Script | Spoken-Tutorial - User contributions [en]

Avogadro/C4/File-Extensions/Tamil

2018-01-10T07:36:30Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- |00:01 | வணக்கம் '''File Extensions''' குறித்த இந்த டுடோரி..."

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
|00:01
| வணக்கம் '''File Extensions''' குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.
|-
|00:05
| இந்த டுடோரியலில், : '''GAMESS, Gaussian, MOPAC, NWChem''' முதலிய '''computational chemistry''' programmeகளுக்கு எப்படி input file களை உருவாக்குவது என்பது குறித்தும்,
|-
|00:18
|மேலும், '''GAMESS''' மற்றும் '''Gaussian''' ஆகிய softwareகளில் கிடைக்கும் output file களை வைத்து '''Molecular orbitals ''' மற்றும் '''calculated IR spectrum''' ஆகியவற்றை எப்படி காண்பது என்றும் கற்கலாம்.
|-
|00:28
| நான் பயன்படுத்துவது, '''Ubuntu Linux '''OS version 14.04.
'''Avogadro''' version 1.1.1.
|-
|00:38
| இந்த டுடோரியலைப் பின்தொடர '''Avogadro''' interface குறித்த பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும்.
|-
|00:43
| அது தொடர்பான டுடோரியல்களுக்கு எங்கள் இணையதளத்திற்கு செல்லவும்.
|-
|00:49
| இந்த டுடோரியலில் காட்டப்படும் எடுத்துக்காட்டுகளின் fileகள், code files ஆக கொடுக்கப்பட்டுள்ளன.
|-
|00:55
| அவற்றை desktop இல் ஒரு folder இல் பதிவிறக்கி சேமித்துக்கொள்ளவும்.
|-
|01:00
| ஒரு புதிய '''Avogadro''' விண்டோவைத் திறந்துள்ளேன்.
|-
|01:04
| '''Build''' மெனுவில் இருந்து '''Insert fragment''' library ஐப் பயன்படுத்தி ஒரு benzene மூலக்கூறை load செய்யவும்.
|-
|01:12
| வடிவமைப்பை, tool bar இல் உள்ள '''Auto-optimization tool''' ஐப் பயன்படுத்தி optimize செய்யவும்.

|-
|01:20
| '''Extensions''' மெனுவை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|01:23
| '''Avogadro''' வைப் பயன்படுத்தி நன்கு அறியப்பட்ட,
'''GAMESS,'''
'''Gaussian'''
'''MOLPRO'''
'''MOPAC'''
'''Q-CHEM'''
போன்ற quantum code களுக்கு input file களை உருவாக்கலாம்.
|-
|01:36
|'''Gaussian''' option ஐ கிளிக் செய்யவும். ஒரு graphical data input dialog box தோன்றும்.

|-
|01:43
|'''Gaussian''' programக்கு எவ்வாறு input file ஐ உருவாக்குவது என்று காட்டுகிறேன்.
|-
|01:49
| dialog box இல் தோன்றும் தேவையான அம்சங்களை நிரப்ப வேண்டும்.
|-
| 01:55
| '''Avogadro'''வால் தானாகவே '''molecular orbital'''களை கணக்கிட முடியாது.
|-
| 01:59
| எனவே நாம் '''benzene''' மூலக்கூறின் '''molecular orbital'''களைக் காண உதவும் Input file ஐ உருவாக்கலாம்.
|-
|02:05
| '''Gaussian''' input dialog box இல், '''Benzene hyphen MO'''என்று டைப் செய்து தலைப்பிடவும்.
|-
|02:11
| '''Calculation''' drop down இல் '''Frequencies''' ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
'''Processors'''க்கு '''1''' ,
'''Theory''' க்கு '''B3LYP''' ,
'''6-31G(d)''' என '''Basis set'''க்கு ,
'''Charge க்கு zero''' ,
'''Multiplicity க்கு 1''' ,
'''Output''' க்கு '''Standard.''' ,
'''Format''' க்கு '''cartesian''' என தேர்வு செய்து
'''checkpoint check box''' ஐ செக் செய்யவும்.
|-
|02:40
| input file இன் preview வை dialog box இன் கீழே காண முடியும்.
|-
|02:45
| இது option களை மாற்றினால் update செய்யப்படும்.
|-
|02:49
| '''Generate''' button ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|02:52
| '''Save input Deck''' dialog box திறக்கிறது.
|-
|02:56
|உருவாக்கப்படும் '''Gaussian input file''' ஆனது, ஒரு '''dot com''' extension ஆக சேமிக்கப்படும்.
|-
|03:02
| File name ஐ '''Benzene''' என டைப் செய்து location ஐ '''Desktop''' என தேர்வு செய்து '''Save''' button ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:10
| File '''Benzene.com''' என desktop இல் சேமிக்கப்படும். அதனை '''gedit''' ஐ கொண்டு திறக்கவும்.
|-
|03:18
| இப்பொழுது இந்த file ஐ, '''Gaussian''' software programmeல் input file ஆகப் பயன்படுத்தலாம்.
|-
|03:24
| '''Gaussian''' software பற்றி ஒரு அறிமுகம்.
|-
|03:28
|'''Gaussian''' என்பது '''computational chemistry'''க்கான ஒரு computer programme.
|-
|03:32
| இதனை '''Gaussian Inc''' எனும் நிறுவனம் தயாரித்து, உரிமம் வழங்குகிறது.
மேல் அதிக தகவல்கள் இந்த தளத்தில் உள்ளது. http://www.gaussian.com/
|-
|03:41
| '''Avogadro''' விண்டோவுக்கு திரும்பி dialog box ஐ மூடவும்.
|-
|03:46
| இனி '''GAMESS''' programmeக்கு ஏற்றவாறு எப்படி ஒரு input file ஐ உருவாக்குவது என்று காணலாம்.
|-
|03:51
|ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும். '''Tools''' மெனுவில் “'''New'''”ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:56
| '''Draw tool''' மூலம் நீர் மூலக்கூறை வரைந்து Element ஐ '''Oxygen''' என மாற்றவும்.
|-
|04:01
| panel இல் கிளிக் செய்து '''auto-optimization tool'''ஐப் பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை Optimize செய்யவும்.
|-
|04:08
| '''Extensions மெனுவை கிளிக் செய்து sub-menu வில் '''GAMESS, Input generator''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
|04:16
| '''GAMESS''' input dialog box திறக்கிறது. இதில் '''Basic setup''' மற்றும் '''Advanced setup''' என இரண்டு tab கள் உள்ளன.
|-
|04:24
| '''Gaussian '''input file இல் செய்தது போலவே, தேவையான தகவல்களை நிரப்பவும்.
|-
|04:29
| '''Basic Setup'''இன் கீழே, '''Calculate''' field இல் '''Equilibrium Geometry ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
|04:36
| '''RHF''', என்றால் '''Restricted Hartee Fock'''. இது'''wave function''' களை தீர்மானிக்கும் ஒரு '''method of approximation ''' ஆகும்
|-
|04:44
| நீர் ஒரு சிறிய மூலக்கூறு, எனவே நாம் '''6-31G (d,p)''' ஐ '''Basis set''' என தேர்ந்தெடுக்கலாம்.
|-
|04:52
| ''' Gas''' phase இல் '''singlet''', ஏனெனில் எல்லா electron களும் pair ஆகி இருக்கும்.
|-
|04:58
| நீர் சம மின்விசை உடையது எனவே, ''' charge''' ஐ '''neutral''' என தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|05:02
| '''Advanced Setup ''' இன் மீது கிளிக் செய்து optimization ஐக் கட்டுப்படுத்தும் மேலும் சில parameter களை சேர்க்கவேண்டும்.
|-
|05:08
| '''Basis ''' இன் செயல்பாட்டை மாற்ற விரும்பினால் கிளிக் செய்யவும்.
|-
|05:12
| '''Data'''வை கிளிக் செய்யவும்
|-
|05:14
| '''Title''' ஐ '''water-MO''' என டைப் செய்யவும்.
|-
|05:18
| '''Point Group''' ஐ '''CnV''' என மாற்றவும்.
|-
|05:21
|'''Order of Principal Axis''' ஐ '''2''' என மாற்றவும்.
|-
|05:24
| தற்போதைக்கு நாம் முன்னிருப்பாக இருக்கும் parameter களை அப்படியே வைப்போம்.

|-
|05:29
|'''Generate''' ஐ கிளிக் செய்யவும். ஒரு '''Save Input deck''' திறக்கிறது.
|-
|05:34
|முன்னிருப்பாக, file extension '''dot inp''' என இருக்கும்.
|-
|05:38
|file name ஐ '''Water''' என டைப் செய்யவும்.
|-
|05:42
| File location ஐ '''Desktop''' என தேர்வு செய்து, '''Save button''' ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
|05:48
| '''GAMESS''' input file '''Desktop'''இல் '''Water.inp''' என சேமிக்கப்பட்டிருக்கும்.
|-
|05:55
| '''GAMESS'''ஐப் பற்றி ஒரு அறிமுகம்
|-
|05:57
| '''GAMESS''' என்பது: '''General Atomic and Molecular Electronic Structure System'''.
இது ஒரு பொதுவான ab initio quantum chemistry package ஆகும்.
|-
|06:08
| இது கல்வி நிலைய பயனர்களுக்கும், தொழில் நிறுவனங்களுக்கும் இலவசமாக கிடைக்கிறது.
|-
|06:14
| இதை பதிவிறக்கி நிறுவுதல் பற்றி பின்வரும் வலைத்தளத்தில் உள்ளது. http://www.msg.ameslab.gov/gamess/download.html
|-
|06:20
| நாம் இப்பொழுது '''GAMESS''' மற்றும் '''Gaussian''' programmeகளுக்கான input file களை உருவாக்கியுள்ளோம்.
|-
|06:26
|இவை அந்தந்த programmeகளில் load செய்ய தாயாராக உள்ளன.
|-
|06:31
| பார்வையாளர்கள் கவனத்திற்கு, '''Gaussian''' ஒரு வணிக மென்பொருள் ஆகும். எனவே என்னால் load செய்யப்படும் interface ஐ காட்ட முடியாது.
|-
|06:41
| முன் சொன்னது போல '''GAMESS''' ஒரு இலவச மென்பொருள் ஆகும்.
|-
|06:45
| விருப்பமுள்ளவர்கள் '''GAMESS''' softwareஐபின்வரும் link இல் இருந்து பதிவிறக்கி,
input file ஐ load செய்து output file ஐ உருவாக்கலாம்.
http://www.msg.ameslab.gov/gamess/download.htm

|-
|06:53
| என்னிடம் சில '''Gaussian மற்றும் GAMESS''' output fileகள் desktop இல் உள்ளன.
|-
|06:58
|அவற்றை இந்த டுடோரியலுடன் code files ஆக இணைத்துள்ளேன்.
|-
|07:03
|இந்த output fileகளை '''Avogadro''' வில் காணலாம்.
|-
|07:07
| ஒரு புதிய Avogadro விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
|07:10
| Tool bar இல் '''open''' icon ஐ திறக்கவும்.
|-
|07:13
| File locationக்கு சென்று, '''Benzene.log'''ஐ தேர்வு செய்யவும்
|-
|07:18
| File திறக்கிறது, '''benzene''' இன் வடிவமைப்பை panelஇல் காணமுடிகிறது.
|-
|07:24
| '''Benzene.log''' ஆனது '''Gaussian''' ஆல் உருவாக்கப்பட்டது.
|-
|07:28
|இதில் '''molecular orbitals''', '''C-C''' மற்றும் '''C-H '''bond stretching குறித்த தகவல்கள் உள்ளன.
|-
|07:36
| சிலநேரம் log file இல் orbital informationகள் இருக்காது.
|-
|07:40
|அதுபோன்ற நேரங்களில் code file களில் கொடுக்கப்பட்டிருக்கும்'''.fchk '''file ஐத் திறக்கவும்,
|-
|07:47
| '''orbitals,'''களை காண்பதற்கு list இல் '''orbital''' இல் கிளிக் செய்யவும்.
|-
|07:54
| '''orbitals'''களின் தோற்றத்தை மாற்ற விரும்பினால், display types இல் surfaces option க்கு அடுத்து உள்ள '''spanner''' symbol இல் கிளிக் செய்யவும்.
|-
|08:02
| '''Surface Setting''' dialog box இல், '''slider''' ஐ இழுத்து opacity ஐ மாற்றவும். Panel இல் பாருங்கள்.
|-
|08:10
| '''Render''' drop-down இல், '''fill''', '''lines''' மற்றும் '''points''' என மூன்று optionகள் உள்ளன.

|-
|08:17
| முன்னிருப்பாக, '''orbitals '''கள் '''fill''' என render செய்யப்பட்டிருக்கும்.
|-
|08:21
| lobeகளின் வண்ணத்தை மாற்றும் வசதி உள்ளது.
|-
|08:25
| '''Positive''' மற்றும் '''Negative''' option களுக்கு அடுத்துள்ள '''Color''' tabs ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
|08:30
| '''Select Color''' dialog box தோன்றுகிறது.
|-
|08:33
| ஏதேனும் ஒரு வண்ணத்தை தேர்ந்தெடுத்து '''OK'''பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|08:38
| panel இல் பாருங்கள், இப்போது orbital களின் வண்ணங்கள் மாறியிருக்கிறது. Dialog boxஐ மூடவும்.
|-
|08:45
| Orbital களை வடிவமைப்பில் இருந்து நீக்க; '''Display Types''' ல் '''Surfaces''' option ஐ Un-check செய்யவும்.
|-
|08:51
| '''Vibrations''' ல் கிளிக் செய்து '''vibrational frequencies ''' ஐ காண முடியும்.
|-
|08:56
| '''Vibration''' window வில், லிஸ்ட்டில் காணும் ஏதேனும் ஒரு frequency ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|09:01
|விண்டோவின் கீழே இருக்கும் '''Start Animation''' button ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|09:06
| Panel இல் பாருங்கள். '''C-C''' மற்றும் '''C-H''' பிணைப்புகளின் stretching கள் animate செய்யப்படுகிறது.
|-
|09:13
| வடிவமைப்பின் IR spectrum ஐ காண முடியும்.
|-
|09:17
| '''Show Spectra''' ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
|09:20
| ஒரு '''Spectra Visualization''' விண்டா திறக்கிறது. இதில் '''Benzene''' இன் calculated''' IR spectrum''' உள்ளது.
|-
|09:27
| ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும். '''GAMESS''' programmeல் உருவாக்கப்பட்ட நீர் மூலக்கூறின் '''log''' file ஐத் திறக்கவும்.
|-
|09:35
| நீர் மூலக்கூறின் வடிவமைப்பு மற்றும் Molecular orbital information உடன் '''log''' file திறக்கிறது.
|-
|09:41
| List இல் இருந்து '''orbital''' இன் பெயர் மீது கிளிக் செய்யவும். Panel இல் Orbital காட்டப்படுகிறது.
|-
|09:47
| அனைத்தையும் நினைவு கூறலாம்.
|-
|09:49
| இந்த டுடோரியலில், '''GAMESS மற்றும் Gaussian''' முதலிய '''computational chemistry''' programmeகளுக்கு input files ஐ உருவாக்குவது,
|-
|09:58
| '''Benzene''' மற்றும் '''water''' மூலக்கூறுகளின் '''Molecular orbital''' களைக் காண்பது,
|-
|10:04
| '''Gaussian''' இல் உருவாக்கிய log file களைக் கொண்டு மூலக்கூறுகளின் '''IR spectrum''' ஐ காண்பது, ஆகியவற்றைக் கற்றுள்ளோம்.
|-
|10:11
| பயிற்சிக்காக, code files ல் கொடுக்கப்பட்டிருக்கும் '''benzene''' மூலக்கூறின் log file ஐத் திறந்து,
|-
|10:18
| List இல் இருந்து ஏதேனும் ஒரு '''Molecular Orbital''' ஐக் காட்டவும்.
|-
|10:22
| Lobe களின் தோற்றத்தையும், வண்ணத்தையும் மாற்றவும். image ஐ '''JPEG '''format இல் சேமிக்கவும்.
|-
|10:29
| இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்.
|-
|10:35
| Spoken Tutorialகளை பயன்படுத்தி பயிற்சி வகுப்புகள் நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம். எங்களைத் தொடர்பு கொள்ளவும்.
|-
|10:42
| இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.
|-
|10:48
| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம். குரல் கொடுத்தது…. நன்றி.
|}

Avogadro/C3/Stereoisomerism/Tamil

2018-01-03T18:57:50Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- || 00:01 ||அனைவருக்கும் வணக்கம். '''Stereoisomerism'''குறி..."

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
|| 00:01
||அனைவருக்கும் வணக்கம். '''Stereoisomerism'''குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
||00:06
||இந்த டுடோரியலில் நாம் '''Conformational isomerism''',

'''Geometrical isomerism''' மற்றும் '''R-S configuration''' களை உதாரணத்துடன் கற்போம்.

|-
||00:18
||நான் பயன்படுத்துவது,
'''Ubuntu Linux''' OS version. 14.04
'''Avogadro''' version 1.1.1.
|-
||00:28
|| இந்த டுடோரியலைப் பின்தொடர '''Avogadro''' interface குறித்த பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும். அது தொடர்பான டுடோரியல்களுக்கு எங்கள் இணைய தளத்திற்கு செல்லவும்.
|-
||00:39
|| இந்த டுடோரியலில் காட்டப்படும் எடுத்துக்காட்டுகளின் fileகள், code files ஆக கொடுக்கப்பட்டுள்ளன.
|-
||00:45
||இந்த டுடோரியலில் '''Avogadro''' வைப் பயன்படுத்தி '''stereoisomer'''களைக் கட்டமைப்பது பற்றி காணலாம்.
|-
||00:51
||'''stereoisomerism'''குறித்து சிறிய அறிமுகம் செய்கிறேன்.
|-
||00:56
||அணுக்களின் spatial arrangement களின் மூலம் '''Stereoisomerism''' தோன்றுகிறது.
|-
||01:03
||'''Isomer'''கள் என்பவை ஒரே வடிவமைப்பைக் கொண்டவை. எனவே அவை பண்புகளில் பெரிதாக வேறுபடுவதில்லை.
|-
||01:09
||'''isomer'''களின் வகைப்பாடு இந்த slideல் காட்டப்படுகிறது.
|-
||01:16
||நான் '''Conformational isomerism'''இல் இருந்து தொடங்குகிறேன்.
|-
||01:21
||இது stereoisomerism இன் ஒரு வகையாகும்.
|-
||01:23
||இவற்றில், '''isomer'''களின் ஒற்றைப் பிணைப்பை சுழற்றுவதன் மூலம் ஒரு வகையிலிருந்து மற்றொரு வகைக்கு மாற்றிக்கொள்ள முடியும்.
|-
||01:30
||ஒற்றைப் பிணைப்பை மேற்கொண்டு சுழற்றுவது '''rotational energy barrier'''இன் மூலம் தடுக்கப்படுகிறது.
|-
|| 01:36
||'''1,2-dichloroethane'''இன் conformers உடன் தொடங்குவோம்.

|-
|| 01:41
||'''1,2-dichloroethane''' இவை மூன்று '''conformer''' களில் காணப்படுகிறது. அவை :
'''Eclipsed''', '''Gauche''' மற்றும் '''Anti'''
|-
|| 01:50
||நான் '''Avogadro''' விண்டோவைத் திறந்துள்ளேன்.
|-
|| 01:53
|| '''Draw''' tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|| 01:55
||'''Adjust Hydrogens''' check box ஐ அன் செக் செய்யவும்.
|-
|| 01:59
||'''Panel'''இல் கிளிக் மற்றும் drag செய்து இரண்டு அணுக்களை வரையவும்.
|-
|| 02:04
||'''Element''' drop down இல் இருந்து'''Chlorine''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
|| 02:08
||ஒவ்வொரு '''carbon''' னிலும் பிணைப்பை வரையவும்.
|-
||02:11
||'''Build'''மெனுவுக்கு சென்று '''Add Hydrogens'''ன் மீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
||02:15
||'''Panel'''இல் '''1,2-dichloroethane''' வரையப்பட்டுள்ளது.

|-
||02:19
||நாம் வடிவமைப்பை optimize செய்யலாம்.
|-
||02:22
||'''Auto Optimization''' tool ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
||02:25
|| '''Force Field'''இல்'''MMFF94'''ஐ தேர்வு செய்து '''Start'''பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
||02:35
||'''Stop''' ஐ கிளிக் செய்து '''optimization''' செயலை நிறுத்தவும்.
|-
||02:40
||'''Navigation''' tool ஐ கிளிக் செய்து வடிவமைப்பை சரியான இணக்கத்திற்கு சுழற்றவும்.
|-
||02:45
||'''Panel'''இல் '''Gauche conformer''' உள்ளது.
|-
||02:49
||'''1,2-dichloroethane'''இன் '''conformers''' ஐ காண நான் சுழலும் தளத்தை சரி செய்கிறேன்.
|-
|| 02:55
||'''Bond Centric Manipulation''' tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||02:59
||இரண்டு '''carbon''' அணுக்களுக்கு இடையே உள்ள பிணைப்பை கிளிக் செய்யவும்.
|-
||03:03
||அணுக்களுக்கு இடையே உள்ள தளம் நீலம் அல்லது மஞ்சள் வண்ணத்தில் தோன்றுகிறது.
|-
||03:08
||'''Chlorine'''அணுவின் மீது கர்ஸரை வைக்கவும்.
|-
||03:10
||பிணைப்பை கடிகாரம் சுழலும் திசையில் சுழற்றவும்.
|-
||03:14
||'''Navigation''' tool ஐ கிளிக் செய்து வடிவமைப்பை சுழற்றவும்.
|-
||03:18
||'''Panel'''இல் '''Anti conformer''' உள்ளது
|-
||03:21
||மறுபடியும் '''Bond centric Manipulation''' tool ஐ பயன்படுத்தி '''C-C bond'''சுழற்றவும்.
|-
||03:25
|| நம்மிடம்'''Panel'''இல் '''Eclipsed conformer''' உள்ளது.
|-
||03:30
||இனி '''Cyclohexane''' இன் பல்வேறு '''conformers'''ஐ காட்டுகிறேன்.
|-
||03:35
||ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
||03:38
||'''Draw settings''' மெனுவில் '''Carbon''' முன்னிருப்பு தனிமமாக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டுள்ளது.

|-
||03:44
||'''Adjust Hydrogens'''செக் பாக்ஸை அன் செக் செய்யவும்.
|-
||03:48
||'''cyclohexane''' இன் அமைப்பை '''boat form'''இல் வரையலாம்.
|-
||03:53
||Click மற்றும் drag செய்து '''cyclohexane''' இன் '''boat conformer'''ஐ'''Panel''' இல் வரையவும்.
|-
||04:01
||அணுக்களை label செய்ய, '''Display Types''' இல் இருக்கும் '''Label''' செக் பாக்ஸில் கிளிக் செய்யவும்.
|-
||04:07
||labeling எல்லா நேரமும் ஒரே மாதிரி இருக்காது என்பதை நினைவில் கொள்க.
|-
||04:11
||நமது தேவைக்கேற்ப '''conformers''' ஐ label செய்யலாம்.
|-
||04:16
||'''Selection''' tool ஐ கிளிக் செய்து பின், முதல் '''carbon''' அணுவில் ரைட் கிளிக் செய்யவும்.
|-
||04:21
||ஒரு menu கிடைக்கும். அதில் '''Change label''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
||04:25
||'''Change label of the atom''' text box தோன்றுகிறது.
|-
||04:30
||'''New Label''' field இல் 1 என டைப் செய்து '''OK'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||04:35
||பின்பு இரண்டாவது அணுவில் ரைட் கிளிக் செய்து label ஐ 2 என மாற்றவும்.
|-
||04:41
||இதேபோல 3, 4, 5 மற்றும் 6 வது அணுவின் label களை மாற்றுகிறேன்.
|-
||04:50
||'''boat''' ஐ '''twist boat conformer'''ஆக மாற்றலாம்.
|-
||04:54
||'''Manipulation''' Tool பின் 2 ஐ கிளிக் செய்து மேல் பக்கம் இழுக்கவும்.
|-
||04:57
||5 இன் மீது கிளிக் செய்து மேல் பக்கம் இழுக்கவும். 3 இன் மீது கிளிக் செய்து மேல் பக்கம் இழுக்கவும்.
|-
||05:08
||இப்போது'''Panel''' இல் '''twist boat''' உள்ளது.
|-
||05:10
||இனி '''twist boat'''ஐ '''half chair conformer''' ஆக மாற்றுவோம்.
|-
||05:16
||2 ஐ கிளிக் செய்து கீழ் பக்கம் இழுக்கவும்.
|-
||05:19
||5 ஐ கிளிக் செய்து கீழ் பக்கம் இழுக்கவும்.

|-
||05:23
||4 ஐ கிளிக் செய்து பக்கவாட்டில் இழுக்கவும்.
|-
||05:27
||சரியான வடிவமைப்புக்கு தேவைப்பட்டால் அனைத்து '''carbon''' அணுக்களின் இருப்பிடத்தை சரிசெய்யவும்.
|-
||05:33
|| '''Panel'''இல் இருப்பது '''half chair conformer'''ஆகும்.
|-
||05:36
||இப்பொழுது '''half chair'''ஐ '''chair conformer'''க்கு மாற்றியமைப்போம்.
|-
||05:41
||4 ஐ கிளிக் செய்து கீழ் பக்கம் இழுக்கவும்.
|-
||05:44
||1 ஐ கிளிக் செய்து கீழ் பக்கம் இழுக்கவும்.
|-
||05:47
||சரியான வடிவமைப்புக்கு தேவைப்பட்டால் அனைத்து '''carbon''' அணுக்களின் இருப்பிடத்தை சரிசெய்யவும்.
|-
||05:53
||இப்பொழுது இருப்பது '''chair conformer''' ஆகும்.
|-
||05:56
||பயிற்சிக்காக, '''Butane''' மற்றும் '''Cyclopentane''' இன் பல்வேறு '''conformer''' களை வரையவும்.

|-
||06:03
||இனி '''geometrical isomerism'''ஐ எடுத்துக்காட்ட சில வடிவமைப்புகளை வரைகிறேன்.
|-
||06:09
||இரட்டைப்பிணைப்பைச் சுற்றி அணுக்கள் பல்வேறு தளத்தில் அமைவதன் காரணமாக '''Geometrical isomerism''' ஏற்படுகிறது.
|-
||06:17
||இங்கே '''double-bonded carbon'''இன் மீது அணுக்கள் அல்லது groupகள் சுழல தடை உள்ளது.
|-
||06:24
||செயல் விளக்கத்திற்காக, '''cisplatin'''எனப்படும் '''diamminedichloroplatinum(II)''' இன் வடிவமைப்பை வரைகிறேன்.
|-
||06:33
||ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
||06:36
||'''Draw settings''' மெனுவில், '''Element''' drop down ஐ கிளிக் செய்து '''Other''' ஐ தேர்வு செய்யவும். '''Periodic table'''விண்டோ திறக்கிறது.
|-
||06:44
||பட்டியலில் '''Platinum (Pt)''' ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும். '''Periodic table''' விண்டோவை மூடவும்.
|-
||06:50
||'''Panel''' இல் கிளிக் செய்யவும்.
|-
||06:53
||'''Element''' drop down இல் '''Chlorine''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
||06:55
||இரண்டு '''chlorine bond'''களை '''Platinum''' அணுவின் ஒரே பக்கத்தில் வரையவும்.
|-
||07:00
||'''Element''' drop down இல் '''Nitrogen''' ஐ தேர்ந்தெடுத்து முன்பு போல இரண்டு '''nitrogen bonds''' ஐ வரையவும்.
|-
||07:07
||வடிவமைப்பை வரைந்து முடிக்க nitrogen அணுக்களில் மூன்று hydrogen கள் தேவை.
|-
||07:13
||'''Element''' drop down இல் '''Hydrogen'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|07:16
||ஒவ்வொரு'''nitrogen'''அணுவையும் கிளிக் செய்து மூன்றாவது பிணைப்பை வரையவும்.
|-
||07:21
||வடிவமைப்பை optimize செய்யலாம்.
|-
||07:24
||'''Auto Optimization''' tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||07:27
||'''Force Field''' இல் '''UFF''' ஐ கிளிக் செய்து '''Start''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
||07:35
||'''Stop''' ஐ கிளிக் செய்து optimization செயலை நிறுத்தவும்.
|-
||07:39
||செய்முறை விளக்கத்திற்கு இரண்டு வடிவங்கள் தேவை.
|-
||07:43
||நான் வடிவமைப்பை copy மற்றும் paste செய்கிறேன்.
|-
||07:46
||'''Selection''' tool ஐ கிளிக் செய்து வடிவமைப்பை தேர்வு செய்யவும்.
|-
||07:50
||முறையே '''CTRL+C''' மற்றும் '''CTRL+V''' அழுத்தி copy, paste செய்யவும். வடிவமைப்பை வலதுபக்கத்துக்கு Drag செய்யவும்.
|-
||07:57
||வசதிக்காக நான் அணுக்களை label செய்கிறேன்.
|-
||08:00
||'''Display Types''' மெனுவில் '''Label''' check box ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||08:05
||'''Hydrogen'''களை நீக்க '''Build''' மெனுவில் '''Remove Hydrogens'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||08:11
||இப்போது '''Panel'''இல் '''cisplatin''' இன் இரண்டு isomerகள் உள்ளன.
|-
||08:16
||நான் இரண்டாவது '''cis isomer''' ஐ '''trans isomer''' ஆக மாற்றுகிறேன்.
|-
||08:21
||'''Manipulation''' toolஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
||08:24
|| '''Cl4''' ஐ கிளிக் செய்து இடது பக்கம் drag செய்யவும். '''N4'''ஐ கிளிக் செய்து வலதுபக்கம் drag செய்யவும்.
|-
||08:32
||பின்னர் பிணைப்புகளின் இருப்பிடத்தை சரியான இணக்கத்திற்கு சரிசெய்து கொள்ளவும்
|-
||08:38
||'''Build''' மெனுவுக்கு சென்று '''Add Hydrogens'''ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
||08:43
||முன்பு போல ஒவ்வொரு '''nitrogen''' அணுவிலும் இரண்டு ஹைட்ரஜன் அணுக்கள் இணைக்கப்பட்டுள்ளது.
|-
||08:48
||மூன்றாவது '''Hydrogen'''ஐ '''Draw''' tool இல் உள்ள '''Hydrogen''' மூலம் இணைக்கவும்.
|-
||08:53
||வடிவத்தை optimize செய்யலாம்.
|-
||08:55
||'''Auto Optimization''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|| 08:59
|| '''Force Field''' இல் '''UFF''' ஐ தேர்வு செய்து '''Start''' button ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||09:05
|| '''Stop''' ஐ கிளிக் செய்து optimization செயலை நிறுத்தவும்.

|-
||09:09
||இப்போது '''Panel'''இல் இரண்டு '''diamminedichloroplatinum(II)''' இன் இரண்டு '''geometrical isomer'''கள் உள்ளன.
|-
||09:17
||இதுபோலவே நம்மிடம் '''diamminetetracyanoferrate(III)ion '''[Fe(NH3</sub)2(CN)4]-'''இன் '''geometrical isomerகள்''' உள்ளன.
|-
||09:25
||அடுத்ததாக '''R-S configuration'''பற்றி காணலாம்.
|-
||09:29
||'''Chiral centre''', இருப்பதன் காரணமாக '''R-S configurations'''உருவாகின்றன.
|-
||09:35
||'''Chiral centre''' என்பது ஒரு அணு நான்கு வெவ்வேறு substituent களுடன் இணைந்திருப்பதை குறிப்பதாகும்.
|-
||09:41
||Configuration கள் மற்றவையின் '''non-superimposable mirror images''' ஆகும்.
|-
||09:47
||'''R-S configurations''' இன் செயல் விளக்கத்திற்காக நான் '''amino acid - Alanine''' ஐ பயன்படுத்துகிறேன்.
|-
||09:53
||ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

|-
||09:56
||'''Alanine''' வடிவமைப்பை '''Fragment library''' இல் இருந்து load செய்கிறேன்.
|-
||10:01
||'''Fragment library'''இல் இருக்கும் அனைத்து '''amino acid'''களும் '''optically active''' ஆகும்.
|-
||10:07
||நீங்கள் உங்கள் வசதிக்கேற்ப explore செய்துகொள்ளலாம்.
|-
||10:11
|| '''CTRL+SHIFT''' மற்றும் '''A''' ஐ அழுத்தி வடிவமைப்பை deselect செய்யவும்.
|-
||10:15
||'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி சரியான இணக்கத்திற்கு வடிவமைப்பை சுழற்றிக்கொள்ளவும்.
|-
||10:22
||நான்கு வெவ்வேறு தொகுதிகளுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள மைய '''carbon''' அணு '''chiral''' ஆகும்.
|-
||10:26
||'''R S configuration''' substituent க்கு clockwise அல்லது anticlockwise திசையில் கொடுக்கப்படும் முன்னுரிமையைப் பொறுத்ததாகும்.
|-
||10:35
||substituent இன் அணு எண்ணைப் பொறுத்து முன்னுரிமை வழங்கப்படுகிறது.
|-
||10:40
||அதிக அணு எண் கொண்டுள்ள Substituent முதல் முன்னுரிமையைப் பெறுகிறது.

|-
||10:45
||நாம் இப்போது clockwise திசையில் முன்னுரிமையைக் காண்கிறோம்.
|-
||10:49
||இந்த வடிவமைப்பில், '''nitrogen''' முதல் முன்னுரிமையைப் பெறுகிறது.
|-
||10:53
||'''Oxygen'''கள் இணைக்கப்பட்டுள்ள '''Carbon''' இரண்டாவது முன்னுரிமையையும், '''methyl''' தொகுதி மூன்றாவது முன்னுரிமையையும் பெறுகிறது.
|-
||11:02
||இந்த வடிவம் '''R configuration'''ஐக் கொண்டுள்ளது.
|-
||11:05
||நான் '''chiral carbon'' உடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள தொகுதிகளை இடம் மாற்றுகிறேன்.
|-
||11:10
||'''Build''' மெனுவுக்கு சென்று '''Remove Hydrogens''' ஐத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
||11:15
|| Manipulation tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
||11:17
||'''Carbon''' ஐ வலதுபக்கம் நகர்த்தவும்.
|-
||11:20
||'''oxygens''' உடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள '''carbon''' ஐ இடது பக்கம் நகர்த்தவும்.
|-
|11:25
||'''Build''' மெனுவுக்கு சென்று '''Add Hydrogens'''ஐத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
||11:29
||இப்போது முன்னுரிமையை anti-clockwise திசையில் காணலாம்.
|-
||11:33
||'''Nitrogen''' முதல் முன்னுரிமையையும், '''Oxygen'''களுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள '''Carbon''' இரண்டாவது முன்னுரிமையையும் '''Methyl''' தொகுதி மூன்றாவது முன்னுரிமையையும் பெற்றுள்ளது.
|-
||11:45
||இந்த அமைப்பு '''S configuration''' ஆகும்.
|-
||11:48
||இதுபோல '''Glyceraldehyde''' இன் '''R''' மற்றும் '''S configuration'''கள் '''Panel''' இல் உள்ளன.
|-
||11:55
||அனைத்தையும் நினைவு கூறலாம்.
|-
||11:57
||இந்த டுடோரியலில் நாம்,
'''1,2-dichloroethane''' இன் '''Conformation'''கள்
'''cyclohexane''' இன் '''Conformation'''கள்
'''cisplatin''' இன் '''Geometrical '''isomer'''கள்
மற்றும் '''amino acid Alanine''' இன் '''R-S configuration'''கள் ஆகியவற்றை வரைய கற்றுள்ளோம்.
|-
||12:15
||பயிற்சிக்காக, '''2-butene''' மற்றும் '''1,2-dichloroethene''' இன் Geometrical '''isomer'''களையும், '''bromochloroiodomethane'''இன் '''R-S configuration'''களையும் வரையவும்.
|-
||12:29
||இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்.
|-
||12:37
||Spoken Tutorialகளை பயன்படுத்தி பயிற்சி வகுப்புகள் நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம். எங்களைத் தொடர்பு கொள்ளவும்.
|-
||12:44
|| இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.
|-
||12:51
|| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம். குரல் கொடுத்தது…. நன்றி.
|-
|}

Avogadro/C3/General-Features-in-Avogadro/Tamil

2017-12-27T21:21:40Z

Balasubramaniam: Created page with "{|border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- |00:01 |அனைவருக்கும் வணக்கம்! ''' Avogadro'''ல் General Features குறித்த..."

{|border=1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
|00:01
|அனைவருக்கும் வணக்கம்! ''' Avogadro'''ல் General Features குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
|00:08
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கபோவது: '''pH values''' ஐ மாற்றுவதன் மூலம் compoundகளில் '''Proton transfer'''

|-
|00:16
|crystal structures ஐ Load செய்வது,

|-
| 00:19
|பல்வேறு '''Miller planes''' ஐ காட்டுவது,

|-
|00:22
|super cells ஐக் கட்டமைப்பது,

|-
|00:24
|coordination compound களின் வடிவமைப்பை காண்பது மற்றும் '''nanotubes'''களைக் கட்டமைப்பது.

|-
|00:31
|நான் பயன்படுத்துவது: '''Ubuntu Linux''' OS version 14.04

|-
|00:37
|'''Avogadro''' version 1.1.1.

|-
|00:41
|இந்த டுடோரியலைப் பின்தொடர '''Avogadro''' interface குறித்த பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும்.

|-
|00:47
|அது தொடர்பான டுடோரியல்களுக்கு எங்கள் இணையதளத்திற்கு செல்லவும்.

|-
|00:52
|இந்த டுடோரியலில் காட்டப்படும் எடுத்துக்காட்டுகளின் fileகள், code files ஆக கொடுக்கப்பட்டுள்ளன.

|-
|00:58
|ஒரு புதிய '''Avogadro''' விண்டோவைத் திறந்துள்ளேன்.

|-
|01:01
|நான் '''pH value''' களை மாற்றுவதன் மூலம் compound களில் '''proton transfer''' ஐ செய்து காட்டுகிறேன்.

|-
|01:07
|இதற்காக '''Fragment library''' இல் இருந்து '''amino acid''' களை load செய்கிறேன்.

|-
|01:12
|'''Build''' menu, வை பயன்படுத்தி '''Fragment library'''க்கு செல்லவும்.

|-
|01:16
|'''Fragment library,''' யில் '''Amino acids''' folderஐ டபுள் கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:21
|'''D-alanine.cml''' ஐ தேர்வு செய்து '''Insert''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:26
|'''Insert Fragment''' dialog box ஐ மூடவும்.

|-
|01:30
|'''CTRL, SHIFT''' மற்றும் '''A''' கீகளை ஒரு சேர அழுத்தி வடிவமைப்பை deselect செய்யவும்.

|-
|01:34
|'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை சரியான இணக்கத்திற்கு rotate செய்து கொள்ளவும்.

|-
|01:39
|'''amino acid'''களில் '''pH value''' களை மாற்றுவதன் மூலம் '''proton transfer''' ஐ செய்து காட்டுகிறேன்.

|-
|01:46
|'''Build''' மெனுவிற்கு சென்று '''Add Hydrogens for pH''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|01:51
|'''Add Hydrogens for pH''' text box முன்னிருப்பான 7.4 மதிப்புடன் திறக்கிறது.

|-
|01:57
|text box இல் '''pH value''' ஐ 7.0 என்று மாற்றி '''OK''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:04
|வடிவமைப்பில் '''Carboxylic group(COOH)''','''Carboxylate ion'''ஆக மாற்றப்படிருப்பதைக் கவனிக்கவும்

|-
|02:11
|'''Amino group(NH2)''', '''protonated(NH3+)''' ஆகவும் மாறுகிறது.

|-
|02:15
|'''Build '''மெனுவிற்கு சென்று,'''Add Hydrogens for pH''' ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:20
|text box இல், '''pH''' ஐ 2.0 என மாற்றி '''Ok''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:26
|'''Carboxylate ion''', '''Carboxylic group''' ஆக மாற்றப்படுகிறது.

|-
|02:31
|'''Build '''மெனுவிற்கு சென்று,'''Add Hydrogens for pH''' ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:35
|text box இல், '''pH''' ஐ 10.0 என மாற்றி '''Ok''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:41
|'''Carboxylic group''','''Carboxylate ion''' ஆக மாற்றப்படுகிறது.

|-
|02:46
|'''Amino''' group(NH2), '''deprotonate''' செய்யப்படுகிறது.

|-
|02:49
|'''Delete''' ஐ அழுத்தி வடிவமைப்பை நீக்கவும்.

|-
|02:52
|இனி'''amine''' களில் '''pH'''ஐ மாற்றுவதன் மூலம் '''proton transfer''' குறித்து காட்டுகிறேன்.

|-
|02:58
|இதற்காக '''Fragment library''' யில் இருந்து '''ethylamine''' வடிவமைப்பை load செய்கிறேன்’.

|-
|03:05
|'''Insert Fragment''' dialog boxஐ மூடவும்.

|-
|03:09
| '''CTRL, SHIFT''' மற்றும் '''A''' கீகளை ஒருசேர அழுத்தி வடிவமைப்பை deselect செய்யவும்.

|-
|03:13
|'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை சரியான இணக்கத்திற்கு rotate செய்து கொள்ளவும்.

|-
|03:18
|'''Build'''மெனுவிற்கு சென்று,'''Add Hydrogens for pH'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:23
|'''Add Hydrogens for pH''' text box திறக்கிறது.

|-
|03:27
|text box இல், '''pH''' மதிப்பை to 7.0 என மாற்றி '''OK''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:34
|வடிவமைப்பைக் கவனிக்கவும். '''Amino''' தொகுதி '''protonate''' செய்யப்படுகிறது.

|-
|03:39
|'''Build'''மெனுவிற்கு சென்று, '''Add Hydrogens for pH'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:43
|text box இல், '''pH''' மதிப்பை 2.0 என மாற்றி '''OK''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:49
|இப்போது வடிவமைப்பில் எந்த மாற்றமும் இல்லை.

|-
|03:53
|ஆகவே '''ethylamine''' காரத்தன்மை உடைய திரவங்களில் மட்டுமே '''proton transfer''' செய்கிறது.

|-
|03:59
||'''Build'''மெனுவிற்கு சென்று,'''Add Hydrogens for pH'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:03
|text box இல், '''pH''' மதிப்பை 10.0 என மாற்றி '''OK''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:09
|'''Amino group''', '''deprotonate'''ஆகிறது.

|-
|04:12
|இனி'''Crystal Library''' இல் இருந்து '''Crystal structures'''ஐ எவ்வாறு load செய்வது என்றும், சில '''Crystal properties'''குறித்தும் செயல் விளக்கம் காண்பிக்கிறேன்.

|-
|04:20
|tool bar இல் '''New''' ஐகானை’கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

|-
|04:25
|'''File''' மெனுவில், '''Import'''க்கு சென்று '''Crystal''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|04:30
|'''Insert Crystal''' dialog box தோன்றும்.

|-
|04:34
|இங்கே பல folderகள் இருக்கின்றன.

|-
|04:37
|'''halides''' folderஐ டபுள் கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:40
|'''NaCl-Halite.cif''' fileஐ தேந்தெடுத்து '''Insert'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:47
|'''Insert Crystal''' dialog boxஐ மூடவும்.

|-
|04:51
|சரியாக பார்ப்பதற்கு '''Tool Settings''' மற்றும் '''Display Settings''' ஐ மூடுகிறேன்.

|-
|04:58
| '''sodium chloride''' ன்'''Crystal''' அமைப்பு '''Panel''' இல் காட்டப்பட்டுள்ளது.

|-
|05:02
|அந்த அமைப்புடன் அதன் '''Cell Parameter'''களும் காட்டப்பட்டுள்ளன.

|-
|05:07
|'''Panel''' இன் மேல் இடது பக்கம் இருப்பவை:

'''Lattice Type'''

'''Space group''' மற்றும்

'''sodium chloride crystal''' இன் '''Unit cell volume'''

|-
|05:18
|இப்போது இந்த '''crystal'''க்கு '''Miller plane''' களைக் காட்டுகிறேன்.

|-
|05:22
|அதற்கு முன் '''Miller indices''' குறித்த ஒரு சிறிய அறிமுகம்.

|-
|05:28
|'''Miller Indices''' என்பவை மூன்று இலக்கங்கள் கொண்டவை ('''hkl''').

|-
|05:34
|இவை'''crystal system'''களில் உள்ளமைந்துள்ள '''plane''' களின் திசைகளைக் குறிப்பிடப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.

|-
|05:41
|இனி '''sodium chloride crystal''' இன் '''Miller planes''' பற்றி காணலாம்.

|-
|05:45
|'''View''' மெனுவிற்கு சென்று '''Crystal View Options''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:51
|'''Crystal View Options''' மெனு வலது பக்கத்தில் தோன்றுகிறது.

|-
|05:56
|'''Miller Indices''' radio button ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:00
|நான் '''h', 'k', 'l'''' ன் மதிப்பை முறையே 2, 3, 2 என மாற்றுகிறேன்.

|-
|06:07
|'''plane''' களிலும் '''crystal''' இல் '''atom''' களின் இருப்பிடத்திலும் ஏற்படும் மாற்றத்தை கவனிக்கவும்.

|-
|06:13
|இனி எப்படி ஒரு super cell ஐ கட்டமைப்பது என்று விளக்குகிறேன்.

|-
|06:17
|'''Build''' மெனுவில் '''Super Cell Builder''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|06:22
|'''Super Cell Parameters''' dialog box தோன்றும்.

|-
| 06:26
|'''Super Cell Option,'''களுக்கு கீழே நாம் '''unit cell parameters 'A', 'B'''' மற்றும் ''''C'''' ஐ மாற்ற முடியும்.

|-
|06:34
|நான் ''''A', 'B'''' and ''''C'''' இன் மதிப்புகளை '2', '2', '2' என மாற்றுகிறேன்.

|-
|06:43
|'''Generate cell''' ஐ கிளிக் செய்யவும். பின் '''Close''' ஐ கிளிக் செய்து dialog boxஐ மூடவும்.

|-
|06:50
|மூலக்கூறை நன்றாக பார்க்க ஏதுவாக, தேவையான அளவு பெரியதாக்கிக் கொள்ளவும்.

|-
|06:55
| Panel இல் '''Crystal lattice''' காட்டப்படுகிறது.

|-
|06:59
|இப்பொழுது '''Miller Indices'''ஐ 3, 2, 3 என மாற்றுகிறேன்.

|-
|07:05
|'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி cell ஐ சுழற்றவும் .

|-
|07:09
|புள்ளியால் ஆன வரைபடம் '''plane''' ஐ காட்டுகிறது.

|-
|07:13
|''''h', 'k', 'l'''' மதிப்புகளை மாற்றுவதன் மூலம் பல '''plane'''களை காணமுடியும்.

|-
|07:20
|இப்போது '''Hexamminecobalt(III)''' க்கு '''octahedral''' வடிவமைப்பை உருவாகுகிறேன்.

|-
|07:26
| tool bar இல் '''New''' ஐகானை கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

|-
|07:31
|'''Hexammine cobalt(III)''', வரைய '''Draw''' tool ஐகானை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|07:37
|'''Element''' drop down இல் '''Other'''என்பதை தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|07:41
|'''Periodic table''' விண்டோ திறக்கிறது.

|-
|07:44
|அட்டவணையில் இருந்து '''Cobalt'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|07:47
|'''Periodic table''' விண்டோவை மூடவும்.

|-
|07:50
|'''Panel'''இன் மீது கிளிக் செய்து '''Element''' drop down இல் இருந்து '''Nitrogen'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|07:56
|'''cobalt atom''' ன் மீது ஆறு '''bond''' களை கிளிக் மற்றும் drag செய்து வரையவும்.

|-
|08:03
|ஒவ்வொரு '''Nitrogen'''னும் இரண்டு '''hydrogen'''களுடன் பிணைக்கப்பட்டிருப்பதை கவனிக்கவும்.

|-
|08:08
|'''Hexamminecobalt(III)''' இன் அமைப்பில் , ஒவ்வொரு '''nitrogen''' னும் மூன்று '''hydrogen''' களுடன் பிணைக்கப்பட்டுள்ளன.

|-
|08:15
|'''Element''' drop down இல் இருந்து'''Hydrogen''' ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|08:19
|எல்லா '''Nitrogen atom''' களின் மீதும் Click மற்றும் drag செய்யவும்.

|-
|08:25
|'''Hexamminecobalt(III)''' இன் அமைப்பு Panel இல் வரையப்பட்டுள்ளது.

|-
|08:29
|'''Display Settings''' ஐ கிளிக் செய்து '''Display Settings''' மெனுவைத் திறக்கவும்

|-
|08:36
|இனி நான்'''Hexamminecobalt(III)''' இன் '''octahedral geometry''' ஐ காண்பிக்கிறேன்.

|-
|08:42
|இதற்காக நான் '''Polygon Display Type'''ஐ பயன்படுத்துகிறேன்.

|-
|08:46
|'''Polygon Display Type''' activate செய்யப்படவில்லை எனில், '''Add''' பட்டனைப் பயன்படுத்தி activate செய்து கொள்ளவும்.

|-
|08:52
|'''Polygon Display Type''' checkbox ன் மீது கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:56
|optimize செய்வதற்கு , tool barல் உள்ள '''Auto Optimization Tool''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|09:01
|'''Force Field''' drop down இல் , '''UFF'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|09:06
|optimize செய்ய '''Start''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|09:11
|'''Stop''' பட்டனை கிளிக் செய்து '''Auto optimization''' செயலை நிறுத்தவும்.

|-
|09:16
|'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி , வடிவமைப்பின் '''octahedral geometry'''ஐ பார்க்க ஏதுவாக சுழற்றவும்.

|-
|09:22
|அதுபோலவே இது '''iodine heptafluoride''' இன் '''pentagonal bipyramidal geometry'''ஆகும்.

|-
|09:29
|இனி, நாம் '''Build''' மெனுவில் உள்ள'''Nanotube builder''' எனப்படும் மற்றொரு வசதியைப் பற்றி காண்போம்.

|-
|09:35
|'''nanotube''' என்பது '''nanometer-scale tube'''-மாதிரியான வடிவமைப்பாகும்.

|-
|09:40
|'''Boron carbon nitrogen''', '''Boron carbon''' மற்றும் '''Carbon''' ஆகியவை பல்வகைப்பட்ட '''nanotube''' களுக்கான உதாரணமாகும்:

|-
|09:50
|ஒரு '''carbon nanotube''', என்பது'''carbon structure''' இன் மிகச்சிறிய உருளை வடிவமாகும். அதில் அறுகோண '''graphite molecules''' இரண்டு முனைகளிலும் இணைக்கப்பட்டுள்ளன.
|-
|10:01
|Tool bar இல் '''New''' ஐ கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

|-
|10:06
|'''nanotube''' ஐ சரியாக பார்க்க, பின்புற வண்ணத்தை நீல நிறமாக மாற்றுகிறேன்.

|-
|10:12
|'''View''' க்கு சென்று '''Set Background Color''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|10:17
|'''Select Color''' dialog box தோன்றும்.

|-
|10:21
|பெட்டியில் , நீல வண்ணத்தை தேர்வு செய்து '''Ok'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|10:26
|'''Build''' மெனுவிற்கு சென்று '''Nanotube Builder ஐ தேர்வு செய்யவும்.'''

|-
|10:30
|'''Nanotube Builder''' மெனு '''Panel'''க்கு கீழே தோன்றுகிறது.

|-
|10:35
|நான் '''Nanotube Builder'''மெனுவை காண ஏதுவாக '''Avogadro''' விண்டோவின் அளவை சரிசெய்கிறேன்.

|-
|10:40
|'''chirality indexகள் n, m''' ஐ தேர்வு செய்வதன் மூலம் '''nanotube'''இன் வகையைத் தீர்மானிக்கலாம்.

|-
|10:47
|நான் ''' n''' மற்றும் '''m''' க்கான index valueகளை 4 மற்றும் 4 என தேர்வு செய்கிறேன்.

|-
|10:53
|'''Length''' ஐ 4.00(நான்கு புள்ளி பூஜ்ஜியம் பூஜ்ஜியம்) என மாற்றவும்.

|-
|10:57
|''Unit '''field ஐ '''Periodic units'''க்கு அமைக்கவும்.

|-
|11:01
|'''Find double bonds''' checkbox ஐ கிளிக் செய்து '''nanotube''' இல் உள்ள இரட்டைப்பிணைப்பை பார்க்கலாம்.

|-
|11:08
|அதன்பின் '''Build''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|11:10
| '''CTRL + SHIFT + A'''களை ஒருசேர அழுத்தி வடிவமைப்பை deselect செய்யவும்.

|-
|11:15
|'''Navigation''' tool ஐ பயன்படுத்தி சுழற்றி, பெரியதாக்கி '''nanotube''' ஐ சரியான காட்சிக்கு வைக்கவும்.

|-
|11:21
|அடுத்து, நான் 6,6 '''index values'''உள்ள ஒரு nanotube ஐ கட்டமைக்கிறேன்.

|-
|11:27
|'''Build''' மெனுவிற்கு சென்று '''Nanotube Builder''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|11:31
|'''n '''மற்றும் '''m''' மதிப்புகளை 6 மற்றும் 6 என மாற்றி பின்னர் '''Build''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|11:40
|இரண்டு '''nanotube'''களும் ஒன்றன் மேல் ஒன்றாக அடுக்கப்படிருப்பதைக் கவனிக்கவும்.

|-
|11:44
|'''nanotube'''களை optimize செய்ய, '''Auto Optimization Tool''' இன் மீது கிளிக் செய்யவும்.

|-
|11:50
|'''Force Field''' drop down இல் ,'''MMFF94''' ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|11:56
|optimize செய்வதற்கு '''Start''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும் .

|-
|12:02
|'''Stop''' ஐ கிளிக் செய்து '''auto optimization'''செயல்பாட்டை நிறுத்தவும்.

|-
|12:07
|'''CTRL + SHIFT + A''' கீகளை ஒருசேர அழுத்தி வடிவமைப்பை deselect செய்யவும்.

|-
|12:11
|'''Panel''' இல் இரட்டைச்சுவர் கொண்ட ஒரு '''nanotube''' காட்டப்படுகிறது.

|-
|12:16
|'''Navigation tool,''' ஐப் பயன்படுத்தி '''nanotube'''ஐ சரியான காட்சிக்காக சுழற்றிக்கொள்ளவும்.

|-
| 12:21
|இப்போது நான் '''nanotube''' இல் உள்ள '''carbon hexagon ring'''களைக் காட்டுகிறேன்.

|-
|12:26
|'''Display Types''' மெனுவில், ''' Ring''' checkbox ஐ தேர்வு செய்யவும்

|-
|12:31
|'''Navigation''' tool ஐப் பயன்படுத்தி '''nanotube''' ஐ சுழற்றி '''carbon hexagon''' களைக் காணவும்.

|-
|12:38
|அனைத்தையும் சுருங்க கூறுவோம்.

|-
|12:40
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது:

|-
|12:43
|Compounds களில் '''pH values'''ஐ மாற்றி '''Proton transfer''' செய்வது.

|-
|12:48
|'''crystal library'''இல் இருந்து '''crystal structures'''ஐ load செய்வது

|-
|12:51
|பல்வேறு '''Miller planes''' ஐ காட்டுவது,

|-
|12:54
|super cells ஐக் கட்டமைப்பது,

|-
|12:56
|Coordination compound களின் வடிவமைப்பைக் காண்பது மற்றும் '''nanotube'''களைக் கட்டமைப்பது .

|-
|13:03
|பயிற்சிக்காக

'''Silver chloride(AgCl) இன் crystal structure'''ஐ Load செய்து அதன் '''Miller planes''' ஐக் காட்டவும்.

|-
|13:09
|Coordination library இல் இருந்து வடிவமைப்பை load செய்து அதன் geometry களைக் காட்டவும்.

|-
|13:14
|''Chirality index''' 9,9 கொண்ட ஒரு '''nanotube'''ஐக் கட்டமைக்கவும்.

|-
|13:19
|இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்
|-
|13:27
|Spoken Tutorialகளை பயன்படுத்தி பயிற்சி வகுப்புகள் நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம். எங்களைத் தொடர்பு கொள்ளவும்
|-
|13:34
|இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.

|-
|13:41
| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம். குரல் கொடுத்தது…. நன்றி.
|-

Avogadro/C2/Hydrogen-Bonding/Tamil

2017-12-27T21:04:54Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 |அனைவருக்கும் வணக்கம். மூலக்கூறுகளில் Hydrogen Bonding..."

{| border=1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
| 00:01
|அனைவருக்கும் வணக்கம். மூலக்கூறுகளில் Hydrogen Bonding குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
|00:07
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது: Avogadroவை Configure செய்தல்

|-
|00:11
|மூலக்கூறில் hydrogen பிணைப்பை காட்டுதல்.
|-
|00:14
|Hydrogen பிணைப்பின் நீளத்தை அளத்தல்.
|-
|00:16
| மூலக்கூறுகளில் Force display type மற்றும் dipole moments ஐ காட்டுதல்

|-
|00:22
|இங்கு நான் பயன்படுத்துவது Linux OS version 14.04

|-
|00:27
|Avogadro version 1.1.1. மற்றும் இணைய இணைப்பு.

|-
|00:34
| இந்த டுடோரியலைப் புரிந்துகொள்ள Avogadro interface குறித்து பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும்.

|-
|00:40
| அது சம்பந்தமான டுடோரியலுக்கு திரையில் தோன்றும் இணைப்பிற்கு செல்க.

|-
|00:45
| இந்த டுடோரியலில் பயன்படுத்தப்படும் மூலக்கூறின் அமைப்புகள் உங்கள் வசதிக்காக code files ஆக கொடுக்கப்பட்டுள்ளன.

|-
|00:52
|ஒரு புதிய '''Avogadro''' விண்டோவைத் திறந்துள்ளேன்.

|-
|00:56
| '''Draw Tool''' ஐகானை கிளிக் செய்து, '''Panel''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:01
| '''Panel''இல் '''methane''' வரையப்பட்டுள்ளது.

|-
|01:04
|நாம் இப்போது '''Avogadro''' வை configure செய்ய கற்போம்.

|-
|01:08
| '''Settings''' மெனுவிற்கு சென்று '''Configure Avogadro''' வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:13
|'''Settings''' dialog box தோன்றும்.

|-
|01:16
|Dialog boxல் மூன்று தேர்வுகள் உள்ள ஒரு பக்க menu தோன்றுகிறது

General

Plugins

Project tree.

|-
|01:24
|முன்னிருப்பாக '''General'''மெனு தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டிருக்கும்.

|-
|01:28
|'''General''' மெனுவில் '''Quality''' மற்றும் '''Fog'''என்ற இரண்டு ஸ்லைடர்கள் உள்ளன.

|-
|01:34
|'''Low''' இல் இருந்து '''High''' க்கு slider ஐ நகர்த்தும் பொழுது rendering இன் தரம் மேம்படுகிறது.

|-
|01:41
|'''Quality''' slider ஐ '''Low''' க்கு நகர்த்தி '''Apply''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:47
|மூலக்கூறின் வடிவம் சரியாக Render செய்யப்படிருப்பதை கவனிக்கவும்.

|-
|01:51
| '''Quality''' slider ஐ '''High'''க்கு நகர்த்தி, '''Apply'''பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:56
| High quality rendering இல் மூலக்கூறு தெளிவாகத் தோன்றுவதை கவனிக்கவும்.
|-
|02:02
|வடிவத்தை அச்சிடவும், பதிப்பிக்கவும் High quality rendering அமைக்கப்படுகிறது.

|-
|02:07
|இது அதிக CPU சக்தியை எடுத்துக்கொள்கிறது

|-
|02:11
| '''Quality''' slider ஐ '''Medium'''க்கு நகர்த்தி '''Apply'''பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:16
|அன்றாட பயன்பாட்டுக்கு Medium quality செட்டிங்கே போதுமானது.

|-
|02:21
|இனி '''Fog''' slider ஐ பற்றி காணலாம்.

|-
|02:24
| '''Fog''' slider ஐ ‘''Lots''' க்கு நகர்த்தி '''Apply''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:28
|இப்போது மூலக்கூறு Fog செய்யப்பட்டிருப்பதை காணலாம்.

|-
|02:32
| '''Fog''' slider ஐ '''Some''' க்கு நகர்த்தி '''Apply''' இன் மீது கிளிக் செய்யவும். இப்போது மூலக்கூறு தெளிவாக தோன்றுகிறது.

|-
|02:40
|அடுத்ததாக '''Plugins''' மெனு

|-
|02:43
|'''Display Types''' drop downs தோன்றுகிறது.

|-
|02:46
| '''Display Types''' இல் அனைத்து check box களும் enable செய்யப்பட்டிருக்கும்.

|-
|02:51
| '''Axes''' ஐ கிளிக் செய்க. '''Axes Display Type''' பற்றிய விவரங்கள் '''Details''' text box இல் காட்டப்படுகிறது.

|-
|02:59
|இதேபோல் மற்ற '''Display Type'''களின் விவரங்களையும் காணலாம்.

|-
|03:04
|நான் அனைத்து check box களையும் un-check செய்து '''Apply'''பட்டனை கிளிக் செய்கிறேன்.

|-
|03:11
|'''Ball and Stick''' check box மட்டும் '''Display Types''' menu வில் தோன்றுகிறது.

|-
|03:16
| '''Ball and Stick Display Type''' checkbox ஐ Uncheck செய்யவும்.

|-
|03:20
| '''Ball and Stick''' disable செய்யப்பட்டிருந்தது எனில் '''Panel''' இல் இருந்து மூலக்கூறு மறைந்துவிடும்.

|-
|03:26
| '''Ball and Stick''' check box ஐ கிளிக் செய்து மூலக்கூறை திரையில் வர வைக்கவும்.

|-
|03:30
|அனைத்து '''Display Types'''யும் enable செய்ய '''Plugins'''க்கு செல்லவும்.

|-
|03:33
|'''Display Types''' drop down இல் அனைத்து check box களையும் கிளிக்செய்யவும்.

|-
|03:39
|'''Apply'''பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:41
|அனைத்து '''Display Type''' களும் '''Display Types''' drop downஇல் தோன்றுகின்றன.

|-
|03:46
| '''OK''' ஐ கிளிக் செய்து '''Settings''' dialog box ஐ மூடவும்.

|-
|03:50
| '''Display Types''' மெனுவில் ஏதேனும் ஒரு '''Display Type''' activate செய்யப்படவில்லை எனில் '''Add''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:58
|'''Add Display Type''' dialog box தோன்றும்.

|-
|04:02
|'''Types''' drop down இல் கிளிக் செய்து தேவையான '''Display Type''' ஐத் தெர்ந்தெடுக்கவும்

|-
|04:07
|நான் '''Hydrogen Bond''' ஐ தேர்வு செய்து '''OK'''ஐ கிளிக் செய்கிறேன்.

|-
|04:11
|'''Display Types'''மெனுவில் '''Hydrogen Bond Display Type''' தோன்றுகிறது.

|-
|04:16
|இப்போது '''polar methanol'''மூலக்கூறுகளில் hydrogen bonding ஐ செய்து காட்டுகிறேன்.

|-
|04:22
|ஏற்கனவே'''Panel''இல் '''methane''' மூலக்கூறு உள்ளது.

|-
|04:26
|பயிற்சிக்காக '''methane''' தொகுதி மூலக்கூறுகள் நமக்கு தேவை.

|-
|04:31
|'''methane'''மூலக்கூறை எளிதாக '''Draw tool'''ஐப் பயன்படுத்தி வரையலாம்.

|-
|04:36
|முன்னிருப்பாக '''Draw Settings''' மெனுவில், '''Element''' இல் '''Carbon''' என்றும் '''Bond Order''' இல்'''Single'''என்றும் இருக்கும் .

|-
|04:43
|'''Panel'''ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:46
|'''Element''' drop down ஐ கிளிக் செய்து '''Oxygen'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|04:50
|பின்னர் '''methane''' மூலக்கூறில் ஏதேனும் ஒரு Hydrogen ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:56
|இப்போது '''Panel'''இல்'''Methanol''' தொகுதி மூலக்கூறு உள்ளது.

|-
|05:00
|'''Display Types'''இல் '''Hydrogen Bond''' check box ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:04
|நாம் மூலக்கூறின் சரியான இணக்கத்தை optimize செய்யலாம்.

|-
|05:08
|Tool bar இல் '''Auto Optimization Tool''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:12
|'''Auto Optimization Settings''' மெனு இடதுபக்கத்தில் தோன்றும்.

|-
|05:17
|'''Force Field''' drop down இல் '''MMFF94'''என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|05:22
| optimize செய்வதற்கு '''Start''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:26
|'''hydrogen''' bond மஞ்சள் நிற கோட்டுத்துண்டுகளாக உருவாவதைக் காணலாம்.

|-
|05:31
|இந்த கோட்டுத்துண்டுகள் ஒரு மூலக்கூறின் '''hydrogen''' க்கும் மற்றொரு மூலக்கூறின் '''oxygen''' க்கும் இடையே உருவாகிறது.

|-
|05:38
|'''Auto optimization'''ஐ நிறுத்த '''Stop''' ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:42
|இப்போது '''ortho-nitrophenol''' இல் intramolecular '''hydrogen''' bonding ஐ செய்து காட்டுகிறேன்.

|-
|05:48
|இதற்காக நான் '''Chemical structure database''' இல் இருந்து மூலக்கூறை பதிவிறக்குகிறேன்.

|-
|05:54
|முன்னர் திறந்து வைத்துள்ள அனைத்து விண்டோக்களையும் மூடி ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

|-
|05:59
|'''File''' மெனு வை கிளிக் செய்து '''Import'''க்கு செல்லவும். '''Fetch by Chemical name'''என்பதைத் தேர்வு செய்யவும்.

|-
|06:06
|'''Chemical Name''' text box தோன்றுகிறது.

|-
|06:09
| '''ortho-nitrophenol''' என சிறிய எழுத்துகளில் டைப் செய்து OK பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|06:15
|'''Ortho-nitrophenol''' மூலக்கூறு '''Panel''' இல் தோன்றுகிறது.

|-
|06:19
| '''hydrogen''' bonding ஐ காட்ட, '''Panel'''இல் '''Ortho-nitrophenol''' தொகுதி மூலக்கூறுகள் தேவை.

|-
|06:26
|நான் Panel இல் copy செய்து paste செய்துள்ளேன்.

|-
|06:30
|selection toolஐப் பயன்படுத்தி மூலக்கூறை தேர்வு செய்யவும்.

|-
|06:34
|Copy செய்வதற்கு '''CTRL + C'''ஐ அழுத்தவும். paste க்கு '''CTRL + V''' ஐ அழுத்தவும்.

|-
|06:39
|'''Hydrogen Bond''' check box இன் மீது கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:42
|தேவைப்பட்டால் மூலக்கூறை சரியான இணக்கத்திற்கு Optimize செய்துகொள்ளவும்.

|-
|06:46
|optimization செயல்பாட்டின் பொழுது, மூலக்கூறுகளுக்கிடையே Intra molecular Hydrogen bond உருவாகிறது.

|-
|06:54
|மூலக்கூறில் உள்ள '''nitro''' தொகுதியின் Oxygen க்கும் '''Hydroxy''' தொகுதியின் Hydrogen க்கும் இடையே Hydrogen bond உருவாகிறது.

|-
|07:02
|நாம் hydrogen bond இன் பிணைப்பின் நீளத்தை அளக்கலாம்

|-
|07:06
| tool bar இல் '''Click to Measure''' icon ஐ கிளிக் செய்யவும்
.

|-
|07:10
|Hydrogenஅணுவையும் Oxygen அணுவையும் கிளிக் செய்யவும்.

|-
|07:14
|Hydrogen பிணைப்பின் நீளம் Panel இன் கீழே தோன்றுகிறது.

|-
|07:19
|இந்த slide, hydrogen bonding இன் முக்கியத்துவத்தைக் காட்டுகிறது.

|-
|07:23
|Hydrogen bond கள்: நீரின் தனித்துவமான கரை திறன்களையும், பனிக்கட்டியின் படிக அமைப்பையும் நிர்ணயிக்கின்றன.

|-
|07:32
| DNA இன் complementary strand களை இறுக்கமாக பிடித்துக்கொள்கின்றன.

|-
|07:36
|Proteins மற்றும் nucleic acid களின் வடிவமைப்பை நிர்ணயிக்கவும் நிலைப்படுத்தவும் செய்கின்றன.

|-
|07:41
|Enzyme catalysis இல் வினையூக்கியாக செயல்புரிகின்றன.

|-
|07:46
|பயிற்சிக்காக கீழ்கண்ட மூலக்கூறுகளில் Hydrogen bonding ஐ காட்டவும்

1. Para-hydroxybenzoic acid.

2. Nucleobases, adenine மற்றும் uracil.

|-
|07:56
|உங்கள் பயிற்சிகளுக்கான விடை பின்வருமாறு தோன்ற வேண்டும்

|-
|08:00
| '''Para-hydroxybenzoic acid''' மூலக்கூறில் inter molecular hydrogen bonding உருவாவதைக் கவனிக்கவும்.

அதேபோல '''adenine''' மற்றும் '''uracil''' மூலக்கூறுகளிலும்.

|-
|08:10
|'''Display Types''' இல் மூலக்கூறுகளுக்கான force ஐ காட்டும் ஒரு option உள்ளது.

|-
|08:15
|சில நீர் மூலக்கூறுகளுடன் ஒரு விண்டோவைத் திறக்கிறேன்.

|-
|08:19
|'''Display Types''' இல் '''Force''' checkbox ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:23
| '''Hydrogen Bond''' checkboxஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:26
|Tool bar இல் '''Auto Optimization Tool''' ஐகானை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:30
|'''MMFF94 Force Field''' ஐ தேர்வு செய்து '''Start''' பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:36
|Optimization செயல் நடக்கும் பொழுது ஒவ்வொரு அணுவிலும் செயல்படும் விசைகளை பச்சை நிற அம்புக்குறியுடன் '''Force''' display type காட்டுகிறது.

|-
|08:45
|அம்புக்குறிகள் விசையின் திசையையும், அளவையும் குறிக்கின்றன.

|-
|08:49
|ஒரு மூலக்கூறு optimization ஐ நெருங்கும் பொழுது, அம்புக்குறிகள் சிறிதாகி மறைகின்றன.

|-
|08:55
|இனி மூலக்கூறின் '''dipole moment'''பற்றி பார்க்கலாம்.

|-
|08:59
|'''polar''' மூலக்கூறுகளின் மின்விசை பிரிவினால்'''Dipole moment''' உருவாகிறது.

|-
|09:04
|Dipole moment(μ) = charge(Q) times, distance of separation(r)

|-
|09:09
|Dipole moment ஆனது Debye units ஆல் குறிக்கப்படுகிறது.

|-
|09:13
|நான் ஹைட்ரஜன் சயனைடு (HCN) மற்றும் நீர் மூலக்கூறுகளின் dipole moment ஐ காட்டுகிறேன்.

|-
|09:20
|ஒரு புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.

Draw tool ஐ பயன்படுத்தி, ஹைட்ரஜன் சயனைடு மூலக்கூறின் அமைப்பை (HCN) Panel இல் வரையவும்.

|-
|09:27
| Hydrogen ஐ தேர்வு செய்து carbon க்கு ஒரு பிணைப்பை வரையவும்.

|-
|09:31
|Nitrogenஐ தேர்வு செய்யவும். bond order ஐ triple என தேர்வு செய்து கொண்டு திரையில் காட்டியவாறு பிணைப்பை வரையவும்.

|-
|09:38
|'''MMFF94 Force Field'''ஐ பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை Optimize செய்யவும்.

|-
|09:44
|'''dipole moment''' ஐக் காண்பதற்கு '''Display Types'''இல் '''Dipole''' check box இல் கிளிக் செய்யவும்.

|-
|09:50
|'''Dipole''' ஒரு சிவப்பு அம்புக்குறியுடன் காட்டப்படுகிறது.

|-
| 09:54
|dipole moment பற்றிய கணிப்புக்கு '''View''' மெனுவிற்கு செல்லவும்.

|-
|09:57
| '''Properties''' க்கு சென்று '''Molecule Properties'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

Molecule Properties விண்டோ திறக்கிறது.

|-
|10:05
|விண்டோவில் hydrogen cyanide இன் கணிக்கப்பட்ட dipole moment '''0.396D'''என்று காட்டப்படுகிறது.

|-
|10:13
|அதேபோல நீர் மூலக்கூறின் dipole moment ஆனது '''0.245D'''.

|-
|10:21
|சுருங்கக்கூற வேண்டும் எனில்.

|-
|10:23
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது, -

Avogadroஐ Configure செய்வது,

|-
|10:27
|Methanol இல் intermolecular hydrogen bonding ஐ காட்டுவது,

|-
|10:31
|ortho-nitrophenol இல் intramolecular hydrogen bonding ஐ காட்டுவது,

|-
|10:35
|hydrogen bonds இன் நீளத்தை அளத்தல்,

|-
|10:38
|நீர் மூலக்கூறின் Force display type ஐ காட்டுவது,

|-
|10:42
|HCN மற்றும் நீர் மூலக்கூறுகளின் dipole moments ஐக் காண்பது.

|-
|10:48
|தன்னறிவு சோதனைக்காக,
1. carbon dioxide மற்றும் methyl chloride மூலக்கூறுகளின் dipole moments ஐ காட்டவும்.

2. Ammonia மூலக்கூறுகளுக்கு'''Force Display Type''' ஐ காட்டவும்.

|-
|10:59
| இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்.
|-
|11:06
| Spoken Tutorialகளை பயன்படுத்தி பயிற்சி வகுப்புகள் நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம்.

எங்களைத் தொடர்பு கொள்ளவும்.

|-
|11:12
| இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.

|-
|11:18
| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம். குரல் கொடுத்தது….. நன்றி.
|-

Avogadro/C2/Create-Surfaces/Tamil

2017-12-27T20:48:45Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border=1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- |00.01 |அனைவருக்கும் வணக்கம். Create surfaces குறித்த..."

{| border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>
|-
|00.01
|அனைவருக்கும் வணக்கம். Create surfaces குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.
|-
|00.07
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது, மூலக்கூறின் பண்புகளைப் பார்ப்பது,
|-
|00.13
|partial charge கொண்டுள்ள அணுக்களை Label செய்வது
|-
|00.17
|Van der waals surface ஐ உருவாக்குவது
|-
|00.20
|electrostatic potential energy களைப் பொறுத்து surface இன் வண்ணத்தை மாற்றுவது.
|-
|00.25
|Avogadro version 1.1.1.
|-
|00.25
|இங்கு நான் பயன்படுத்துவது Ubuntu Linux OS version. 14.04
|-
|00.35
|இந்த டுடோரியலைப் பின்பற்ற, Avogadro interface குறித்து பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும்.
|-
|00.41
|அது தொடர்பான டுடோரியல்களுக்கு எங்கள் வலைதளத்தை பார்க்கவும்.
|-
|00.47
|இங்கே Avogadro window வை திறந்துள்ளேன்.
|-
|00.51
| Insert Fragment Library யில் இருந்து ஒரு butane மூலக்கூறை உள்ளே சேர்க்கவும்.
|-
|00.57
| Build menu வை கிளிக் செய்து Insert ->fragment ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|01:04
| alkanes folder ஐ டபுள் கிளிக் செய்து திறந்து butane.cml ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|01:11
|Insert பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|01:14
|dialog box ஐ மூடவும்.
|-
|01:17
|n-butane இன் மூலக்கூறு மாதிரி panel இல் காட்டப்படுகிறது.
|-
|01:21
|Select menu வில் இருந்து Select none option ஐ தேர்வு செய்து ஏற்கனவே இருக்கும் தேர்வை நீக்கவும்.
|-
|01:26
|இனி மூலக்கூறின் பண்புகளைக் காணலாம்.
|-
|01:30
|View வை கிளிக் செய்து, Properties option ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
|01:35
|sub-menu வில் இருந்து, Molecule Properties ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|01:39
|Molecule Properties window திறக்கிறது. இதில்IUPAC Molecule Name, Molecular weight, Chemical Formula, Dipole moment முதலிய தகவல்கள் இருக்கும்.
|-
|01:54
|OK வை கிளிக் செய்து விண்டோவை மூடவும்.
|-
|01:57
|இது போல அணுக்களின் பண்புகளைப் பார்க்க properties மெனுவில் இருந்து Atom properties optionஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|02:04
|மூலக்கூறில் இருக்கும் அனைத்து அணுக்களைப் பற்றிய Element, Type, Valence, Formal charge தரவுகளைக் கொண்ட ஒரு பட்டியல் தோன்றும்.
|-
|02:17
|dialog boxஐ மூடவும்
|-
|02:20
|பட்டியலில் இருந்து மற்ற பண்புகளான Angle, Torsion மற்றும் Conformer ஐ ஆய்ந்தறியவும்.
|-
|02:27
|மூலக்கூறில் partial charge உள்ள அணுக்களை எப்படி label செய்வது என்று தெரிந்து கொள்வோம்.
|-
|02:33
| Display settings ஐ கிளிக் செய்யவும். Display Types லிஸ்டில் இருந்து, Label என்ற checkbox ஐ குறியிடவும்.
|-
|02:43
| Label check box இன் வலது பக்கம் உள்ள Spanner symbol மீது கிளிக் செய்க.
|-
|02:48
|Label Settings விண்டோ திறக்கிறது.
|-
|02:51
|atom labels text drop down இல் இருந்து Partial charge option ஐ கிளிக் செய்யவும். இப்போது மூலக்கூறில் உள்ள அனைத்து அணுக்களும் partial charge ஆக label இடப்பட்டுள்ளது.
|-
|03:01
|partial charge இன் பரவல், carbon அணுக்களின் வேதிவினைகளைக் கணிக்க பயன்படுகிறது.
|-
|03:07
|அணுக்களை partial charge ஆக labeling செய்வதன் மூலம் Inductive effect ஐ விளக்க முடியும்.
|-
|03:14
|ஒரு hydrogen க்கு பதிலாக chlorine ஐ வைப்போம். carbon சங்கிலியில் உள்ள partial charge மதிப்பில் ஏற்படும் மாறுதல்களைக் கவனிக்கவும்.
|-
|03:22
|inductive effect இன் காரணமாக chlorine அணுக்களின் அருகில் இருக்கும் carbonகள் அதிக நேர்மின் தன்மை அடைகிறது.
|-
|03:28
|நம்மால் பிணைப்புகளையும் label செய்ய முடியும். bond labels text box இன் மீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:35
| drop-down menu பிணைப்புகளை label செய்யும் optionகளைக் கொண்டுள்ளது.
|-
|03:39
| bond length இன் மீது கிளிக் செய்யவும். எல்லா பிணைப்புகளுக்குமான bond lengths, panel இல் காட்டப்படுகிறது.
|-
|03:46
|label களின் வண்ணத்தை மாற்ற, வண்ணங்கள் நிரப்பப்பட்டுள்ள பெட்டிகளின் மீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:51
|Select atoms label color விண்டோவில் தேவையான வண்ணத்தைத் தேர்ந்தெடுத்து OK buttonமீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:59
|நாம் X, Y மற்றும் Z direction இல் லேபிள்களை நகர்த்தலாம்.
|-
|04:04
| label shift மெனுவில் இருந்து. increment அல்லது decrement buttonகளை கிளிக் செய்யவும்
dialog boxஐ மூடவும்.
|-
|04:12
| Avogadroவின் மற்றொரு மிக உபயோகமான வசதி, பரப்புகளை உருவாக்கும் வசதியாகும்.
|-
|04:18
|extensions மெனுவில் பரப்புகளை உருவாக்கும் தேர்வு உள்ளது.
|-
|04:24
|extensions மெனுவை கிளிக் செய்து, create surfaces option மீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
|04:30
|திரையில் create surface dialog box தோன்றும்.
|-
|04:34
|Surface type drop-down இல் இரண்டு option கள் உள்ளன: Van der waals மற்றும் electro-static potential.
|-
|04:42
|Electrostatic potential surfaces இன்னும் Avogadro வில் support செய்யப்படவில்லை.
|-
|04:48
|Van der waals option ஐ தேர்வுசெய்யவும். Color By drop down இல் Nothing ஐ தேர்வுசெய்யவும்.
|-
|04:55
| Resolution ஐ Medium என அமைக்கவும்
|-
|04:58
|Iso value ஐ zero என அமைக்கவும். Calculate பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|05:04
|Panel இல் van der waals surface காட்டப்படுகிறது.
|-
|05:04
|dialog boxஐ மூடவும்
|-
|05:11
|Van der waals surface என்பது ஒரு மூலக்கூறு மற்றொரு மூலக்கூறுடன் எந்தெந்த பரப்புகளில் வினைபுரியும் என்று காட்டுவதாகும்.
|-
|05:19
|surface settings ஐ மாற்ற: அந்தந்த பரப்புகளுக்குரிய spanner symbol இன் மீது கிளிக் செய்யவும்.
|-
|05:26
| surface setting dialog box திறக்கிறது. slider ஐ இழுத்து opacityயை சரிசெய்யவும்.
|-
|05:34
| Render drop-down இல் Fill, lines மற்றும் points முதலிய பல்வேறு தோற்ற அமைப்புகளை தேர்வு செய்ய முடியும்.
|-
|05:42
|முன்னிருப்பாக fill தேர்ந்தெடுக்கப்படும்.
|-
|05:45
|பரப்பின் வண்ணத்தை மாற்ற: positive option க்கு அடுத்து இருக்கும் வண்ணம் நிரப்பப்பட்ட பெட்டியை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|05:52
|அடிப்படை வண்ண அட்டவணையில் இருந்து ஒரு வண்ணத்தை தேர்வு செய்ய அதன் மேல் கிளி செய்து OK ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:00
|Create surface விண்டோவில் அடுத்ததாக Color by drop-down இல் இருந்து Electrostatic potential ஐ தேர்வு செய்யவும்
|-
|06:07
| resolutionஐ medium என அமைக்கவும். Iso value வை 0.02 க்கு அமைக்கவும்.

|-
|06:14
|Iso value ஐ குறைவாக அமைப்பதால் மென்மையான பரப்பு கிடைக்கும்.
|-
|06:18
| Calculate button ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
|06:21
|Panel இல் நாம் 1-chloro butane இன் பரப்பை காண்கிறோம், இது அந்த மூலக்கூறில் உள்ள அணுக்களின் electro-static potential valueகளுக்கு தகுந்தவாறு வண்ணமிடப்பட்டுள்ளது
|-
|06:31
|Electrostatic potential surface மூலக்கூறின் charge distributionகளை காட்டுகிறது
|-
|06:37
|இது மூலக்கூறின் எதிர்வினையைக் கணிக்க பயன்படுகிறது.
|-
|06:42
|முன்னிருப்பாக அதிக electronegativity உள்ள பரப்புகள் சிவப்பு வண்ணத்திலும் குறைந்தவை நீல வண்ணத்திலும் காட்டபட்டிருக்கும்
|-
|06:49
|இங்கே இன்னும் சில electro-static potential surfaces உள்ள மூலக்கூறுகளின் மாதிரிகள் உள்ளன.
|-
|06:56
|Aniline மற்றும் cyclohexylamine.
|-
|07:00
|cyclohexylamine இல் உள்ள Nitrogen இன் electron density, aniline ஐ விட அதிகமாக localize ஆகியுள்ளது
|-
|07:00
|எனவே cyclohexylamine ஒரு வலிமையான காரமாகும்.
|-
|07:12
|அனைத்தையும் நினிவு கூர்வோம். இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றுக்கொண்டது .மூலக்கூறின் பண்புகளை தெரிந்துகொள்வது
|-
|07:20
|partial charge உள்ள அணுக்களை Label செய்வது.
|-
|07:24
|Van der waals surface ஐ உருவாக்குவது
|-
|07:27
|electrostatic potential energies க்கு தகுந்தவாறு வண்ணமிடுவது ஆகியவை.
|-
|07:33
|பயிற்சிக்காக acetaldehyde மற்றும் formamide இன் வினைத்திறனை electro-static potential surfaceஐப் பயன்படுத்தி ஒப்பிடுக
|-
|07:43
|partial charge உள்ள அணுக்களை Label செய்யவும்
|-
|07:47
|சரியாக செய்து முடிக்கப்பட பயிற்சி இவ்வாறு இருக்கவேண்டும்
|-
|07:51
|சிகப்பில் காட்டப்பட்டுள்ள எதிர்மின் ஆற்றல் acetaldehyde இன் oxygen அணுவின் மீது அதிகமாக localize ஆகியுள்ளது.
|-
|07:58
|எதிர்மின் ஆற்றல் formamide இல் அதிகமாக delocalize ஆகியுள்ளது
|-
|08:02
|எனவே Acetaldehyde தான் Formamide ஐ விட அதிக வினைத்திறன் வாய்ந்தது.
|-
|08:07
|இந்த வீடியோ Spoken tutorial திட்டத்தை சுருங்கச்சொல்கிறது. உங்களிடம். நல்ல bandwidth இல்லையெனில் இதை பதிவிறக்கி பார்த்துக்கொள்ளலாம்.
|-
|08:15
|நாங்கள் spoken tutorialகளை பயன்படுத்தி workshop நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம். நீங்கள் இந்த இமெயில் முகவரியில் எங்களை தொடர்பு கொள்ளலாம்
|-
|08:22
|இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.
|-
|08:29
|இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம். குரல் கொடுத்தது நன்றி.
|}

Avogadro/C2/Edit-molecules/Tamil

2017-12-16T13:50:52Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border =1 |'''Time''' |'''Narration''' |- |00:01 |அனைவருக்கும் வணக்கம். Edit Molecules குறித்த இந்த டுட..."

{| border =1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
|00:01
|அனைவருக்கும் வணக்கம். Edit Molecules குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
|0.08
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது: அணுக்களை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல்,.

|-
|00:14
|பிணைப்புகளை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல்,

|-
|00:16
|பிணைப்புகளை சுழற்றுதல்,

|-
|00:18
|பிணைப்பின் நீளத்தை மாற்றுதல்,

|-
|00:20
|ஹைட்ரஜனை methyl group ஆக மாற்றுதல்

|-
|00:23
|வடிவங்களை இணைத்தல் மற்றும் copy, paste செய்தல்.

|-
|00:27
|இங்கு நான் பயன்படுத்துவது: Ubuntu Linux OS version 14.04, Avogadro version 1.1.1

|-
|00:37
|இந்த டுடோரியலைப் புரிந்துகொள்ள Avogadro interface குறித்து பரிச்சயம் இருக்க வேண்டும்.

|-
|00:43
|அது சம்பந்தமான டுடோரியலுக்கு திரையில் தோன்றும் இணைப்பிற்கு செல்க.

|-
|00:49
|இங்கு Avogadro வை terminal ஐப் பயன்படுத்தி எப்படி திறப்பது என்று காட்டுகிறேன்.

|-
|00:55
|terminal ஐ திறக்க ctrl, alt மற்றும் t கீகளை ஒரு சேர அழுத்தவும்.

|-
|01:03
|Prompt இல் Avogadro என டைப் செய்து enter பட்டனை அழுத்தவும்.

|-
|01:08
|Avogadro application விண்டோ திறக்கும்.

|-
|01:12
|பயிற்சிக்காக Fragment library இல் இருந்து n butane எனும் மூலக்கூறை காட்டுகிறேன்.

|-
|01:19
|Build மெனுவிற்கு சென்று insert-> Fragment என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|01:25
|Insert fragment dialogue box தோன்றும்.

|-
|01:29
|fragmentகளின் பட்டியலில் இருந்து alkanes folder ஐ டபுள் கிளிக் செய்து திறக்கவும்.

|-
|01:35
|கிடைக்கும் drop down list இல் இருந்து n butane.cml ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|01:41
|Insert பட்டனை கிளிக் செய்யவும். பின் X ஐ கிளிக் செய்து Insert fragment dialogue boxஐ மூடவும்.

|-
|01:49
|Butane மூலக்கூறு நீல நிறத்தில் highlight செய்யப்பட்டு panel இல் தோன்றுகிறது.

|-
|01:54
|Highlight ஐ விடுவிக்க ctrl, shift மற்றும் a கீகளை ஒரு சேர அழுத்தவும்.

|-
|02:02
|Navigation tool ஐப் பயன்படுத்தி சரியான தகவமைப்பில் இருக்குமாறு சுழற்றவும்.

|-
|02:09
|இனி இந்த மூலக்கூறில் எப்படி அணுக்களை இணைப்பது என்று பார்ப்போம்.

|-
|02:14
|tool bar இல் Draw tool icon ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:18
|முடிவில் உள்ள Carbon அணுவை கிளிக் செய்து drag செய்யவும்.

|-
|02:23
|ஒரு Carbon அணுவும் தேவையான Hydrogen அணுக்களும் சேர்த்து இணைக்கப்படும்.

|-
|02:27
|இப்போது panel இல் pentane மூலக்கூறு உள்ளது.

|-
|02:32
|இதே போன்று Draw tool ஐ பயன்படுத்தி தேவையான Alkane களின் தொகுதியை உருவாக்கலாம்.

|-
|02:39
|புதிய விண்டோவைத் திறந்து Draw tool ஐ பயன்படுத்தி propane மூலக்கூறை வரைந்து

|-
|02:45
|முடிவில் உள்ள Carbon அணுவை நீக்கி Ethane மூலக்கூறைப் பெறுவோம்.

|-
|02:52
|அணுக்களை நீக்க tool bar இல் Selection tool ஐகானை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|02:57
|கடைசியில் இருக்கும் Carbon அணுவை கிளிக் மற்றும் drag செய்து தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|03:02
|தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டுள்ள Carbon அணு நீல நிறத்தில் தோன்றுகிறது.

|-
|03:06
|Backspace கீயைப் பயன்படுத்தி நீக்கவும். மாற்றாக edit மெனுவில் clearஐயும் தேர்ந்தெடுக்கலாம்.

|-
|03:14
|Redo செய்வதற்கு ctrl, z கீகளை ஒருசேர அழுத்தவும்.

|-
|03:20
|இனி எவ்வாறு பிணைப்புகளை சேர்ப்பது மற்றும் நீக்குவது என்று காண்போம்.

|-
|03:26
|பிணைப்புகளை சேர்க்க tool bar இல் Draw tool ஐகானை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:31
|இடது பக்கத்தில் Draw Settings menu தோன்றுகிறது.

|-
|03:35
|Element drop down list இல் Carbon முன்னிருப்பாக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டிருக்கும்.

|-
|03:40
|இரட்டைப் பிணைப்பை சேர்க்க, Bond Order drop down இல் Doubleஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|03:46
|முதல் மற்றும் இரண்டாம் carbon அணுக்களுக்கு இடையில் உள்ள பிணைப்பை கிளிக் செய்து இரட்டைப் பிணைப்பாக மாற்றவும்.

|-
|03:52
|இரட்டைப் பிணைப்பை முப்பிணைப்பாக மாற்ற Bond Order இல் Tripleஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
தேவையான பிணைப்பை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|03:59
|பிணைப்புகளை நீக்க, பிணைப்பின் மீது right mouse buttonஐ hold செய்து click செய்யவும்.

|-
|04:04
|இது இரண்டு தனித்தனி மூலக்கூறுகளை உருவாக்குகிறது.

|-
|04:08
|இந்த இரண்டையும் ஒன்றிணைப்போம்.

|-
|04:11
|ஒரு மூலக்கூறின் carbon ஐ கிளிக் செய்து மற்றொரு மூலக்கூறின் carbon அணுவில் drag செய்யவும்.

|-
|04:18
|Bond Centric Manipulation ஐ பயன்படுத்தி பிணைப்பை சுழற்றவும், bond lengths ஐ மாற்றவும் முடியும்.

|-
|04:24
|Tool bar இல் Bond Centric Manipulation tool ஐ கிளிக் செய்யவும்

|-
|04:29
|Bond Centric Manipulate setting menu இடது புறத்தில் தோன்றும்.

|-
|04:34
|இயல்பாக Show Angles மற்றும் Snap-to Bonds குறியிடப்பட்டிருக்கும்

|-
|04:39
|Snap-to Threshold 10°க்கு அமைக்கப்பட்டிருக்கும்.

|-
|04:43
|பயனர்கள் தங்கள் தேவைக்கேற்ப settings ஐ மாற்றலாம்.

|-
|04:49
|கோணத்தை காட்டுவதற்கு இரண்டு அணுக்களுக்கு இடையே உள்ள பிணைப்பை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|04:55
|பிணைப்புகள் சுழலும் தளத்தை நாம் நிலைப்படுத்த வேண்டும்.

|-
|04:59
|தளத்தை நிலைப்படுத்த பிணைப்பின் மீது கிளிக் செய்து மேலும் கீழும் நகர்த்தவும்.

|-
|05:05
|அணுக்களுக்கு இடையே உள்ள தளம் நீலம் அல்லது மஞ்சள் வண்ணத்தில் தோன்றும்.

|-
|05:11
|சுழற்ற ஒரு அணுவில் கிளிக் செய்து நகர்த்தவும்.

|-
|05:16
|அணுக்களுடன் சேர்க்கப்பட்டுள்ள பிணைப்பு நிலையான தளத்தில் சுழல்கிறது.

|-
|05:21
|பிணைப்பின் நீளத்தை மாற்ற மவுஸின் ரைட் பட்டனை கிளிக் செய்து இழுக்கவும்.

|-
|05:27
|இனி hydrogen அணுக்களை எப்படி methyl group ஆக மாற்றுவது என்று காட்டுகிறோம்.

|-
|05:32
|Build menu வை கிளிக் செய்து Change H to Methyl என்பதை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:38
|எல்லா hydrogen அணுக்களும் இப்போது methyl group ஆக மாற்றப்பட்டுள்ளது.

|-
|05:43
|Undo செய்ய ctrl மற்றும் z கீகளை ஒருசேர அழுத்தவும்.

|-
|05:49
|நாம் குறிப்பிட்ட hydrogen ஐ மட்டும் தேர்வு செய்து methyl group ஆக மாற்றலாம்.

|-
|05:55
|Tool bar இல் Selection tool icon ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|05:59
|முனையில் carbon உடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள hydrogen ஐ தேர்ந்தெடுக்க கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:04
|Build menu க்கு சென்று Change H to Methylஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:10
|தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட hydrogen மட்டும் methyl group ஆக மாற்றப்பட்டுள்ளது.

|-
|06:15
|Deselect செய்ய, Ctrl, Shift and A கீகளை ஒருசேர அழுத்தவும்.

|-
|06:22
|இனி வடிவமைப்பை எப்படி copy, paste மற்றும் join செய்வது என்று பார்ப்போம்.

|-
|06:28
|File-> New ஐ கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவை திறக்கவும்.

|-
|06:33
|நாம் ஒரு Maltose மூலக்கூறை எப்படி உருவாகுவது என்று கற்போம்.

|-
|06:37
|Maltose, இரண்டு glucose மூலக்கூறுகளை வைத்து உருவாக்கப்படுகிறது.

|-
|06:41
|glucose மூலக்கூறை உள்நுழைக்க Build மெனுவை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|06:46
|கீழே வந்து Insert -> Fragment என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|06:51
|insert -> Fragment dialog box தோன்றுகிறது.

|-
|06:55
|பட்டியலில் கீழே வந்து Cyclic sugar எனும் folder ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|07:01
|ஒரு submenu தோன்றுகிறது.

|-
|07:04
|கீழே வந்து beta-d-glucopyranose.cml என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|07:10
|Insert பட்டனை கிளிக் செய்யவும். dialog box ஐ மூடவும்.

|-
|07:16
|panel இல் beta-D-glucopyranose.cml நீல நிறத்தில் highlight செய்யப்பட்டு தோன்றுகிறது.
|-
|07:24
|hand tool ஐ பயன்படுத்தி நடுவில் translate செய்யவும்.
|-
|07:28
|நாம் இன்னொரு glucose மூலக்கூறை copy, paste செய்யலாம்.

|-
|07:33
|Menu bar இல் Edit menu வை கிளிக் செய்யவும்.

|-
|07:36
| மறுபடியும் Copy யை கிளிக் செய்யவும் Edit menu வின் கீழே வந்து Paste ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|07:44
|copy, pasteசெய்யும்பொழுது, window சிறிது நேரம் மங்கலாகி சரியாவதை கவனிக்க.

|-
|07:51
|ஒரு புதிய மூலக்கூறு ஏற்கனவே Panel இல் இருக்கும் மூலக்கூறின் மேல் paste ஆகியிருப்பதைக் கவனிக்க.

|-
|07:58
|Cursor, hand toolக்கு மாறுகிறது.

|-
|08:01
|copy செய்யப்பட்ட மூலக்கூறை ஏற்கனவே இருந்த மூலக்கூறை விட்டு நகர்த்தவும்.

|-
|08:06
|இப்போது Panel இல் இரண்டு மூலக்கூறுகள் உள்ளன.

|-
|08:10
|de-select செய்ய Ctrl, Shift மற்றும் A கீகளை ஒருசேர அழுத்தவும்.

|-
|08:17
|மூலக்கூறுகளை நாம் labelling செய்யலாம். இது அணுக்களின் இடத்தை அடையாளப்படுத்த உதவுகிறது.

|-
|08:25
|Label செய்வதற்கு, Display Types drop down இல் Label check boxஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|08:32
|Maltose ஐ பெறுவதற்கு நாம் ஒரு water moleculeஐ நீக்கவேண்டும்.

|-
|08:37
|முதல் மூலக்கூறின் C-1 இல் உள்ள OH group, மற்றும் இரண்டாம் மூலக்கூறின் C-9 இல் உள்ள hydrogen ஐ நீக்கவும்

|-
|08:46
| Draw tool settingsஇல் Carbon ஐ என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|08:50
|Bond Order இல் Single என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|08:54
| Adjust Hydrogens check box ஐ Uncheck செய்யவும்.

|-
|08:58
|இணைப்பதற்கு முதல் மூலக்கூறின் C-1ஐ இரண்டாம் மூலக்கூறின் C-9 வரை Click மற்றும் drag செய்யவும்.

|-
|09:07
|நாம் வடிவமைப்பை optimize செய்ய வேண்டும்.

|-
|09:11
| Auto Optimization tool ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|09:15
|Auto Optimization settings menu இடதுபுறத்தில் தோன்றும்.

|-
|09:20
| MMFF94 force field ஐ தேர்வு செய்து Start ஐ கிளிக் செய்யவும்.

|-
|09:27
|optimization முடிய சில நொடிகள் ஆகலாம். நீங்கள் இப்போது labelகளை நீக்கிவிடலாம்.

|-
|09:35
|இப்போது Panel இல் Maltose மூலக்கூறின் optimized structure உள்ளது.

|-
|09:40
|சுருங்கசொல்ல இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது. அணுக்களை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல்,

|-
|09:47
|பிணைப்புகளை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல்,

|-
|09:50
|பிணைப்புகளை சுழற்றுதல்,

|-
|09:52
|பிணைப்பின் நீளத்தை மாற்றுதல்,

|-
|09:54
|Hydrogen ஐ Methyl group ஆக மாற்றுதல்,

|-
|09:56
|வடிவமைப்புகளை Copy, paste மற்றும் join செய்தல்.

|-
|10:00
|பயிற்சிக்காக draw tool ஐ பயன்படுத்தி ஒரு Butane மூலக்கூறை உருவாக்கவும்.

|-
|10:06
|அதை 2,3 dimethyl Butane ஆக மாற்றவும்.

|-
|10:10
|பிணைப்புகளை சுழற்றி பிணைப்பின் நீளத்தை மாற்றவும்.

|-
|10:14
|ஒரு cellulose மூலக்கூறை உருவாக்கவும் (குறிப்பு: Insert fragment library இல் D- glucose monomer உள்ளது.)

|-
|10:22
|UFF force field பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை Optimize செய்யவும்.

|-
|10:27
|இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது.

|-
|10:36
|உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்.

|-
|10:44
|இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.

|-
|10:52
|இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது பாலசுப்பிரமணியம் . நன்றி.

|}

Avogadro/C2/Build-molecules/Tamil

2017-12-16T13:34:09Z

Balasubramaniam: Created page with "{| border =1 |'''Time''' |'''Narration''' |- |00:01 |அனைவருக்கும் வணக்கம். Build Molecules குறித்த இந்த டுட..."

{| border =1
|'''Time'''
|'''Narration'''

|-
|00:01
|அனைவருக்கும் வணக்கம். Build Molecules குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
|00:07
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது: database இல் இருந்து மூலக்கூறுகளை பதிவிறக்குதல்,

|-
|00:11
|அவற்றை rotate செய்தல், Zoom in மற்றும் Zoom out செய்தல்

|-
|00:15
|Panel இல் மூலக்கூறுகளை கட்டமைத்தல்

|-
|00:17
|Force field ஐ set up செய்தல், அதன் வடிவத்தை optimize செய்தல்

|-
|00:21
|Bond length, Bond angleமற்றும் dihedral angle ஆகியவற்றை அளத்தல்,

|-
|00:25
|Fragment Library ஐ காட்டுதல்

|-
|00:27
|DNA மூலக்கூறுகள் மற்றும் peptides களைக் கட்டமைத்தல்.

|-
|00:31
|இங்கு நான் பயன்படுத்துவது: Linux OS version 14.04, Avogadro version 1.1.1 மற்றும் இணைய இணைப்பு

|-
|00:44
|இந்த டுடோரியலைப் புரிந்துகொள்ள அடிப்படை வேதியியல் பற்றி தெரிந்திருக்க வேண்டும். Avogadro 1.1.1ஐப் பதிவிறக்க திரையில் தோன்றும் இணைப்பிற்கு செல்க.

|-
|00:53
|ஏற்கனவே நான் அதைப் பதிவிறக்கி விட்டேன்.

|-
|00:56
|Avogadro வை திறக்க Dash Home இல் கிளிக் செய்யவும்.

|-
|01:00
|search barல் Avogadro என டைப் செய்யவும்.
|-
|01:02
|Avogadro ஐகானை கிளிக் செய்து அதனைத் திறக்கவும்
|-
|01:08
|முதலில் Chemical Structure Database இல் இருந்து Xylene மூலக்கூறை பதிவிறக்கலாம்.
|-
|01:15
|ஒரு மூலக்கூறை உள்ளே சேர்ப்பதற்கு இணைய இணைப்பு தேவை.
|-
|01:19
|File மெனுவை கிளிக் செய்து Importக்கு செல்லவும்
|-
|01:23
|ஒரு சப்மெனு தோன்றுகிறது.
|-
|01:25
|Fetch by chemical name என்பதைத் தேர்வு செய்யவும்.
|-
|01:28
|Chemical name dialog box தோன்றும்.
|-
|01:30
|பயிற்சிக்காக நான் Xylene என டைப் செய்கிறேன்.
|-
|01:36
|OK பட்டனை கிளிக் செய்க.
|-
|01:38
|இப்போது Panel இல் Xylene மூலக்கூறு உள்ளது
|-
|01:42
|Panel இல் இந்த மூலக்கூறை rotate செய்யலாம்.
|-
|01:45
|Toolbar இல் Navigation tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|01:49
|Cursor ஐ மூலக்கூறின் மேல் வைக்கவும்.
|-
|01:52
|இடது மவுஸ் பட்டனை கிளிக் செய்து drag செய்யலாம்..
|-
|01:56
|Direction அம்புக்குறிகள் drag செய்யப்படிருப்பதை காட்டுகிறது.
|-
|02:00
|Translate செய்வதற்கு ரைட் கிளிக் செய்து drag செய்யவும்.
|-
|02:06
|மவுசின் Scroll wheel ஐப் பயன்படுத்தி Zoom in மற்றும் Zoom out செய்யலாம்.
|-
|02:10
|இனி, ஒரு மூலக்கூறை புதிதாக எப்படி உருவாக்குவது என்று காண்போம்.
|-
|02:14
|Toolbar இல் Draw tool ஐகானைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்
|-
|02:19
|Draw settings மெனுவிற்கு கீழே Element drop down button மற்றும் Bond Order drop down button மற்றும் Adjust Hydrogens check box ஆகியவற்றைக் காணமுடியும்.
|-
|02:30
|மூலக்கூறின் வரைபடத்தில் ஹைட்ரஜன்கள் வேண்டாம் எனில் Adjust Hydrogens check box ஐ அன்செக் செய்க.
|-
|02:37
|Element drop down list தனிமங்களின் பட்டியலைக் காட்டுகிறது.
|-
|02:42
| மொத்த Periodic table ஐயும் தனி விண்டோவில் பார்ப்பதற்கு Other பட்டனை கிளிக் செய்க.
|-
|02:48
|Close பட்டன் ஐ கிளிக் செய்து விண்டோவை மூடவும்.
|-
|02:51
|Panel இல் நாம் Aniline மூலக்கூறின் அமைப்பை வரைவோம்.
|-
|02:55
|Element drop down list இல் இருந்து Carbon என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|02:59
|Bond Order drop down list இல் இருந்து Single என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|03:03
|Panel இல் கிளிக் செய்யவும்.
|-
|03:05
|ஆறு Carbon அணுக்கள் கொண்ட அறுகோணத்தை Drag and Drop செய்து வரையலாம்.
|-
|03:10
|இரட்டை பிணைப்பை காட்டுவதற்கு Bond Order drop down list இல் இருந்து Double என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|03:16
|ஒன்றுவிட்ட பிணைப்புகளை கிளிக் செய்து Benzene அமைப்பை பெறலாம்.
|-
|03:21
|Aniline மூலக்கூறை வரைந்து முடிப்போம்.
|-
|03:24
|Aniline மூலக்கூறை பெற Element drop down list இல் Nitrogenஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|03:29
|Single Bond Order drop down list இல் இருந்து Singleஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்
|-
|03:33
|ஏதேனும் ஒரு Carbon அணுவை கிளிக் செய்து Drag செய்யவும்.
|-
|03:39
|இப்போது Build மெனுவிற்கு சென்று Add Hydrogensஎன்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|03:45
|இப்போது Panel இல் Aniline மூலக்கூறின் அமைப்பை உருவாக்கியுள்ளோம்.
|-
|03:49
|நிலையான இணக்கத்தைப் பெறுவதற்கு, இந்த Aniline மூலக்கூறின் அமைப்பு optimize செய்யப்பட வேண்டும்.
|-
|03:56
|Toolbar இல் Auto Optimization Tool ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|04:02
|Auto Optimization Settings இடது பக்கத்தில் தோன்றும்.
|-
|04:06
|Force Field drop down list ஐ கிளிக் செய்து MMFF94 ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்
|-
|04:13
|சிறிய ஆர்கானிக் மூலக்கூறுகளை optimize செய்ய இந்த MMFF94 பொதுவாக பயன்படுத்தப்படுகிறது.
|-
|04:20
|Start பட்டனை ஐ கிளிக் செய்யவும்
|-
|04:23
|optimization முடிய சில நொடிகள் ஆகலாம்.
|-
|04:28
|Stop ஐ கிளிக் செய்து Optimization Settings ஐ மூடலாம்.
|-
|04:33
|இப்போது Aniline மூலக்கூறின் Bond length, Bond angle மற்றும் dihedral angle ஆகியவற்றை அளக்கலாம்.
|-
|04:40
|Toolbar இல் Click to Measure ஐகானை கிளிக் செய்யவும்
|-
|04:44
|Bond length ஐ அளப்பதற்கு இரண்டு அடுத்தடுத்த Carbon அணுக்களை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|04:49
|Bond Angle ஐ அளப்பதற்கு அடுத்தடுத்த மூன்று Carbon அணுக்களை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|04:55
|dihedral angles ஐ அளப்பதற்கு அடுத்தடுத்த நான்கு Carbon அணுக்களை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|05:02
|அளக்கப்பட்ட மதிப்புகள் Panel இன் கீழ்ப்புறம் தோன்றும்.
|-
|05:07
|இந்த அமைப்பு வரைபடத்தை சேமிக்க File மெனுவில் இருந்து save as ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|05:13
|Save Molecule As உரையாடல் தோன்றும்.
|-
|05:17
|File name என்ற இடத்தில் Aniline.cml என்று டைப் செய்யவும்.
|-
|05:21
|location ஐ Desktop என்று தேர்வு செய்து Save செய்யவும்.
|-
|05:28
|New icon ஐ கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
|05:32
|Avogadro software, Fragment library யை பயன்படுத்தி சிக்கலான மூலக்கூறுகளை உருவாக்கும் வசதியை கொண்டுள்ளது,
|-
|05:38
|Build menu விற்கு செல்லவும்.
|-
|05:40
|Insert இல் Fragment option ஐ தேர்வுசெய்யவும்.
|-
|05:45
|Insert Fragment dialog box தோன்றும்.
|-
|05:49
|பல்வேறு மூலக்கூறுகளின் அமைப்பைக் கொண்டுள்ள .cml fileகள் உள்ள folderகளை காணமுடியும்.
|-
|05:55
|உதாரணமாக alkens folder ஐத் திறப்போம்.
|-
|06:00
|folder ஐ double click செய்து அதில் இருக்கும் fileகளைக் காணலாம்..
|-
|06:04
|2-methyl-buta-1,3-diene.cml என்பதை தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|06:10
|Insert பட்டனைக் கிளிக் செய்யவும்.
|-
|06:13
|Close பட்டனைக் கிளிக் செய்து மூடவும்.
|-
|06:17
|2-methyl-1,3-butadiene இன் அமைப்பு இப்போது panel ல் காட்டப்படுகிறது.
|-
|06:22
|இது பொதுவாக Isoprene என அழைக்கபடுகிறது.
|-
|06:26
|Isoprene ஐ வைத்து பல இயற்கை மூலக்கூறுகளின் அமைப்பை வரைய முடியும்.
|-
|06:30
|இந்த மூலக்கூறு selectmode இல் இருக்கிறது.
|-
|06:33
|இதை deselect செய்ய CTRL, SHIFT and A கீகளை ஒருசேர அழுத்தவும்.
|-
|06:39
|உதாரணமாக Isopreneஐ வைத்து Vitamin A மற்றும் natural rubber இன் மூலக்கூறு அமைப்பு உருவாக்கப்பட்டிருப்பதைக் காட்டுகிறேன்.
|-
|06:47
|Vitamin A, natural rubber
|-
|06:51
|ஒரு மூலையில் Isopreneஐ Translate செய்கிறேன்.
|-
|06:56
|Build menu க்கு சென்று Insert ஐ திறந்து Fragment ஐ தேர்வுசெய்யவும்.
|-
|07:02
|கீழே Macrocycles folder க்கு scroll செய்து double click செய்து திறக்கவும்.
|-
|07:08
|porphin fragment ஐதேர்ந்தெடுத்து Insert ஐ கிளிக் செய்யவும்.
|-
|07:14
|dialog boxஐ மூடவும்.
|-
|07:16
|porphyrin fragment ஐ பயன்படுத்தி சிக்கலான மூலக்கூறுகளான Chlorophyll மற்றும் Vitamin B12 ஐ நாம் உருவாக்கலாம்.
|-
|07:25
|Chlorophyll
|-
|07:27
|Vitamin B12
|-
|07:30
|Avogadro வை பயன்படுத்தி DNA மற்றும் peptides முதலிய சிக்கலான மூலக்கூறுகளை எளிதாக உருவாக்கலாம்.
|-
|07:37
|New ஐகானை கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
|07:41
|ஒரு DNA மூலக்கூறை உள்ளே சேர்க்க Build மெனுவிற்கு சென்று Insert ஐ தேர்வு செய்து சப் மெனுவில் DNA/RNA ஐ கிளிக் செய்க .
|-
|07:51
|Insert Nucleic Acids dialog box தோன்றுகிறது.
|-
|07:55
|DNA/RNA Builder drop down இல் இருந்து DNA ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.
|-
|08:00
|நான்கு nucleic acid base கள் buttonகளாக காட்டப்படுகிறது.
|-
|08:05
|பட்டன்களில் கிளிக் செய்து nucleic acid sequence ஐ தேர்வு செய்யவும்.
|-
|08:10
|நீங்கள் விரும்பிய nucleic acid sequence ஐ தேர்வு செய்யலாம்.
|-
|08:14
|செயல்விளக்கத்திற்காக நான் A T G C A T G C என்ற sequence ஐ தேர்வு செய்கிறேன்.
|-
|08:26
|nucleic acid களின் தேர்வு வரிசைப்படி Sequence text box இல் தோன்றும்.
|-
|08:32
|Bases Per Turn drop down இல் A மற்றும் 5.0 ஐ தேர்வு செய்யவும். இது ஒரு helix இல் இருக்கும் base pairகளின் எண்ணிக்கையைக் குறிக்கிறது.
|-
|08:41
|Strands இல் Single என்று தேர்ந்தெடுத்து Insert பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|08:47
|Close பட்டனை கிளிக் செய்து dialog boxஐ மூடவும்.
|-
|08:51
|இப்போது panelஇல் single stranded DNA மூலக்கூறு உள்ளது.
|-
|08:56
|இந்த அமைப்பை zoom செய்து panelஇன் மத்தியில் கொண்டுவரவும்.
|-
|09:01
|DNA மூலக்கூறை deselect செய்ய CTRL, SHIFT and A கீ களை ஒருசேர அழுத்தவும்.
|-
|09:09
|Insert மெனுவில் உள்ள Peptide option ஐ வைத்து Peptide sequence ஐ எளிதாக உருவாக்கலாம்.
|-
|09:16
|மறுபடியும் New ஐகானை கிளிக் செய்து புதிய விண்டோவைத் திறக்கவும்.
|-
|09:21
|Build மெனுவிற்கு சென்று Insert இல் peptideஎன்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்
|-
|09:26
|Insert Peptide எ தோன்றுகிறது.
|-
|09:29
|Peptide sequence க்கு தேவையான amino acid களை amino acid பட்டனை கிளிக் செய்து தேர்வு செய்யவும்.
|-
|09:36
|செயல்விளக்கத்திற்கு நான் Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) and Cystine(Cys) என்ற sequence ஐ தேர்ந்தெடுக்கிறேன்.
|-
|09:45
|தேர்வு செய்யப்பட வரிசை Sequence text box இல் தோன்றுகிறது.
|-
|09:50
|Insert Peptide பட்டனை கிளிக் செய்யவும்.
|-
|09:53
|Insert Peptide dialog box ஐ மூடவும்.
|-
|09:57
|Panel இல் Peptide சங்கிலி தோன்றுகிறது.
|-
|10:00
|Panel இல் Peptide மூலக்கூறை deselect செய்ய CTRL, SHIFT மற்றும் A கீ களை ஒருசேர அழுத்தவும்.
|-
|10:07
|உங்களுக்கு தேவையான அமினோஅமிலங்களை தேர்வு செய்து peptide sequence ஐ உருவாக்கலாம்.
|-
|10:13
|இப்போது நாம் அனைத்தையும் நினைவு கூறலாம்.
|-
|10:15
|இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது
|-
|10:18
|database இல் இருந்து மூலக்கூறுகளை பதிவிறக்குதல்,
|-
|10:21
|அவற்றை rotate செய்தல், Zoom in மற்றும் Zoom out செய்தல்
|-
|10:24
|Panel இல் மூலக்கூறுகளை கட்டமைத்தல்
|-
|10:26
|Force fieldஐ set up செய்தல், அதன் வடிவத்தை optimize செய்தல்
|-
|10:30
|Bond length, Bond angle மற்றும் dihedral angle ஆகியவற்றை அளத்தல்,
|-
|10:35
|Fragment Library ஐ காட்டுதல்
|-
|10:37
|DNA மூலக்கூறுகள் மற்றும் peptides களைக் கட்டமைத்தல்
|-
|10:41
|தன்னறிவுச்சோதனைக்காக திரையில் தோன்றும் amino acid residues களைப் பயன்படுத்தி protein sequence ஐ உருவாக்குங்கள்.
|-
|10:49
|UFF Force field ஐ பயன்படுத்தி வடிவமைப்பை optimize செய்க.
|-
|10:53
|வரைபடத்தை .cml file ஆக சேமிக்கவும்.
|-
|10:58
|A U G C Nucleic acidகளைப் பயன்படுத்தி RNA sequence ஐ உருவாக்குக
|-
|11:04
|வடிவமைப்பை MMFF94 force field ஐ பயன்படுத்தி optimize செய்க.
|-
|11:10
|வரைபடத்தை .cml file ஆக சேமிக்கவும்.
|-
|11:14
|இந்த வீடியோ ஸ்போகன் டுடோரியல் பாடத்தை சுருங்க சொல்கிறது.
|-
|11:18
|உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லை எனில் இதை download செய்து பார்த்துக்கொள்ளலாம்.
|-
|11:23
|நாங்கள் spoken tutorialகளை பயன்படுத்தி workshop நடத்தி சான்றிதழ் அளிக்கிறோம். நீங்கள் இந்த இமெயில் முகவரியில் எங்களை தொடர்பு கொள்ளலாம்.
|-
|11:30
|இந்திய அரசின் NMEICT, MHRD இந்த spoken tutorial திட்டத்திற்க்கு தேவையான நிதியுதவியை அளிக்கிறது.
|-
|011:36
|இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்து குரல் கொடுத்தது பாலசுப்பிரமணியம். நன்றி.

|}