમાં જાઉં, ટાઈપ કરો '''cd space Downloads ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:15
| ટાઈપ કરો '''ls ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:20
| અહીં આ રહી આપણે ડાઉનલોડ કરેલી ફાઈલ.

|-
| 03:25
| જો તમે '''32 bit ''' ડાઉનલોડ કરી હોત તો ફાઈલનું નામ '''64'''ની જગ્યા એ '''32''' હોત.

|-
| 03:32
| હવેથી ટર્મિનલ કમાન્ડમાં તમારા '''32 bit installer '''ના ફાઈલનું નામ વાપરવાનું યાદ રાખો

|-
| 03:39
| હવે આપણે ફાઈલ પરમિશનને બદલવી પડશેતો ટાઈપ કરો

|-
| 03:43
| '''sudo space chmod space 777 space hyphen capital R space CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run'''

|-
| 04:08
| '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:12
| '''admin''' પાસવર્ડ ટાઈપ કરો અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:19
| હવે આપણે ફાઈલને રન કરવા ટાઈપ કરીશું '''dot forward slash CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run ''' અને '''Enter''' દબાવીશું.

|-
| 04:39
| '''Setup wizard''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:43
| બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:47
| '''I accept the agreement ''' વિકલ્પ ક્લિક કરીએ અને પછી '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:54
| '''Installation Directory ''' ડાયલોગ આ ડાયરેક્ટરી બતાવે છે જ્યાં '''CellDesigner ''' ઇન્સ્ટોલ થશે.

|-
| 05:00
| તે આ રીતે દેખાશે '''<nowiki>/home/<your username>/CellDesigner4.3</nowiki>''' હવે '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:10
| તે કહે છે '''Ready to Install'''. પાછું '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ઈન્સ્ટોલેશન ચાલુ થશે.

|-
| 05:20
| જેવું પૂરું થાય, '''‘View Readme File’''' ને અનચેક કરો અને '''Finish''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 05:29
| હવે '''Ctrl + Alt + T ''' કીઝ દબાવી નવું '''terminal ''' ખોલો.

|-
| 05:34
| ટાઈપ કરો '''ls''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:39
| અહીં આપણે '''runCellDesigner4.3 ''' ફાઈલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 05:44
| '''CellDesigner'''ને ખોલવા આપણને આ ફાઈલ એગઝીક્યૂટ(execute) કરવી પડશે.

|-
| 05:48
| તો ટાઈપ કરો '''dot forward slash runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:00
| '''CellDesigner''' વીન્ડોવ આપણા '''Linux''' મશીનમાં હવે ખુલ્યું છે .

|-
| 06:05
| તમે ધ્યાનથી જુઓ કે આપણે '''Main menu''' બાર બરાબર જોઈ શકતા નથી. તેને જોવા માટે , આપણને '''system settings''' બદલવા પડશે.

|-
| 06:15
| તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 06:23
| ક્લિક કરતા '''System Settings''' પેજ ખુલે છે.

|-
| 06:28
| પેનલ ''''Personal'''' ની નીચે ''''Appearance'''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:34
| ''''Appearance'''' નામની વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 06:38
| ટેબ ''''Look''''ની નીચેના , '''Theme''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:43
| ''''Theme'''' બોક્સના ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી, ''''Radiance''''ને સિલેક્ટ કરો અને વીન્ડોવ બંધ કરો.

|-
| 06:53
| હવે ધ્યાનથી જુઓ '''Main menu''' બાર બરાબર દેખાય છે. ચાલો આગળ વધીએ હવે.

|-
| 07:01
| નવા ડોક્યુમેન્ટને ખોલવા , '''File''' ક્લિક કરો અને પછી '''New''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:07
| વૈકલ્પિક રીતે , મેનુ બાર ના '''New''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો અથવા '''Ctrl + N''' કીઝ દબાવો.

|-
| 07:16
| '''New Document''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે જે આપણેને કહે છે કે ફાઈલ નું નામ આપો.

|-
| 07:23
| ફાઈલનું નામ ''''Create and Edit'''' ટાઈપ કરો.

|-
| 07:30
| '''Width''' ને 900, '''Height''' ને 800 સેટ કરો.

|-
| 07:36
| નીચે રહેલા '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:40
| એક માહિતી આપતું બોક્સ(information box) ખુલે છે.

|-
| 07:43
| અને નામમાં આપણે આપેલ બધા સ્પેસીસ , બદલાઈને '''underscore''' થઇ જાય છે.

|-
| 07:48
| તો ખરેખર ફાઈલનું નામ થશે ''''Create underscore and underscore Edit''''. '''Ok''' ક્લિક કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 07:58
| કેન્દ્રમાં દેખાતો સફેદ વિભાગ છે તેને આપણે Draw વિભાગ તરીકે બોલીશું.

|-
| 08:02
| આપણે menu bars, toolbars અને વિવિધ panels ને હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખીશું.

|-
| 08:09
| ટૂલ બારના બીજા અન્ય આઇકોનને સિલેક્ટ કરતા પહેલા , '''Select Mode''' બટનને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:16
| તે એક સિલેક્શન ટૂલ તરીકે વર્તશે.આ સિલેક્શન ટૂલની મદદથી ,આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં કમ્પોનન્ટને Select ,Draw અને move કરી શકીએ.

|-
| 08:25
| કમ્પોનન્ટ ડ્રો કરતા પહેલા , આપણે ખાતરી કરીશું કે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાના '''Grid Snap''' અને '''Grid Visible''' એનેબલ છે કે નથી .

|-
| 08:35
| તે માટે "Main Menu " બારના '''Edit'''ને ક્લિક કરીએ .

|-
| 08:39
| નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને '''Grid Snap'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| પાછા '''Edit''' ઉપર જઈએ અને '''Grid Visible'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:49
| '''Grids''' આપણને Draw વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સને સરખું સંરેખિત રીતે ગોઠવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 08:54
| ચાલો હવે '''List '''અને '''Notes''' વિસ્તારના સ્થાન બદલીએ.

|-
| 08:59
| યાદ કરો કે આપણે '''List''' વિસ્તાર, '''Notes''' વિસ્તાર અને Draw વિસ્તાર અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલમાં જ શીખી લીધા છે.

|-
| 09:06
| જો તમને યાદ ન હોય તો આ શ્રેણીના તે ટ્યૂટોરિઅલને તમે નિહાળી શકો છો.

|-
| 09:12
| ચાલો આગળ વધીએ અને List વિસ્તારનું સ્થાન બદલીએ.

|-
| 09:15
| '''View''' વિકલ્પ ઉપર જાઓ, '''List '''ને ક્લિક કરો અને ‘'''Right’''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:24
| તે ‘'''List’'''ને Draw વિસ્તારની જમણી બાજુએ ખસેડે છે.

|-
| 09:30
| આ વિસ્તારોના માપ તેની બોર્ડરલાઈંસને ડ્રેગ કરી બદલી શકાય છે.

|-
| 09:35
| આપણે આ બોર્ડરલાઇન ઉપર કર્સર ખસેડીશું .

|-
| 09:38
| તમે બે મસ્તકવાળો એરો જોઈ શકો છો. તેને Draw વિસ્તારના મહત્તમ અથવા લઘુત્તમમાં ડ્રેગ કરો.

|-
| 09:45
| હવે આપણે Draw વિસ્તારમાં કામ કરવા ઉપર આગળ વધીશું.

|-
| 09:49
| તે પહેલા , આપણે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાં બધા જ આઇકોન્સને જોઈ શકીએ તેવું હોવું જોઈએ.

|-
| 09:55
| તે માટે, Main Menu બારમાંના '''View ''' ઉપર જાઓ.

|-
| 10:00
| '''Change Toolbar Visible''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Show All''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| હવે તમે '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર બધા જ આઇકોન્સ જોઈ શકો છો . ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 10:17
| એક cell અથવા એક intracellular compartmentને દર્શાવવા , આપણે ટૂલ બારમાંના '''Square''' આઇકોનનો ઉપયોગ કરીશું .તો પ્રથમ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:28
| પછી Draw વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ। અને માઉસનું બટન ચોદતા પહેલા, તેને ડ્રેગ કરો જેથી એક ચોરસ બનશે. હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 10:38
| જે ''''Property of Compartment'''' ડાયલોગ ખુલે છે તેમાં, '''Name'''ને '''Cell''' તરીકે લખો અને '''Size'''ને 1.0 આપી '''Ok.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:52
| નામ કમ્પાર્ટમેન્ટના નીચેના ભાગમાં દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 10:57
| તમે કમ્પાર્ટમેન્ટના નામનું સ્થાન પણ બદલી શકો.

|-
| 11:01
| તે કરવા, કમ્પાર્ટમેન્ટ નામને સિલેક્ટ કરો,જે આપણા કેસમાં '''Cell''' છે.

|-
| 11:07
| હવે તેને ડ્રેગ અને ડ્રોપ કરો જ્યાં તમને મૂકવું હોય.

|-
| 11:14
| હવે આ ફાઈલને સેવ કરવા '''File''' ઉપર ક્લિક કરીએ તેના '''Save As''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:22
| હવે તમારે કાયા ફોલ્ડરમાં સેવ કરવું છે તે પસંદ કરો.

|-
| 11:26
| મારે તેને મારા '''Desktop''' ઉપર જ સેવ કરવું છે.

|-
| 11:28
| તો હું ફોલ્ડર તરીકે '''Desktop ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીશ જેમાં મારે ફાઈલને સેવ કરવી છે.

|-
| 11:34
| અને પછી નીચે જમણી બાજુના '''Ok ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 11:38
| હજી પાછું એક વાર, નીચે જમણી બાજુના '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ। આપણી ફાઈલ હવે સેવ થઇ ગઈ છે.

|-
| 11:46
| '''CellDesigner'''ને બંધ કરવા , '''File ''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Exit'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 11:52
| હવે આપણે તે ફોલ્ડરમાં જઈએ જ્યાં આપણે ફાઈલને સેવ કરી છે. તો હું મારા '''Desktop''' ઉપર જાઉં .આ રહી મારી ફાઈલ.

|-
| 12:00
| નોંધ લો કે આ ફાઈલ '''.xml ''' ફોર્મેટમાં સેવ થઇ છે . તે '''CellDesigner '''ની ડિફોલ્ટ ફાઈલ ફોર્મેટ છે.

|-
| 12:08
| વળી નોંધ લો કે આ ફાઈલ માત્ર '''CellDesigner'''માં જ ખુલી શકે.

|-
| 12:12
| ચાલો આ ટ્યૂટોરિઅલનો બોધ જોઈએ કે , આપણે શીખ્યા : કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને

|-
| 12:17
| '''CellDesigner ''' આવૃત્તિ 4.3ને '''Ubuntu Linux OS ''' ઉપર ઇન્સ્ટોલ કરવું, '''CellDesigner '''માં '''Compartment''' બનાવવું

|-
| 12:27
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:35
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં '''spoken-tutorial.org''' ઉપર લખો.

|-
| 12:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે.આ ઉપર વધુ માહિતી '''spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:57
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા આભાર।

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T07:56:58Z

Shivanigada:

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|કેમ છો બધા. '''Installation of CellDesigner on Linux OS'''ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''CellDesigner 4.3'''ને '''Ubuntu Linux Operating System'''માં ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવાનું શીખીશું.

|-
| 00:18
|અને '''CellDesigner'''ના '''Draw''' વિસ્તારમાં '''Compartment''' બનાવવાનું પણ જોઈશું.

|-
| 00:23
| અહીં હું '''Ubuntu Operating System 14.04''' , '''CellDesigner version 4.3''' અને '''Java version 1.7''' વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
|આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમેં '''Linux Operating System'''ના બેઝિક ઓપરેશનોના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:42
| જો તમે ન હોવ,તો તેને સંબંધિત '''Linux tutorials''' અમારી વેબસાઈટ '''www.spoken-tutorial.org''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 00:51
| '''CellDesigner'''ને ઇન્સ્ટોલ કરવા, તમારું વેબ બ્રાઉઝર(Web Browser) ખોલો અને જે '''URL''' દેખાય છે તેના ઉપર જાઓ.

|-
| 01:00
| જમણા હાથ તરફ રહેલ '''Download CellDesigner''' બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|એક નવું વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:09
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને '''Download'''ને શોધો.

|-
| 01:13
| તે '''Download for Linux 64 bit''' અને '''Download for Linux 32 bit''' બતાવે છે.

|-
| 01:20
| હવે, આપણે જોઈએ કે તમારા મશીનના '''OS type'''ની વિગતો કેવી રીતે શોધાય.

|-
| 01:26
| આ માટે,તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:34
| '''System Settings'''ને ક્લિક કરતા એક પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:40
| પેનલ ''''System''''ની નીચે, ''''Details'''' આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:48
| અહીં નવી વીન્ડોવ ''''Details'''' ખુલે છે. તમારા મશીનની '''OS type'''’ ચેક કરો કે શું તે '''64-bit''' છે કે '''32-bit'''.

|-
| 02:00
| મારુ મશીન '''64 bit'''નું છે. હવે આ વીન્ડોવને બંધ કરી પાછા બ્રાઉઝર ઉપર જઈએ.

|-
| 02:07
| જો તમારું મશીન '''32 bit'''નું હોય તો '''32 bit version''' ડાઉનલોડ કરવાનું.

|-
| 02:14
| હું લિંક'''Download for Linux 64 bit ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:19
| તરત જ એક નવી વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 02:22
| હું એક નવી ઉઝર હોવાથી, વિકલ્પ '''First Time User ''' ઉપર હું ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:26
| અને પછી '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 02:29
| હવે આપણને થોડીક વ્યક્તિગત વિગતો ભરવા માટે પૂછવામાં આવે છે.

|-
| 02:33
| તે ભર્યા પછી, '''Download ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:37
| એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.અહીં '''Save File''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| આ થોડીક ક્ષણ લેશે જે તમારા ઈન્ટરનેટની ગતિ ઉપર આધાર રાખે છે.

|-
| 02:49
| જેવી ફાઈલ ડાઉનલોડ થઇ જાય,'''Ctrl+Alt+T ''' કીઝ દબાવી '''terminal''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:58
| મેં પહેલેથી જ આ ફાઈલ ડાઉનલોડ કરી રાખી છે જે ડિફોલ્ટ ફોલ્ડર '''Downloads '''માં છે.

|-
| 03:04
| તો પહેલા હું તે ફોલ્ડરમાં જાઉં, ટાઈપ કરો '''cd space Downloads ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:15
| ટાઈપ કરો '''ls ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:20
| અહીં આ રહી આપણે ડાઉનલોડ કરેલી ફાઈલ.

|-
| 03:25
| જો તમે '''32 bit ''' ડાઉનલોડ કરી હોત તો ફાઈલનું નામ '''64'''ની જગ્યા એ '''32''' હોત.

|-
| 03:32
| હવેથી ટર્મિનલ કમાન્ડમાં તમારા '''32 bit installer '''ના ફાઈલનું નામ વાપરવાનું યાદ રાખો

|-
| 03:39
| હવે આપણે ફાઈલ પરમિશનને બદલવી પડશેતો ટાઈપ કરો

|-
| 03:43
| '''sudo space chmod space 777 space hyphen capital R space CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run'''

|-
| 04:08
| '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:12
| '''admin''' પાસવર્ડ ટાઈપ કરો અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:19
| હવે આપણે ફાઈલને રન કરવા ટાઈપ કરીશું '''dot forward slash CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run ''' અને '''Enter''' દબાવીશું.

|-
| 04:39
| '''Setup wizard''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:43
| બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:47
| '''I accept the agreement ''' વિકલ્પ ક્લિક કરીએ અને પછી '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:54
| '''Installation Directory ''' ડાયલોગ આ ડાયરેક્ટરી બતાવે છે જ્યાં '''CellDesigner ''' ઇન્સ્ટોલ થશે.

|-
| 05:00
| તે આ રીતે દેખાશે '''<nowiki>/home/<your username>/CellDesigner4.3</nowiki>''' હવે '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:10
| તે કહે છે '''Ready to Install'''. પાછું '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ઈન્સ્ટોલેશન ચાલુ થશે.

|-
| 05:20
| જેવું પૂરું થાય, '''‘View Readme File’''' ને અનચેક કરો અને '''Finish''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 05:29
| હવે '''Ctrl + Alt + T ''' કીઝ દબાવી નવું '''terminal ''' ખોલો.

|-
| 05:34
| ટાઈપ કરો '''ls''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:39
| અહીં આપણે '''runCellDesigner4.3 ''' ફાઈલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 05:44
| '''CellDesigner'''ને ખોલવા આપણને આ ફાઈલ એગઝીક્યૂટ(execute) કરવી પડશે.

|-
| 05:48
| તો ટાઈપ કરો '''dot forward slash runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:00
| '''CellDesigner''' વીન્ડોવ આપણા '''Linux''' મશીનમાં હવે ખુલ્યું છે .

|-
| 06:05
| તમે ધ્યાનથી જુઓ કે આપણે '''Main menu''' બાર બરાબર જોઈ શકતા નથી. તેને જોવા માટે , આપણને '''system settings''' બદલવા પડશે.

|-
| 06:15
| તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 06:23
| ક્લિક કરતા '''System Settings''' પેજ ખુલે છે.

|-
| 06:28
| પેનલ ''''Personal'''' ની નીચે ''''Appearance'''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:34
| ''''Appearance'''' નામની વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 06:38
| ટેબ ''''Look''''ની નીચેના , '''Theme''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:43
| ''''Theme'''' બોક્સના ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી, ''''Radiance''''ને સિલેક્ટ કરો અને વીન્ડોવ બંધ કરો.

|-
| 06:53
| હવે ધ્યાનથી જુઓ '''Main menu''' બાર બરાબર દેખાય છે. ચાલો આગળ વધીએ હવે.

|-
| 07:01
| નવા ડોક્યુમેન્ટને ખોલવા , '''File''' ક્લિક કરો અને પછી '''New''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:07
| વૈકલ્પિક રીતે , મેનુ બાર ના '''New''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો અથવા '''Ctrl + N''' કીઝ દબાવો.

|-
| 07:16
| '''New Document''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે જે આપણેને કહે છે કે ફાઈલ નું નામ આપો.

|-
| 07:23
| ફાઈલનું નામ ''''Create and Edit'''' ટાઈપ કરો.

|-
| 07:30
| '''Width''' ને 900, '''Height''' ને 800 સેટ કરો.

|-
| 07:36
| નીચે રહેલા '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:40
| એક માહિતી આપતું બોક્સ(information box) ખુલે છે.

|-
| 07:43
| અને નામમાં આપણે આપેલ બધા સ્પેસીસ , બદલાઈને '''underscore''' થઇ જાય છે.

|-
| 07:48
| તો ખરેખર ફાઈલનું નામ થશે ''''Create underscore and underscore Edit''''. '''Ok''' ક્લિક કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 07:58
| કેન્દ્રમાં દેખાતો સફેદ વિભાગ છે તેને આપણે Draw વિભાગ તરીકે બોલીશું.

|-
| 08:02
| આપણે menu bars, toolbars અને વિવિધ panels ને હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખીશું.

|-
| 08:09
| ટૂલ બારના બીજા અન્ય આઇકોનને સિલેક્ટ કરતા પહેલા , '''Select Mode''' બટનને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:16
| તે એક સિલેક્શન ટૂલ તરીકે વર્તશે.આ સિલેક્શન ટૂલની મદદથી ,આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં કમ્પોનન્ટને Select ,Draw અને move કરી શકીએ.

|-
| 08:25
| કમ્પોનન્ટ ડ્રો કરતા પહેલા , આપણે ખાતરી કરીશું કે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાના '''Grid Snap''' અને '''Grid Visible''' એનેબલ છે કે નથી .

|-
| 08:35
| તે માટે "Main Menu " બારના '''Edit'''ને ક્લિક કરીએ .

|-
| 08:39
| નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને '''Grid Snap'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| પાછા '''Edit''' ઉપર જઈએ અને '''Grid Visible'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:49
| '''Grids''' આપણને Draw વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સને સરખું સંરેખિત રીતે ગોઠવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 08:54
| ચાલો હવે '''List '''અને '''Notes''' વિસ્તારના સ્થાન બદલીએ.

|-
| 08:59
| યાદ કરો કે આપણે '''List''' વિસ્તાર, '''Notes''' વિસ્તાર અને Draw વિસ્તાર અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલમાં જ શીખી લીધા છે.

|-
| 09:06
| જો તમને યાદ ન હોય તો આ શ્રેણીના તે ટ્યૂટોરિઅલને તમે નિહાળી શકો છો.

|-
| 09:12
| ચાલો આગળ વધીએ અને List વિસ્તારનું સ્થાન બદલીએ.

|-
| 09:15
| '''View''' વિકલ્પ ઉપર જાઓ, '''List '''ને ક્લિક કરો અને ‘'''Right’''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:24
| તે ‘'''List’'''ને Draw વિસ્તારની જમણી બાજુએ ખસેડે છે.

|-
| 09:30
| આ વિસ્તારોના માપ તેની બોર્ડરલાઈંસને ડ્રેગ કરી બદલી શકાય છે.

|-
| 09:35
| આપણે આ બોર્ડરલાઇન ઉપર કર્સર ખસેડીશું .

|-
| 09:38
| તમે બે મસ્તકવાળો એરો જોઈ શકો છો. તેને Draw વિસ્તારના મહત્તમ અથવા લઘુત્તમમાં ડ્રેગ કરો.

|-
| 09:45
| હવે આપણે Draw વિસ્તારમાં કામ કરવા ઉપર આગળ વધીશું.

|-
| 09:49
| તે પહેલા , આપણે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાં બધા જ આઇકોન્સને જોઈ શકીએ તેવું હોવું જોઈએ.

|-
| 09:55
| તે માટે, Main Menu બારમાંના '''View ''' ઉપર જાઓ.

|-
| 10:00
| '''Change Toolbar Visible''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Show All''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| હવે તમે '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર બધા જ આઇકોન્સ જોઈ શકો છો . ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 10:17
| એક cell અથવા એક intracellular compartmentને દર્શાવવા , આપણે ટૂલ બારમાંના '''Square''' આઇકોનનો ઉપયોગ કરીશું .તો પ્રથમ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:28
| પછી Draw વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ। અને માઉસનું બટન ચોદતા પહેલા, તેને ડ્રેગ કરો જેથી એક ચોરસ બનશે. હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 10:38
| જે ''''Property of Compartment'''' ડાયલોગ ખુલે છે તેમાં, '''Name'''ને '''Cell''' તરીકે લખો અને '''Size'''ને 1.0 આપી '''Ok.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:52
| નામ કમ્પાર્ટમેન્ટના નીચેના ભાગમાં દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 10:57
| તમે કમ્પાર્ટમેન્ટના નામનું સ્થાન પણ બદલી શકો.

|-
| 11:01
| તે કરવા, કમ્પાર્ટમેન્ટ નામને સિલેક્ટ કરો,જે આપણા કેસમાં '''Cell''' છે.

|-
| 11:07
| હવે તેને ડ્રેગ અને ડ્રોપ કરો જ્યાં તમને મૂકવું હોય.

|-
| 11:14
| હવે આ ફાઈલને સેવ કરવા '''File''' ઉપર ક્લિક કરીએ તેના '''Save As''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:22
| હવે તમારે કાયા ફોલ્ડરમાં સેવ કરવું છે તે પસંદ કરો.

|-
| 11:26
| મારે તેને મારા '''Desktop''' ઉપર જ સેવ કરવું છે.

|-
| 11:28
| તો હું ફોલ્ડર તરીકે '''Desktop ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીશ જેમાં મારે ફાઈલને સેવ કરવી છે.

|-
| 11:34
| અને પછી નીચે જમણી બાજુના '''Ok ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 11:38
| હજી પાછું એક વાર, નીચે જમણી બાજુના '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ। આપણી ફાઈલ હવે સેવ થઇ ગઈ છે.

|-
| 11:46
| '''CellDesigner'''ને બંધ કરવા , '''File ''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Exit'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 11:52
| હવે આપણે તે ફોલ્ડરમાં જઈએ જ્યાં આપણે ફાઈલને સેવ કરી છે. તો હું મારા '''Desktop''' ઉપર જાઉં .આ રહી મારી ફાઈલ.

|-
| 12:00
| નોંધ લો કે આ ફાઈલ '''.xml ''' ફોર્મેટમાં સેવ થઇ છે . તે '''CellDesigner '''ની ડિફોલ્ટ ફાઈલ ફોર્મેટ છે.

|-
| 12:08
| વળી નોંધ લો કે આ ફાઈલ માત્ર '''CellDesigner'''માં જ ખુલી શકે.

|-
| 12:12
| ચાલો આ ટ્યૂટોરિઅલનો બોધ જોઈએ કે , આપણે શીખ્યા : કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને

|-
| 12:17
| '''CellDesigner ''' આવૃત્તિ 4.3ને '''Ubuntu Linux OS ''' ઉપર ઇન્સ્ટોલ કરવું, '''CellDesigner '''માં '''Compartment''' બનાવવું

|-
| 12:27
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:35
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં ‘’’spoken-tutorial.org’’’ ઉપર લખો.

|-
| 12:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:57
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા આભાર।

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner-on-Linux/Gujarati

2017-10-09T07:53:25Z

Shivanigada: Created page with "{| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 |કેમ છો બધા. ‘’’Installation of CellDesigner on Linux OS’’’ના આ સ્પોકન..."

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|કેમ છો બધા. ‘’’Installation of CellDesigner on Linux OS’’’ના આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:08
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે ‘’’CellDesigner’’’ 4.3ને ‘’’Ubuntu Linux Operating System’’’માં ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવાનું શીખીશું.

|-
| 00:18
|અને ‘’’CellDesigner’’’ના ‘’’Draw’’’ વિસ્તારમાં ‘’’Compartment ‘’’ બનાવવાનું પણ જોઈશું.

|-
| 00:23
| અહીં હું ‘’’Ubuntu Operating System 14.04’’’ , ‘’’CellDesigner version 4.3’’’ અને ‘’’Java version 1.7’’’ વાપરી રહી છું.

|-
| 00:35
|આ ટ્યૂટોરિઅલને સમજવા તમેં ‘’’Linux Operating System’’’ના બેઝિક ઓપરેશનોના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:42
| જો તમે ન હોવ,તો તેને સંબંધિત ‘’’Linux tutorials’’’ અમારી વેબસાઈટ ‘’’www.spoken-tutorial.org’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે.

|-
| 00:51
| ‘’’CellDesigner’’’ ને ઇન્સ્ટોલ કરવા, તમારું વેબ બ્રાઉઝર(Web Browser) ખોલો અને જે ‘’’URL’’’ દેખાય છે તેના ઉપર જાઓ.

|-
| 01:00
| જમણા હાથ તરફ રહેલ ‘’’Download CellDesigner’’’ બટનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:07
|એક નવું વેબ પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:09
| નીચે સ્ક્રોલ કરો અને ‘’’Download’’’ને શોધો.

|-
| 01:13
| તે ‘’’Download for Linux 64 bit’’’ અને ‘’’Download for Linux 32 bit’’’ બતાવે છે.

|-
| 01:20
| હવે, આપણે જોઈએ કે તમારા મશીનના '''OS type'''ની વિગતો કેવી રીતે શોધાય.

|-
| 01:26
| આ માટે,તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 01:34
| '''System Settings'''ને ક્લિક કરતા એક પેજ ખુલે છે.

|-
| 01:40
| પેનલ ''''System''''ની નીચે, ''''Details'''' આઇકોન ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 01:48
| અહીં નવી વીન્ડોવ ''''Details'''' ખુલે છે. તમારા મશીનની '''OS type'''’ ચેક કરો કે શું તે '''64-bit''' છે કે '''32-bit'''.

|-
| 02:00
| મારુ મશીન '''64 bit'''નું છે. હવે આ વીન્ડોવને બંધ કરી પાછા બ્રાઉઝર ઉપર જઈએ.

|-
| 02:07
| જો તમારું મશીન '''32 bit'''નું હોય તો '''32 bit version''' ડાઉનલોડ કરવાનું.

|-
| 02:14
| હું લિંક'''Download for Linux 64 bit ''' ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:19
| તરત જ એક નવી વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 02:22
| હું એક નવી ઉઝર હોવાથી, વિકલ્પ '''First Time User ''' ઉપર હું ક્લિક કરીશ.

|-
| 02:26
| અને પછી '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરીશું.

|-
| 02:29
| હવે આપણને થોડીક વ્યક્તિગત વિગતો ભરવા માટે પૂછવામાં આવે છે.

|-
| 02:33
| તે ભર્યા પછી, '''Download ''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:37
| એક ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.અહીં '''Save File''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| આ થોડીક ક્ષણ લેશે જે તમારા ઈન્ટરનેટની ગતિ ઉપર આધાર રાખે છે.

|-
| 02:49
| જેવી ફાઈલ ડાઉનલોડ થઇ જાય,'''Ctrl+Alt+T ''' કીઝ દબાવી '''terminal''' ઉપર જાઓ.

|-
| 02:58
| મેં પહેલેથી જ આ ફાઈલ ડાઉનલોડ કરી રાખી છે જે ડિફોલ્ટ ફોલ્ડર '''Downloads '''માં છે.

|-
| 03:04
| તો પહેલા હું તે ફોલ્ડરમાં જાઉં, ટાઈપ કરો '''cd space Downloads ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:15
| ટાઈપ કરો '''ls ''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 03:20
| અહીં આ રહી આપણે ડાઉનલોડ કરેલી ફાઈલ.

|-
| 03:25
| જો તમે '''32 bit ''' ડાઉનલોડ કરી હોત તો ફાઈલનું નામ '''64'''ની જગ્યા એ '''32''' હોત.

|-
| 03:32
| હવેથી ટર્મિનલ કમાન્ડમાં તમારા '''32 bit installer '''ના ફાઈલનું નામ વાપરવાનું યાદ રાખો

|-
| 03:39
| હવે આપણે ફાઈલ પરમિશનને બદલવી પડશેતો ટાઈપ કરો

|-
| 03:43
| '''sudo space chmod space 777 space hyphen capital R space CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run'''

|-
| 04:08
| '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:12
| '''admin''' પાસવર્ડ ટાઈપ કરો અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 04:19
| હવે આપણે ફાઈલને રન કરવા ટાઈપ કરીશું '''dot forward slash CellDesigner hyphen 4.3 hyphen linux hyphen x64 hyphen installer.run ''' અને '''Enter''' દબાવીશું.

|-
| 04:39
| '''Setup wizard''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:43
| બટન ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:47
| '''I accept the agreement ''' વિકલ્પ ક્લિક કરીએ અને પછી '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 04:54
| '''Installation Directory ''' ડાયલોગ આ ડાયરેક્ટરી બતાવે છે જ્યાં '''CellDesigner ''' ઇન્સ્ટોલ થશે.

|-
| 05:00
| તે આ રીતે દેખાશે '''<nowiki>/home/<your username>/CellDesigner4.3</nowiki>''' હવે '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:10
| તે કહે છે '''Ready to Install'''. પાછું '''Next''' ક્લિક કરીએ.

|-
| 05:17
| ઈન્સ્ટોલેશન ચાલુ થશે.

|-
| 05:20
| જેવું પૂરું થાય, '''‘View Readme File’''' ને અનચેક કરો અને '''Finish''' બટન ક્લિક કરો.

|-
| 05:29
| હવે '''Ctrl + Alt + T ''' કીઝ દબાવી નવું '''terminal ''' ખોલો.

|-
| 05:34
| ટાઈપ કરો '''ls''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 05:39
| અહીં આપણે '''runCellDesigner4.3 ''' ફાઈલ જોઈ શકીએ છીએ.

|-
| 05:44
| '''CellDesigner'''ને ખોલવા આપણને આ ફાઈલ એગઝીક્યૂટ(execute) કરવી પડશે.

|-
| 05:48
| તો ટાઈપ કરો '''dot forward slash runCellDesigner4.3''' અને '''Enter''' દબાવો.

|-
| 06:00
| '''CellDesigner''' વીન્ડોવ આપણા '''Linux''' મશીનમાં હવે ખુલ્યું છે .

|-
| 06:05
| તમે ધ્યાનથી જુઓ કે આપણે '''Main menu''' બાર બરાબર જોઈ શકતા નથી. તેને જોવા માટે , આપણને '''system settings''' બદલવા પડશે.

|-
| 06:15
| તમારા મશીનમાં સૌથી ઉપર જમણી બાજુના ખૂણામાં રહેલ ''''System Settings'''' આઇકોનને ક્લિક કરો.

|-
| 06:23
| ક્લિક કરતા '''System Settings''' પેજ ખુલે છે.

|-
| 06:28
| પેનલ ''''Personal'''' ની નીચે ''''Appearance'''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરો.

|-
| 06:34
| ''''Appearance'''' નામની વીન્ડોવ ખુલે છે.

|-
| 06:38
| ટેબ ''''Look''''ની નીચેના , '''Theme''' ઉપર જાઓ.

|-
| 06:43
| ''''Theme'''' બોક્સના ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ માંથી, ''''Radiance''''ને સિલેક્ટ કરો અને વીન્ડોવ બંધ કરો.

|-
| 06:53
| હવે ધ્યાનથી જુઓ '''Main menu''' બાર બરાબર દેખાય છે. ચાલો આગળ વધીએ હવે.

|-
| 07:01
| નવા ડોક્યુમેન્ટને ખોલવા , '''File''' ક્લિક કરો અને પછી '''New''' ક્લિક કરો.

|-
| 07:07
| વૈકલ્પિક રીતે , મેનુ બાર ના '''New''' આઇકોન ઉપર ક્લિક કરો અથવા '''Ctrl + N''' કીઝ દબાવો.

|-
| 07:16
| '''New Document''' ડાયલોગ બોક્સ સ્ક્રીન ઉપર ખુલે છે જે આપણેને કહે છે કે ફાઈલ નું નામ આપો.

|-
| 07:23
| ફાઈલનું નામ ''''Create and Edit'''' ટાઈપ કરો.

|-
| 07:30
| '''Width''' ને 900, '''Height''' ને 800 સેટ કરો.

|-
| 07:36
| નીચે રહેલા '''Ok''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:40
| એક માહિતી આપતું બોક્સ(information box) ખુલે છે.

|-
| 07:43
| અને નામમાં આપણે આપેલ બધા સ્પેસીસ , બદલાઈને '''underscore''' થઇ જાય છે.

|-
| 07:48
| તો ખરેખર ફાઈલનું નામ થશે ''''Create underscore and underscore Edit''''. '''Ok''' ક્લિક કરીએ અને આગળ વધીએ.

|-
| 07:58
| કેન્દ્રમાં દેખાતો સફેદ વિભાગ છે તેને આપણે Draw વિભાગ તરીકે બોલીશું.

|-
| 08:02
| આપણે menu bars, toolbars અને વિવિધ panels ને હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખીશું.

|-
| 08:09
| ટૂલ બારના બીજા અન્ય આઇકોનને સિલેક્ટ કરતા પહેલા , '''Select Mode''' બટનને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:16
| તે એક સિલેક્શન ટૂલ તરીકે વર્તશે.આ સિલેક્શન ટૂલની મદદથી ,આપણે ડ્રો વિસ્તારમાં કમ્પોનન્ટને Select ,Draw અને move કરી શકીએ.

|-
| 08:25
| કમ્પોનન્ટ ડ્રો કરતા પહેલા , આપણે ખાતરી કરીશું કે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાના '''Grid Snap''' અને '''Grid Visible''' એનેબલ છે કે નથી .

|-
| 08:35
| તે માટે "Main Menu " બારના '''Edit'''ને ક્લિક કરીએ .

|-
| 08:39
| નીચે સ્ક્રોલ કરીએ અને '''Grid Snap'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| પાછા '''Edit''' ઉપર જઈએ અને '''Grid Visible'''ને ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:49
| '''Grids''' આપણને Draw વિસ્તારમાં કમ્પોનંટ્સને સરખું સંરેખિત રીતે ગોઠવવા ઉપયોગી નીવડે છે.

|-
| 08:54
| ચાલો હવે '''List '''અને '''Notes''' વિસ્તારના સ્થાન બદલીએ.

|-
| 08:59
| યાદ કરો કે આપણે '''List''' વિસ્તાર, '''Notes''' વિસ્તાર અને Draw વિસ્તાર અગાઉંના ટ્યૂટોરિઅલમાં જ શીખી લીધા છે.

|-
| 09:06
| જો તમને યાદ ન હોય તો આ શ્રેણીના તે ટ્યૂટોરિઅલને તમે નિહાળી શકો છો.

|-
| 09:12
| ચાલો આગળ વધીએ અને List વિસ્તારનું સ્થાન બદલીએ.

|-
| 09:15
| '''View''' વિકલ્પ ઉપર જાઓ, '''List '''ને ક્લિક કરો અને ‘'''Right’''' વિકલ્પને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 09:24
| તે ‘'''List’'''ને Draw વિસ્તારની જમણી બાજુએ ખસેડે છે.

|-
| 09:30
| આ વિસ્તારોના માપ તેની બોર્ડરલાઈંસને ડ્રેગ કરી બદલી શકાય છે.

|-
| 09:35
| આપણે આ બોર્ડરલાઇન ઉપર કર્સર ખસેડીશું .

|-
| 09:38
| તમે બે મસ્તકવાળો એરો જોઈ શકો છો. તેને Draw વિસ્તારના મહત્તમ અથવા લઘુત્તમમાં ડ્રેગ કરો.

|-
| 09:45
| હવે આપણે Draw વિસ્તારમાં કામ કરવા ઉપર આગળ વધીશું.

|-
| 09:49
| તે પહેલા , આપણે '''CellDesigner''' વીન્ડોવમાં બધા જ આઇકોન્સને જોઈ શકીએ તેવું હોવું જોઈએ.

|-
| 09:55
| તે માટે, Main Menu બારમાંના '''View ''' ઉપર જાઓ.

|-
| 10:00
| '''Change Toolbar Visible''' ઉપર ક્લિક કરો અને ''' Show All''' વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| હવે તમે '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર બધા જ આઇકોન્સ જોઈ શકો છો . ચાલો આગળ વધીએ.

|-
| 10:17
| એક cell અથવા એક intracellular compartmentને દર્શાવવા , આપણે ટૂલ બારમાંના '''Square''' આઇકોનનો ઉપયોગ કરીશું .તો પ્રથમ તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:28
| પછી Draw વિસ્તાર ઉપર ક્લિક કરીએ। અને માઉસનું બટન ચોદતા પહેલા, તેને ડ્રેગ કરો જેથી એક ચોરસ બનશે. હવે માઉસ બટનને છોડી દો.

|-
| 10:38
| જે ''''Property of Compartment'''' ડાયલોગ ખુલે છે તેમાં, '''Name'''ને '''Cell''' તરીકે લખો અને '''Size'''ને 1.0 આપી '''Ok.''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:52
| નામ કમ્પાર્ટમેન્ટના નીચેના ભાગમાં દ્રશ્યમાન થાય છે.

|-
| 10:57
| તમે કમ્પાર્ટમેન્ટના નામનું સ્થાન પણ બદલી શકો.

|-
| 11:01
| તે કરવા, કમ્પાર્ટમેન્ટ નામને સિલેક્ટ કરો,જે આપણા કેસમાં '''Cell''' છે.

|-
| 11:07
| હવે તેને ડ્રેગ અને ડ્રોપ કરો જ્યાં તમને મૂકવું હોય.

|-
| 11:14
| હવે આ ફાઈલને સેવ કરવા '''File''' ઉપર ક્લિક કરીએ તેના '''Save As''' વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 11:22
| હવે તમારે કાયા ફોલ્ડરમાં સેવ કરવું છે તે પસંદ કરો.

|-
| 11:26
| મારે તેને મારા '''Desktop''' ઉપર જ સેવ કરવું છે.

|-
| 11:28
| તો હું ફોલ્ડર તરીકે '''Desktop ''' ઉપર બે વાર ક્લિક કરીશ જેમાં મારે ફાઈલને સેવ કરવી છે.

|-
| 11:34
| અને પછી નીચે જમણી બાજુના '''Ok ''' બટન ઉપર ક્લિક કરીશ.

|-
| 11:38
| હજી પાછું એક વાર, નીચે જમણી બાજુના '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ। આપણી ફાઈલ હવે સેવ થઇ ગઈ છે.

|-
| 11:46
| '''CellDesigner'''ને બંધ કરવા , '''File ''' ઉપર ક્લિક કરો અને પછી '''Exit'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 11:52
| હવે આપણે તે ફોલ્ડરમાં જઈએ જ્યાં આપણે ફાઈલને સેવ કરી છે. તો હું મારા '''Desktop''' ઉપર જાઉં .આ રહી મારી ફાઈલ.

|-
| 12:00
| નોંધ લો કે આ ફાઈલ '''.xml ''' ફોર્મેટમાં સેવ થઇ છે . તે '''CellDesigner '''ની ડિફોલ્ટ ફાઈલ ફોર્મેટ છે.

|-
| 12:08
| વળી નોંધ લો કે આ ફાઈલ માત્ર '''CellDesigner'''માં જ ખુલી શકે.

|-
| 12:12
| ચાલો આ ટ્યૂટોરિઅલનો બોધ જોઈએ કે , આપણે શીખ્યા : કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને

|-
| 12:17
| '''CellDesigner ''' આવૃત્તિ 4.3ને '''Ubuntu Linux OS ''' ઉપર ઇન્સ્ટોલ કરવું, '''CellDesigner '''માં '''Compartment''' બનાવવું

|-
| 12:27
| આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે.

|-
| 12:35
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં ‘’’spoken-tutorial.org’’’ ઉપર લખો.

|-
| 12:45
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી ’’’’spoken hyphen tutorial dot org slash NMEICT hyphen Intro ’’’ ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 12:57
| ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા આભાર।

|}

CellDesigner/C2/Installation-of-CellDesigner/Gujarati

2017-10-09T07:40:18Z

Shivanigada:

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Installation of CellDesigner''' ને સમજાવતા આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:05
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખીશું: '''CellDesigner 4.3''' ને '''Windows''' ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 00:14
|આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા, હું '''Windows XP''' અને '''CellDesigner 4.3''' નો ઉપયોગ કરી રહી છું.

|-
| 00:21
|ખાસ ધ્યાન રાખો કે '''CellDesigner''' એ '''Linux''' અને '''Mac OS X''' ઉપર પણ કાર્ય કરે છે.

|-
| 00:27
|ધ્યાન રાખો કે જો તમારે કોઈ પણ સોફ્ટવેર ઇન્સ્ટોલ કરવું હોય તો તમે એક એડમીન યુઝર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:34
|તમે '''www.celldesigner.org''' વેબસાઈટ ઉપરથી '''CellDesigner''' ડાઉનલોડ કરી શકો છો.

|-
| 00:42
| હોમ પેજ ઉપર તમને '''downloads''' નામનું ટેબ મળશે. તેના ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:48
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે. નીચે સ્ક્રોલ કરો.

|-
| 00:53
| '''Download CellDesigner''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 00:56
| નીચે સ્ક્રોલ કરો. '''Download''' શીર્ષક નીચે, ચાર લિંક્સ દેખાઈ રહી છે.

|-
| 01:03
| પ્રથમ લિંક ઉપર ક્લિક કરો જે છે '''Download for windows 32 bit'''.

|-
| 01:09
|તે તમને બીજા અન્ય પેજ ઉપર લઇ જશે.

|-
| 01:11
| અહીં આ બે વિકલ્પો છે - '''Registered User''' અને '''First Time User'''

|-
| 01:17
| તમે હમણાં પહેલીવારના ઉપભોગકર્તા(user) છો.

|-
| 01:21
| તો '''First Time User''' ઉપર ક્લિક કરો. '''Continue''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:25
| હવે તમારે તમારી વિગતો અહીં ભરવાની છે.

|-
| 01:27
| ચાલો હું અહીં વિગતો ભરું.

|-
| 01:30
| એકવાર વિગતો નીચે જય અહીં '''Download''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:37
|તમારે આ વિગતો એક જ વાર ભરવી પડશે.

|-
| 01:41
|પછીથી તમારે જો કોઈ બીજી નવી આવૃત્તિ ઇન્સ્ટોલ કરવી હોય તો તમારે '''Registered user''' ઉપર દબાવવું પડશે''.

|-
| 01:48
| ઈમેલ એડ્રેસ અને પાસવર્ડ લખો અને તમને આ પ્રમાણે સેટ અપ ફાઈલ મળશે.

|-
| 01:53
| હવે '''Save File''' ઉપર ક્લિક કરો

|-
| 01:56
| તે સેટ અપ ફાઈલ ડાઉનલોડ થવાનું શરુ કરશે . તે માત્ર થોડીક ક્ષણ લેશે

|-
| 02:02
|ડાઉનલોડિંગ ખતમ થયા પછી '''set-up''' ફાઈલ ખોલીએ,

|-
| 02:07
| તેના ઉપર ક્લિક કરો. હવે '''Run''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:12
| '''Next''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:14
| આ વિકલ્પ '''I accept the agreement'''ને પસંદ કરીએ.

|-
| 02:17
| '''Next''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:20
| '''CellDesigner''' તમારા કોમ્પ્યુટર ઉપર ક્યાં ઇન્સ્ટોલ કરવું છે તે માટે યોગ્ય ફોલ્ડર પસંદ કરો.

|-
| 02:25
| '''Next''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:27
| '''Next''' બટન ક્લિક કરીએ

|-
| 02:31
| ઈન્સ્ટોલેશન ક્રિયાને પૂર્ણ કરવા '''Finish''' બટન ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 02:36
| તમને કેટલીક સૂચનાઓ મળશે. તેને ધ્યાનથી વાંચો

|-
| 02:40
| અને પછી '''OK''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:44
| હવે સેલડિઝાઈનરને ચાલુ કરવા ડેસ્કટોપ પરના '''shortcut CellDesigner icon''' ને ક્લિક કરો .

|-
| 02:52
| આ '''CellDesigner Interface''' છે.

|-
| 02:56
| હવે પછીના આવતા ટ્યૂટોરિઅલ્સમાં આપણે મેનુ બાર્સ,ટૂલ બાર્સ અને વિવિધ પેનલ્સ વિશે શીખીશું.

|-
| 03:02
|આ મોડેલ '''CellDesigner'''ની મદદથી દોરેલું છે.

|-
| 03:07
|અહીં આ સબસ્ટ્રેટ(નીચેનો થર) આ એન્ઝાઇમ(પાચક રસ) સાથે જોડાય છે અને એક એન્ઝાઇમ-સબસ્ટ્રેટ કોમ્પ્લેક્સની રચના થાય છે. આ સબસ્ટ્રેટ એક બનાવટમાં રૂપાંતરિત થાય છે.

|-
| 03:17
|ચાલો આ મોડેલ '''CellDesigner'''માં જોઈએ

|-
| 03:20
|આપણે આવા ઘણા જૈવિક(બાયોલોજીકલ) નેટવર્ક્સ '''CellDesigner''' દ્વારા બનાવી શકીએ છીએ.

|-
| 03:25
| ઈન્સ્ટોલેશન બરાબર થયું છે કે નહિ તેની ચકાસણી કરવા.

|-
| 03:30
| ચાલો પાછા '''CellDesigner''' વીન્ડોવ ઉપર જઈએ .

|-
| 03:34
| ચાલો અહીં એક '''Protein''' ઉમેરીએ.

|-
| 03:37
| ચાલો ફાઈલમાં જઈએ,'''New''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 03:41
| હું એને '''trial''' નામ આપીશ. '''OK''' ઉપર ક્લિક કરીએ

|-
| 03:45
| હું '''protein''' ને પસંદ કરું.

|-
| 03:48
| અહીં ક્લિક કરો અને એને નામ આપો '''A'''.

|-
| 03:52
| અને '''OK''' ક્લિક કરીએ

|-
| 03:55
| હવે પછીના ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે આની સાથે કરીશું અને આ મોડેલ બનાવીશું।

|-
| 04:01
| તો આ આપણને આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલના અંતે લઇ જાય છે જે છે '''Installation-of-CellDesigner'''.

|-
| 04:07
|આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે શીખ્યું કે '''CellDesigner 4.3'''ને '''Windows Operating System''' ઉપર કેવી રીતે ડાઉનલોડ અને ઇન્સ્ટોલ કરવું.

|-
| 04:15
|આ આપેલ લિંક ઉપર ઉપલબ્ધ વિડિયો જુઓ તે તમને સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ વિશે માહિતી આપે છે. જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિથ ન હોય તો તમે તેને ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.

|-
| 04:27
|સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અહીં '''spoken-tutorial.org''' ઉપર લખો.

|-
| 04:44
|સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ યોજના એ ટોક ટુ અ ટીચર યોજનાનો એક ભાગ છે. જે આઇસીટી,એમએચઆરડી,ભારત સરકાર દ્વારા શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધારભૂત છે. આ ઉપર વધુ માહિતી "સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ '''NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો''' ઉપર ઉપલબ્ધ છે .

|-
| 05:06
|ભાષાંતર કરનાર હું છું શિવાની ગડા. અમારી સાથે જોડાવા માટે આભાર।

|}